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拟无枝酸菌属次级代谢潜能分析及代表菌株基因编辑体系建立
被引量:
1
1
作者
杨英哲
范可强
+4 位作者
王海燕
向丽军
张书平
赵燕
潘国辉
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1713-1731,共19页
【背景】拟无枝酸菌属作为一类重要的稀有放线菌,是抗菌、抗癌类药物的重要来源,其合成天然产物的潜能尚待系统分析及发掘。【目的】揭示拟无枝酸菌属不同结构类型次级代谢产物合成潜能,并建立两个代表性菌株的遗传操作体系,为结构新颖...
【背景】拟无枝酸菌属作为一类重要的稀有放线菌,是抗菌、抗癌类药物的重要来源,其合成天然产物的潜能尚待系统分析及发掘。【目的】揭示拟无枝酸菌属不同结构类型次级代谢产物合成潜能,并建立两个代表性菌株的遗传操作体系,为结构新颖或生物活性优良的次级代谢产物发掘及研究提供条件。【方法】使用多位点序列分析(multi-locus sequence analysis,MLSA)方法评价已公布的拟无枝酸菌基因组之间的相似度。同时,使用antiSMASH分析所有基因组的基因簇,预测其合成产物结构信息,并利用BiG-SCAPE对基因簇进行聚类分析。利用pSET152整合载体优化两个代表性拟无枝酸菌的接合转移条件,以建立遗传操作体系。采用CRISPR-cBEST碱基编辑和传统的同源重组确定靶基因失活方案。【结果】146个拟无枝酸菌基因组的生物信息学分析显示,平均每个基因组中含有33个基因簇。其中聚肽、聚酮及萜类合成基因簇的丰度较高,并且大多数基因簇与已知化合物基因簇不同。成功确定了拟无枝酸菌属两个代表菌株的最适接合转移条件。尽管CRISPR基因编辑质粒能够转入拟无枝酸菌,但6个载体均未成功编辑目标基因,而利用传统同源重组方法则成功敲除目标基因,建立了目的基因敲除系统。【结论】次级代谢潜能分析显示拟无枝酸菌属中蕴含丰富的新颖天然产物资源。此外,成功建立的基因编辑体系实现了外源基因整合及内源基因敲除,为该属新颖次级代谢产物的挖掘及生物合成研究提供了坚实的研究基础。
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关键词
拟
无
枝
酸
菌
属
次级代谢
天然产物
生物合成基因簇
基因编辑
原文传递
拟无枝酸菌属羽毛降解菌株BJA-103的诱变育种
被引量:
1
2
作者
严冬
李姜函
+3 位作者
陈欢
赵康康
颜华
贾良辉
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2021年第6期139-145,共7页
【目的】对具有羽毛降解能力的BJA-103菌株进行硫酸二乙酯(DES)诱变,筛选羽毛降解速率更快、降解程度更高的突变株,并对突变株产生的角蛋白酶性质进行初步探究,为其进一步扩大发酵及生产应用提供理论依据。【方法】使用DES对BJA-103菌...
【目的】对具有羽毛降解能力的BJA-103菌株进行硫酸二乙酯(DES)诱变,筛选羽毛降解速率更快、降解程度更高的突变株,并对突变株产生的角蛋白酶性质进行初步探究,为其进一步扩大发酵及生产应用提供理论依据。【方法】使用DES对BJA-103菌株进行诱变,涂布解除氮代谢分解调节筛选培养基为第1次初筛,点植法接种牛奶平板为第2次初筛,羽毛摇瓶降解为复筛。得到理想突变株后,对该突变株进行羽毛降解试验,初步探究降解时间、温度、pH对角蛋白酶活性的影响。【结果】筛选获得解除氮代谢分解调节突变株库(1253株),牛奶平板筛选水解圈宽度为8.5~12 mm的突变株5株(RT、BM′、CV′、FX′、NK′),平均水解圈大小为野生型的2.5倍。羽毛降解复筛得到突变株NK′,降解试验中,其48 h内的羽毛降解率为65.29%,远大于野生型(12.82%);其最终降解率为90.74%(降解144 h),大于野生型的降解率79.24%。突变株NK′产生的角蛋白酶最适发酵时间为72 h,最适反应温度为70℃,最适反应pH为11。【结论】筛选出1株羽毛降解速率快、降解程度高的突变株NK′,其所生产的角蛋白酶可耐高温、高碱环境。
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关键词
诱变育种
拟
无
枝
酸
菌
属
羽毛降解角蛋白酶
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职称材料
将一株原红霉素链霉菌转入拟无枝菌酸菌属的分类学研究
被引量:
1
3
作者
刘志恒
钱宇冬
+2 位作者
张亚美
石彦林
谢家仪
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
1996年第6期405-410,共6页
对保藏的红霉素链霉菌AS4.894、AS4.198的化学分类研究表明,它们的胞壁类型为IV/A型,不属于胞壁为I型的链霉菌属。菌株AS4.198与已由Labeda(1987)转入糖多孢菌属,定名为Saccharopo...
对保藏的红霉素链霉菌AS4.894、AS4.198的化学分类研究表明,它们的胞壁类型为IV/A型,不属于胞壁为I型的链霉菌属。菌株AS4.198与已由Labeda(1987)转入糖多孢菌属,定名为Saccharopolyspora erythreus的菌株相似;菌株AS4.894虽然胞壁型与糖多孢菌相似,但磷酸类脂为PⅡ型,应转入拟无枝菌酸菌属。通过与红霉素糖多孢菌和白色拟无枝菌酸菌进行比较。
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关键词
放线
菌
红霉素链霉
菌
拟
无
枝
菌
酸
菌
属
分类
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职称材料
题名
拟无枝酸菌属次级代谢潜能分析及代表菌株基因编辑体系建立
被引量:
1
1
作者
杨英哲
范可强
王海燕
向丽军
张书平
赵燕
潘国辉
机构
山东第一医科大学(山东省医学科学院)生物医学科学学院(省医药生物技术研究中心)
中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室
中国科学院大学存济医学院
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1713-1731,共19页
基金
国家重点研发计划(2022YFC2303100)
国家自然科学基金(32270080)。
文摘
【背景】拟无枝酸菌属作为一类重要的稀有放线菌,是抗菌、抗癌类药物的重要来源,其合成天然产物的潜能尚待系统分析及发掘。【目的】揭示拟无枝酸菌属不同结构类型次级代谢产物合成潜能,并建立两个代表性菌株的遗传操作体系,为结构新颖或生物活性优良的次级代谢产物发掘及研究提供条件。【方法】使用多位点序列分析(multi-locus sequence analysis,MLSA)方法评价已公布的拟无枝酸菌基因组之间的相似度。同时,使用antiSMASH分析所有基因组的基因簇,预测其合成产物结构信息,并利用BiG-SCAPE对基因簇进行聚类分析。利用pSET152整合载体优化两个代表性拟无枝酸菌的接合转移条件,以建立遗传操作体系。采用CRISPR-cBEST碱基编辑和传统的同源重组确定靶基因失活方案。【结果】146个拟无枝酸菌基因组的生物信息学分析显示,平均每个基因组中含有33个基因簇。其中聚肽、聚酮及萜类合成基因簇的丰度较高,并且大多数基因簇与已知化合物基因簇不同。成功确定了拟无枝酸菌属两个代表菌株的最适接合转移条件。尽管CRISPR基因编辑质粒能够转入拟无枝酸菌,但6个载体均未成功编辑目标基因,而利用传统同源重组方法则成功敲除目标基因,建立了目的基因敲除系统。【结论】次级代谢潜能分析显示拟无枝酸菌属中蕴含丰富的新颖天然产物资源。此外,成功建立的基因编辑体系实现了外源基因整合及内源基因敲除,为该属新颖次级代谢产物的挖掘及生物合成研究提供了坚实的研究基础。
关键词
拟
无
枝
酸
菌
属
次级代谢
天然产物
生物合成基因簇
基因编辑
Keywords
Amycolatopsis
secondary metabolism
natural products
biosynthetic gene clusters
gene editing
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
拟无枝酸菌属羽毛降解菌株BJA-103的诱变育种
被引量:
1
2
作者
严冬
李姜函
陈欢
赵康康
颜华
贾良辉
机构
西北农林科技大学生命科学学院
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2021年第6期139-145,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31601700)。
文摘
【目的】对具有羽毛降解能力的BJA-103菌株进行硫酸二乙酯(DES)诱变,筛选羽毛降解速率更快、降解程度更高的突变株,并对突变株产生的角蛋白酶性质进行初步探究,为其进一步扩大发酵及生产应用提供理论依据。【方法】使用DES对BJA-103菌株进行诱变,涂布解除氮代谢分解调节筛选培养基为第1次初筛,点植法接种牛奶平板为第2次初筛,羽毛摇瓶降解为复筛。得到理想突变株后,对该突变株进行羽毛降解试验,初步探究降解时间、温度、pH对角蛋白酶活性的影响。【结果】筛选获得解除氮代谢分解调节突变株库(1253株),牛奶平板筛选水解圈宽度为8.5~12 mm的突变株5株(RT、BM′、CV′、FX′、NK′),平均水解圈大小为野生型的2.5倍。羽毛降解复筛得到突变株NK′,降解试验中,其48 h内的羽毛降解率为65.29%,远大于野生型(12.82%);其最终降解率为90.74%(降解144 h),大于野生型的降解率79.24%。突变株NK′产生的角蛋白酶最适发酵时间为72 h,最适反应温度为70℃,最适反应pH为11。【结论】筛选出1株羽毛降解速率快、降解程度高的突变株NK′,其所生产的角蛋白酶可耐高温、高碱环境。
关键词
诱变育种
拟
无
枝
酸
菌
属
羽毛降解角蛋白酶
Keywords
mutagenesis breeding
Amycolatopsis.sp
feather degrading
keratinase
分类号
Q939.96 [生物学—微生物学]
Q933
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职称材料
题名
将一株原红霉素链霉菌转入拟无枝菌酸菌属的分类学研究
被引量:
1
3
作者
刘志恒
钱宇冬
张亚美
石彦林
谢家仪
机构
中国科学院微生物研究所
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
1996年第6期405-410,共6页
文摘
对保藏的红霉素链霉菌AS4.894、AS4.198的化学分类研究表明,它们的胞壁类型为IV/A型,不属于胞壁为I型的链霉菌属。菌株AS4.198与已由Labeda(1987)转入糖多孢菌属,定名为Saccharopolyspora erythreus的菌株相似;菌株AS4.894虽然胞壁型与糖多孢菌相似,但磷酸类脂为PⅡ型,应转入拟无枝菌酸菌属。通过与红霉素糖多孢菌和白色拟无枝菌酸菌进行比较。
关键词
放线
菌
红霉素链霉
菌
拟
无
枝
菌
酸
菌
属
分类
Keywords
Saccharopolyspora erythreus, Amycolatopsis erythreus
分类号
Q939.130.9 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
拟无枝酸菌属次级代谢潜能分析及代表菌株基因编辑体系建立
杨英哲
范可强
王海燕
向丽军
张书平
赵燕
潘国辉
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
原文传递
2
拟无枝酸菌属羽毛降解菌株BJA-103的诱变育种
严冬
李姜函
陈欢
赵康康
颜华
贾良辉
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2021
1
下载PDF
职称材料
3
将一株原红霉素链霉菌转入拟无枝菌酸菌属的分类学研究
刘志恒
钱宇冬
张亚美
石彦林
谢家仪
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
1996
1
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职称材料
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