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应用改进的SSP-抑制PCR技术扩增cDNA片段旁侧序列 被引量:4
1
作者 陈渝萍 薛社普 《基础医学与临床》 CSCD 1999年第4期87-91,共5页
结合抑制PCR和单链特异引物PCR技术,降低RACE过程中由公用引物引发的非特异扩增、增加目的cDNA在原始模板中的相对比例,从而提高RACE特异性,有效地扩增靶序列。
关键词 RACE 抑制pcr CDNA片段 旁侧序列
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罗田甜柿Ty1-copia类逆转座子RNaseH-LTR序列的分离和特性分析 被引量:12
2
作者 杜晓云 张青林 罗正荣 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期501-508,共8页
逆转座子序列信息的获得,对了解其在基因组中的行为及系统学研究有重要价值。本试验从罗田甜柿(Diospyros kaki Thunb.‘Luotian-tianshi’)基因组中分离出31个RNaseH-LTR(long terminal repeat,长末端重复)序列,并利用逆转座子间扩增... 逆转座子序列信息的获得,对了解其在基因组中的行为及系统学研究有重要价值。本试验从罗田甜柿(Diospyros kaki Thunb.‘Luotian-tianshi’)基因组中分离出31个RNaseH-LTR(long terminal repeat,长末端重复)序列,并利用逆转座子间扩增多态性(inter-retrotransposon amplified polymorphism,IRAP)技术对部分序列相应的逆转座子家族在柿属植物中的转座活性及分布情况进行初步探讨。序列分析结果表明,至少有10个Ty1-copia类逆转座子家族得到扩增;其家族间普遍表现高度异质,碱基替换、插入或缺失突变,以及翻译成氨基酸后发生不同程度的终止密码子突变、氨基酸取代和移框突变等,是产生高异质性的原因;此外,其家族内部某些序列间的相似性极高,可能是寄主基因组与逆转座子间互惠关系的体现。应用部分逆转座子引物的IRAP分析结果表明,相应的逆转座子家族在柿属植物中普遍存在,其分布广泛,拷贝数高,转座活性强,具有进一步开发为多种逆转座子分子标记的潜力。 展开更多
关键词 Ty1-copia逆转座子 抑制pcr 长末端重复 逆转座子间扩增多态性
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香蕉果实采后抑制差减文库的构建与鉴定 被引量:7
3
作者 徐碧玉 苏伟 金志强 《分子植物育种》 CAS CSCD 2005年第4期499-502,共4页
抑制差减杂交技术(suppressionsubtractivehybridization,SSH),是抑制PCR与差减杂交技术相结合而产生的。其优点是在差减杂交过程中使不同丰度cDNA的拷贝数差异趋于均衡,因此不同丰度的差异表达基因都能得到有效克隆,能有效分离低丰度... 抑制差减杂交技术(suppressionsubtractivehybridization,SSH),是抑制PCR与差减杂交技术相结合而产生的。其优点是在差减杂交过程中使不同丰度cDNA的拷贝数差异趋于均衡,因此不同丰度的差异表达基因都能得到有效克隆,能有效分离低丰度的差异表达基因,避免了表达序列标签分析中高丰度基因重复测序的缺点。因此SSH技术被应用于植物差异表达基因的分离。香蕉果实采后成熟过程中发生一系列复杂的生理变化,这些变化涉及到许多基因的表达。为了研究香蕉果实采后与采前在基因表达上的差异,我们首次采用抑制缩减文库的方法,以分离香蕉果实在采后表达的基因。以采后0h的香蕉果实cDNA为驱动子,对香蕉果实采后48h果实cDNA为待测子,进行抑制缩减杂交,抑制缩减杂交产物与pGEM-TEasyVecter连接,转化E.coliDH5琢,构建了抑制缩减文库。该文库共包含312个克隆,采用PCR方法对文库进行了重组子的鉴定,共有302个重组子。该文库的构建成功为深入研究香蕉果实采后基因的表达奠定了基础,为研究香蕉果实采后成熟的分子生物学机理提供了一个新的思路。 展开更多
关键词 果实采后 构建 差减文库 鉴定 差异表达基因 抑制差减杂交技术 分子生物学机理 cDNA 表达序列标签 香蕉果实 E.coli 抑制pcr SSH技术 pcr方法 基因重复 生理变化 成熟过程 基因表达 采后成熟 重组子 缩减 拷贝数 低丰度
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抑制性消减杂交在生物基因克隆中的应用 被引量:2
4
作者 黄凤兰 胡国富 胡宝忠 《生物技术通讯》 CAS 2004年第4期396-398,共3页
抑制性消减杂交(SSH)是抑制PCR与消减杂交技术相结合,能对未知序列差异表达基因克隆的一种方法。该方法具有速度快、效率高、假阳性率低、目的序列富集程度高、实验结果复杂程度低等特点。本文主要介绍其基本原理、操作过程、优缺点、... 抑制性消减杂交(SSH)是抑制PCR与消减杂交技术相结合,能对未知序列差异表达基因克隆的一种方法。该方法具有速度快、效率高、假阳性率低、目的序列富集程度高、实验结果复杂程度低等特点。本文主要介绍其基本原理、操作过程、优缺点、在生物基因克隆中的应用,并对其应用前景进行了分析。 展开更多
关键词 抑制性消减杂交 基因 克隆 抑制pcr 消减杂交技术 表达
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Mechanism of gold nanoparticle induced simultaneously increased PCR efficiency and specificity 被引量:2
5
作者 LIN Yan LI Jia +4 位作者 YAO Jing LIANG Yong ZHANG Jie ZHOU QunFang JIANG GuiBin 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2013年第36期4593-4601,共9页
Gold nanoparticles(AuNPs)have been reported to induce faster heat transfer of polymerase chain reaction(PCR)solution to enhance PCR efficiency.AuNPs can also increase the specificity of PCR by functioning analogously ... Gold nanoparticles(AuNPs)have been reported to induce faster heat transfer of polymerase chain reaction(PCR)solution to enhance PCR efficiency.AuNPs can also increase the specificity of PCR by functioning analogously to single-stranded DNA binding protein(SSB).However,the simple structure of AuNPs makes it difficult to determine how AuNPs affect PCR efficiency and specificity.This study aimed to elucidate the effect of AuNPs on PCR efficiency by altering the denaturation times and annealing temperatures.In addition,comparative study of the effect of AuNPs on PCR inhibition caused by two competitive primers allowed investigation of the mechanisms of AuNP-enhanced PCR accuracy.Finally,heat-treated salmon sperm DNA was used to evaluate whether AuNPs could eliminate the inhibitory PCR effect caused by DNA impurities.This study demonstrated that enhanced thermal conductivity by AuNPs was the main mechanism for increased PCR efficiency and specificity.AuNPs promoted efficient double-stranded DNA template unwinding and dissociation between mismatched primers,DNA fragments and template,and enhanced PCR efficiency and specificity simultaneously.Thus,this significant finding suggests the future use of AuNP-assisted PCR in different fields,especially in rapid clinical diagnosis and screening by PCR. 展开更多
关键词 金纳米粒子 抑制pcr 诱导机制 异性 单链DNA DNA模板 聚合酶链反应 鱼精子DNA
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抑制PCR富集法分离三化螟基因组微卫星分子标记 被引量:1
6
作者 周宇 杨琼 +1 位作者 韩光杰 方继朝 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2013年第5期999-1004,共6页
采用抑制PCR的方法构建三化螟的微卫星文库,并分离微卫星分子标记。挑取的201个阳性克隆测序结果表明,187个克隆含有微卫星序列,抑制PCR筛选微卫星序列的准确率达到93.03%。对该187个微卫星序列进行比对,得到18个不同的微卫星序列,并成... 采用抑制PCR的方法构建三化螟的微卫星文库,并分离微卫星分子标记。挑取的201个阳性克隆测序结果表明,187个克隆含有微卫星序列,抑制PCR筛选微卫星序列的准确率达到93.03%。对该187个微卫星序列进行比对,得到18个不同的微卫星序列,并成功提交至GenBank。对这18个序列设计了30对特异性引物,检测德阳种群48个体,共得到5个三化螟微卫星分子标记。 展开更多
关键词 三化螟 微卫星 抑制pcr 富集文库
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库拉索芦荟6号染色体表达序列标签的研究 被引量:1
7
作者 张明浩 崔丽华 陈正华 《北京师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期543-547,共5页
将微分离的库拉索芦荟(Alove vera[L.]Burm.f)6号染色体DNA及库拉索芦荟叶总cDNA分别用LA-PCR(linker adaptor polymerase chain reaction)方法扩增,然后采用杂交片段扩增技术(hybrid specific amplification,HSA)分离6号染色体与cDNA... 将微分离的库拉索芦荟(Alove vera[L.]Burm.f)6号染色体DNA及库拉索芦荟叶总cDNA分别用LA-PCR(linker adaptor polymerase chain reaction)方法扩增,然后采用杂交片段扩增技术(hybrid specific amplification,HSA)分离6号染色体与cDNA同源的表达序列片段.对表达序列片段进行克隆,得到约40 000个重组子.随机选取96个克隆进行分析,分别用DIG标记6号染色体的LA-PCR产物和cDNA扩增产物作探针对其进行点杂交,对显示阳性信号的克隆进行测序.将库拉索芦荟6号染色体的表达序列标签(expressed sequence tags,EST)与GenBank中核苷酸进行比较,发现库拉索芦荟6号染色体的表达序列中有87.4%与植物的EST具有同源性,12.6%的EST与人或动物的EST具有较弱同源性,其中与石刁柏的EST及非生物素胁迫下的小麦(Triticum aestivum)、咖啡(coffee)、高梁(Sorghum bicolor)和菠萝(pineapple)等作物的EST具有很高的同源性(>93%). 展开更多
关键词 库拉索芦荟 杂交片段扩增(HSA) 抑制pcr 表达序列标签
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双重抑制PCR技术分离鹅微卫星标记 被引量:13
8
作者 杜文兴 虞德兵 +3 位作者 刘红林 练春兰 候水生 王林云 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期63-67,共5页
用双重抑制PCR技术分离11对鹅的特异微卫星引物,应用于浙东白鹅和太湖鹅的基因组PCR扩增。结果表明:11对引物在浙东白鹅和太湖鹅中分别扩增出37和36个清晰条带,20个等位基因为两品种所共有,11对引物中有5对呈中等多态、6对呈高度多态。... 用双重抑制PCR技术分离11对鹅的特异微卫星引物,应用于浙东白鹅和太湖鹅的基因组PCR扩增。结果表明:11对引物在浙东白鹅和太湖鹅中分别扩增出37和36个清晰条带,20个等位基因为两品种所共有,11对引物中有5对呈中等多态、6对呈高度多态。各位点产生2~6个等位基因,各位点的平均杂合度为0.456~0.772,以G07位点为最高,G06位点为最低;平均多态信息为0.375~0.737,以G07位点为最高,G01、G03和G11位点为最低。浙东白鹅和太湖鹅有效等位基因数分别为2.655和2.558,与实际测得的两品种平均值3.364和3.273较接近。研究结果表明,两品种的等位基因分布较为均匀,与鹅的实际品种特征一致,因此,双重抑制PCR技术适合于鹅的基因组结构研究。 展开更多
关键词 双重抑制pcr技术 微卫星标记
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抑制PCR技术及其在基因分析中的应用 被引量:5
9
作者 周炜 赵寿元 李昌本 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 1999年第1期55-59,12,共6页
介绍了PCR技术在基因组走步、寻找基因旁侧序列、从总RNA构建cDNA文库、分析样本间共同序列、构建均等化(normalized)cDNA文库、构建差异表达的cDNA文库中的应用。
关键词 抑制pcr技术 pcr 基因组 基因分析
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利用双重抑制PCR技术分离鸭微卫星标记 被引量:3
10
作者 王利刚 虞德兵 +5 位作者 杜文兴 徐银学 刘红林 练春兰 候水生 王林云 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期72-75,90,共5页
用双重抑制PCR技术分离10对鸭的特异微卫星引物,应用于北京鸭、樱桃谷鸭、高邮鸭3个品种的基因组PCR扩增。结果表明:10对引物中有7对引物具有多态,3对呈高度多态,4对呈中度多态。7对引物在上述3个鸭品种中分别扩增出23、22、23个等... 用双重抑制PCR技术分离10对鸭的特异微卫星引物,应用于北京鸭、樱桃谷鸭、高邮鸭3个品种的基因组PCR扩增。结果表明:10对引物中有7对引物具有多态,3对呈高度多态,4对呈中度多态。7对引物在上述3个鸭品种中分别扩增出23、22、23个等位基因,其中15个等位基因为3个品种所共有;各位点产生4~7个等位基因,平均杂合度为0.494~0.650,平均多态信息含量为0.414~0.586,平均有效等位基因数为2.001~2.870。3个鸭品种的平均杂合度分别为0.578、0.566、0.594,平均多态信息含量分别为0.496、0.480、0.524;平均有效等位基因数分别为2.441、2.340、2.615,与实测平均等位基因数3.286、3.1z12、3.286较接近。 展开更多
关键词 双重抑制pcr技术 微卫星标记
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抑制性消减杂交技术原理及应用 被引量:23
11
作者 杨倩 成军 +2 位作者 刘妍 王建军 张树林 《世界华人消化杂志》 CAS 2003年第4期456-458,共3页
0引言 抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术是一种鉴定、分离组织细胞中选择性表达基因的技术.其原理是以抑制性多聚酶链反应(PCR)反应为基础的cDNA消减杂交技术.通过合成两个不同的接头,连接于测试cDNA片段... 0引言 抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术是一种鉴定、分离组织细胞中选择性表达基因的技术.其原理是以抑制性多聚酶链反应(PCR)反应为基础的cDNA消减杂交技术.通过合成两个不同的接头,连接于测试cDNA片段的5'末端,达到选择性扩增差异性表达的cDNA片段,抑制非目的cDNA的扩增.该技术与其他消减杂交技术相比具有假阳性率低、敏感性高、效率高等优点而得到广泛应用. 展开更多
关键词 抑制性消减杂交技术 原理 真核生物细胞 基因 抑制pcr反应 分子生物学 慢性肝炎 肝纤维化 肝细胞癌
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抑制性消减杂交技术及其应用研究进展 被引量:4
12
作者 周变华 王宏伟 +3 位作者 杨自军 王国永 郝雪琴 孔涛 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第12期40-42,共3页
抑制性消减杂交(SSH)技术是结合抑制性PCR和消减杂交技术发展起来的一种高效分离差异表达基因的方法,具有特异性高、假阳性率低、操作简便、速度快、效率高等优点。利用SSH技术进行不同状态下基因的表达变化分析、差异基因的克隆和鉴定... 抑制性消减杂交(SSH)技术是结合抑制性PCR和消减杂交技术发展起来的一种高效分离差异表达基因的方法,具有特异性高、假阳性率低、操作简便、速度快、效率高等优点。利用SSH技术进行不同状态下基因的表达变化分析、差异基因的克隆和鉴定对了解基因表达调控有着重要意义。为此,综述了SSH技术的原理及其在发育调控基因、疾病发生机制、药物研发、性状筛选及环境生物修复等方面的应用研究进展。 展开更多
关键词 抑制性消减杂交技术 抑制pcr 分子生物学
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利用抑制性PCR提高兼并引物扩增效率及特异性 被引量:1
13
作者 朱晓静 戴忠敏 《杭州师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2015年第6期581-584,共4页
为提高兼并引物PCR的特异性和扩增效率,改进了兼并引物的设计,在兼并引物上加入接头序列,使其延长,并利用该方法成功获得了一个新的聚酮类合成酶的基因片段,表明抑制性PCR能够提高兼并引物扩增的效率及特异性.
关键词 抑制pcr 兼并引物 分子克隆
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