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利用杂种F_2世代鉴定数量性状主基因-多基因混合遗传模型并估计其遗传效应 被引量：174
1
作者 王建康 盖钧镒 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1997年第5期432-440,共9页
大量实验数据和OTL作图结果表明:控制数量性状的基因中既有遗传效应较大的主基因,又有遗传效应较小的多基因,其分离世代表现出多峰性,即出现多个分布混合的特征。本文利用混合模型理论的AIC信息准则在F_2世代中鉴定影响数量性状的主基... 大量实验数据和OTL作图结果表明:控制数量性状的基因中既有遗传效应较大的主基因,又有遗传效应较小的多基因,其分离世代表现出多峰性,即出现多个分布混合的特征。本文利用混合模型理论的AIC信息准则在F_2世代中鉴定影响数量性状的主基因的存在,当主基因存在时通过分离分析估计主基因的遗传效应以及主基因的遗传变异占总变异的分量;同时还提出利用P_1、P_2、F_2和F_2 4个世代鉴定多基因存在的方法。以大豆开花期性状为例说明了该方法的应用,在所分析的骨绿豆×上海红芒早杂交组合的F_2世代数据中发现有主基因的存在,主基因表现出完全显性(晚开花),并且有多基因存在。 展开更多
关键词 数量性状 主基因-多基因 混合遗传 遗传效应
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数量性状遗传分析的新方法及其在育种中的应用 被引量：92
2
作者 朱军 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期1-6,共6页
介绍了近年来我们研究发展的一系列新的遗传模型和相应的统计分析方法 .这些模型包括农艺性状遗传模型、种子品质性状遗传模型、动物性连锁遗传模型、QTL基因定位的遗传模型等 .基于混合线性模型的分析原理的统计分析方法包括方差和协... 介绍了近年来我们研究发展的一系列新的遗传模型和相应的统计分析方法 .这些模型包括农艺性状遗传模型、种子品质性状遗传模型、动物性连锁遗传模型、QTL基因定位的遗传模型等 .基于混合线性模型的分析原理的统计分析方法包括方差和协方差估算方法、随机效应的无偏预测方法、条件遗传方差和条件遗传效应的分析方法、复合区间作图方法等 . 展开更多
关键词 数量性状 遗传模型 统计分析方法
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QTL混合遗传模型扩展至2对主基因+多基因时的多世代联合分析 被引量：120
3
作者 盖钧镒 章元明 王建康 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期385-391,共7页
本文将 Gai and Wang( 1998)的 P1、F1、P2 、B1、B2 和 F2 6个世代联合分离分析方法从 A、B、C、D4类共 17种遗传模型扩展至 E( 2对主基因 +多基因 )共 5类 2 4种遗传模型。成分分布参数估计的方法由 EM算法改进为迭代条件 EM算法 ( IE... 本文将 Gai and Wang( 1998)的 P1、F1、P2 、B1、B2 和 F2 6个世代联合分离分析方法从 A、B、C、D4类共 17种遗传模型扩展至 E( 2对主基因 +多基因 )共 5类 2 4种遗传模型。成分分布参数估计的方法由 EM算法改进为迭代条件 EM算法 ( IECM) ,其收敛性和所获结果优于 EM算法。水稻株高例中 2对主基因 +多基因的遗传模型 ( E- 2 )优于原所获得的 1对主基因 +多基因的遗传模型 ( D) 展开更多
关键词 数量性状 混合遗传 多世代联合分析 IECM算法
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植物数量性状关联分析研究进展 被引量：111
4
作者 杨小红 严建兵 +2 位作者 郑艳萍 余建明 李建生 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期523-530,共8页
关联分析是新近开始在植物数量性状研究和植物育种中应用的一种分析方法。它以连锁不平衡为基础鉴定某一群体内性状与遗传标记或候选基因间的关系。本文在介绍连锁不平衡的定义和度量方法的基础上,综述了连锁不平衡和关联分析在植物方... 关联分析是新近开始在植物数量性状研究和植物育种中应用的一种分析方法。它以连锁不平衡为基础鉴定某一群体内性状与遗传标记或候选基因间的关系。本文在介绍连锁不平衡的定义和度量方法的基础上,综述了连锁不平衡和关联分析在植物方面的研究进展,并讨论了交配体系、重组、遗传漂变等对连锁不平衡程度的影响,以及连锁不平衡程度和群体结构对关联分析的影响,最后讨论了关联分析在植物数量性状和分子育种研究中可能的应用。 展开更多
关键词 关联分析 连锁不平衡 数量性状
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植物数量性状分离分析Windows软件包SEA的研制 被引量：129
5
作者 曹锡文 刘兵 章元明 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期1-6,共6页
近十几年来,利用双亲分离群体数量性状表型观测值来鉴定数量性状主基因+多基因混合遗传模式的研究时有报道,其结果可指导作物育种实践。然而,随着计算机技术的进步,本课题组研制的软件操作性、算法和功能模块等方面都存在一定缺陷。在Mi... 近十几年来,利用双亲分离群体数量性状表型观测值来鉴定数量性状主基因+多基因混合遗传模式的研究时有报道,其结果可指导作物育种实践。然而,随着计算机技术的进步,本课题组研制的软件操作性、算法和功能模块等方面都存在一定缺陷。在Microsoft Visual Studio 2010操作平台下,利用C++语言研制了Windows界面友好的植物数量性状分离分析(segregation analysis,SEA)软件包,其中采用了线性算法包Clapack V3.1.1解线性方程组并估计一阶遗传参数,更精确地计算适合性检验的概率,增加了结果输出模块和计算分离群体植株或家系的主基因型后验概率。新软件包计算更稳定,结果更全面,界面更友好。 展开更多
关键词 数量性状 主基因+多基因混合遗传 C++语言 软件包
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数量性状基因的完备区间作图方法 被引量：117
6
作者 王建康 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期239-245,共7页
结合分子标记和表型数据的QTL作图已成为数量性状遗传分析的常规方法。复合区间作图是近10多年来广泛应用的一种QTL定位方法,但它在算法上有一些缺陷,致使QTL效应可能会被侧连标记区间之外的标记变量吸收,同时不同的背景标记选择方法对... 结合分子标记和表型数据的QTL作图已成为数量性状遗传分析的常规方法。复合区间作图是近10多年来广泛应用的一种QTL定位方法,但它在算法上有一些缺陷,致使QTL效应可能会被侧连标记区间之外的标记变量吸收,同时不同的背景标记选择方法对作图结果的影响较大,并且难以推广到上位型互作QTL的定位。针对这些问题,笔者提出完备区间作图方法。本文介绍了该方法的遗传和统计原理,并通过一个大麦加倍单倍体群体说明其在定位加性QTL和加性×加性互作QTL中的应用。完备区间作图包含两个步骤:首先利用所有标记的信息,通过逐步回归选择重要的标记变量并估计其效应;然后利用逐步回归得到的线性模型校正表型数据,通过一维扫描定位加(显)性效应QTL,通过二维扫描定位上位型互作QTL。这种作图策略简化了复合区间作图中控制背景遗传变异的过程,提高了对QTL的检测功效。 展开更多
关键词 数量性状 QTL作图 完备区间作图 加显性效应 上位型互作
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质量-数量性状的遗传分析 Ⅰ.遗传组成和主基因基因型鉴别 被引量：78
7
作者 莫惠栋 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 1993年第1期1-6,共6页
质量-数量性状是指具有主基因效应的数量性状,它在作物的许多重要经济性状中均有存在。这种性状可能同时受主基因和多基因控制,但迄今尚缺乏相应的遗传分析方法。本文分析了主基因为一个位点时质量-数量性状的世代遗传组成。结果表明,... 质量-数量性状是指具有主基因效应的数量性状,它在作物的许多重要经济性状中均有存在。这种性状可能同时受主基因和多基因控制,但迄今尚缺乏相应的遗传分析方法。本文分析了主基因为一个位点时质量-数量性状的世代遗传组成。结果表明,如果能够区别分离世代中的各种主基因基因型,就能对这种性状是否存在主基因和/或多基因效应作出有效的测验;而主基因基因型(如果存在的话),则可通过其后裔株系的平均数和方差的分类或聚类进行鉴别。因此,质量-数量性状的遗传也可以应用生统遗传学方法作出分析。 展开更多
关键词 数量性状 基因 遗传组成 作物
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利用P_1F_1P_2和F_2或F_(2∶3)世代联合的数量性状分离分析 被引量：99
8
作者 章元明 盖钧镒 张孟臣 《西南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 2000年第1期6-9,共4页
文章建立了利用亲本、F1和F2 或F2∶3 4个世代的数量性状主基因 +多基因 (简称主 +多基因 )混合遗传分离分析方法 ,包括 1对主基因、2对主基因、多基因、1对主 +多基因和 2对主 +多基因 5类共 2 4个遗传模型。
关键词 数量性状 大豆 混合遗传 分离分析法 IECM算法
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植物QTL定位方法的研究进展 被引量：32
9
作者 高用明 朱军 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2000年第3期175-179,共5页
本文系统地介绍了QTL定位的单一标记分析法、区间作图法以及复合区间作图法、混合显性模型的分析方法 ,概述了一些主要定位方法的分析原理、存在的主要优缺点。单一标记分析法可以采用方差分析、回归分析或似然比检验的方法分析。区间... 本文系统地介绍了QTL定位的单一标记分析法、区间作图法以及复合区间作图法、混合显性模型的分析方法 ,概述了一些主要定位方法的分析原理、存在的主要优缺点。单一标记分析法可以采用方差分析、回归分析或似然比检验的方法分析。区间作图法和复合区间作图法是基于两个相邻标记的QTL定位方法 ,可采用回归分析或最大似然法分析。复合区间作图法在模型中包括了与其他QTL连锁的标记 ,可以提高作图的精度和效率。混合线性模型的QTL定位方法可以包括复杂的遗传效应及QTL与环境的互作效应 ,具有更广阔的应用前景。 展开更多
关键词 QTL定位 数量性状 遗传分析方法 植物
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枣树数量性状的概率分级研究 被引量：103
10
作者 刘孟军 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 1996年第2期105-109,共5页
借助计算机和概率理论对枣树9个主要数量性状的品种间变异和分布特征及其规范化分级方法进行了探讨,结果表明,变异系数以单果重最大,达51.95％,可食率最低,仅2.67％;果实制干率、生育期、维生素C和可溶性固形物含量及花径和叶长的取值... 借助计算机和概率理论对枣树9个主要数量性状的品种间变异和分布特征及其规范化分级方法进行了探讨,结果表明,变异系数以单果重最大,达51.95％,可食率最低,仅2.67％;果实制干率、生育期、维生素C和可溶性固形物含量及花径和叶长的取值遵从正态分布;单果重、可食率和枣吊长度近似X2分布;对正态分布性状可统一用(x-1.2818S)、(x-0.5246S)、(x+0.5246S)和(x+1.2818S)4个分点分为5级,从而使性状值落入1～5级的概率分别为10％、20％、40％、20％和10％,或用(x-0.5246S)和(x+0.5246S)2个分点分为3级,性状值落入3级的概率分别为30％、40％和30％。文中还列出了3级和5级分级标准,并对分点值的规范化处理及概率分级的优缺点等进行了讨论。 展开更多
关键词 枣树 数量性状 概率 分级标准
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桃(Prunus persica L.)种质资源果实数量性状评价指标探讨 被引量：99
11
作者 王力荣 朱更瑞 方伟超 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期1-5,共5页
对桃(PrunuspersicaL.)的282～491份品种资源果实的平均单果质量、核质量、可溶性固形 物、可溶性糖、可滴定酸、维生素C、带皮硬度和去皮硬度等8项指标进行研究和统计分析,提出我国桃 种质资源评价系统中这些性状的数值分级指标... 对桃(PrunuspersicaL.)的282～491份品种资源果实的平均单果质量、核质量、可溶性固形 物、可溶性糖、可滴定酸、维生素C、带皮硬度和去皮硬度等8项指标进行研究和统计分析,提出我国桃 种质资源评价系统中这些性状的数值分级指标和参照品种,为我国桃种质资源描述系统数量化、规范化的 建立奠定基础。 展开更多
关键词 桃 果实 数量性状 评价指标
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数量性状主-多基因混合遗传的P_1、P_2、F_1、F_2和F_(2∶3)联合分析方法 被引量：77
12
作者 王建康 盖钧镒 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第6期651-659,共9页
本文提出利用亲本P_1和P_2、杂种F_1,F_2和F_(2∶3)五世代联合分析数量性状主基因和多基因遗传的统计方法,共建立可供选择的单基因遗传、多基因遗传以及一个主基因+多基因混合遗传三类11个遗传模型;AIC信息准则用于选择最适遗传模型,通... 本文提出利用亲本P_1和P_2、杂种F_1,F_2和F_(2∶3)五世代联合分析数量性状主基因和多基因遗传的统计方法,共建立可供选择的单基因遗传、多基因遗传以及一个主基因+多基因混合遗传三类11个遗传模型;AIC信息准则用于选择最适遗传模型,通过适合性检验对所选择的遗传模型做进一步检验;以D类模型为例,给出参数估计EM过程的一般步骤。以邳县天鹅蛋(P_1)和1138—2(P_2)杂交组合为例,分析了大豆抗豆秆黑潜蝇性状的遗传,发现该性状符合主基因+多基因混合遗传模式,主基因的加显性效应分别为-1.86和-1.64,F_2世代主基因的遗传率为43.84％,F_(2∶3)家系世代主基因的遗传率为88.59％,F_2群体的抗感分界线为11≤x≤12,F_(2∶3)群体的抗感分界线为10.6≤x≤11.0。 展开更多
关键词 数量性状 主基因 多基因混合 遗传模型
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利用P_1、P_2和DH或RIL群体联合分离分析的拓展 被引量：80
13
作者 章元明 盖钧镒 王永军 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期467-470,共4页
QTL定位常报道主基因数多于 3的情形。然而 ,利用基因型杂合的分离群体拓展 3对主基因 +多基因混合遗传模型非常困难 ,而DH或RIL群体是遗传分析的很好群体且拓展 3对主基因 +多基因模型相对容易些。在文献 1～ 4的基础上 ,拓展利用亲本... QTL定位常报道主基因数多于 3的情形。然而 ,利用基因型杂合的分离群体拓展 3对主基因 +多基因混合遗传模型非常困难 ,而DH或RIL群体是遗传分析的很好群体且拓展 3对主基因 +多基因模型相对容易些。在文献 1～ 4的基础上 ,拓展利用亲本和DH或RIL群体的 2对连锁主基因、2对连锁主基因 +多基因、3对主基因和3对主基因 +多基因 4类遗传模型。通过大豆科丰 1号× 1138$C 2构成的RIL群体及其亲本研究了大豆开花期的遗传规律。 展开更多
关键词 DH群体 RIL群体 主基因+多基因混合遗传 大豆 开花期 数量性状
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利用回交B_1和B_2及F_2群体鉴定数量性状两对主基因+多基因混合遗传模型 被引量：77
14
作者 章元明 盖钧镒 王建康 《生物数学学报》 CSCD 2000年第3期358-366,共9页
ＱＴＬ作图和主基因＋多基因混合遗传分析表明：拓展两对主基因＋多基因混合遗传模型十分必要．本文利用混合分布理论、 ＡＩＣ准则在回交 Ｂ１和 Ｂ２群体或 Ｆ２群体中鉴定两对主基因的存在，当主基因存在时估计其遗传参数；同时还改... ＱＴＬ作图和主基因＋多基因混合遗传分析表明：拓展两对主基因＋多基因混合遗传模型十分必要．本文利用混合分布理论、 ＡＩＣ准则在回交 Ｂ１和 Ｂ２群体或 Ｆ２群体中鉴定两对主基因的存在，当主基因存在时估计其遗传参数；同时还改进了利用亲本、 Ｆ１和回交Ｂ１和 Ｂ２群体，或亲本、 Ｆ１和 Ｆ２群体鉴定多基因存在的方法．分布参数的估计采用 ＩＥＣＭ算法．以水稻株高性状为例说明该方法的应用． 展开更多
关键词 数量性状 主基因+多基因混合遗传 IECM算法
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数量性状基因定位研究中若干常见问题的分析与解答 被引量：91
15
作者 李慧慧 张鲁燕 王建康 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期918-931,共14页
QTL作图是基因精细定位、克隆以及有效开展分子育种的基础,在利用QTL作图开展数量性状基因定位研究的过程中经常会碰到一些问题,与统计方法有关的一些问题包括LOD的统计学意义是什么?检测QTL的可信度和LOD临界值的关系是什么?如何评价... QTL作图是基因精细定位、克隆以及有效开展分子育种的基础,在利用QTL作图开展数量性状基因定位研究的过程中经常会碰到一些问题,与统计方法有关的一些问题包括LOD的统计学意义是什么?检测QTL的可信度和LOD临界值的关系是什么?如何评价不同的QTL作图方法?提高QTL检测效率的途径有哪些?与遗传参数估计有关的一些问题包括QTL的贡献率是如何计算出来的?如何确定QTL有利等位基因的来源?选择基因型分析的有效性如何?复合性状是否适宜于QTL作图?与作图群体及遗传图谱有关的一些问题包括QTL作图群体中表型数据是否要求服从正态分布?加密标记是否可以显著提高QTL检测功效?缺失分子标记对QTL作图有什么影响?奇异分离标记对QTL作图有什么影响?文章试图结合笔者多年研究工作对这12个有共性的常见问题做出分析和解答,以供科研工作者参考。 展开更多
关键词 数量性状 QTL作图 完备区间作图 似然比检验 功效分析
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利用DH或RIL群体检测QTL体系并估计其遗传效应 被引量：58
16
作者 章元明 盖钧镒 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2000年第7期634-640,共7页
利用DH或RIL群体并结合重复内分组随机区组设计对作物产量等遗传率较低的数量性状进行分离分析可提高遗传分析的精度。根据混合分布理论扩展了利用DH或AIL群体重复实验数据鉴定数量性状混合遗传模型的分离分析法，特别是2对连锁主基因... 利用DH或RIL群体并结合重复内分组随机区组设计对作物产量等遗传率较低的数量性状进行分离分析可提高遗传分析的精度。根据混合分布理论扩展了利用DH或AIL群体重复实验数据鉴定数量性状混合遗传模型的分离分析法，特别是2对连锁主基因＋多基因模型。该方法可鉴定数量性状的遗传模型和主基因的作用方式，估计主基因、多基因的遗传效应和遗传方差，在两主基因存在连锁时可估计其重组率。下面通过应用举例说明该方法。 展开更多
关键词 数量性状 DH群体 RIL群体 QTL体系 遗传效应
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利用回交或F_(2∶3)家系世代鉴定数量性状主基因-多基因混合遗传模型 被引量：67
17
作者 盖钧镒 王建康 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第4期402-409,共8页
主-多基因性状在分离世代中表现出多峰或偏态现象,具有混合分布的特征。本文利用混合分布理论提出从回交或F_(2∶3)家系个别分离世代鉴定主基因的存在并估计其遗传效应的统计分析方法。利用所提出的方法可以鉴别主基因的存在并估计其遗... 主-多基因性状在分离世代中表现出多峰或偏态现象,具有混合分布的特征。本文利用混合分布理论提出从回交或F_(2∶3)家系个别分离世代鉴定主基因的存在并估计其遗传效应的统计分析方法。利用所提出的方法可以鉴别主基因的存在并估计其遗传效应和方差等遗传参数。 展开更多
关键词 大豆 数量性状 SG-PG遗传模型 鉴定 混合分布
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水稻株高及其构成因素数量性状基因座位的分子标记定位 被引量：52
18
作者 林鸿宣 庄杰云 +5 位作者 钱惠荣 陆军 闵绍楷 熊振民 郑康乐 黄宁 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 1996年第3期257-263,共7页
应用具有89个标记位点的F_2群体的RFLP图谱,对控制水稻株高及其构成因素的数量性状基因座位(QTL)进行定位等研究.共定位了32个QTLs,其中涉及株高的有7个、穗长有3个、第一节间长有2个、第二节间长和第三节间长各3个、第四节间长有6个、... 应用具有89个标记位点的F_2群体的RFLP图谱,对控制水稻株高及其构成因素的数量性状基因座位(QTL)进行定位等研究.共定位了32个QTLs,其中涉及株高的有7个、穗长有3个、第一节间长有2个、第二节间长和第三节间长各3个、第四节间长有6个、节间数和第一节间干重各有4个.分别位于第1、2、3、4、5、8、12染色体的7个QTLs对株高的联合贡献率高达79%.此外,估算了每个QTL的贡献率、加性与显性效应值. 展开更多
关键词 水稻 株高 数量性状 基因座位 基因定位
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我国农作物QTL定位研究的现状和进展 被引量：46
19
作者 阮成江 何祯祥 钦佩 《植物学通报》 CSCD 北大核心 2003年第1期10-22,共13页
植物大多数重要的经济性状都是数量性状 ,研究植物数量性状遗传对植物育种具有十分重要的意义。近十几年来 ,分子生物学特别是分子标记技术的飞速发展 ,许多植物高饱和的分子连锁图谱的构建 ,使得我们可以更深入地进行数量性状的研究。... 植物大多数重要的经济性状都是数量性状 ,研究植物数量性状遗传对植物育种具有十分重要的意义。近十几年来 ,分子生物学特别是分子标记技术的飞速发展 ,许多植物高饱和的分子连锁图谱的构建 ,使得我们可以更深入地进行数量性状的研究。本文综述了近年来我国在农作物数量性状遗传研究方面的进展及发展动态。列举了我国利用DNA分子标记进行数量性状QTL定位的 47个实例。总结了控制数量性状的QTL的数目、类别、效应及其互作和QTL与环境间的互作关系。讨论了当前在该研究领域中存在的问题 ,展望了该领域的发展前景。 展开更多
关键词 农作物 QTL定位 研究进展 现状 数量性状 中国
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道地药材形成的分子机制及其遗传基础 被引量：84
20
作者 黄璐琦 郭兰萍 +1 位作者 胡娟 邵爱娟 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第20期2303-2308,共6页
作者综述了当前道地药材分子机制研究的主要领域和成就,包括道地药材遗传多样性研究及分子鉴别,道地药材遗传分化及进化遗传学研究,道地药材地理变异及环境适应性研究,道地药材种质资源评价及品种选育,道地药材功能基因表达及调控研究,... 作者综述了当前道地药材分子机制研究的主要领域和成就,包括道地药材遗传多样性研究及分子鉴别,道地药材遗传分化及进化遗传学研究,道地药材地理变异及环境适应性研究,道地药材种质资源评价及品种选育,道地药材功能基因表达及调控研究,道地药材转基因及生物安全性评价。认为道地药材的分子机制的研究,就是要在分子水平揭示道地药材居群水平的遗传变异,明确道地药材基因型特征,以及环境对道地药材基因表达的影响,从而揭示遗传因素对道地药材形成的贡献率。指出道地性的遗传本质在居群水平通常是个量变的过程,它与种内其他非道地药材区别主要表现为居群内基因型频率的改变;在个体水平表现为微效多基因控制的数量遗传,或是微效多基因和主基因联合控制的数量性状。提出道地药材分子机制研究中应高度重视遗传学及生态学上的尺度效应,充分利用数量遗传学的理论和方法,重点开展基因与环境的交互作用。 展开更多
关键词 道地药材 分子机制 遗传本质 数量性状 多基因
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