基于MiSeq测序技术分析红鳍东方鲀养殖环境菌群多样性 被引量：19

1

作者 赵晓伟 丁君 +2 位作者 窦妍 王梦鸽 常亚青 《生态学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期2965-2970,共6页

养殖环境中的微生物在物质循环及能量流动中发挥着重要的作用。对养殖环境中微生物多样性研究，不仅可以为养殖过程中病害防治提供基础，还可以发现新的微生物资源。本文利用MiSeq测序技术分析了大连某养殖公司红鳍东方鲍养殖环境中室... 养殖环境中的微生物在物质循环及能量流动中发挥着重要的作用。对养殖环境中微生物多样性研究，不仅可以为养殖过程中病害防治提供基础，还可以发现新的微生物资源。本文利用MiSeq测序技术分析了大连某养殖公司红鳍东方鲍养殖环境中室内养殖环境水、室外入水口水和底泥中菌群结构特征，从室内养殖环境水、室外入水口水和室外入水口底泥样品中分别获得27164、41146和30474条有效序列。结果表明：红鳍东方鲍养殖环境中具有较高的菌群多样性，其中室外入水口底泥中菌群多样性较其相应养殖水环境中菌群多样性高；3个样品中的细菌可归为33个门类，除常见报道的绿弯菌门、拟杆菌门、浮霉菌门、蓝藻门、酸杆菌门、变形菌门、梭杆菌门、疣微菌门、厚壁菌门和放线菌门外，还有23个鲜见报道的门类的菌群被检测到；各样品中菌群组成虽有差异，但变形菌门和拟杆菌门为优势菌，约占68．33％～93．37％。本文揭示了大连某养殖公司红鳍东方鲍池塘养殖环境中的菌群多样性和丰度，比较了其菌群结构及差异，为红鳍东方鲍健康养殖提供参考。 展开更多

关键词 优势类群 变形菌门 拟杆菌门

原文传递

肠道菌群与2型糖尿病关系的研究进展 被引量：18

2

作者 易金阳 王烨 李琳琳 《新疆医科大学学报》 CAS 2012年第6期725-731,共7页

糖尿病（Diabetes Mellitus）是一种具有遗传倾向的内分泌代谢性疾病,主要因胰岛素绝对或相对分泌不足及周围组织（骨骼肌、脂肪、肝脏等）发生胰岛素抵抗,引起碳水化合物、脂肪、蛋白质、水及电解质代谢紊乱,从而导致高血糖、糖尿,

关键词 肠道菌群 型糖尿病 糖尿病症状 胰岛素抵抗 肠道细菌 双歧杆菌 微生物群落 碳水化合物 古细菌 拟杆菌门

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膳食胆酸对营养性肥胖大鼠肠道炎症的改善及对肠道菌群中拟杆菌门与厚壁菌门比例的影响 被引量：13

3

作者 陈说 张帆 +3 位作者 范艳飞 彭卫群 洪小瑜 吴佩娴 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2022年第10期1126-1131,共6页

目的探讨膳食胆酸对营养性肥胖大鼠肠道炎症的改善作用及对肠道菌群中拟杆菌门与厚壁菌门比例的影响。方法建造营养性肥胖大鼠模型,随机分为模型组、低剂量组、高剂量组和阳性对照组,另设健康组。经一系列干预后,测量大鼠体质量和体长,... 目的探讨膳食胆酸对营养性肥胖大鼠肠道炎症的改善作用及对肠道菌群中拟杆菌门与厚壁菌门比例的影响。方法建造营养性肥胖大鼠模型,随机分为模型组、低剂量组、高剂量组和阳性对照组,另设健康组。经一系列干预后,测量大鼠体质量和体长,计算各组大鼠增重率和肥胖指数;ELISA检测血清炎症因子水平;采用全自动生化分析仪检测血脂水平;收集大鼠新鲜粪便标本,用高通量测序技术检测肠道菌群结构;取附睾周围同一处脂肪,HE染色观察脂肪细胞大小;Western blotting检测大鼠结肠中G蛋白偶联胆汁酸受体1(G-protein coupled bile acid receptor 1,GPBAR1/TGR5)、核因子κB(nuclear factor-κB,NF-κB)信号通路蛋白表达。结果模型组、低剂量组、高剂量组、阳性对照组和健康组的大鼠增重率、肥胖指数、血清TNF-α、IL-6、TG、TC和LDL-C水平依次降低,肠道中拟杆菌门比例依次升高,厚壁菌门比例依次降低(P<0.05)。与健康组比较,模型组大鼠脂肪细胞形态饱满,呈圆形,细胞壁模糊,细胞相交处可见有融合成大细胞团的趋势;与模型组比较,低剂量组、高剂量组和阳性对照组细胞呈多角形,细胞体塌陷,体积较小,细胞壁清晰。模型组、低剂量组、高剂量组、阳性对照组和健康组大鼠结肠中TGR5蛋白相对表达量依次升高,NF-κB蛋白相对表达量依次降低(P<0.05)。结论膳食胆酸可减轻营养性肥胖大鼠肠道炎症,并改善肠道菌群结构,可能是通过激活TGR5、抑制NF-κB通路蛋白发挥作用。 展开更多

关键词 膳食胆酸 营养性肥胖 炎症 肠道菌群 拟杆菌门 厚壁菌门

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基于16S rRNA测序技术初步探讨多囊卵巢综合征大鼠肠道菌群多样性 被引量：12

4

作者 肖慧 刘艳霞 +2 位作者 征征 邢雅雯 邢玉 《疑难病杂志》 CAS 2020年第4期399-405,共7页

目的应用16S rRNA测序技术分析来曲唑联合高脂饮食诱导的多囊卵巢综合征(PCOS)大鼠肠道菌群多样性的特点。方法2018年10月—2019年3月于北京中医药大学进行实验。选取SPF级雌性SD大鼠12只,随机数字表法分为对照组和模型组,每组6只;对照... 目的应用16S rRNA测序技术分析来曲唑联合高脂饮食诱导的多囊卵巢综合征(PCOS)大鼠肠道菌群多样性的特点。方法2018年10月—2019年3月于北京中医药大学进行实验。选取SPF级雌性SD大鼠12只,随机数字表法分为对照组和模型组,每组6只;对照组予普通饮食,模型组予来曲唑联合高脂饮食诱导大鼠PCOS模型,采用16S rRNA高通量基因测序技术检测肠道菌群多样性。结果与对照组比较,模型组大鼠肠道菌群中拟杆菌门丰度减少(t=-2.951,P=0.033),厚壁杆菌门丰度增加(t=2.800,P=0.038),拟杆菌门/厚壁杆菌门比值显著降低(t=-3.378,P=0.02)。模型组大鼠肠道菌群中各分类水平的拟杆菌丰度均减少,包括属水平的Allpprevotella、拟杆菌属、副拟杆菌属、普氏菌属等;厚壁杆菌门中多个分类水平的菌群丰度增加,包括属水平的丹毒丝菌属、红蝽菌属等,而瘤胃菌科丰度减少;变形菌门中属水平的Parasutterella增多,差异有统计学意义(P均<0.05)。结论来曲唑联合高脂饮食诱导的PCOS大鼠肠道菌群存在菌群失调的现象,主要表现为拟杆菌门丰度减少,厚壁杆菌门丰度增加;Allpprevotella、拟杆菌属、副拟杆菌属、普氏菌属、瘤胃菌科等益生菌丰度减少,而梭菌属、Parasutterella、红蝽菌科等有害菌群丰度增加。 展开更多

关键词 多囊卵巢综合征 肠道菌群 16S RRNA 拟杆菌门 厚壁杆菌门 大鼠

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基于MiSeq分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及群落结构 被引量：12

5

作者 陈芸 刘旗 +3 位作者 邓俊良 任志华 杨颜铱 高爽 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期286-291,共6页

采用MiSeq高通量测序技术分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及菌群结构。选用3只140日龄健康公羊,其平均体质量为(15.53±0.21)kg,饲喂10 d后,于150日龄时采集瘤胃液(样品A),40 d后再次采集瘤胃液(样品F),提取瘤胃液细菌基因组DNA,对... 采用MiSeq高通量测序技术分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及菌群结构。选用3只140日龄健康公羊,其平均体质量为(15.53±0.21)kg,饲喂10 d后,于150日龄时采集瘤胃液(样品A),40 d后再次采集瘤胃液(样品F),提取瘤胃液细菌基因组DNA,对细菌16S rDNA序列V4区进行MiSeq测序。结果显示:1)从样品A与样品F中共获得高质量序列338 830条,聚类后得3 400个运算分类单位(OTU);2)样品A的α多样性指数高于样品F的,但其差异无统计学意义;3)门水平上,样品A最高相对丰度为拟杆菌门的(占总序列数的40.87%),其次为厚壁菌门的(27.19%),样品F最高相对丰度为拟杆菌门的(47.12%),其次为变形菌门的(19.99%),再次为厚壁菌门的(18.05%),样品A厚壁菌门的相对丰度极显著高于样品F的(P<0.01);4)在属水平上,样品A与样品F的最高相对丰度均为普雷沃氏菌属的(样品A的为25.54%,样品F的为27.67%),样品A中月形单胞菌属、丁酸弧菌属、瘤胃球菌属、琥珀酸弧菌属、琥珀酸菌属等的相对丰度显著高于样品F的(P<0.05)。试验结果表明,川中黑山羊瘤胃中相对丰度最高的菌门为拟杆菌门,相对丰度最高的菌属为普雷沃氏菌属,且两瘤胃样品中部分细菌相对丰度间的差异显著。 展开更多

关键词 川中黑山羊 瘤胃细菌 多样性 群落结构 MiSeq测序 拟杆菌门 普雷沃氏菌属

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白细胞介素家族成员对溃疡性结肠炎严重程度及肠道菌群的影响研究 被引量：11

6

作者 宋亚华 安苗 +3 位作者 秦赟 焦美艳 赵平 李锐 《现代消化及介入诊疗》 2021年第7期870-873,共4页

目的探讨白细胞介素家族成员对溃疡性结肠炎(UC)严重程度及肠道菌群的影响。方法收集2019年1月至2020年6月西安交通大学第二附属医院消化科住院初治的98例UC患者,以及同期内镜室检查无炎症性肠病患者60例,分别采集两组人员空腹静脉血,... 目的探讨白细胞介素家族成员对溃疡性结肠炎(UC)严重程度及肠道菌群的影响。方法收集2019年1月至2020年6月西安交通大学第二附属医院消化科住院初治的98例UC患者,以及同期内镜室检查无炎症性肠病患者60例,分别采集两组人员空腹静脉血,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)测定两组的血清IL-1β、IL-6、IL-8、IL-12、IL-17A、IL-17C、IL-21、IL-22、IL-23、IL-27及IL-35水平。根据UC病情严重程度不同将UC组分为轻度、中度、重度组,比较不同分组的上述白介素水平。收集粪便标本,检测肠道菌群的构成和丰度。结果与对照组相比,UC组血清中IL-1β、IL-8、IL-17A、IL-21、IL-22、IL-23、IL-27及IL-6均明显升高,IL-12和IL-35明显降低,差异均具有统计学意义(P<0.05)。与对照组相比,UC组血清中IL-17C明显升高(P<0.05),但未见不同严重程度UC患者血清中的IL-17C水平存在差异(P>0.05)。与对照组相比,UC组中拟杆菌门和放线菌门丰度明显下降(P<0.05),厚壁菌门和变形菌门丰度明显上升(P<0.05),UC轻度组梭杆菌门比例明显高于对照组(P<0.05)。结论白细胞介素家族成员对UC病情严重程度具有较好的诊疗指示作用,调理肠道菌群或在UC预防和治疗中获益。 展开更多

关键词 溃疡性结肠炎 IL-1Β IL-17C 拟杆菌门 厚壁菌门

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土壤拟杆菌与梭菌分解多糖类有机物质的研究进展与展望 被引量：9

7

作者 黄俊杰 陆雅海 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期1147-1157,共11页

土壤有机质的分解需要一系列环境微生物的参与,包括上游微生物进行有机质的初步分解、中间微生物的再分解利用和下游微生物的最终代谢过程。由微生物分泌的胞外水解酶将复杂有机质转变为简单有机质是整个分解过程的关键。近年来,针对肠... 土壤有机质的分解需要一系列环境微生物的参与,包括上游微生物进行有机质的初步分解、中间微生物的再分解利用和下游微生物的最终代谢过程。由微生物分泌的胞外水解酶将复杂有机质转变为简单有机质是整个分解过程的关键。近年来,针对肠道复杂有机质的微生物分解研究取得了显著进展,本文首先比较了有机质分解过程在人体肠道、反刍动物瘤胃和土壤环境三类生境的异同,然后详细分析比较了拟杆菌门(Bacteroidetes)和梭菌纲(Clostridia)进行糖类物质转运的过程机制。拟杆菌利用T9SS分泌系统进行胞外酶的分泌并依赖其多糖利用位点通过外膜的Sus复合体将初步分解后的寡糖类物质转运至周质空间,周质空间的糖苷水解酶将寡糖类物质进一步分解生成小分子糖,再经由内膜糖转运蛋白转运进胞内完成分解代谢过程。然而梭菌则是依靠纤维小体在胞外进行多聚糖的分解,再被胞外的底物结合蛋白捕获并由ABC转运蛋白转运进胞内,胞内单糖的浓度由双组分系统和碳代谢底物抑制机制协同调控。最后对未来有关土壤有机质分解需要解决的问题进行了展望。 展开更多

关键词 有机物质分解 拟杆菌门 多糖利用位点 梭菌纲 ABC转运蛋白

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大豆乳清粉对小鼠肠道菌群及其产生短链脂肪酸的影响 被引量：9

8

作者 韩伟 庄绪会 +3 位作者 张云鹏 陈园 王大为 张晓琳 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期104-110,共7页

大豆乳清是制备大豆分离蛋白时产生的副产物,带来的环境污染问题十分严重。为了利用这一废弃物资源并促进传统产业升级,本研究进一步探索了大豆乳清的营养功能。利用喷雾干燥方法得到大豆乳清粉,检测其蛋白质、膳食纤维、低聚糖、灰分... 大豆乳清是制备大豆分离蛋白时产生的副产物,带来的环境污染问题十分严重。为了利用这一废弃物资源并促进传统产业升级,本研究进一步探索了大豆乳清的营养功能。利用喷雾干燥方法得到大豆乳清粉,检测其蛋白质、膳食纤维、低聚糖、灰分及氨基酸组成等主要成分指标。将大豆乳清分别按0. 5%、1. 0%和2. 0%的添加量加入小鼠饮食,饲喂28 d后分析其对动物肠道菌群及其产生短链脂肪酸(SCFAs)的影响。结果表明:大豆乳清粉主要成分如下:灰分含量20. 9%,蛋白质含量20. 1%,低聚糖含量9. 68%,总膳食纤维含量5. 01%,脂肪含量3. 8%。与对照组相比,大豆乳清粉饲喂小鼠的肠道中厚壁菌门与拟杆菌门菌群比值显著降低,比值为0. 71～1. 20;另枝菌相对丰度增加,毛螺菌、拟普雷沃菌、拟杆菌、普雷沃菌相对丰度降低。不同剂量大豆乳清粉饲喂小鼠的肠道中总SCFAs含量显著提高,且SCFAs结构有明显不同。本研究结果可以为大豆乳清的高附加值利用提供理论依据和基础数据。 展开更多

关键词 大豆乳清 小鼠 肠道菌群 厚壁菌门 拟杆菌门 短链脂肪酸

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先天性巨结肠儿童肠道菌群特异性变化 被引量：7

9

作者 张现伟 张飞 +5 位作者 侯广军 周良 耿荷红 侯立功 张万存 周崇臣 《湖南师范大学自然科学学报》 CAS 北大核心 2019年第4期53-58,65,共7页

为分析先天性巨结肠(Hirschsprung’s Disease, HD)患儿肠道菌群组成及丰度变化,为HD患儿的发病机制及治疗提供理论依据,选取2016年6月至2017年8月入院治疗的29例HD患儿作为HD组,同时选取17例正常儿童作为对照组。提取两组粪便样品细菌... 为分析先天性巨结肠(Hirschsprung’s Disease, HD)患儿肠道菌群组成及丰度变化,为HD患儿的发病机制及治疗提供理论依据,选取2016年6月至2017年8月入院治疗的29例HD患儿作为HD组,同时选取17例正常儿童作为对照组。提取两组粪便样品细菌基因组DNA,采用16S rDNA高通量测序技术检测两组样本肠道菌群的组成及丰度并比较其差异。研究结果表明,在门水平上,HD组变形菌门、拟杆菌门丰度显著高于对照组,而放线菌门丰度显著低于对照组;在目水平上,HD组拟杆菌目丰度显著高于对照组,而双歧杆菌目丰度显著低于对照组;在科、属及种水平上,HD组双歧杆菌科、双歧杆菌属、短双歧杆菌、唾液乳杆菌丰度显著低于对照组。HD患儿肠道菌群发生紊乱,变形菌门及拟杆菌门丰度显著增加,而益生菌丰度显著降低,建议通过口服益生菌制剂调节HD患儿肠道菌群结构,加速HD患儿康复速度。 展开更多

关键词 先天性巨结肠 肠道微生物 双歧杆菌 变形菌门 拟杆菌门

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特应性皮炎患儿与正常儿童肠道菌群差异性研究 被引量：7

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作者 罗瑞静 刘杰 +6 位作者 彭勇 王英杰 武宗琴 姜珠倩 李淑 柴维汉 李斌 《中华皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期767-770,共4页

目的探讨特应性皮炎(AD)患儿与正常儿童肠道菌群的差异。方法收集2015年4月至2017年4月在上海市嘉定区中医医院皮肤科门诊就诊的AD患儿35例,以27例健康儿童作为对照组。取受试者粪便,提取总DNA后,PCR扩增细菌的16SrRNA基因V3~V4区,应用I... 目的探讨特应性皮炎(AD)患儿与正常儿童肠道菌群的差异。方法收集2015年4月至2017年4月在上海市嘉定区中医医院皮肤科门诊就诊的AD患儿35例,以27例健康儿童作为对照组。取受试者粪便,提取总DNA后,PCR扩增细菌的16SrRNA基因V3~V4区,应用Illumina Miseq测序平台行高通量测序,分析菌群丰度差异。选择两组丰度排名前15的门、属、种分别比较物种差异,采用Wilcoxon秩和检验。结果两组肠道菌群主要由厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门组成。在菌门水平,AD组与健康对照组拟杆菌门丰度分别为29.16%±19.96%、39.06%±15.98%(P=0.042),梭杆菌门分别为0.06%±0.17%、0.50%±1.71%(P=0.041);在菌属水平,两组拟杆菌属丰度分别为23.77%±18.08%、33.1%±15.75%(P=0.029);在菌种水平,丰度排名前15的菌种两组间分布差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论特应性皮炎患儿与正常儿童肠道菌群构成及菌群相对丰度存在一定差异。 展开更多

关键词 皮炎 特应性 微生物群落 儿童 拟杆菌门 梭杆菌门

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大气颗粒物暴露对肠道细菌丰度调节研究进展

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作者 王耀晗 黄楠楠 +3 位作者 李彬 陈汉清 李晓波 陈瑞 《环境与职业医学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期451-456,共6页

大气颗粒物是我国主要的大气污染物,由于其分布广泛、治理困难一直受到广泛关注。大气颗粒物主要通过呼吸道暴露进入机体,引发多种健康问题。近年来研究表明,大气颗粒物暴露与消化系统疾病的发生发展紧密相关,其可以通过呼吸道间接或者... 大气颗粒物是我国主要的大气污染物,由于其分布广泛、治理困难一直受到广泛关注。大气颗粒物主要通过呼吸道暴露进入机体,引发多种健康问题。近年来研究表明,大气颗粒物暴露与消化系统疾病的发生发展紧密相关,其可以通过呼吸道间接或者通过消化道直接进入人体。肠道菌群是定位于肠道上皮黏膜及肠腔的微生物群,数量庞大,功能丰富,其稳态对个体的肠道健康甚至是机体健康都起着重要的作用。肠道菌群可能介导环境因素诱导的健康效应,因此现有越来越多的研究关注大气颗粒物对肠道菌群的影响。因此,本综述检索并整理了多种大气颗粒物暴露对肠道菌群稳态的影响,以厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门及疣微菌门这五大菌门为主,讨论了它们的主要功能及大气颗粒物对其稳态和丰度的影响。 展开更多

关键词 颗粒物 肠道菌群 厚壁菌门 拟杆菌门 变形菌门 放线菌门 疣微菌门

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黄连解毒汤与复合抗生素对大鼠胃肠道菌群结构的影响 被引量：6

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作者 杨光勇 刘莉莉 +7 位作者 游丰锋 马希 何亚敏 喻良锦 李慧 汪席敏 涂小华 何光志 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第9期130-135,139,共7页

为了探讨黄连解毒汤与复合抗生素对大鼠胃肠道菌群微生态的调节作用,将大鼠分为对照组、抗生素组和黄连解毒汤高、中、低剂量组,各组大鼠每天灌胃2 mL对应药物。对照组大鼠灌胃纯化水;抗生素组大鼠第1周灌胃氨苄西林56 mg/mL,第2周灌胃... 为了探讨黄连解毒汤与复合抗生素对大鼠胃肠道菌群微生态的调节作用,将大鼠分为对照组、抗生素组和黄连解毒汤高、中、低剂量组,各组大鼠每天灌胃2 mL对应药物。对照组大鼠灌胃纯化水;抗生素组大鼠第1周灌胃氨苄西林56 mg/mL,第2周灌胃氨苄西林+链霉素(56+28)mg/mL,第3周灌胃氨苄西林+链霉素+克林霉素(56+28+50)mg/mL;黄连解毒汤高、中、低剂量组大鼠分别灌胃黄连解毒汤192,96,48 mg/mL。于给药后第7,14,21天处死大鼠,收集胃、十二指肠、空肠、回肠和结肠的内容物,提取细菌DNA,采用肠杆菌基因间重复一致序列聚合酶链反应(ERIC-PCR)技术对胃肠道各段中细菌菌群的结构多样性进行检测。结果表明:对照组大鼠胃肠道菌群结构相对稳定,ERIC-PCR条带数量以结肠最多,其次是回肠、十二指肠、胃、空肠;抗生素组大鼠胃肠道菌群结构表现出优势菌群的明显降低,并且随着灌胃周期的延长呈现抑制增强的现象。黄连解毒汤高剂量组大鼠胃肠道菌群以大肠杆菌、痤疮丙酸杆菌、沙门氏杆菌等为主要优势菌群,中剂量组大鼠胃肠道菌群以放线菌、绿孢链霉菌、梭状芽孢杆菌、链霉菌、减肥细菌为优势菌群,低剂量组胃肠道优势菌群为痤疮丙酸杆菌。说明黄连解毒汤具有一定的类似抗生素的作用,可抑制胃肠道各段拟杆菌门细菌生长,并有可能促进胃肠道内减肥细菌的增殖。 展开更多

关键词 黄连解毒汤 肠杆菌基因间重复一致序列聚合酶链反应 复合抗生素 胃肠道菌群 拟杆菌门 减肥细菌

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来曲唑诱导大鼠多囊卵巢综合征模型的肠道菌群分析

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作者 杨宏 张振 付旭锋 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期585-591,共7页

目的探讨来曲唑(雌激素合成抑制剂)是否会对多囊卵巢综合征患者的肠道微生物群的组成、多样性和丰度有影响。方法利用来曲唑诱导并构建了PCOS大鼠模型,通过16S rRNA的测序方法分析了正常和PCOS大鼠模型的肠道菌群结构。结果在门水平,PCO... 目的探讨来曲唑(雌激素合成抑制剂)是否会对多囊卵巢综合征患者的肠道微生物群的组成、多样性和丰度有影响。方法利用来曲唑诱导并构建了PCOS大鼠模型,通过16S rRNA的测序方法分析了正常和PCOS大鼠模型的肠道菌群结构。结果在门水平,PCOS组的厚壁菌门(73.29%±5.34%vs.77.17%±4.01%)的丰度较正常组降低,拟杆菌门(23.85%±6.22%vs.17.21%±6.90%)的丰度增加。在属水平,PCOS的罗氏菌属(5.61%±3.20%vs.16.13%±6.20%)和苏黎世杆菌属(1.75%±2.23%vs.9.98%±7.34%)的丰度较正常组降低,而乳杆菌属(18.83%±11.50%vs.15.88%±7.06%)、普雷沃氏菌属(4.58%±1.09%vs.0.46%±0.15%)和瘤胃球菌属(2.97%±1.56%vs.1.16%±0.60%)的丰度增加,进一步分析了两组差异菌群的KEGG信号通路,结果显示PCOS大鼠模型的肠道内胆汁酸生物合成相关的信号通路发生了变化。结论来曲唑灌胃构建的PCOS大鼠模型的肠道菌群结构明显发生紊乱,并且可能与胆汁酸生物合成相关的信号通路有关。 展开更多

关键词 多囊卵巢综合征 肠道微生物 16S rRNA测序 厚壁菌门 拟杆菌门 胆汁酸生物合成

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基于16S rRNA测序技术分析圈养黑叶猴肠道微生物

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作者 木仁 夏张琴 +2 位作者 韩朝恒 格根图雅 徐文斌 《现代畜牧兽医》 2024年第7期17-23,共7页

研究旨在明确圈养黑叶猴(Trachypithecus francoisi)肠道菌群结构及功能,采用16S rRNA高通量测序技术对3只圈养成年个体(雄性记为M,雌性记为Fa和Fb)的粪便样品进行分析。结果显示,3只个体共注释到10个门,优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes... 研究旨在明确圈养黑叶猴(Trachypithecus francoisi)肠道菌群结构及功能,采用16S rRNA高通量测序技术对3只圈养成年个体(雄性记为M,雌性记为Fa和Fb)的粪便样品进行分析。结果显示,3只个体共注释到10个门,优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes),M个体厚壁菌门和螺旋体门(Spirochaetes)的相对丰度显著低于Fa和Fb个体(P<0.05),WPS-2相对丰度极显著高于Fa和Fb个体(P<0.01)。3只个体共注释到76个属,M个体毛螺菌科未分类属和f_鼠杆菌科_未分类属的相对丰度显著高于Fa和Fb个体(P<0.05),f_uncultured_rumen_bacterium_unclassified的相对丰度极显著高于Fa和Fb个体(P<0.01)。M个体瘤胃球菌UCG-005、密螺旋体科_2相对丰度显著低于Fa和Fb个体(P<0.05),瘤胃球菌UCG-002、瘤胃球菌UCG-013、f_瘤胃球菌_未分类属和瘤胃球菌UCG-014相对丰度极显著低于Fa和Fb个体(P<0.01)。M个体中未发现dgA-11_gut_group,Fa和Fb个体中未发现梭杆菌属(Fusobacterium)。KEGG分析发现,M个体新陈代谢通路富集基因相对丰度极显著高于Fa和Fb个体(P<0.01),但细胞过程通路富集基因相对丰度极显著低于Fa和Fb个体(P<0.01)。研究表明,圈养黑叶猴的雄性个体M与雌性个体Fa和Fb间肠道菌群组成及功能存在较大差异,可能主要与性别间的生理差异有关。 展开更多

关键词 16S rRNA 圈养黑叶猴 肠道菌群 厚壁菌门 拟杆菌门

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多囊卵巢综合征和输卵管阻塞不孕症患者肠道菌群特征分析 被引量：4

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作者 武亚丽 李宏睿 +1 位作者 马晓玲 杨媛 《海军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1378-1384,共7页

目的 探讨多囊卵巢综合征(PCOS)和输卵管阻塞不孕症患者与健康育龄期女性肠道菌群特征之间的差异。方法 选择2020年9月至12月于兰州大学第一医院生殖中心就诊且符合纳入标准的30例不孕症患者为研究对象,分为PCOS不孕组(n=20)和输卵管阻... 目的 探讨多囊卵巢综合征(PCOS)和输卵管阻塞不孕症患者与健康育龄期女性肠道菌群特征之间的差异。方法 选择2020年9月至12月于兰州大学第一医院生殖中心就诊且符合纳入标准的30例不孕症患者为研究对象,分为PCOS不孕组(n=20)和输卵管阻塞不孕组(n=10),选择同期于兰州大学第一医院行备孕检查的健康育龄期女性作为健康对照组(n=10)。收集各组研究对象的新鲜粪便及血液样品,采用16S rRNA基因测序技术检测肠道菌群特征,并分析其与临床参数的关系。结果 在门水平,与健康对照组相比,PCOS不孕组和输卵管阻塞不孕组厚壁菌门相对丰度均降低(P均<0.05),PCOS不孕组拟杆菌门、变形菌门相对丰度均升高(P均<0.05);与输卵管阻塞不孕组相比,PCOS不孕组厚壁菌门相对丰度降低、变形菌门相对丰度升高(P均<0.05)。在PCOS不孕组,厚壁菌门与卵泡刺激素,拟杆菌门、变形菌门、放线菌门与总胆固醇,放线菌门与稳态模型胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)均呈正相关(P均<0.05);厚壁菌门与总胆固醇、脱硫杆菌门与空腹血糖、梭杆菌门与HOMA-IR均呈负相关(P均<0.05)。在输卵管阻塞不孕组,弯曲菌门与黄体生成素/卵泡刺激素比值、未分类菌门与甘油三酯、厚壁菌门与雌二醇均呈正相关(P均<0.05);弯曲菌门与HOMA-IR、未分类菌门与腰臀比均呈负相关(P均<0.05)。结论 PCOS不孕和输卵管阻塞不孕症患者肠道菌群结构发生紊乱,且与糖、脂代谢相关。 展开更多

关键词 多囊卵巢综合征 输卵管功能障碍 肠道菌群 厚壁菌门 拟杆菌门

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精神分裂症患者肠道菌群特征与认知损害的关系

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作者 高春元 刘晓云 +1 位作者 沙宏亮 王雪 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2023年第5期584-589,共6页

目的观察精神分裂症患者肠道菌群特征,并分析其与认知损害的关系。方法选择2020年3月至2022年3月我院收治的175例精神分裂症患者作为研究对象。所有患者入院时均接受轻度认知损害筛查量表(sMCI)评估,根据认知损害发生情况,分为认知损害... 目的观察精神分裂症患者肠道菌群特征,并分析其与认知损害的关系。方法选择2020年3月至2022年3月我院收治的175例精神分裂症患者作为研究对象。所有患者入院时均接受轻度认知损害筛查量表(sMCI)评估,根据认知损害发生情况,分为认知损害组和非认知损害组。统计两组患者一般资料和肠道菌群特征,分析精神分裂症患者肠道菌群特征与认知损害的关系。结果175例精神分裂症患者中出现认知损害91例(52.00%),未出现认知损害84例(48.00%)。认知损害组患者sMCI评分低于非认知损害组(P<0.05)。两组患者肠道菌群α多样性比较差异无统计学意义(均P>0.05)。两组对象肠道菌群的特征性物种在门水平为拟杆菌门(LDA=2.54),厚壁菌门(LDA=4.25);在纲水平为拟杆菌纲(LDA=3.57),梭菌纲(LDA=4.31);在科水平为产碱杆菌科(LDA=4.23)和梭菌科(LDA=2.76);在属水平为萨特菌属(LDA=3.18)。认知损害组患者肠道拟杆菌门丰度高于非认知损害组,厚壁菌门丰度低于非认知损害组;拟杆菌纲丰度高于非认知损害组,梭菌纲丰度低于非认知损害组;产碱杆菌科丰度高于非认知损害组,梭菌科丰度低于非认知损害组;萨特菌属丰度高于非认知损害组(均P<0.05)。Logistics回归分析显示,高丰度的拟杆菌门、拟杆菌纲、产碱杆菌科、萨特菌属是精神分裂症患者发生认知损害的危险因素(OR>1,均P<0.05);高丰度的厚壁菌门、梭菌纲是精神分裂症患者发生认知损害的保护因素(OR<1,均P<0.05)。结论精神分裂症患者肠道菌群结构显著失衡,且部分菌群丰度与认知损害密切相关。 展开更多

关键词 精神分裂症 肠道菌群 认知损害 厚壁菌门 拟杆菌门 产碱杆菌科

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糖尿病并发抑郁症大鼠肠道菌群失衡初步研究

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作者 马文恺 李薇 +2 位作者 雷诗卉 杨蕙 王瑾茜 《实用预防医学》 CAS 2023年第2期139-143,共5页

目的 通过对糖尿病并发抑郁症(diabetes-related depression, DD)大鼠肠道微生物进行16s rRNA测序分析,探讨该疾病状态下肠道菌群的改变。方法 建立DD模型,以健康SD大鼠作为空白对照组。每周称量体重的同时进行空腹血糖检测;采用强迫游... 目的 通过对糖尿病并发抑郁症(diabetes-related depression, DD)大鼠肠道微生物进行16s rRNA测序分析,探讨该疾病状态下肠道菌群的改变。方法 建立DD模型,以健康SD大鼠作为空白对照组。每周称量体重的同时进行空腹血糖检测;采用强迫游泳和矿场实验检测大鼠行为学;对各组大鼠肠道内容物进行16s rRNA测序;以血清为检测对象,对下丘脑-垂体-肾上腺轴(hypothalamic-pituitary-adrenal axis, HPA轴)相关蛋白及细菌脂多糖(lipopolysaccharide, LPS)含量进行检测。结果 与空白组比较,DD模型组血糖显著升高并表现出明显抑郁样行为和HPA轴亢进;16s rRNA测序结果提示,与空白组比较,DD模型组肠道菌群α多样性(Chao、Simpson、Shannon指数)无明显差异;但β多样性差异明显,即空白组与DD模型组的样品间距离较远;肠道菌群组间差异明显,与空白组比较,DD模型组中厚壁菌门丰度明显降低(P<0.01),而拟杆菌门则无明显差异;Bugbase表型预测提示,与空白组比较,DD模型组中革兰氏阴性菌明显升高,且血清中LPS含量升高。结论 DD模型组中肠道菌群紊乱,其变化与单独的糖尿病或抑郁症不同;同时肠道菌群的紊乱至DD中条件致病菌增加,从而引起LPS升高,这可能与HPA轴亢进有关。 展开更多

关键词 糖尿病并发抑郁症 肠道菌群 16s rRNA 厚壁菌门 拟杆菌门

原文传递

鱼腥草共附生细菌组成及其对小鼠肠道菌群的影响

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作者 陆秋丹 徐芳 +3 位作者 崔古贞 刘翔 张峥嵘 陈峥宏 《贵州农业科学》 CAS 2023年第8期85-92,共8页

【目的】了解鱼腥草共附生细菌的组成,以及小鼠食用新鲜鱼腥草对其肠道菌群的影响,为探明鱼腥草的药用价值及其相关机制提供参考。【方法】采用高通量测序技术对鱼腥草进行共附生细菌16S rRNA基因测序;试验组和对照组小鼠分别用鱼腥草(... 【目的】了解鱼腥草共附生细菌的组成,以及小鼠食用新鲜鱼腥草对其肠道菌群的影响,为探明鱼腥草的药用价值及其相关机制提供参考。【方法】采用高通量测序技术对鱼腥草进行共附生细菌16S rRNA基因测序;试验组和对照组小鼠分别用鱼腥草(试验组)和生理盐水(对照组)连续灌胃20 d,在灌胃前和停止灌胃7 d后分别采集试验组与对照组小鼠粪便进行细菌16S rRNA基因高通量测序分析。【结果】鱼腥草共附生细菌的优势菌门为变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria),其相对丰度分别为85.45%、10.52%和1.63%。试验组中,灌胃后与灌胃前相比,小鼠粪便菌群中变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)的相对丰度并未增加;菌群多样性的Shannon指数显著增高。灌胃后,试验组较对照组小鼠粪便菌群结构有显著差异,在门分类水平上,试验组厚壁菌门/拟杆菌门(Firmicutes/Bacteroidetes)显著高于对照组。【结论】新鲜鱼腥草能增加小鼠肠道菌群的多样性以及调节小鼠肠道菌群结构;鱼腥草对小鼠肠道菌群的调节作用主要是通过调节厚壁菌门/拟杆菌门(Firmicutes/Bacteroidetes)的比值实现。 展开更多

关键词 鱼腥草 共附生细菌 肠道菌群 高通量测序 厚壁菌门 拟杆菌门

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多囊卵巢综合征大鼠肠道菌群多样性研究 被引量：2

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作者 颜芳 刘艳霞 +3 位作者 张偲 范琼尹 苏泽琦 王停 《中国医学前沿杂志（电子版）》 2022年第11期34-42,共9页

目的采用16S rRNA测序技术对多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)大鼠及正常大鼠肠道菌群进行检测,比较正常及PCOS大鼠的肠道菌群多样性。方法选取无特定病原体(specific pathogen free,SPF)级雌性SD大鼠12只,对照组和模型... 目的采用16S rRNA测序技术对多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)大鼠及正常大鼠肠道菌群进行检测,比较正常及PCOS大鼠的肠道菌群多样性。方法选取无特定病原体(specific pathogen free,SPF)级雌性SD大鼠12只,对照组和模型组各6只;对照组给予大鼠维持饲料,模型组给予高脂饲料联合来曲唑灌胃;观察大鼠阴道涂片及卵巢组织学变化。采用16S rRNA高通量基因测序技术检测两组大鼠肠道菌群多样性。结果与对照组相比,模型组在多个水平上表现出有益菌丰度减少,有害菌丰度增加。LEfSe分析发现,Negativicutes菌纲下的多个水平菌群在对照组富集;变形杆菌门下的多个水平菌群在模型组富集。结论与正常大鼠相比,高脂饲料联合来曲唑构建的PCOS大鼠肠道菌群失调,主要表现为有益菌群丰度减少,有害菌群丰度增加。并且Negativicutes菌多个水平菌群在对照组富集;变形杆菌门多个水平在模型组富集。 展开更多

关键词 多囊卵巢综合征 肠道菌群 16S rRNA 拟杆菌门 厚壁杆菌门 变形菌门

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结直肠癌肝转移和非肝转移患者的肠道菌群构成差异

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作者 樊启林 张松 +9 位作者 徐丹 文峰 朱杰伦 张俊 金敏 师琳丽 周彬 程明霞 程建国 刘红利 《实用肿瘤杂志》 CAS 2023年第3期229-238,共10页

目的分析结直肠癌伴肝转移(liver metastasis,LM)和结直肠癌不伴肝转移(non-liver metastasis,NLM)患者的肠道微生物特征。方法选取2015年1月1日至2017年12月31日华中科技大学同济医学院附属协和医院的结直肠癌患者73例作临床研究。建立... 目的分析结直肠癌伴肝转移(liver metastasis,LM)和结直肠癌不伴肝转移(non-liver metastasis,NLM)患者的肠道微生物特征。方法选取2015年1月1日至2017年12月31日华中科技大学同济医学院附属协和医院的结直肠癌患者73例作临床研究。建立2个队列,分别是原发肿瘤组织固定及石蜡包埋样本队列(primary tumor tissues with fixation and paraffin embedding,FFPE samples)和粪便标本队列(Fecal samples)。每个队列按照有无LM分为两组:LM组和NLM组。FFPE samples队列中,LM组入组15例,NLM组入组30例;Fecal samples队列中,LM组入组12例,NLM组入组16例。采用16S rRNA高通量测序分析LM组和NLM组患者肠道菌群的多样性和物种组成情况。采用随机森林模型进一步寻找可预测结直肠癌LM的潜在微生物标志物。结果在2个队列中,LM组肠道微生物丰富度和多样性均高于NLM组(均P<0.05),LM组和NLM组的物种组成差异均具有统计学意义(均P<0.05)。拟杆菌门在2个队列的LM组中均显著富集。随机森林模型分析进一步表明,拟杆菌门可作为预测结直肠癌LM的潜在微生物标志物,对评估其无进展生存率及总生存率等预后生存状态具有重要意义。结论结直肠癌LM组和NLM组之间具有不同的肠道菌群特征。拟杆菌门对结直肠癌LM和预后不良具有潜在的预测价值。 展开更多

关键词 结直肠癌 肠道菌群 肝转移 拟杆菌门

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