目的对西宁市2017—2018年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)人肠道病毒柯萨奇A16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)的VPl基因特征进行分析。方法对西宁市2017—2018年送检的HFMD标本,用荧光定量PCR方法检测,对CV-A16阳性标本进...目的对西宁市2017—2018年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)人肠道病毒柯萨奇A16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)的VPl基因特征进行分析。方法对西宁市2017—2018年送检的HFMD标本,用荧光定量PCR方法检测,对CV-A16阳性标本进行病毒分离,对分离到的病毒提取核酸,用RT-PCR方法对VP1编码区进行扩增及核苷酸序列测定和分析,并与CV-A16各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果西宁市2017—2018年共分离到70株CV-A16,2017年西宁市流行的10株CV-A16可以被划分为2个基因亚型,其中3株为B1a基因亚型7株为B1b基因亚型。而2018年CV-A16流行株则只有B1b基因亚型。结论西宁市2017—2018从手足口病病例分离到的CV-A16病毒有B1a与B1b两种基因亚型,共同进化与流行,其中B1b基因亚型为主要流行株。展开更多
文摘目的对西宁市2017—2018年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)人肠道病毒柯萨奇A16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)的VPl基因特征进行分析。方法对西宁市2017—2018年送检的HFMD标本,用荧光定量PCR方法检测,对CV-A16阳性标本进行病毒分离,对分离到的病毒提取核酸,用RT-PCR方法对VP1编码区进行扩增及核苷酸序列测定和分析,并与CV-A16各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果西宁市2017—2018年共分离到70株CV-A16,2017年西宁市流行的10株CV-A16可以被划分为2个基因亚型,其中3株为B1a基因亚型7株为B1b基因亚型。而2018年CV-A16流行株则只有B1b基因亚型。结论西宁市2017—2018从手足口病病例分离到的CV-A16病毒有B1a与B1b两种基因亚型,共同进化与流行,其中B1b基因亚型为主要流行株。
