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2011~2018年埃可病毒25型山东分离株的分子流行病学特征 被引量：3
1
作者 赵晨旭 陶泽新 +3 位作者 林小娟 王素婷 纪峰 徐爱强 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期795-801,共7页
埃可病毒25型(Echovirus 25,E-25)感染所导致的疾病谱广泛,其侵入中枢神经系统后可引起严重的儿童感染性疾病无菌性脑膜炎(Aseptic meningitis,AM)。为探索E-25山东分离株分子流行病学特征,本研究对2011~2018年山东省环境生活污水标本... 埃可病毒25型(Echovirus 25,E-25)感染所导致的疾病谱广泛,其侵入中枢神经系统后可引起严重的儿童感染性疾病无菌性脑膜炎(Aseptic meningitis,AM)。为探索E-25山东分离株分子流行病学特征,本研究对2011~2018年山东省环境生活污水标本和AM患儿脑脊液标本开展病毒分离,并对分离物进行核酸提取、VP1区序列扩增和型别鉴定,通过同源性比较和系统发生学分析,研究山东省及全球不同来源E-25分离株的亲缘进化关系。结果显示,2011~2018年环境污水分离株之间核苷酸同源性为87.7%~100.0%,与原型株(JV-4)核苷酸同源性为78.2%~80.9%,与无菌性脑膜炎病例分离株之间高度同源(核苷酸同源性为90.6%~98.2%)。通过系统发生学分析将全球的E-25分离株分为6个基因群A^F,山东分离株位于基因群A的两个不同的分支。本研究结果证实了环境监测对探索肠道病毒本地流行的重要作用,为E-25在山东省内的流行趋势及对其感染所致相关疾病的一级预防提供分子流行病学依据。 展开更多
关键词 埃可病毒25型(E-25) 无菌性脑膜炎(am) 分子流行病学 环境监测
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柯萨奇病毒A9型山东地方株的进化遗传学特征 被引量：1
2
作者 黄蓉蓉 林小娟 +5 位作者 李漫时 刘尧 熊萍 赵晨旭 陶泽新 徐爱强 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1333-1340,共8页
柯萨奇病毒A9型(Coxsackievirus A9,CVA9)是常见的人类肠道病毒血清型,其感染可引起无菌性脑膜炎、脑炎等疾病。为探索其进化遗传学特征,本研究对山东省1991-2018年CVA9分离株的VP1完整编码区进行了序列测定,并与GenBank中获得的全球序... 柯萨奇病毒A9型(Coxsackievirus A9,CVA9)是常见的人类肠道病毒血清型,其感染可引起无菌性脑膜炎、脑炎等疾病。为探索其进化遗传学特征,本研究对山东省1991-2018年CVA9分离株的VP1完整编码区进行了序列测定,并与GenBank中获得的全球序列一并进行系统发生学和进化遗传学分析。结果显示全球CVA9可分为I-XII 12个基因型,优势基因型为VII,包括山东株在内的所有中国分离株均属于该基因型。进化遗传学研究显示,CVA9 VP1区序列的每年每个碱基的平均进化速率约为6.25×10^(-3),共同祖先起源于1919年。CVA9 VP1区的基因多样性在2003年以前无明显变化,2003年以后出现明显波动。本研究为我们了解CVA9的流行趋势和遗传变异提供了数据,对CVA9相关疾病的防控和诊断试剂的研发具有重要的现实意义。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A9型(CVA9) 系统发生学 进化遗传学 无菌性脑膜炎(am)
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2013-2019年全国手足口病ECHO-9的分子流行病学研究
3
作者 司芬芬 卫海燕 +9 位作者 关路媛 冀天娇 王东艳 张勇 祝双利 宋洋 韩振志 李俊含 许文波 严冬梅 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期115-122,共8页
埃可病毒9型(Echovirus 9,ECHO-9)是引起无菌性脑膜炎(Aseptic meningitis,AM)和手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)暴发流行的重要病原体,但目前全球关于ECHO-9分子流行病学研究仍比较匮乏,ECHO-9基于VP1全长的基因分型结果... 埃可病毒9型(Echovirus 9,ECHO-9)是引起无菌性脑膜炎(Aseptic meningitis,AM)和手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)暴发流行的重要病原体,但目前全球关于ECHO-9分子流行病学研究仍比较匮乏,ECHO-9基于VP1全长的基因分型结果尚未明确。本研究依托国家HFMD监测网络,2013-2019年在中国大陆共分离到15株ECHO-9毒株,对其进行VP1区全长序列测定和分析,并与GenBank中下载的全部112条ECHO-9VP1区全长序列共同构建系统发育进化树。结果显示,全球ECHO-9分为A-G七个基因型,其中C、D和F基因型可被进一步划分为C1-C2,D1-D4和F1-F2基因亚型。各洲之间优势基因型别有显著差异,亚洲和欧洲分别以D和C基因型为绝对优势基因型。中国大陆ECHO-9优势基因型别为D基因型,但其优势基因亚型随时间推移有明显转变。2000-2005年,中国大陆ECHO-9全部为D1基因亚型,2006年开始出现D1、D2和D3基因亚型的共同流行,2010年后D1和D2基因亚型消失,D3成为中国大陆绝对优势基因型别。本研究测定的15株ECHO-9分离自2013-2019年,其中14株属于D3基因亚型,1株江西ECHO-9为C2基因亚型,推测其可能来源于境外。本研究建立了全球ECHO-9基于VP1全长的基因分型方法,揭示了ECHO-9在全国及全球范围的分子流行特征。 展开更多
关键词 埃可病毒9型(ECHO-9) 无菌性脑膜炎(am) 手足口病(HFMD) 基因分型 分子流行病学
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