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基于液质联用代谢组学方法分析不同产地和表型的玛咖 被引量：2
1
作者 梁晓庆 杨长军 +1 位作者 王桐 耿越 《现代食品科技》 EI CAS 北大核心 2020年第5期319-328,共10页
本实验基于液质联用代谢组学分析方法对20种不同表型和产地玛咖进行分析,采用超高效液相色谱串联四级杆静电场轨道阱高分辨质谱(Dionex Ultimate 3000-Q Exactive Orbitrap),原始数据经过Compound Discoverer软件处理后通过SIMACA 14.1... 本实验基于液质联用代谢组学分析方法对20种不同表型和产地玛咖进行分析,采用超高效液相色谱串联四级杆静电场轨道阱高分辨质谱(Dionex Ultimate 3000-Q Exactive Orbitrap),原始数据经过Compound Discoverer软件处理后通过SIMACA 14.1软件分析可能的标志性代谢物,然后对这些潜在的标志性代谢产物进行二级质谱分析,通过相关文献和数据库(HMDB或NIST)对其进行定性。结果表明按照产地分组的多元变量统计分析中,五个产地的玛咖在OPLS-DA中成功分组,丽江和香格里拉两个产地玛咖在PLS-DA和OPLS-DA中分组成功;三种表型的紫色、黄色和黑色玛咖在PLS-DA和OPLS-DA中分组成功。聚类分析表明黄色、黑色和紫色玛咖各分为不同三类,三种表型玛咖内活性成分差异较大,与OPLS-DA得分图结果相吻合。表明高分辨质谱结合代谢组学技术可用于玛咖不同表型及产地的鉴别。由于目前对于玛咖中代谢物质定性的数据库和文献较少,本实验只定性出黑色玛咖的标志性代谢产物N-苄基-15Z-烯二十四酰胺以及黄色和紫色玛咖标志性代谢产物3-甲氧基苯基乙酸。 展开更多
关键词 玛咖 代谢组学 液质联用 标志性代谢产物
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α-核突触蛋白转基因小鼠肝组织内源性代谢产物的变化规律研究
2
作者 陈宁 隋云鹏 +2 位作者 苏东宁 魏明豪 孟凡刚 《山西医科大学学报》 CAS 2019年第10期1429-1434,共6页
目的通过对野生型和α-核突触蛋白转基因小鼠肝组织中内源性代谢性产物的比对分析研究,进一步明确α-核突触蛋白与帕金森的生理病理相关性以及相应的临床意义。方法采用超高效液相色谱-质谱(ultra performance liquid chromatography-ma... 目的通过对野生型和α-核突触蛋白转基因小鼠肝组织中内源性代谢性产物的比对分析研究,进一步明确α-核突触蛋白与帕金森的生理病理相关性以及相应的临床意义。方法采用超高效液相色谱-质谱(ultra performance liquid chromatography-mass spectrum,UPLC-MS)分别检测WT野生型和α-核突触蛋白转基因小鼠肝组织中内源性代谢性产物,数据采用mzcloud对小鼠肝组织内源性代谢物质进行鉴定,利用分子式和分子量确定内源性物质,将相应数据进行主成分分析(PCA)和聚类分析,解析其差异表达代谢物,并构建通路图和互作网络图。结果①在基于LC/MS方法的代谢组分析中,发现野生型小鼠与基因敲除小鼠之间有一定差异,差异代谢物以氨基酸类及磷脂类等为主,包括2-脱氧葡萄糖、1,2,3-丙三羧酸、抗坏血酸、络氨酸、丝氨酸、肌酸、多巴胺、组氨酸、苯乙胺、磷脂酰胆碱、苏氨酸、丙氨酸、胆酸、棕榈酸等。②构建了代谢通路,主要涉及苯丙氨酸、络氨酸和色氨酸生物合成,苯丙氨酸代谢,甲氨酸代谢,络氨酸代谢,组氨酸代谢,甘油磷脂代谢,氨酰tRNA生物合成等,并从中发现9个具有标志性的代谢成分。结论通过对两组动物的代谢产物研究发现:络氨酸、丝氨酸、肌酸、多巴胺、组氨酸、苯乙胺、磷脂酰胆碱、苏氨酸、丙氨酸等生物学标志性代谢产物发生显著变化,并涉及数个代谢通路。 展开更多
关键词 Α-突触核蛋白 转基因 帕金森 代谢组学 标志性代谢产物
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α-核突触蛋白基因突变小鼠脑组织中内源性代谢产物的变化
3
作者 陈宁 隋云鹏 +3 位作者 张亮 曹屹东 贾栋 魏明豪 《现代生物医学进展》 CAS 2019年第21期4011-4016,4025,共7页
目的:明确α-核突触蛋白与帕金森病的病理生理相关性及其临床意义。方法:采用相色谱-质谱联用(UPLC-MS)检测野生型小鼠和基因突变型小鼠脑组织中内源性代谢性产物,通过mzcloud法对小鼠脑组织中内源性代谢物质进行鉴定,将相应数据进行主... 目的:明确α-核突触蛋白与帕金森病的病理生理相关性及其临床意义。方法:采用相色谱-质谱联用(UPLC-MS)检测野生型小鼠和基因突变型小鼠脑组织中内源性代谢性产物,通过mzcloud法对小鼠脑组织中内源性代谢物质进行鉴定,将相应数据进行主成分分析(PCA)和聚类分析,分析其相关差异表达代谢物,并构建通路图和互作网络图。结果:(1)基于LC/MS法的代谢组分析结果显示两组间差异代谢物以氨基酸类及磷脂类等为主,包括β-丙氨酰-L-组氨酸、L-精氨酸、L-组氨酸、L-亮氨酸、L-苯丙氨酸、L-缬氨酸、L-天门冬氨酸、L-丙氨酸、磷脂酰胆碱等;(2)构建的代谢通路主要涉及酮体的合成和降解、牛磺酸和亚牛磺酸代谢、丙氨酸,天冬氨酸和谷氨酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、组氨酸代谢、苯丙氨酸代谢、缬氨酸,亮氨酸和异亮氨酸的生物合成、甘油磷脂代谢等,从中发现18个具有标志性的代谢成分。结论:α-核突触蛋白基因突变后,酮体的合成和降解、牛磺酸和亚牛磺酸代谢、丙氨酸,天冬氨酸和谷氨酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、组氨酸代谢、苯丙氨酸代谢、缬氨酸,亮氨酸和异亮氨酸的生物合成、甘油磷脂代谢等代谢通路发生了变化,涉及β-丙氨酰-L-组氨酸、L-精氨酸、L-组氨酸、L-亮氨酸、L-苯丙氨酸、L-缬氨酸、L-天门冬氨酸、L-丙氨酸、磷脂酰胆碱等的生物学标志性代谢产物变化。 展开更多
关键词 Α-突触核蛋白 基因突变 帕金森 代谢组学 标志性代谢产物
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代谢组学在中医学中的现代研究进展 被引量：4
4
作者 袁博 杜小正 +3 位作者 王金海 张星华 田亮 朱博雯 《辽宁中医药大学学报》 CAS 2015年第12期57-59,共3页
代谢组学与中医以及针灸在整体性、动态性、即时性的特点上有明显的趋同性,因此代谢组学可为研究中医证候、针灸治疗提供新思路,即运用代谢组学方法寻找中医证候以及针灸干预后的标志性代谢产物或代谢通路,初步揭示证候的分子生物学诊... 代谢组学与中医以及针灸在整体性、动态性、即时性的特点上有明显的趋同性,因此代谢组学可为研究中医证候、针灸治疗提供新思路,即运用代谢组学方法寻找中医证候以及针灸干预后的标志性代谢产物或代谢通路,初步揭示证候的分子生物学诊断指标,明确证候中发生的相应变化物质,从而为中医药现代化搭建了重要平台。 展开更多
关键词 代谢组学 中医证候 特异标志性代谢产物 辨证论治 针灸
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代谢组学在儿科学的应用
5
作者 蔺湘宁 王小荣 +5 位作者 王鹏飞 王凤仪 张弢 尚菁 王强 李玉霞 《甘肃医药》 2017年第1期16-19,共4页
儿科疾病的发病、病理具有明显的差异性,早期诊断和及时干预对疾病治疗有积极作用。代谢组学作为系统生物学研究的终端,对生物体不同情况下产生的小分子代谢产物进行分析,获得疾病特异性指标,为儿科疾病的诊断和治疗提供可靠依据。本文... 儿科疾病的发病、病理具有明显的差异性,早期诊断和及时干预对疾病治疗有积极作用。代谢组学作为系统生物学研究的终端,对生物体不同情况下产生的小分子代谢产物进行分析,获得疾病特异性指标,为儿科疾病的诊断和治疗提供可靠依据。本文就代谢组学在儿科学的应用作一综述。 展开更多
关键词 儿科 代谢组学 特异标志性代谢产物
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代谢组学与中医证候标志物 被引量：2
6
作者 于卓 《实用中医内科杂志》 2013年第4期15-15,共1页
中医证候与代谢组学研究技术通常先进行疾病中医辨证分型,然后通过采集证候样本或模型动物血浆、尿样品或其他体液并进行代谢产物分析,得到各自代谢产物图谱,找出特异标志性代谢产物,用生物信息学方法分析生物标志物功能,筛选、鉴定与... 中医证候与代谢组学研究技术通常先进行疾病中医辨证分型,然后通过采集证候样本或模型动物血浆、尿样品或其他体液并进行代谢产物分析,得到各自代谢产物图谱,找出特异标志性代谢产物,用生物信息学方法分析生物标志物功能,筛选、鉴定与各证型相关生物标志物群,以确定证候相关代谢谱群,探讨中医证候与代谢组学的关系。代谢组学为研究中医证候提供新思路,并从客观本质上解释二者关系,为中医药现代化搭建了重要平台。 展开更多
关键词 代谢组学 辨证分型 证候 特异标志性代谢产物 标志物 辨证论治
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