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人类1号染色体可变剪接与普通剪接基因同义密码子的使用分析 I.同义密码子偏爱使用分析(英文)
1
作者
陈学平
武耀廷
+2 位作者
郭家明
张成
马飞
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第1期1-5,共5页
人类1号染色体可变剪接(选择性剪接)基因344非冗余蛋白质编码序列(188183密码子)和普通剪接(非可变剪接)基因的386蛋白质编码序列(223116密码子)被用于研究人类密码子使用偏爱模式。全部密码子使用数据分析表明,人类可变剪接基因密码子...
人类1号染色体可变剪接(选择性剪接)基因344非冗余蛋白质编码序列(188183密码子)和普通剪接(非可变剪接)基因的386蛋白质编码序列(223116密码子)被用于研究人类密码子使用偏爱模式。全部密码子使用数据分析表明,人类可变剪接基因密码子的偏爱水平显著高于普通剪接基因。在人类1号染色体基因中,密码子第三位置的G+C含量有很大的异质性(0 24～0 95),并且可变剪接基因密码子第三位置平均G+C含量(64 66%)大于普通剪接基因(59 97%)。Nc值对GC3s图显示密码子偏爱使用除了受核苷酸组成制约外,其它的因子可能也影响密码子的使用变化。此外,可变剪接基因中以G或C结尾的密码子比普通剪接基因出现的频率高。密码子使用的差异可能是由可变剪接基因pre mRNA特有的结构特征和多种剪接模式决定的。
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关键词
人类
1号染色体
可变
剪接
普通
剪接
同义密码子
密码子使用
偏爱模式
基因结构
剪接
模式
下载PDF
职称材料
人类1号染色体可变剪接与普通剪接基因同义密码子的使用分析 Ⅱ.基因表达水平和基因长度与密码子使用偏爱(英文)
2
作者
陈学平
武耀廷
+2 位作者
张成
郭家明
马飞
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第1期6-14,共9页
进一步研究基因表达水平和基因长度与密码子使用偏爱之间的关系。多变量统计分析发现,人类1号染色体选择性剪接基因和普通剪接基因密码子使用变化都呈现单一趋势,且它们之间的密码子使用模式也非常相似,推测的高表达基因确实偏爱以C或G...
进一步研究基因表达水平和基因长度与密码子使用偏爱之间的关系。多变量统计分析发现,人类1号染色体选择性剪接基因和普通剪接基因密码子使用变化都呈现单一趋势,且它们之间的密码子使用模式也非常相似,推测的高表达基因确实偏爱以C或G结尾的密码子,基因表达水平与密码子使用偏爱之间的关联也达到显著水平。因此,人类1号染色体高表达基因密码子的使用偏爱可能主要被翻译选择所决定。此外,基因长度与密码子偏爱水平之间也存在高度相关,说明相对较短的基因具有较高的密码子使用偏爱,翻译选择可能缩短了高表达基因的长度从而提高翻译效率。
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关键词
人类
1号染色体
可变
剪接
普通
剪接
基因表达
基因长度
翻译选择
密码子使用
偏爱模式
下载PDF
职称材料
题名
人类1号染色体可变剪接与普通剪接基因同义密码子的使用分析 I.同义密码子偏爱使用分析(英文)
1
作者
陈学平
武耀廷
郭家明
张成
马飞
机构
中国科学技术大学经济技术学院
中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室
合肥市植保站
厦门大学生命科学学院
出处
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第1期1-5,共5页
基金
Chinapostdoctoralprogramsfoundation( 2 0 0 2 11)
文摘
人类1号染色体可变剪接(选择性剪接)基因344非冗余蛋白质编码序列(188183密码子)和普通剪接(非可变剪接)基因的386蛋白质编码序列(223116密码子)被用于研究人类密码子使用偏爱模式。全部密码子使用数据分析表明,人类可变剪接基因密码子的偏爱水平显著高于普通剪接基因。在人类1号染色体基因中,密码子第三位置的G+C含量有很大的异质性(0 24～0 95),并且可变剪接基因密码子第三位置平均G+C含量(64 66%)大于普通剪接基因(59 97%)。Nc值对GC3s图显示密码子偏爱使用除了受核苷酸组成制约外,其它的因子可能也影响密码子的使用变化。此外,可变剪接基因中以G或C结尾的密码子比普通剪接基因出现的频率高。密码子使用的差异可能是由可变剪接基因pre mRNA特有的结构特征和多种剪接模式决定的。
关键词
人类
1号染色体
可变
剪接
普通
剪接
同义密码子
密码子使用
偏爱模式
基因结构
剪接
模式
Keywords
alternative splicing
common splicing
codon usage
human
分类号
Q987.1 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
人类1号染色体可变剪接与普通剪接基因同义密码子的使用分析 Ⅱ.基因表达水平和基因长度与密码子使用偏爱(英文)
2
作者
陈学平
武耀廷
张成
郭家明
马飞
机构
中国科学技术大学经济技术学院
中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室
合肥市植保站
厦门大学生命科学学院
出处
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第1期6-14,共9页
基金
Chinapostdoctoralprogramsfoundation( 2 0 0 2 11)
文摘
进一步研究基因表达水平和基因长度与密码子使用偏爱之间的关系。多变量统计分析发现,人类1号染色体选择性剪接基因和普通剪接基因密码子使用变化都呈现单一趋势,且它们之间的密码子使用模式也非常相似,推测的高表达基因确实偏爱以C或G结尾的密码子,基因表达水平与密码子使用偏爱之间的关联也达到显著水平。因此,人类1号染色体高表达基因密码子的使用偏爱可能主要被翻译选择所决定。此外,基因长度与密码子偏爱水平之间也存在高度相关,说明相对较短的基因具有较高的密码子使用偏爱,翻译选择可能缩短了高表达基因的长度从而提高翻译效率。
关键词
人类
1号染色体
可变
剪接
普通
剪接
基因表达
基因长度
翻译选择
密码子使用
偏爱模式
Keywords
alternative splicing
gene expression
gene length
translational selection
mutation bias
分类号
Q987 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
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1
人类1号染色体可变剪接与普通剪接基因同义密码子的使用分析 I.同义密码子偏爱使用分析(英文)
陈学平
武耀廷
郭家明
张成
马飞
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004
0
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职称材料
2
人类1号染色体可变剪接与普通剪接基因同义密码子的使用分析 Ⅱ.基因表达水平和基因长度与密码子使用偏爱(英文)
陈学平
武耀廷
张成
郭家明
马飞
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004
0
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职称材料
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