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一个用于黄单胞菌核开关筛选鉴定的GUS报告载体的构建
1
作者 张云帆 王家孟 +3 位作者 詹紫璐 陈泳伶 杨汇瀛 唐东阶 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期117-128,共12页
核开关(riboswitch)是存在于信使RNA(messenger RNA,mRNA)分子的5′非翻译区(5′-untranslated region,5′UTR)的一段具有调控功能的RNA片段,它通过与特定的代谢物分子直接结合来调控所在mRNA自身的表达。核开关广泛存在于细菌中,在调... 核开关(riboswitch)是存在于信使RNA(messenger RNA,mRNA)分子的5′非翻译区(5′-untranslated region,5′UTR)的一段具有调控功能的RNA片段,它通过与特定的代谢物分子直接结合来调控所在mRNA自身的表达。核开关广泛存在于细菌中,在调控细菌的基础代谢以及致病等生理过程中发挥非常重要的作用。尽管目前在大肠杆菌(Escherichia coli)等模式细菌中已经鉴定了许多核开关,然而,至今在重要的植物病原细菌黄单胞菌属(Xanthomonas)细菌中只鉴定了1个核开关。为了实现在全基因组水平上对黄单胞菌的核开关进行高通量筛选鉴定,本研究设计和构建了1个β-葡萄糖苷酸酶(β-glucuronidase,GUS)报告载体pL3-SD^(+)gusA。该载体既适用于在黄单胞菌属细菌中对候选的核开关进行验证,也可以通过构建基因组DNA表达文库而实现对黄单胞菌核开关的高通量筛选鉴定。 展开更多
关键词 黄单胞菌 GUS报告载体 核开关 高通量筛选鉴定
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辅酶类核开关的种类、结构和调控机制研究进展
2
作者 许笑晨 任艾明 《自然杂志》 CAS 2024年第2期105-116,共12页
核开关是一类保守的RNA元件,可以通过特异性识别小分子配体来开启或关闭下游相关基因的表达,进而调控细胞的生命活动。目前已鉴定出近60种核开关,它们分别识别不同的代谢物或小分子配体。随着这些核开关的发现,它们的序列特征、高级结... 核开关是一类保守的RNA元件,可以通过特异性识别小分子配体来开启或关闭下游相关基因的表达,进而调控细胞的生命活动。目前已鉴定出近60种核开关,它们分别识别不同的代谢物或小分子配体。随着这些核开关的发现,它们的序列特征、高级结构以及调控机制逐渐成为核开关领域的研究热点。截至目前,大部分核开关的三维结构已经被解析,相关研究不仅阐明了这些核开关对配体的特异性识别方式,还从分子层面阐释了其对下游基因表达的调控机制,为开发核开关相关应用提供了重要的研究基础。文章综述了目前已鉴定的核开关的种类和主要功能,详细探讨了辅酶类核开关的三维空间结构和配体识别机制,并展望了核开关的研究前景及潜在应用。 展开更多
关键词 非编码RNA 核开关 辅酶 三维结构 小分子药物
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核开关:一个新的基因调控元件,一类潜在的药物靶点 被引量：4
3
作者 骆迎峰 陈跃磊 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第8期684-687,共4页
核开关是一类通过结合小分子代谢物调控基因表达的mRNA元件 .它位于特定的mRNA区域 ,可以不依赖任何蛋白质因子而直接结合小分子代谢物 ,继而发生构象重排 ,影响该mRNA的活动 .核开关在特定细菌中 ,参与调控包括维生素B12 和甲硫氨酸生... 核开关是一类通过结合小分子代谢物调控基因表达的mRNA元件 .它位于特定的mRNA区域 ,可以不依赖任何蛋白质因子而直接结合小分子代谢物 ,继而发生构象重排 ,影响该mRNA的活动 .核开关在特定细菌中 ,参与调控包括维生素B12 和甲硫氨酸生物合成等在内的代谢途径 .核开关的发现 ,尤其是其可以特异性紧密结合特定配体 ,从而精确调控生物基本代谢途径的特征 ,使人们开始关注它在科研和医学上的应用潜力 .核开关的研究进展。 展开更多
关键词 核开关 基因 表达 调控 蛋白质因子 配体 药物靶点
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环二鸟苷酸(c-di-GMP)在微生物体内的作用及其类似物的研究 被引量：5
4
作者 那路新 杨振军 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期307-312,258,共6页
环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,包括细胞分化、生物被膜形成、致病因子产生等。细菌细胞内c-di-GMP合成与降解代谢分别受二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)和... 环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,包括细胞分化、生物被膜形成、致病因子产生等。细菌细胞内c-di-GMP合成与降解代谢分别受二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)和磷酸二酯酶(phosphodiesterase,PDE)调控,DGC和PDE共处于同一个蛋白中,是一个双功能蛋白酶的两个区域,分别负责菌体内c-di-GMP的合成和降解。c-di-GMP作用菌体内下游靶点包括PilZ结构域和GEMM核开关两种类型。目前发现c-di-GMP核开关是唯一不参与代谢活动而参与信号传导的一类核开关。本文综述了c-di-GMP的代谢途径、调控机制、生物学功能,以及c-di-GMP结构类似物合成及生物学评价等方面的最新研究进展。 展开更多
关键词 环二鸟苷酸 C-DI-GMP 细菌信号传导 代谢酶 GEMM核开关
原文传递
核开关结构、机制及应用新进展 被引量：2
5
作者 何珊 来鲁华 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2010年第1期7-13,共7页
核开关(riboswitch)是Breaker等在2002年发现的一种全新的转录后调节机制.它可以通过小分子与mRNA结合来直接调控基因的表达,不需要任何蛋白质的参与.与常见的经由蛋白质的调控方式相比,riboswitch响应更迅速,对细胞内代谢物的变化更敏... 核开关(riboswitch)是Breaker等在2002年发现的一种全新的转录后调节机制.它可以通过小分子与mRNA结合来直接调控基因的表达,不需要任何蛋白质的参与.与常见的经由蛋白质的调控方式相比,riboswitch响应更迅速,对细胞内代谢物的变化更敏感.它的发现为RNA研究展示了新的领域.目前在这个领域,既有基础研究,如riboswitch晶体结构解析、作用机制和动力学研究,又有前沿应用研究,如基于riboswitch的生物传感器和药物设计.Topp等通过设计riboswitch成功地改变了大肠杆菌的趋化性,这为合成生物学和人工生物网络的设计提供了新思路.目前对于riboswitch结构、机制及动力学的研究为基于riboswitch的合理药物设计奠定了基础,有望针对这一新的机制开发新一代抗菌药物. 展开更多
关键词 核开关(riboswitch) 基因调控 药物设计 合成生物学
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核子秤称量系统在原料混匀配料中的应用与改进 被引量：1
6
作者 陈铁军 王彩琴 《山东冶金》 CAS 2006年第4期74-75,共2页
介绍了核子秤称量系统的控制原理和控制方案。莱钢烧结厂核子秤称量系统在实际生产运行中经常出现核源开关的小车脱轨、控制小车的电机烧毁、速度传感器损坏等问题。针对这些问题,对电动开关装置和测速装置进行了改进,应用表明,改进后... 介绍了核子秤称量系统的控制原理和控制方案。莱钢烧结厂核子秤称量系统在实际生产运行中经常出现核源开关的小车脱轨、控制小车的电机烧毁、速度传感器损坏等问题。针对这些问题,对电动开关装置和测速装置进行了改进,应用表明,改进后的系统运行平稳,提高了配料精度。 展开更多
关键词 核子秤 混匀配料 核源开关小车
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