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多重PCR鉴定三种颚口线虫方法的建立
被引量:
4
1
作者
李树清
李雯雯
+6 位作者
张鸿满
陈韶红
李健
陈志飞
王巧全
张永年
黄维义
《中国动物传染病学报》
CAS
2014年第6期38-45,共8页
为了建立快速、灵敏、可靠的鉴别颚口线虫虫种的方法,根据GenBank中发表的棘颚口线虫、日本颚口线虫和杜氏颚口线虫ITS-2序列,设计了3对特异引物,建立了这3种颚口线虫的单一PCR和多重PCR检测方法,并分别对单一PCR和多重PCR方法的特异性...
为了建立快速、灵敏、可靠的鉴别颚口线虫虫种的方法,根据GenBank中发表的棘颚口线虫、日本颚口线虫和杜氏颚口线虫ITS-2序列,设计了3对特异引物,建立了这3种颚口线虫的单一PCR和多重PCR检测方法,并分别对单一PCR和多重PCR方法的特异性和敏感性进行了鉴定。结果显示单一PCR和多重PCR均能特异扩增出棘颚口线虫、日本颚口线虫和杜氏颚口线虫,其片段大小分别为282、358、183 bp,单一PCR对棘颚口线虫、日本颚口线虫和杜氏颚口线虫虫体DNA最小检出量分别为0.2、0.01、0.01 ng/μL。对宫脂线虫、异尖线虫、棘口吸虫以及迭宫绦虫均不能进行扩增。用建立的多重PCR方法对菲律宾、印度尼西亚、黑龙江颚口线虫等12条颚口线虫DNA模板进行扩增,经鉴定菲律宾与印度尼西亚的颚口线虫为棘颚口线虫,黑龙江的颚口线虫为日本颚口线虫。鉴定结果与原虫体样本的形态鉴定和测序分析结果一致。研究显示建立的多重PCR方法具有很强的特异性和较高的敏感性,可用于棘颚口线虫、日本颚口线虫和杜氏颚口线虫虫种的鉴定和流行病学调查。
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关键词
棘颚口线虫
日本颚口线虫
杜氏颚口线虫
多重PCR
虫种鉴定
下载PDF
职称材料
湖南省野猪杜氏颚口线虫线粒体cytb基因序列种系发育分析
被引量:
4
2
作者
王欣茹
尹代杰
+3 位作者
杨逸豪
李萌
刘思齐
刘伟
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第7期643-645,649,共4页
为阐明野猪杜氏颚口线虫分离株线粒体细胞色素b(cytb)基因的遗传变异情况,并利用该基因探究杜氏颚口线虫与其它线虫的种群遗传关系。本研究利用PCR扩增从野猪体内分离出的杜氏颚口线虫cytb基因,并对该基因序列进行分析。结果显示,8株杜...
为阐明野猪杜氏颚口线虫分离株线粒体细胞色素b(cytb)基因的遗传变异情况,并利用该基因探究杜氏颚口线虫与其它线虫的种群遗传关系。本研究利用PCR扩增从野猪体内分离出的杜氏颚口线虫cytb基因,并对该基因序列进行分析。结果显示,8株杜氏颚口线虫分离株线粒体cytb基因序列长度均为1 067 bp,与Genbank中登录的杜氏颚口线虫分离株同源性均大于98.3%,与其它线虫的同源性均小于72.0%;通过该基因建立的系统发育树分析显示,所有的杜氏颚口线虫分离株均与已知杜氏颚口线虫属于同一大分支。表明,线粒体cytb基因序列种内相对保守,种间差异明显,可以作为分子标记应用于杜氏颚口线虫的种间遗传变异研究。本研究为杜氏颚口线虫的分子流行病学和群体遗传学奠定基础。
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关键词
野猪
杜氏颚口线虫
线粒体DNA
CYTB基因
种系发育分析
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职称材料
题名
多重PCR鉴定三种颚口线虫方法的建立
被引量:
4
1
作者
李树清
李雯雯
张鸿满
陈韶红
李健
陈志飞
王巧全
张永年
黄维义
机构
上海出入境检验检疫局
中山大学附属第一医院动物实验中心
广西疾病预防控制中心
中国疫病预防控制中心寄生虫病预防控制所
广西大学动物科学技术学院
出处
《中国动物传染病学报》
CAS
2014年第6期38-45,共8页
基金
上海市科委技术标准专项(11dz0503100)
国家质检总局科技专项(2010IK013)
文摘
为了建立快速、灵敏、可靠的鉴别颚口线虫虫种的方法,根据GenBank中发表的棘颚口线虫、日本颚口线虫和杜氏颚口线虫ITS-2序列,设计了3对特异引物,建立了这3种颚口线虫的单一PCR和多重PCR检测方法,并分别对单一PCR和多重PCR方法的特异性和敏感性进行了鉴定。结果显示单一PCR和多重PCR均能特异扩增出棘颚口线虫、日本颚口线虫和杜氏颚口线虫,其片段大小分别为282、358、183 bp,单一PCR对棘颚口线虫、日本颚口线虫和杜氏颚口线虫虫体DNA最小检出量分别为0.2、0.01、0.01 ng/μL。对宫脂线虫、异尖线虫、棘口吸虫以及迭宫绦虫均不能进行扩增。用建立的多重PCR方法对菲律宾、印度尼西亚、黑龙江颚口线虫等12条颚口线虫DNA模板进行扩增,经鉴定菲律宾与印度尼西亚的颚口线虫为棘颚口线虫,黑龙江的颚口线虫为日本颚口线虫。鉴定结果与原虫体样本的形态鉴定和测序分析结果一致。研究显示建立的多重PCR方法具有很强的特异性和较高的敏感性,可用于棘颚口线虫、日本颚口线虫和杜氏颚口线虫虫种的鉴定和流行病学调查。
关键词
棘颚口线虫
日本颚口线虫
杜氏颚口线虫
多重PCR
虫种鉴定
Keywords
G.spinigerum
G.nipponicum
G.doloresi
multiplex PCR
identification
分类号
S852.731 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
湖南省野猪杜氏颚口线虫线粒体cytb基因序列种系发育分析
被引量:
4
2
作者
王欣茹
尹代杰
杨逸豪
李萌
刘思齐
刘伟
机构
湖南农业大学国际学院
湖南农业大学动物医学院
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第7期643-645,649,共4页
基金
2016年国际学院大学生科技创新基金项目
文摘
为阐明野猪杜氏颚口线虫分离株线粒体细胞色素b(cytb)基因的遗传变异情况,并利用该基因探究杜氏颚口线虫与其它线虫的种群遗传关系。本研究利用PCR扩增从野猪体内分离出的杜氏颚口线虫cytb基因,并对该基因序列进行分析。结果显示,8株杜氏颚口线虫分离株线粒体cytb基因序列长度均为1 067 bp,与Genbank中登录的杜氏颚口线虫分离株同源性均大于98.3%,与其它线虫的同源性均小于72.0%;通过该基因建立的系统发育树分析显示,所有的杜氏颚口线虫分离株均与已知杜氏颚口线虫属于同一大分支。表明,线粒体cytb基因序列种内相对保守,种间差异明显,可以作为分子标记应用于杜氏颚口线虫的种间遗传变异研究。本研究为杜氏颚口线虫的分子流行病学和群体遗传学奠定基础。
关键词
野猪
杜氏颚口线虫
线粒体DNA
CYTB基因
种系发育分析
Keywords
wild boar
G.doloresi
mitochondrial DNA
cytb gene
sequence analysis
分类号
S852.7 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
多重PCR鉴定三种颚口线虫方法的建立
李树清
李雯雯
张鸿满
陈韶红
李健
陈志飞
王巧全
张永年
黄维义
《中国动物传染病学报》
CAS
2014
4
下载PDF
职称材料
2
湖南省野猪杜氏颚口线虫线粒体cytb基因序列种系发育分析
王欣茹
尹代杰
杨逸豪
李萌
刘思齐
刘伟
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
4
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职称材料
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