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患儿分离的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌耐药基因分析 被引量：9
1
作者 孔子艳 沈俊 +3 位作者 李心愿 康海全 孙丹 顾兵 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第20期3124-3127,3131,共5页
目的分析临床患儿分离的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药性和耐药基因。方法收集2015年6月-2018年6月医院的住院患儿分离非重复的CRKP 29株,对最小抑菌浓度(MIC)进行检测,PCR扩增常见的碳青霉烯类耐药基因(bla_(KPC),bla_(SME),... 目的分析临床患儿分离的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药性和耐药基因。方法收集2015年6月-2018年6月医院的住院患儿分离非重复的CRKP 29株,对最小抑菌浓度(MIC)进行检测,PCR扩增常见的碳青霉烯类耐药基因(bla_(KPC),bla_(SME),bla_(GES),bla_(VIM),bla_(IMP),bla_(NDM),bla_(OXA-48))、超广谱β-内酰胺酶耐药基因(bla_(SHV),bla_(TEM),bla_(CTX-M-1group),bla_(CTX-M-2group),bla_(CTX-M-8group),bla_(CTX-M-9group))、头孢菌素酶耐药基因(bla_(MOX),bla_(CIT),bla_(DHA),bla_(ACC),bla_(EBC),bla_(FOX))。结果29株CRKP对美罗培南和亚胺培南完全耐药,对阿米卡星,米诺环素,左氧氟沙星,氨曲南的耐药率分别为3.45%,10.34%,17.24%,93.10%,对头孢类和酶抑制类药物均耐药,对多黏菌素和替加环素均敏感。29株CRKP均携带碳青霉烯类耐药基因,以bla_(NDM-5)基因阳性率最高为51.72%(15/29),bla_(NDM-1)基因阳性率为31.03%(9/29),bla_(KPC-2)基因阳性率为17.24%(5/29),1株既携带bla_(KPC-2)又携带bla_(IMP-4)。结论本地区分离的患儿CRKP菌株均为多药耐药菌,患儿临床分离的肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类药物耐药的机制主要是产NDM-5型碳青霉烯酶。 展开更多
关键词 碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌 新德里金属-β-内酰胺酶
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分离自住院患儿产NDM型碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌分子流行病学调查 被引量：3
2
作者 李媛睿 刘婧娴 +2 位作者 俞静 朱威南 刘瑛 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期689-693,共5页
目的了解产新德里金属-β-内酰胺酶(NDM)型碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌(CRKP)分离株的分子流行病学特点。方法收集2013年9月至2016年3月住院患儿的非重复CRKP;采用PCR方法扩增NDM型碳青霉烯酶基因,并对阳性产物进行DNA测序;对产NDM酶菌株进... 目的了解产新德里金属-β-内酰胺酶(NDM)型碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌(CRKP)分离株的分子流行病学特点。方法收集2013年9月至2016年3月住院患儿的非重复CRKP;采用PCR方法扩增NDM型碳青霉烯酶基因,并对阳性产物进行DNA测序;对产NDM酶菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE),并利用BioNumerics软件进行分型;比较不同型别菌株患儿的临床特征。结果从93株CRKP中检出42株产NDM酶,其中23株产NDM-1酶,19株产NDM-5酶。产NDM酶CRKP分为14个PFGE型别(A型~N型),其中A型、M型和N型为优势型别,占菌株总数69%(29/42),其余11型为非优势型别,占菌株总数31%(13/42)。A型菌株(24%,10/42)均产NDM-1酶,M型菌株(17%,7/42)以产NDM-5酶为主,N型菌株(29%,12/42)均产NDM-5酶,其余11个型别菌株(31%,13/42)以产NDM-1酶为主。优势型别组菌株主要在儿科ICU流行,而非优势型别组菌株在儿科各病区散发分布。优势型别组患儿在入院48小时后发生感染率、留置引流管比例和ICU住院时间均高于非优势型别组患儿,差异有统计学意义(P<0.05);两组患儿的年龄、性别、抗生素使用和预后等的差异均无统计学意义(P>0.05)。结论住院患儿产NDM酶CRKP的碳青霉烯酶类型以NDM-1和NDM-5多见,A型、M型和N型为PFGE优势型别,优势型别在儿科ICU存在小范围播散。 展开更多
关键词 新德里金属-β-内酰胺酶 碳青霉烯酶 肺炎克雷伯菌 分子流行病学
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东莞地区肠杆菌科细菌碳青霉烯酶的表型与基因型分析 被引量：2
3
作者 黄亚 谢树金 +9 位作者 林偲思 朱艳 王套瑞 吕飞 程理维 方颖 黄晓君 谢佩 陈青诗 郭主声 《海南医学》 CAS 2022年第10期1270-1274,共5页
目的了解东莞地区耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌(CRE)临床感染分布、耐药情况以及产碳青霉烯酶的表型与基因型,完善东莞地区耐药监测信息,为临床控制和治疗CRE的感染提供可靠依据。方法使用VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定药敏系统分析仪系... 目的了解东莞地区耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌(CRE)临床感染分布、耐药情况以及产碳青霉烯酶的表型与基因型,完善东莞地区耐药监测信息,为临床控制和治疗CRE的感染提供可靠依据。方法使用VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定药敏系统分析仪系统对东莞耐药监测网2020年收集的40株CRE菌株进行菌种鉴定与药敏试验,采用纸片扩散法(K-B法)和E-test法测定药敏。采用碳青霉烯酶抑制剂增强试验检测碳青霉烯酶表型,采用GeneXpert Carba-R检测和鉴定碳青霉烯酶的基因型。使用WHONET 5.6软件和SPSS23.0软件进行统计分析。结果40株CRE菌株中检出最高的是肺炎克雷伯菌27株(占67.5%),其次是大肠埃希菌10株(占25%);标本中检出率最高的是呼吸道标本(16株,占40%),其次是尿液标本(7株,占17.5%);40株CRE药敏结果显示,亚胺培南的耐药率为92.5%,美罗培南的耐药率为97.5%,替加环素的耐药率较低为40%;碳青霉烯酶型检测结果显示有37株(占92.5%)产生碳青霉烯酶,其中产A类丝氨酸碳青霉烯酶阳性24株(占60.0%),产B类金属β内酰胺酶阳性13株(占32.5%),未检出碳青霉烯酶菌株3株(占7.5%);GeneXpert Carba-R测定法检测出碳青霉烯酶基因共37株(占92.5%),检出13株blaNDM(占32.5%),24株blaKPC(占60%);携带blaKPC的CRE菌株对阿米卡星、替加环素和氨曲南的耐药率比携带blaNDM的CRE菌株的高,差异有统计学意义(P<0.05)。结论东莞地区分离的CRE菌株以产A类丝氨酸碳青霉烯酶和产B类金属β-内酰胺酶的菌株为主。检出的碳青霉烯酶基因型主要为blaNDM和blaKPC,其中携带blaNDM的CRE菌株对阿米卡星、替加环素和氨曲南的耐药率较低。GeneXpert Carba-R可以快速检测并鉴定碳青霉烯酶基因型。建议实验室同时进行表型和基因型的检测,指导临床合理使用抗生素。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌 碳青霉烯酶抑制剂增强试验 肺炎克雷伯氏菌碳青霉烯酶 新德里金属-β-内酰胺酶
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毛细管PCR芯片电泳快速检测NDM-1耐药菌方法的建立 被引量：2
4
作者 王秋平 《检验医学与临床》 CAS 2018年第24期3674-3677,3681,共5页
目的建立一种毛细管聚合酶链反应(PCR)芯片电泳方法,实现快速、准确地检测新德里金属-β-内酰胺酶(NDM-1)耐药菌。方法根据NDM-1基因设计1对特异引物,对临床微生物检测的80株耐药肠道杆菌和60株鲍曼不动杆菌的细菌培养液进行毛细管振荡... 目的建立一种毛细管聚合酶链反应(PCR)芯片电泳方法,实现快速、准确地检测新德里金属-β-内酰胺酶(NDM-1)耐药菌。方法根据NDM-1基因设计1对特异引物,对临床微生物检测的80株耐药肠道杆菌和60株鲍曼不动杆菌的细菌培养液进行毛细管振荡流PCR扩增,芯片电泳快速检测PCR产物。将NDM-1阳性标本进行测序验证,同时对NDM-1阳性菌细菌悬液定量梯度稀释进行PCR,考察免核酸提取PCR的敏感度。结果毛细管PCR芯片电泳方法检测出2例阳性标本,其产物经测序验证,确定携带NDM-1基因,阳性率为100%。该方法在40min内实现产NDM-1耐药菌扩增产物的快速分离检测,细菌检测线为1.15×101 CFU/mL。结论毛细管PCR芯片电泳方法检测NDM-1基因准确性高、特异性强,具有快速、廉价等特点,适合NDM-1阳性菌的早期快速现场诊断。 展开更多
关键词 新德里金属-β-内酰胺酶 芯片电泳 聚合酶链反应
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产新德里金属-β-内酰胺酶耐药菌的相关文献计量分析 被引量：1
5
作者 杨杰 蔡芸 +3 位作者 刘哲元 梁蓓蓓 白楠 王睿 《中国临床药理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期618-622,共5页
目的从文献计量学角度对国内外产新德里金属-β-内酰胺酶(NDM-1)相关文献进行分析。方法检索至今的Pubmed、Embase、CNKI、维普和万方数据库中NDM-1相关文献,对纳入研究的文献进行统计分析。结果纳入研究的文献共57篇。目前有超过20个... 目的从文献计量学角度对国内外产新德里金属-β-内酰胺酶(NDM-1)相关文献进行分析。方法检索至今的Pubmed、Embase、CNKI、维普和万方数据库中NDM-1相关文献,对纳入研究的文献进行统计分析。结果纳入研究的文献共57篇。目前有超过20个国家或地区有撰文报道该耐药菌,相关病例报告主要集中在印度和欧洲部分国家。结论产NDM-1细菌全球流行趋势明显,国外已建立较为完善的监控体系并进行了初步研究。 展开更多
关键词 计量分析 新德里金属-β-内酰胺酶
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新德里金属-β-内酰胺酶的原核表达及其多克隆抗体的制备 被引量：1
6
作者 赵祖国 喻云梅 +8 位作者 刘炜 许壁榆 张腊喜 刘仿 杨银梅 王凯 周小棉 徐军发 丁元林 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2012年第12期1663-1666,1670,共5页
目的原核表达新德里金属-β-内酰胺酶(New Delhi metallo-β-lactamase-1,NDM-1),并制备其多克隆抗体。方法以临床分离的产NDM-1的臭鼻克雷伯杆菌为模板,PCR扩增NDM-1基因,克隆入pET-28a载体,构建重组原核表达质粒pET-28a-NDM-1,转化E.c... 目的原核表达新德里金属-β-内酰胺酶(New Delhi metallo-β-lactamase-1,NDM-1),并制备其多克隆抗体。方法以临床分离的产NDM-1的臭鼻克雷伯杆菌为模板,PCR扩增NDM-1基因,克隆入pET-28a载体,构建重组原核表达质粒pET-28a-NDM-1,转化E.coli BL21(DE3)pLyss,IPTG诱导表达重组蛋白。表达的重组蛋白经硫酸铵沉淀、离子交换层析、Ni亲和层析及分子筛层析纯化后,免疫日本大耳白兔,制备NDM-1多克隆抗体。抗体经硫酸铵沉淀和SPA-Sepharose亲和层析纯化后,Western blot鉴定其特异性。结果重组表达质粒pET-28a-NDM-1经PCR及测序鉴定构建正确;表达的重组蛋白相对分子质量约为28 000,诱导表达的重组菌破菌上清存在较强的β-内酰胺酶活性,表明NDM-1蛋白为可溶性形式表达;最终纯化获得的NDM-1蛋白纯度高于95%;制备的NDM-1多克隆抗体能与诱导表达的重组菌胞外蛋白特异性结合。结论成功原核表达了NDM-1,并制备了其多克隆抗体,为NDM-1的快速检测提供了新的思路。 展开更多
关键词 新德里金属-β-内酰胺酶 原核细胞 基因表达 多克隆抗体
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ST571型产NDM-1肺炎克雷伯菌检出及分子流行病学研究 被引量：9
7
作者 刘婧娴 俞静 刘瑛 《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期402-408,共7页
目的探讨产新德里金属-β-内酰胺酶1(NDM-1)肺炎克雷伯菌检出的分子流行病学意义。方法实验菌株为从临床标本中分离到的1株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌。采用VITEK-2 Compact全自动微生物分析系统进行鉴定及药敏试验,PCR及测序方法检测ND... 目的探讨产新德里金属-β-内酰胺酶1(NDM-1)肺炎克雷伯菌检出的分子流行病学意义。方法实验菌株为从临床标本中分离到的1株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌。采用VITEK-2 Compact全自动微生物分析系统进行鉴定及药敏试验,PCR及测序方法检测NDM-1等碳青霉烯酶基因的表达,并对菌株进行质粒转移接合试验及多位点序列分型(MLST)。经检索Pub Med收集其他地区产NDM-1肺炎克雷伯菌的MLST数据,采用e BURST V3软件及Tree drawing软件进行分析。结果该菌株对包括碳青霉烯类在内的多种抗生素均高度耐药,携带NDM-1基因,MLST为ST571含有该基因的质粒通过接合方式成功转移到受体菌。共收集源自28个国家的238株产NDM-1肺炎克雷伯菌的MLST信息,包含41个ST型,CC258(clone complex)为主要流行株。结论我国首次检出ST571型产NDM-1肺炎克雷伯菌,耐药基因可能通过质粒进行传播。产NDM-1肺炎克雷伯菌的分子分型呈多样化,以CC258流行最广,本实验菌株与该克隆复合体菌株的亲缘关系甚远。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 新德里金属-β-内酰胺酶1 多位点序列分型 分子流行病学
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耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌的耐药性及分子机制研究 被引量：7
8
作者 安童童 赵志军 +4 位作者 李刚 康宇婷 刘学雷 杨宁爱 贾伟 《宁夏医科大学学报》 2019年第1期19-23,共5页
目的探讨耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌的耐药性及其分子机制。方法采用WHONET 5.6软件对某三甲综合教学医院2014-2016年分离的肠杆菌科中耐亚胺培南的细菌进行初筛,采用肉汤稀释法检测碳青霉烯类抗生素对细菌的最低抑菌浓度(MIC),用PCR方... 目的探讨耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌的耐药性及其分子机制。方法采用WHONET 5.6软件对某三甲综合教学医院2014-2016年分离的肠杆菌科中耐亚胺培南的细菌进行初筛,采用肉汤稀释法检测碳青霉烯类抗生素对细菌的最低抑菌浓度(MIC),用PCR方法检测blaNDM、blaKPC-2、blaCTX-M-15、blaOXA-48等耐药基因;利用测序方法鉴定blaNDM亚型。结果共筛选出92株耐药菌,标本来源主要为胆汁、痰和无菌中段尿,92株耐药菌主要分离自肝胆外科、ICU和血管外科。药敏试验表明92株耐药菌对阿米卡星的敏感率最高(88%),对其他抗生素敏感率均较低,对头孢呋辛、头孢唑啉和亚胺培南的敏感率低至0。应用PCR检测耐药基因,其中blaNDM、blaCTX-M-15、blaTEM和blaSHV检出率较高,分别为64.1%、64.1%、91.3%和72.8%;blaKPC-2和blaVIM阳性率较低,分别为13.0%和3.3%,未检测出blaOXA-48耐药基因;测序发现59株blaNDM阳性菌中有35株为blaNDM-1,24株为blaNDM-5。结论耐碳青霉烯的肠杆菌科细菌耐药基因检出率高;宁夏地区首次发现blaNDM-5亚型;blaNDM型耐药基因的阳性率高,应加强对基因的监测,控制其在医院内的传播流行。 展开更多
关键词 肠杆菌科 碳青霉烯酶 新德里金属-β-内酰胺酶-1 耐药基因
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两株携带NDM-1型金属β-内酰胺酶阴沟肠杆菌的临床特征研究 被引量：2
9
作者 曹丽军 李慧卿 +2 位作者 耿凤珍 史峥 时东彦 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第23期5305-5307,5325,共4页
目的调查分析两株耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌临床资料,探讨NDM-1产生的根源及预防和控制的措施。方法收集2012年7月医院培养两株耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌,采用微量肉汤稀释法进行药敏试验,改良Hodge试验和金属酶试验检测产酶类型,聚合酶链反... 目的调查分析两株耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌临床资料,探讨NDM-1产生的根源及预防和控制的措施。方法收集2012年7月医院培养两株耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌,采用微量肉汤稀释法进行药敏试验,改良Hodge试验和金属酶试验检测产酶类型,聚合酶链反应(PCR)检测耐药基因并进行测序。结果两株阴沟肠杆菌对亚胺培南和美罗培南的MIC均>8μg/ml,改良Hodge试验阳性,金属酶表型初筛试验阳性,经基因扩增并测序后,与Genebank比对,表明与NDM-1基因有99%的相似性,临床资料显示,该两株菌有一定的同源性,可能有共同的传播途径。结论对碳青霉烯类抗菌药物高度耐药的阴沟肠杆菌有传播的趋势,通过消毒等措施能得到控制。 展开更多
关键词 阴沟肠杆菌 碳青霉烯类 抗菌药物 新德里金属-β-内酰胺酶-1
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携带bla_(NDM-1)的质粒pNDM-BJ01在鲁氏不动杆菌中的适应度代价 被引量：2
10
作者 徐丽 吕瑞辰 +5 位作者 王海燕 胡红焱 赵向娜 杨瑞馥 赵建宏 宋亚军 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期99-104,共6页
【目的】了解编码新德里金属-β-内酰胺酶-1(blaNDM-1)的质粒pNDM-BJ01在鲁氏不动杆菌10621菌株中的适应度代价,进而评估该质粒在鲁氏不动杆菌群体中存续和扩散的潜能。【方法】通过不含亚胺培南的液体培养基连续传代培养,获得抗性质粒... 【目的】了解编码新德里金属-β-内酰胺酶-1(blaNDM-1)的质粒pNDM-BJ01在鲁氏不动杆菌10621菌株中的适应度代价,进而评估该质粒在鲁氏不动杆菌群体中存续和扩散的潜能。【方法】通过不含亚胺培南的液体培养基连续传代培养,获得抗性质粒丢失的10621衍生菌株,利用生长曲线、生物被膜、无营养生存时间等体外适应度测量实验,分析10621NDM-1(+)及质粒缺失的10621NDM-1(-)之间的适应度差异。【结果】pNDM-BJ01在10621菌株中不稳定,连续传代11次即在群体中完全丢失。在26℃和37℃下,10621NDM-1(-)与10621NDM-1(+)菌株的生长曲线无显著性差异。在26℃条件下,10621NDM-1(-)菌株形成生物被膜的能力明显强于10621NDM-1(+),而在37℃条件下,10621NDM-1(+)强于10621NDM-1(-)。在无营养的PBS缓冲液中,10621NDM-1(-)菌株生存能力明显高于10621NDM-1(+)。【结论】编码blaNDM-1的质粒pNDM-BJ01在鲁氏不动杆菌中具有较大的适应度代价,缺失这一质粒的菌株在外界环境中的生存能力强于抗性菌株,pNDM-BJ01在鲁氏不动杆菌存续与扩散的能力有限。 展开更多
关键词 鲁氏不动杆菌 新德里金属-β-内酰胺酶-1 生物被膜 适应度代价
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产NDM-1型碳青霉烯酶液化沙雷菌耐药性研究 被引量：1
11
作者 赵树龙 梁慧 +1 位作者 张薇 胡红焱 《中国卫生检验杂志》 CAS 2015年第6期889-891,共3页
目的研究产NDM-1型碳青霉烯酶液化沙雷菌的临床和微生物学特点。方法通过VITEK-2型全自动微生物分析仪对临床分离菌株进行鉴定,利用PCR技术来鉴定NDM-1基因,抗菌药物MIC使用肉汤稀释法进行测定。同时对产NDM-1型液化沙雷菌感染的患者的... 目的研究产NDM-1型碳青霉烯酶液化沙雷菌的临床和微生物学特点。方法通过VITEK-2型全自动微生物分析仪对临床分离菌株进行鉴定,利用PCR技术来鉴定NDM-1基因,抗菌药物MIC使用肉汤稀释法进行测定。同时对产NDM-1型液化沙雷菌感染的患者的临床资料进行调查分析。结果在本院儿科患者的痰标本中发现1株NDM-1型的液化沙雷菌。药敏结果显示该细菌对β-内酰胺类抗生素耐药,对氯霉素中介,对庆大霉素、左氧氟沙星、阿米卡星、复方新诺明、环丙沙星、米诺环素敏感;进行接合实验显示bla NDM-1能被转移到大肠杆菌J53中。结论产NDM-1型液化沙雷菌细菌的出现,说明bla NDM-1可能已经开始在肠杆菌科细菌中广泛传播,因此临床必须采取严格的措施来控制抗生素的使用,同时,需要采取更加严格和规范的院感控制措施,防止此类细菌的暴发传播。 展开更多
关键词 液化沙雷菌 新德里金属-β-内酰胺酶1 最低抑菌浓度 鉴定
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NDM1基因常规PCR与荧光定量PCR检测方法的建立及其检测结果比较 被引量：1
12
作者 陈宣男 全首祯 《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期625-629,F0003,共6页
目的:建立NDM1基因常规PCR和荧光定量PCR(FQ-PCR)检测方法,并对其检测结果进行比较。方法:设计3对NDM1基因常规PCR与FQ-PCR引物,建立常规PCR与FQ-PCR反应体系和条件,比较2种检测方法的特异性、灵敏度和对模拟临床样品的检测效果。结果:... 目的:建立NDM1基因常规PCR和荧光定量PCR(FQ-PCR)检测方法,并对其检测结果进行比较。方法:设计3对NDM1基因常规PCR与FQ-PCR引物,建立常规PCR与FQ-PCR反应体系和条件,比较2种检测方法的特异性、灵敏度和对模拟临床样品的检测效果。结果:成功建立NDM1基因常规PCR和FQ-PCR检测方法;特异性检测,常规PCR与FQ-PCR检测7种常见病原菌均为阴性;灵敏度检测,常规PCR检测限为106 mL-1,FQ-PCR检测限为104 mL-1;模拟临床样品检测,常规PCR和FQ-PCR检测结果一致。结论:常规PCR与FQ-PCR均有很好的特异性,FQ-PCR灵敏度比常规PCR高100倍。 展开更多
关键词 新德里金属-β-内酰胺酶1基因 常规PCR 荧光定量PCR
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新德里金属β内酰胺酶-1序列和抗药性的生物信息学分析
13
作者 程琪 温权 +3 位作者 胡小林 徐真昊 廖智宇 赵一雷 《生命科学仪器》 2014年第6期41-45,共5页
在2009年报导的新德里金属-β-内酰胺酶-1（NDM-1）是“超级细菌”的一种主要的抗药物酶，具有通过基因重组在不同物种间转移的潜力，而且它具有广谱耐药性，目前已知的抗生素中，仅替加环素对其有抑制作用。本文旨在通过生物信息学技... 在2009年报导的新德里金属-β-内酰胺酶-1（NDM-1）是“超级细菌”的一种主要的抗药物酶，具有通过基因重组在不同物种间转移的潜力，而且它具有广谱耐药性，目前已知的抗生素中，仅替加环素对其有抑制作用。本文旨在通过生物信息学技术探索NDM-1的基因重组的方式，并利用分子对接方法研究替加环素抑制NDM-1的分子机制。通过对一系列金属-β-内酰胺酶的氨基酸序列的进化树分析，发现三种来自海洋生物的蛋白与NDM-1具有较近的功能类似性，而相应编码基因的进化树分析发现仅其中一种与NDM-1有较近的进化距离。GC含量分析也发现NDM-1上游100～350bp剧烈波动，而在编码区段与该种基因的GC含量较为相似。因此认为NDM-1基因可能通过该基因水平转移的获得其特殊的功能。另外，通过半柔性分子对接，对NDM-1与替加环素的优势结合构象的潜在氢键进行分析，并与另外5种抗生素与NDM-1的对接结果进行比较，初步确定替加环素对于NDM-1蛋白存在竞争抑制优势，从而为NDM-1抑制剂的设计提供有价值的信息。 展开更多
关键词 超级细菌 新德里金属-β-内酰胺酶-1 序列分析 基因重组 分子对接
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LAMP法检测超级细菌NDM-1基因
14
作者 潘翊 何金洋 +1 位作者 刘亚敏 李兰芳 《医学动物防制》 2011年第5期433-435,共3页
目的建立超级细菌NDM-1基因的LAMP检测方法。方法根据目前Genbank上公布的超级细菌NDM-1基因序列,交由商业性的公司化学合成NDM-1全基因,然后以PCR、酶切及测序鉴定基因合成是否成功;再以LAMP法扩增NDM-1基因重组质粒,电泳观察扩增是否... 目的建立超级细菌NDM-1基因的LAMP检测方法。方法根据目前Genbank上公布的超级细菌NDM-1基因序列,交由商业性的公司化学合成NDM-1全基因,然后以PCR、酶切及测序鉴定基因合成是否成功;再以LAMP法扩增NDM-1基因重组质粒,电泳观察扩增是否成功。结果经证实化学合成NDM-1基因是成功的;之后进行的LAMP法扩增NDM-1基因也是成功的。结论成功建立了LAMP法检测超级细菌NDM-1基因的方法,为超级细菌的检测提供了一种可用的方法。 展开更多
关键词 新德里金属-β-内酰胺酶-1 环介导的等温扩增 检测
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细菌耐药现状及治疗——从超级细菌谈起 被引量：37
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作者 赵敏 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期104-108,共5页
全球细菌耐药形势十分严峻,多耐药、泛耐药革兰阴性菌逐年增加,成为抗感染治疗中的难点。2010年在全球多个地区出现的产新德里金属β-内酰胺酶Ⅰ型(NDM-1)革兰阴性细菌又一次敲响了警钟。NDM-1是新发现的碳青霉烯酶,多见于大肠埃希菌和... 全球细菌耐药形势十分严峻,多耐药、泛耐药革兰阴性菌逐年增加,成为抗感染治疗中的难点。2010年在全球多个地区出现的产新德里金属β-内酰胺酶Ⅰ型(NDM-1)革兰阴性细菌又一次敲响了警钟。NDM-1是新发现的碳青霉烯酶,多见于大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌,导致广泛耐药。临床研究中多黏菌素、替甲环素及磷霉素治疗多耐药、泛耐药肠杆菌感染有效。减少多耐药、泛耐药细菌的发生和传播重在预防。 展开更多
关键词 耐药 细菌 新德里金属β-内酰胺酶-1 变异
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产NDM-1肺炎克雷伯菌中国分离株的初步研究 被引量：25
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作者 邹明祥 邬靖敏 +4 位作者 李军 豆清娅 周蓉蓉 黄嫄 刘文恩 《中国当代儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期616-621,共6页
目的探讨湖南地区出现的肺炎克雷伯菌新德里金属β-内酰胺酶1型(NDM-1)基因特征及其与耐药性的关系。方法临床菌株分离自湖南某综合医院一例重症肺炎并中毒性心肌炎患儿的痰液标本。采用全自动微生物分析系统VITEK-2 compact对菌株进行... 目的探讨湖南地区出现的肺炎克雷伯菌新德里金属β-内酰胺酶1型(NDM-1)基因特征及其与耐药性的关系。方法临床菌株分离自湖南某综合医院一例重症肺炎并中毒性心肌炎患儿的痰液标本。采用全自动微生物分析系统VITEK-2 compact对菌株进行鉴定及药敏检测;改良Hodge试验筛查碳青霉烯酶;双纸片协同试验及双纸片增效试验检测金属β-内酰胺酶;聚合酶链反应(PCR)特异性扩增NDM-1基因,并对扩增产物进行测序和BLAST分析;质粒接合转移试验分析其耐药机制,并对接合前后的药敏结果进行比较。结果该菌株经鉴定为肺炎克雷伯菌。改良Hodge试验、双纸片协同试验及双纸片增效试验均为阳性。PCR扩增产物基因序列与Gen-Bank中NDM-1基因FN396876.1同源性为100%。以筛选的接合子DNA为模板扩增NDM-1基因全长并测序,结果与供体菌NDM-1基因扩增产物完全一致。接合子E.coli J53(NDM-1)对所有β-内酰胺类药物的MIC值较受体菌E.coli J53均有很大提高,其中对厄他培南和亚胺培南MIC均提高了8倍以上,头孢他啶及头孢曲松则提高了64倍以上。结论中国大陆出现了产NDM-1肺炎克雷伯菌;NDM-1基因可在不同菌株之间传递,导致细菌对β-内酰胺类药物广泛耐药。 展开更多
关键词 新德里金属β-内酰胺酶1型 肺炎克雷伯菌 基因 耐药 中国
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提高常规手段执行力 应对超级细菌挑战 被引量：24
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作者 吴安华 《中国感染控制杂志》 CAS 2011年第1期1-4,共4页
著名医学杂志《柳叶刀感染病分册》2010年第9期载文称。在印度、巴基斯坦、英国出现一种新的抗生素耐药机制，即上述地域分离的部分大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌能产生一种新的新德里金属β-内酰胺酶（简称为NDM1），此酶能破坏目前所有的... 著名医学杂志《柳叶刀感染病分册》2010年第9期载文称。在印度、巴基斯坦、英国出现一种新的抗生素耐药机制，即上述地域分离的部分大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌能产生一种新的新德里金属β-内酰胺酶（简称为NDM1），此酶能破坏目前所有的β-内酰胺类抗生素，包括美罗培南和亚胺培南在内的碳青霉烯类抗生素。 展开更多
关键词 多重耐药菌 超级细菌 新德里金属β-内酰胺酶 NDM-1 感染控制 医院感染管理
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新德里金属β-内酰胺酶亚型在碳青霉烯类耐药肠杆菌中分布及分子流行病学研究 被引量：20
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作者 梅艳芳 刘盼盼 +5 位作者 王莲慧 魏丹丹 万腊根 邓琼 曹先伟 刘洋 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期241-246,共6页
目的研究临床分离碳青霉烯类抗菌药物耐药肠杆菌科细菌中新德里金属β-内酰胺酶(NDM)及其亚型的分布及流行特点。方法收集医院2014年1月-2015年1月各种临床标本中分离碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌563株,结合改良Hodge试验、EDTA协同及增... 目的研究临床分离碳青霉烯类抗菌药物耐药肠杆菌科细菌中新德里金属β-内酰胺酶(NDM)及其亚型的分布及流行特点。方法收集医院2014年1月-2015年1月各种临床标本中分离碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌563株,结合改良Hodge试验、EDTA协同及增效试验与PCR扩增检测blaNDM基因;通过肠杆菌基因间重复一致序列聚合酶链反应(ERIC-PCR)及多位点序列分型(MLST)分析菌株之间的同源性,采用药物敏感性试验、接合试验、质粒图谱分析、特异性聚合酶链反应(PCR)扩增和序列分析等技术研究细菌新德里金属β-内酰胺酶耐药的分子机制。结果共筛选出45株产NDM菌株,其中肺炎克雷伯菌38株,包括NDM-1型37株、NDM-5型1株,大肠埃希菌7株,均为NDM-7型;所有菌株呈现多药耐药现象,且每株菌均携带多种耐药基因,其中blaCTX-M、blaTEM、blaSHV、qnrB、qnrS、acc(6′)-Ib、rmtB、armA等为最常见共同携带耐药基因;MLST分型显示,产NDM-1肺炎克雷伯菌主要分布于ST11、ST76、ST495、ST37、ST700及ST395型中,产NDM-5肺炎克雷伯菌仅为ST14型;21株产NDM菌株接合试验阳性,其中包括13株NDM-1型、1株NDM-5型及7株NDM-7型,部分质粒之间有着相似图谱,blaNDM均定位于约46kb大小IncX3质粒上。结论医院已出现多种NDM亚型,主要通过IncX3型质粒在肠杆菌科细菌中传播,存在克隆传播现象;此外,NDM亚型的出现也表明NDM或正处于快速进化过程中而导致其广泛传播。 展开更多
关键词 肠杆菌科细菌 新德里金属β-内酰胺酶 抗药性 细菌 流行病学
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关于超级细菌NDM-1的若干思考 被引量：20
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作者 黄留玉 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1409-1411,共3页
自印度出现耐药性"超级细菌"以来,英国、美国、加拿大、澳大利亚、荷兰等国也相继出现了"超级细菌"感染,使之成为继"非典"、"甲流"之后又一引起国际社会广泛关注的全球公共卫生问题。我国宁夏... 自印度出现耐药性"超级细菌"以来,英国、美国、加拿大、澳大利亚、荷兰等国也相继出现了"超级细菌"感染,使之成为继"非典"、"甲流"之后又一引起国际社会广泛关注的全球公共卫生问题。我国宁夏和福建也同时发现了"超级细菌"感染病例,再次引发了对滥用抗生素问题的思考。什么是超级细菌,为何会引起广泛关注,我们该如何应对?本刊特邀军事医学科学院疾病预防控制所专家撰写此文,以飨读者,为正确解读"超级细菌"提供参考。 展开更多
关键词 抗药性 细菌 新德里金属β-内酰胺酶-1 变异
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中药黄芩对NDM-1乙酸钙不动杆菌的抑菌及质粒消除的研究 被引量：14
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作者 刘彦晶 张雅洁 +2 位作者 纪雪 李丽红 孙洋 《中国药学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期1018-1022,共5页
目的探讨中药黄芩不同提取部位对NDM-1乙酸钙不动杆菌的抑菌效果及质粒消除作用。方法测定黄芩醇提剂和水煎剂对NDM-1乙酸钙不动杆菌的最小抑菌浓度(MIC);观察亚抑菌浓度下对NDM-1乙酸钙不动杆菌生长曲线的变化;利用亚抑菌浓度黄芩醇提... 目的探讨中药黄芩不同提取部位对NDM-1乙酸钙不动杆菌的抑菌效果及质粒消除作用。方法测定黄芩醇提剂和水煎剂对NDM-1乙酸钙不动杆菌的最小抑菌浓度(MIC);观察亚抑菌浓度下对NDM-1乙酸钙不动杆菌生长曲线的变化;利用亚抑菌浓度黄芩醇提剂和水煎剂对乙酸钙不动杆菌NDM-1质粒进行消除,用平板影印法筛选质粒消除株,并比较质粒的消除率及表型变化。结果黄芩醇提剂对NDM-1乙酸钙不动杆菌的MIC值为1.56 mg·m L^(-1),水煎剂MIC值为6.25 mg·m L^(-1)。生长曲线实验结果表明,醇提剂对细菌的繁殖抑制作用更强。黄芩醇提剂和水煎剂均有不同程度的质粒消除作用,以醇提剂传代消除作用更为明显,消除率最高可达61.27%,水煎剂亦能达到49.78%。结论黄芩能够抑制NDM-1乙酸钙不动杆菌的生长并有效消除其耐药质粒,且醇提组分作用效果更佳,可用于控制超耐药不动杆菌的传播或临床感染的辅助治疗。 展开更多
关键词 黄芩 不动杆菌 新德里金属β-内酰胺酶-1 抑菌作用 质粒消除
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