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铁皮石斛叶片内生真菌多样性的研究
被引量:
10
1
作者
陈泽斌
李冰
+5 位作者
王定康
余磊
刘佳妮
徐胜光
靳松
任禛
《福建农业学报》
CAS
北大核心
2015年第10期978-983,共6页
为检测铁皮石斛内生真菌种类,采用高通量测序技术测定铁皮石斛内生真菌的ITS2区序列,用Qiime和Mothur等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析物种的丰度和Alpha多样性。获得的有效序列和OTU数为41361/33;稀疏曲线...
为检测铁皮石斛内生真菌种类,采用高通量测序技术测定铁皮石斛内生真菌的ITS2区序列,用Qiime和Mothur等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析物种的丰度和Alpha多样性。获得的有效序列和OTU数为41361/33;稀疏曲线表明测序深度充分,OTU的数量接近于饱和。铁皮石斛内生真菌主要分布于裸胞壳属Emericella,构巢裸壳孢菌Emericella nidulans是铁皮石斛内生真菌的优势种群。
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关键词
铁皮石斛
内生真
菌
高通量测序
构
巢
裸
壳
孢
菌
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职称材料
题名
铁皮石斛叶片内生真菌多样性的研究
被引量:
10
1
作者
陈泽斌
李冰
王定康
余磊
刘佳妮
徐胜光
靳松
任禛
机构
昆明学院农学院
云南省都市特色农业工程技术研究中心
中国科学院昆明动物研究所
昆明学院生命科学与技术系
出处
《福建农业学报》
CAS
北大核心
2015年第10期978-983,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31460491)
云南省科技厅应用基础研究计划青年项目(2013FD040)
+2 种基金
云南省教育厅科学研究项目(2014Y390)
昆明学院人才引进项目(YJL14005)
云南省高校优势特色重点学科(生态学)建设项目资助
文摘
为检测铁皮石斛内生真菌种类,采用高通量测序技术测定铁皮石斛内生真菌的ITS2区序列,用Qiime和Mothur等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析物种的丰度和Alpha多样性。获得的有效序列和OTU数为41361/33;稀疏曲线表明测序深度充分,OTU的数量接近于饱和。铁皮石斛内生真菌主要分布于裸胞壳属Emericella,构巢裸壳孢菌Emericella nidulans是铁皮石斛内生真菌的优势种群。
关键词
铁皮石斛
内生真
菌
高通量测序
构
巢
裸
壳
孢
菌
Keywords
Dendrobium candidum
endophytic fungi
high-throughput sequencing
Emericella nidulans
分类号
Q939.96 [生物学—微生物学]
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被引量
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1
铁皮石斛叶片内生真菌多样性的研究
陈泽斌
李冰
王定康
余磊
刘佳妮
徐胜光
靳松
任禛
《福建农业学报》
CAS
北大核心
2015
10
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