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基于紫贻贝Mytilus galloprovincialis表达序列的核受体家族分析
1
作者
李娟
李崇德
《海洋通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第2期174-179,共6页
通过对紫贻贝(Mytilus galloprovincialis)公共数据库表达序列的整合分析,共获得29条核受体序列。通过DNA结合结构域(DBD)和配体结合结构域(LBD)的多序列比对,并采用贝叶斯推断法进行系统进化分析,推测其中19个核受体属于NR1亚家族,5个...
通过对紫贻贝(Mytilus galloprovincialis)公共数据库表达序列的整合分析,共获得29条核受体序列。通过DNA结合结构域(DBD)和配体结合结构域(LBD)的多序列比对,并采用贝叶斯推断法进行系统进化分析,推测其中19个核受体属于NR1亚家族,5个属于NR2亚家族,2个属于NR3亚家族,1个属于NR5亚家族。结果表明紫贻贝中存在HR96、E75、ROR、HNF4、RXR、TLL、SVP、ESR、ERR同源的核受体,并且具有新型的2DBD核受体。
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关键词
紫贻贝
核
受体
(
核
激素
受体
)
多序列比对
贝叶斯推断法
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题名
基于紫贻贝Mytilus galloprovincialis表达序列的核受体家族分析
1
作者
李娟
李崇德
机构
国家海洋局北海环境监测中心
中国科学院海洋研究所
国家海洋局北海海洋工程勘察研究院
出处
《海洋通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第2期174-179,共6页
基金
中国博士后科学基金(2012M511553)
海洋公益性行业科研专项(201005016-6)
文摘
通过对紫贻贝(Mytilus galloprovincialis)公共数据库表达序列的整合分析,共获得29条核受体序列。通过DNA结合结构域(DBD)和配体结合结构域(LBD)的多序列比对,并采用贝叶斯推断法进行系统进化分析,推测其中19个核受体属于NR1亚家族,5个属于NR2亚家族,2个属于NR3亚家族,1个属于NR5亚家族。结果表明紫贻贝中存在HR96、E75、ROR、HNF4、RXR、TLL、SVP、ESR、ERR同源的核受体,并且具有新型的2DBD核受体。
关键词
紫贻贝
核
受体
(
核
激素
受体
)
多序列比对
贝叶斯推断法
Keywords
Mytilus galloprovincialis
nuclear receptor
mutiple alignment
Bayesian phylogenetic analysis
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于紫贻贝Mytilus galloprovincialis表达序列的核受体家族分析
李娟
李崇德
《海洋通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
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