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HIV-1B′亚型毒株新型耐药相关突变位点的筛选 被引量：3
1
作者 李韩平 郭伟 +7 位作者 刘永健 鲍作义 李林 庄道民 刘思扬 王铮 王晓林 李敬云 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期499-503,共5页
目的筛选HIV—1 B′亚型病毒株中可能存在的新型耐药相关突变位点。方法收集整理前期研究获得的451条H1V-1B′亚型pol区基因序列，序列含蛋白酶全长（1～99个密码子）和反转录酶全长（1～560个密码子），长度约1977bp。将354条来自接受... 目的筛选HIV—1 B′亚型病毒株中可能存在的新型耐药相关突变位点。方法收集整理前期研究获得的451条H1V-1B′亚型pol区基因序列，序列含蛋白酶全长（1～99个密码子）和反转录酶全长（1～560个密码子），长度约1977bp。将354条来自接受抗病毒治疗艾滋病患者的（服药组）序列与97条来自未接受治疗患者的（未服药组）序列，分别与B亚型野生型pol基因共享序列进行逐个密码子比对，筛选在服药组序列中出现的频率显著高于未服药组序列的突变位点，将筛选出来的突变位点在斯坦福大学HIV-1耐药数据库中检索，根据数据库收录的情况及解释，初步分析突变与耐药的关系。结果在服药组序列中反转录酶区有6个位点7个突变的频率显著高于未服药组，分别是D123E、V292I、K366R、T369A、T369V、A371V和1375V，即前2个突变位于反转录酶的聚合酶区、后5个突变位于反转录酶的连接区。检索数据库收录情况，有7个突变均为相应位点的主要变异形式，在服药患者中出现的频率显著高于未服药患者。结论筛选出的HIV-1B′亚型病毒株7个突变可能与耐药有关。 展开更多
关键词 HIV-1 B′亚型 新型耐药突变
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