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基因芯片筛选软骨肉瘤去分化相关基因初步探讨
被引量:
5
1
作者
王国文
郭卫
+2 位作者
汤小东
彭长亮
赵会
《中国肿瘤临床》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第20期1146-1149,共4页
目的:探讨用基因芯片技术区分普通型软骨肉瘤与去分化软骨肉瘤组织中基因的差异表达。方法:对病理证实的普通型软骨肉瘤及去分化软骨肉瘤组织,提取细胞mRNA,用寡核苷酸芯片,与正常关节软骨组织杂交后获得荧光信号,计算机软件分析荧光信...
目的:探讨用基因芯片技术区分普通型软骨肉瘤与去分化软骨肉瘤组织中基因的差异表达。方法:对病理证实的普通型软骨肉瘤及去分化软骨肉瘤组织,提取细胞mRNA,用寡核苷酸芯片,与正常关节软骨组织杂交后获得荧光信号,计算机软件分析荧光信号结果,并对数据进行归一化处理,分析组间显著变化的基因,然后对其进行聚类和主成份分析,筛选出差异表达的基因。结果:在所检测的人普通型软骨肉瘤与去分化软骨肉瘤组织中,31个基因有表达异常,其中高表达14条,低表达17条。结论:去分化软骨肉瘤与普通型软骨肉瘤间基因表达差异是明显的,这些差异基因主要分布于涉及TGT信号途径、Wnt信号途径、IHH/PThRP轴以及凋亡机制等多方面,且有些基因的作用目前尚不清楚。
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关键词
普通型
软
骨肉瘤
去分化
软
骨肉瘤
基因表达
基因芯片
下载PDF
职称材料
普通型软骨肉瘤患者总生存预测列线图和风险分层建立与验证
被引量:
1
2
作者
于蒙洋
王斌
+3 位作者
黄帅
钟少文
陈灿伟
刘圣曜
《中华肿瘤防治杂志》
CAS
北大核心
2020年第16期1327-1334,共8页
目的普通型软骨肉瘤是最常见的软骨肉瘤,预后较差,需要个体化生存预测模型准确地指导患者管理。本研究构建普通型软骨肉瘤患者总生存期(overall survival,OS)预测列线图以指导患者的管理。方法从SEER数据库中选取普通型软骨肉瘤患者955...
目的普通型软骨肉瘤是最常见的软骨肉瘤,预后较差,需要个体化生存预测模型准确地指导患者管理。本研究构建普通型软骨肉瘤患者总生存期(overall survival,OS)预测列线图以指导患者的管理。方法从SEER数据库中选取普通型软骨肉瘤患者955例,随机分为训练队列668例和验证队列287例。训练队列中采用单因素Cox分析和多因素Cox比例风险回归分析确定预后危险因素,根据多因素Cox比例风险回归的结果构建列线图模型。训练队列内验证和验证队列外验证中通过一致性指数(concordance indexe,C-index)和校准曲线评价该模型的准确性和一致性。基于患者个体化列线图的总得分,构建普通型软骨肉瘤患者的风险分层。结果所有患者中诊断年龄(P<0.001)、分期(P<0.001)、分化程度(P<0.001)、手术(P<0.001)、婚姻状态(P=0.008)以及肿瘤直径(P=0.027)均是骨普通型软骨肉瘤的预后危险因素。预测列线图的训练队列内验证C-index=0.82(95%CI为0.78~0.86),验证队列外验证C-index=0.84(95%CI为0.79~0.89),校准曲线显示列线图预测的生存率与实际生存率接近。基于列线图的总得分,将风险分层分为低风险组、中风险组和高风险组,组间比较差异均有统计学意义,P<0.001;训练队列和验证队列中风险分层差异均有统计学意义,均P<0.001。结论普通型软骨肉瘤患者OS的预测列线图,能相对准确预测普通型软骨肉瘤患者1年、3年和5年的OS,为临床医生更加准确地预测患者的OS以及实现患者的风险分层管理提供科学依据。
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关键词
普通型
软
骨肉瘤
总生存期
列线图
风险分层
SEER数据库
原文传递
题名
基因芯片筛选软骨肉瘤去分化相关基因初步探讨
被引量:
5
1
作者
王国文
郭卫
汤小东
彭长亮
赵会
机构
北京大学人民医院骨与软组织肿瘤诊疗中心
出处
《中国肿瘤临床》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第20期1146-1149,共4页
基金
首都医学发展科研基金资助(编号:2005-1009)
文摘
目的:探讨用基因芯片技术区分普通型软骨肉瘤与去分化软骨肉瘤组织中基因的差异表达。方法:对病理证实的普通型软骨肉瘤及去分化软骨肉瘤组织,提取细胞mRNA,用寡核苷酸芯片,与正常关节软骨组织杂交后获得荧光信号,计算机软件分析荧光信号结果,并对数据进行归一化处理,分析组间显著变化的基因,然后对其进行聚类和主成份分析,筛选出差异表达的基因。结果:在所检测的人普通型软骨肉瘤与去分化软骨肉瘤组织中,31个基因有表达异常,其中高表达14条,低表达17条。结论:去分化软骨肉瘤与普通型软骨肉瘤间基因表达差异是明显的,这些差异基因主要分布于涉及TGT信号途径、Wnt信号途径、IHH/PThRP轴以及凋亡机制等多方面,且有些基因的作用目前尚不清楚。
关键词
普通型
软
骨肉瘤
去分化
软
骨肉瘤
基因表达
基因芯片
Keywords
Conventional chondrosarcoma Dedifferentiated chondrosarcoma Gene expression cDNA microarray
分类号
R738.1 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
普通型软骨肉瘤患者总生存预测列线图和风险分层建立与验证
被引量:
1
2
作者
于蒙洋
王斌
黄帅
钟少文
陈灿伟
刘圣曜
机构
广州医科大学附属第二医院骨科
出处
《中华肿瘤防治杂志》
CAS
北大核心
2020年第16期1327-1334,共8页
基金
广东省自然科学基金(2020A1515010211)。
文摘
目的普通型软骨肉瘤是最常见的软骨肉瘤,预后较差,需要个体化生存预测模型准确地指导患者管理。本研究构建普通型软骨肉瘤患者总生存期(overall survival,OS)预测列线图以指导患者的管理。方法从SEER数据库中选取普通型软骨肉瘤患者955例,随机分为训练队列668例和验证队列287例。训练队列中采用单因素Cox分析和多因素Cox比例风险回归分析确定预后危险因素,根据多因素Cox比例风险回归的结果构建列线图模型。训练队列内验证和验证队列外验证中通过一致性指数(concordance indexe,C-index)和校准曲线评价该模型的准确性和一致性。基于患者个体化列线图的总得分,构建普通型软骨肉瘤患者的风险分层。结果所有患者中诊断年龄(P<0.001)、分期(P<0.001)、分化程度(P<0.001)、手术(P<0.001)、婚姻状态(P=0.008)以及肿瘤直径(P=0.027)均是骨普通型软骨肉瘤的预后危险因素。预测列线图的训练队列内验证C-index=0.82(95%CI为0.78~0.86),验证队列外验证C-index=0.84(95%CI为0.79~0.89),校准曲线显示列线图预测的生存率与实际生存率接近。基于列线图的总得分,将风险分层分为低风险组、中风险组和高风险组,组间比较差异均有统计学意义,P<0.001;训练队列和验证队列中风险分层差异均有统计学意义,均P<0.001。结论普通型软骨肉瘤患者OS的预测列线图,能相对准确预测普通型软骨肉瘤患者1年、3年和5年的OS,为临床医生更加准确地预测患者的OS以及实现患者的风险分层管理提供科学依据。
关键词
普通型
软
骨肉瘤
总生存期
列线图
风险分层
SEER数据库
Keywords
chondrosarcoma not otherwise specified
overall survival
nomogram
risk classification system
SEER database
分类号
R738.3 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基因芯片筛选软骨肉瘤去分化相关基因初步探讨
王国文
郭卫
汤小东
彭长亮
赵会
《中国肿瘤临床》
CAS
CSCD
北大核心
2007
5
下载PDF
职称材料
2
普通型软骨肉瘤患者总生存预测列线图和风险分层建立与验证
于蒙洋
王斌
黄帅
钟少文
陈灿伟
刘圣曜
《中华肿瘤防治杂志》
CAS
北大核心
2020
1
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