构建柴胡活性成分-作用靶点网络和蛋白相互作用网络,对靶点涉及的功能和通路进行分析,探讨柴胡抗抑郁的作用机制。通过TCMSP数据库、文献挖掘和本实验室已有研究获取柴胡主要活性成分,利用DRAR-CPI服务器、Gene Cards和OMIM数据库预测...构建柴胡活性成分-作用靶点网络和蛋白相互作用网络,对靶点涉及的功能和通路进行分析,探讨柴胡抗抑郁的作用机制。通过TCMSP数据库、文献挖掘和本实验室已有研究获取柴胡主要活性成分,利用DRAR-CPI服务器、Gene Cards和OMIM数据库预测和筛选柴胡活性成分抗抑郁的作用靶点。采用Cytoscape软件构建活性成分-作用靶点网络,采用String数据库和Cytoscape软件绘制蛋白相互作用网络,通过Systems Dock Web Site对成分与靶点进行分子对接验证。采用DAVID数据库对靶点进行GO及KEGG通路分析,通过Dis Ge NET数据库对靶点所属的类型进行归属。筛选得到柴胡15个活性成分,涉及50个作用靶点。网络分析结果表明,柴胡主要涉及细胞过程、代谢过程、对应激的应答等生物过程,通过调节PI3K-AKT、MAPK、Rap1、Ras、Fox O和neurotrophin等信号通路来发挥抗抑郁作用。本研究体现了柴胡多成分-多靶点-多途径的作用特点,为进一步开展柴胡抗抑郁作用机制的研究提供了新思路和新方法。展开更多
文摘构建柴胡活性成分-作用靶点网络和蛋白相互作用网络,对靶点涉及的功能和通路进行分析,探讨柴胡抗抑郁的作用机制。通过TCMSP数据库、文献挖掘和本实验室已有研究获取柴胡主要活性成分,利用DRAR-CPI服务器、Gene Cards和OMIM数据库预测和筛选柴胡活性成分抗抑郁的作用靶点。采用Cytoscape软件构建活性成分-作用靶点网络,采用String数据库和Cytoscape软件绘制蛋白相互作用网络,通过Systems Dock Web Site对成分与靶点进行分子对接验证。采用DAVID数据库对靶点进行GO及KEGG通路分析,通过Dis Ge NET数据库对靶点所属的类型进行归属。筛选得到柴胡15个活性成分,涉及50个作用靶点。网络分析结果表明,柴胡主要涉及细胞过程、代谢过程、对应激的应答等生物过程,通过调节PI3K-AKT、MAPK、Rap1、Ras、Fox O和neurotrophin等信号通路来发挥抗抑郁作用。本研究体现了柴胡多成分-多靶点-多途径的作用特点,为进一步开展柴胡抗抑郁作用机制的研究提供了新思路和新方法。
