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Intergeneration CAG expansion in a Wuhan juvenile-onset Huntington disease family 被引量:2
1
作者 刘媛 沈滟 +4 位作者 李和 王慧 杨真荣 陈燕 唐艳平 《Neuroscience Bulletin》 SCIE CAS CSCD 2007年第4期198-202,共5页
Objective To make early diagnosis of IT15 gene mutation in a Wuhan juvenile-onset Huntington disease (HD) family, for providing them with genetic counseling, and making preparation for the further research on pathog... Objective To make early diagnosis of IT15 gene mutation in a Wuhan juvenile-onset Huntington disease (HD) family, for providing them with genetic counseling, and making preparation for the further research on pathogenesis and experimental therapy of HD. Methods According to the principle of informed consent, we extracted genomic DNA from peripheral blood samples and carried genetic diagnosis of pathogenic exon 1 of IT15 gene by modified touchdown PCR and DNA sequencing methods. Results Eight of twenty-five family members carried abnormal allele: Ⅲ10 Ⅲ12, IIIt4, Ⅳ3, and Ⅴ2 carded (CAG) 48, Ⅳ11 and Ⅳ12 carried (CAG) 67, and Ⅳ14 carried (CAG) 63, in contrast with the 8-25 CAG trinucleotides in the members of control group. Ⅳ14 carried 15 more CAG trinucleotides than her father Ⅲ10. Conclusion The results definitely confirm the diagnosis of HD and indicate the CAG trinucleotide repeat expansion of IT15 gene in this HD family. In addition, CAG expansion results in juvenile-onset and anticipation (characterized by earlier age of onset and increasing severity) of the patientⅣ12. 展开更多
关键词 Huntington disease early diagnosis trinucleotide repeat expansion genetic anticipation
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耐氟喹诺酮类药物大肠埃希氏菌基因突变的MAMA-PCR检测 被引量:1
2
作者 陶文琴 曾振灵 +1 位作者 陈杖榴 刘健华 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期534-537,共4页
采用MAMA-PCR法对72株已知突变菌株的突变情况进行了检测。结果,有2种gyrA 83位突变:TCG→TTG和TCG缺失;4种gyrA 87位突变:GAC→AAC、GAC→GGC、GAC→TAC和GAC→CAC;1种parC 80位突变:AGC→ATC以及4种parC 84位突变:GAA→AAA、GAA→GCA... 采用MAMA-PCR法对72株已知突变菌株的突变情况进行了检测。结果,有2种gyrA 83位突变:TCG→TTG和TCG缺失;4种gyrA 87位突变:GAC→AAC、GAC→GGC、GAC→TAC和GAC→CAC;1种parC 80位突变:AGC→ATC以及4种parC 84位突变:GAA→AAA、GAA→GCA、GAA→GGA和GAA→GTA。采用同样的方法,对38株未知突变菌株的检测结果显示,gyrA 83、gyrA 87、parC 80和parC 84位的突变检出的正确率分别为97.4%、94.7%、81.6%和94.7%。结果表明,MAMA-PCR有望成为监测耐氟喹诺酮类药物大肠埃希氏菌的分子生物学常规方法。 展开更多
关键词 大肠埃希氏菌 氟喹诺酮类 耐药性 突变检测 错配扩增突变分析PCR法
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利用四引物扩增受阻突变体系PCR技术检测水稻低直链淀粉含量基因Wx-mq 被引量:42
3
作者 陈涛 骆名瑞 +7 位作者 张亚东 朱镇 赵凌 赵庆勇 周丽慧 姚姝 于新 王才林 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期529-534,共6页
根据Wx-mq基因存在的单核苷酸变异,利用四引物扩增受阻突变体系PCR(Tetra-primer ARMS-PCR)的方法设计特异引物,对12个水稻品种(或品系)以及武育粳3号(不含Wx-mq基因)/关东194(含Wx-mq基因)的F2分离群体进行扩增,依据其PCR产物的带型,... 根据Wx-mq基因存在的单核苷酸变异,利用四引物扩增受阻突变体系PCR(Tetra-primer ARMS-PCR)的方法设计特异引物,对12个水稻品种(或品系)以及武育粳3号(不含Wx-mq基因)/关东194(含Wx-mq基因)的F2分离群体进行扩增,依据其PCR产物的带型,可以准确区分出Wx-mq基因纯合、非Wx-mq基因纯合以及杂合基因型三种类型,其电泳结果与成熟后对胚乳外观特性鉴定完全一致。因此,作为一种简单、低成本的实用技术,四引物ARMS-PCR可以广泛用于Wxmq基因水稻的资源鉴定和分子标记辅助育种。 展开更多
关键词 水稻 低直链淀粉含量 Wx—mq基因 四引物扩增受阻突变体系PCR
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四引物扩增受阻突变体系PCR快速测定绵羊BMPR-IB基因型方法的建立 被引量:20
4
作者 管峰 杨利国 +2 位作者 艾君涛 刘守仁 石国庆 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期579-583,共5页
四引物ARMSPCR是检测SNP有效、快速、简便的方法。绵羊BMPRIB基因是控制Booroola绵羊多胎性状的主效基因,此研究目的在于建立一种对BMPRIB基因四引物ARMSPCR检测方法。根据四引物ARMSPCR技术原理,在绵羊BMPRIB基因突变位点(A746G)设计... 四引物ARMSPCR是检测SNP有效、快速、简便的方法。绵羊BMPRIB基因是控制Booroola绵羊多胎性状的主效基因,此研究目的在于建立一种对BMPRIB基因四引物ARMSPCR检测方法。根据四引物ARMSPCR技术原理,在绵羊BMPRIB基因突变位点(A746G)设计一对特异性引物,并在突变点两侧设计一对参照引物,用来扩增含有突变点的DNA片段,可在一步PCR反应中根据电泳图谱准确判断绵羊个体的BMPRIB基因型,对比PCRRFLP检测结果表明,所建立的方法简单,操作简便,大大提高了检测效率。 展开更多
关键词 四引物扩增受阻突变体系PCR 快速测定 绵羊 BMPR-IB基因型 单核苷酸多态性
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3个肾上腺脑白质营养不良家系的基因突变分析 被引量:14
5
作者 黄梁浒 曾健 +3 位作者 杨渤生 黄惠娟 吴玉水 兰风华 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2004年第3期193-197,共5页
目的 对 3个肾上腺脑白质营养不良 ( adrenoleukodystrophy,AL D) ( MIM# 30 0 10 0 )家系进行基因突变分析。方法 从 3个 AL D患儿及其主要家系成员的外周血白细胞 ,提取总 RNA和基因组 DNA。应用逆转录聚合酶链反应技术 ,对 3个家系... 目的 对 3个肾上腺脑白质营养不良 ( adrenoleukodystrophy,AL D) ( MIM# 30 0 10 0 )家系进行基因突变分析。方法 从 3个 AL D患儿及其主要家系成员的外周血白细胞 ,提取总 RNA和基因组 DNA。应用逆转录聚合酶链反应技术 ,对 3个家系的 ABCD1基因编码区 ,分 4个片段进行 PCR扩增并对 PCR产物直接测序。同时应用 PCR-限制性酶切或扩增阻滞突变系统分析相应的基因组 DNA,进一步确证ABCD1基因的突变位点。结果  3名患儿的 ABCD1基因上均存在错义突变 ,其中患儿 1的 ABCD1基因第 5 34位密码子发生 CCC→ CGC改变 ,使脯氨酸被精氨酸取代 ( P5 34R) ;患儿 2的 ABCD1基因第 2 6 6位密码子发生 GGG→AGG改变 ,使甘氨酸被精氨酸取代 ( G2 6 6 R) ;患儿 3母亲的 ABCD1上一个等位基因第 6 17位密码子发生 CGC→ GGC改变 ,使精氨酸被甘氨酸取代 ( R6 17G) ,另一个等位基因未发生突变。结论 在中国人 AL D患者中发现 1个新的 ABCD1基因突变 ( P5 34R) ,并首次在中国人 AL D患者中检测到G2 6 6 R、R6 展开更多
关键词 肾上腺脑白质营养不良 ABCDl基因 基因突变 扩增阻滞突变系统 逆转录聚合酶链反应
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PCR-CTPP:一种基于错配技术的SNP分型方法的改良 被引量:16
6
作者 王柯 章金涛 +6 位作者 运玉霞 吴晓冰 陈阿群 王鹏 王凯娟 张建营 代丽萍 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期182-188,共7页
为探讨两对交叉引物PCR(PCR-CTPP)技术的原理并提高SNP分型的准确性,以人类MTHFR基因1298位点突变为例,通过设计合理的引物、优化引物终浓度及复性温度等重建PCR-CTPP检测系统,对比常规PCR-CTPP和改良的PCR-CTPP检测系统的可靠性。结果... 为探讨两对交叉引物PCR(PCR-CTPP)技术的原理并提高SNP分型的准确性,以人类MTHFR基因1298位点突变为例,通过设计合理的引物、优化引物终浓度及复性温度等重建PCR-CTPP检测系统,对比常规PCR-CTPP和改良的PCR-CTPP检测系统的可靠性。结果表明,改良的PCR-CTPP检测系统更加准确,支持了常规方法存在理论缺陷的观点;批量鉴定结果进一步验证了改良方法的可靠性。该技术有望在医学和分子生物学等领域广泛应用。 展开更多
关键词 两对交叉引物PCR 四引物扩增受阻突变体系PCR SNP分型 人为错配 亚甲基四氢叶酸还原酶
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稻瘟病广谱抗性基因Pigm特异性分子标记的开发和应用 被引量:16
7
作者 陈涛 孙旭超 +9 位作者 张善磊 梁文化 周丽慧 赵庆勇 姚姝 赵凌 赵春芳 朱镇 张亚东 王才林 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期28-36,共9页
【目的】来自籼稻品种谷梅4号的Pigm是一个对稻瘟病菌具有广谱和持久抗性的重要基因。为有效提高Pigm基因的选择效率,有必要开发具有特异性的共显性分子标记进行辅助育种。【方法】本研究根据谷梅4号Pigm位点存在的特异性核苷酸变异,利... 【目的】来自籼稻品种谷梅4号的Pigm是一个对稻瘟病菌具有广谱和持久抗性的重要基因。为有效提高Pigm基因的选择效率,有必要开发具有特异性的共显性分子标记进行辅助育种。【方法】本研究根据谷梅4号Pigm位点存在的特异性核苷酸变异,利用Tetra-primerARMS-PCR和KASP两种不同的基因分型技术开发出分子标记T-Pigm和K-Pigm,对不同品种(品系)以及淮稻9号/谷梅4号的F2分离群体进行基因型检测,并结合穗颈瘟人工接种鉴定,对标记的准确性进行评价。【结果】序列比对分析表明,谷梅4号Pigm位点中Pigm-Nbs2基因起始密码子上游515 bp处存在一个特殊的单核苷酸变异。利用已开发的两种类型的分子标记能够有效区分3种不同的基因型,且基因型与穗颈瘟人工接种鉴定结果完全一致。【结论】利用分子标记T-Pigm和K-Pigm可以实现对Pigm基因型快速、准确的检测,加快抗稻瘟病水稻新品种的选育进程。 展开更多
关键词 稻瘟病 Pigm 特异性标记 四引物扩增受阻突变体系PCR 竞争性等位基因特异性PCR
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一种SNP检测新方法:四引物扩增受阻突变体系PCR技术 被引量:12
8
作者 管峰 艾君涛 杨利国 《生命的化学》 CAS CSCD 2004年第6期514-516,共3页
详细介绍四引物扩增受阻突变体系PCR技术的原理和分析方法 ,并简单介绍其在检测单核苷酸多态性中的应用 ,为该技术在医学和分子生物学等领域中的推广应用提供理论基础。
关键词 四引物扩增受阻突变体系PCR
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ALS抑制剂类除草剂抗性水稻功能标记的开发与验证 被引量:13
9
作者 陈涛 张善磊 +8 位作者 赵凌 张亚东 朱镇 赵庆勇 周丽慧 姚姝 赵春芳 梁文化 王才林 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期137-145,共9页
【目的】培育具有乙酰乳酸合酶(ALS)抑制剂类除草剂抗性的品种是防治水稻直播田杂草危害最经济、有效的途径之一,而利用分子标记辅助选择有助于提高其品种选择效率。【方法】在明确除草剂抗性突变体黄华占M-1 ALS基因编码区碱基差异的... 【目的】培育具有乙酰乳酸合酶(ALS)抑制剂类除草剂抗性的品种是防治水稻直播田杂草危害最经济、有效的途径之一,而利用分子标记辅助选择有助于提高其品种选择效率。【方法】在明确除草剂抗性突变体黄华占M-1 ALS基因编码区碱基差异的基础上,利用四引物扩增受阻突变体系PCR(Tetra-primer ARMS-PCR)技术,设计引物对不同品种(品系)和淮稻5号/黄华占M-1的F2群体进行基因型检测,并结合除草剂的田间试验对标记的准确性进行验证。【结果】ALS基因编码区序列比对分析表明,尽管籼、粳稻之间具有多处差异碱基,但只有第1642和1643碱基TG到AT的变异能导致位于高度保守域的第548位编码氨基酸由色氨酸突变为甲硫氨酸,进而使水稻产生对ALS抑制剂类除草剂的抗性。依据PCR扩增产物的电泳带型,可以准确区分出3种不同的基因型,其基因型与苗期除草剂抗性的表型完全一致。【结论】利用Tetra-primer ARMS-PCR技术,可以实现对两个连续变异碱基位点基因型的快速检测,从而加快ALS抑制剂类除草剂抗性水稻品种的选育进程。 展开更多
关键词 乙酰乳酸合酶基因 除草剂抗性 碱基突变 四引物扩增受阻突变体系PCR
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四引物扩增受阻突变体系PCR技术在中国明对虾SNP基因分型中的研究 被引量:13
10
作者 张建勇 王清印 +3 位作者 王伟继 孟宪红 孔杰 张全启 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期751-759,共9页
采用四引物扩增受阻突变体系PCR(Tetra-primer ARMS-PCR)技术,对中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)的80个单核苷酸多态性位点(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)进行验证。结果表明,通过优化PCR反应条件、调整内外引物... 采用四引物扩增受阻突变体系PCR(Tetra-primer ARMS-PCR)技术,对中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)的80个单核苷酸多态性位点(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)进行验证。结果表明,通过优化PCR反应条件、调整内外引物浓度和采取Touchdown PCR程序可优化扩增效果,80组引物中有20组引物得到良好的分型效果。群体多态性分析表明有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)及多态性信息含量(PIC)的范围分别为1.127~1.993、0.136~0.607、0.119~0.492和0.145~0.373。结果显示四引物扩增受阻突变体系技术聚合酶链式反应是一种简单快速而有效SNP基因分型的方法。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 基因分型 中国明对虾 四引物扩增受阻突变体系PCR
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晚期非小细胞肺癌患者EGFR基因突变及其与血清肿瘤标志物的相关性 被引量:11
11
作者 牛艳柳 邹明瑾 +5 位作者 阿尔孜古丽 李晋 赵晓文 任浩 苏小红 张义 《检验医学与临床》 CAS 2017年第17期2583-2586,共4页
目的利用扩增阻滞突变系统(ARMS)检测晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者表皮生长因子受体(EGFR)基因突变情况,探讨其与患者临床特征和血清肿瘤标志物的相关性。方法收集2015年1月至2016年4月山东大学齐鲁医院收治的92例晚期NSCLC患者血浆标本... 目的利用扩增阻滞突变系统(ARMS)检测晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者表皮生长因子受体(EGFR)基因突变情况,探讨其与患者临床特征和血清肿瘤标志物的相关性。方法收集2015年1月至2016年4月山东大学齐鲁医院收治的92例晚期NSCLC患者血浆标本,采用ADx-ARMS方法检测EGFR基因突变情况,采用化学发光法检测癌胚抗原(CEA)、鳞状上皮细胞癌抗原(SCC-Ag)、糖类抗原(CA)125、细胞角蛋白19片段(CYFRA21-1)、神经元特异性烯醇化酶(NSE)、唾液酸(SA)水平。结果晚期NSCLC患者EGFR基因总突变率为32.6%(30/92)。其中,EGFR19-del突变率为15.2%(14/92),EGFR21-L858R突变率为12.0%(11/92),EGFR20-T790M突变率为2.2%(2/92)。晚期NSCLC患者EGFR基因突变与患者性别、吸烟史、病理类型具有明显相关性。与EGFR基因野生型患者比较,EGFR基因突变患者CEA水平明显升高(P<0.05),CA125、CYFRA21-1、SCC-Ag水平明显降低(P<0.05)。结论晚期NSCLC患者EGFR基因突变者血清肿瘤标志物CEA、CA125、CYFRA21-1、SCC-Ag水平与未突变患者存在明显差异,为发现EGFR基因突变与血清肿瘤标志物的相关性乃至筛选表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂治疗的优势人群提供参考。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 表皮生长因子受体 扩增阻滞突变系统 癌胚抗原 鳞状上皮细胞癌抗原
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非小细胞肺癌EGFR和KRAS基因突变和临床病理特征分析 被引量:10
12
作者 王哲哲 祁晓莉 +4 位作者 武迪 杜睿 张立英 卢晓红 杜少静 《临床和实验医学杂志》 2022年第4期360-364,共5页
目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)中表皮生长因子受体(EGFR)和鼠类肉瘤病毒癌基因(KRAS)突变状态及其与临床病理特征的关系。方法回顾性收集2019年1月至2021年6月首都医科大学大兴教学医院183例病理确诊NSCLC患者临床病理资料,采用扩增阻滞... 目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)中表皮生长因子受体(EGFR)和鼠类肉瘤病毒癌基因(KRAS)突变状态及其与临床病理特征的关系。方法回顾性收集2019年1月至2021年6月首都医科大学大兴教学医院183例病理确诊NSCLC患者临床病理资料,采用扩增阻滞突变系统(ARMS)法检测肿瘤组织中EGFR和KRAS基因的突变状态,分析基因突变率及其与临床病理特征之间的关系。结果183例NSCLC中EGFR和KRAS基因的突变率分别为56.28%(103/183)、11.48%(21/183),EGFR和KRAS双基因突变率为0.55%(1/183)。EGFR基因突变多见于女性、无吸烟史、腺泡型为主的腺癌、淋巴结无转移患者;KRAS基因多见于男性、有吸烟史患者。结论NSCLC患者EGFR基因突变与患者性别、吸烟史、组织学类型、淋巴结转移相关,KRAS基因突变与患者性别和吸烟史有关,可出现EGFR与KRAS基因联合突变。EGFR、KRAS基因同步检测,有助于筛选EGFR-TKI靶向治疗对象,指导临床用药。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 EGFR基因 KRAS基因 扩增阻滞突变系统
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基于ARMS法检测BRAF V600E突变在甲状腺乳头状癌中的临床价值 被引量:10
13
作者 丁金旺 罗定存 +8 位作者 荀延萍 王炜 徐骁诚 周荣璟 姜燕平 徐益平 张卧 潘钢 叶柳青 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 CAS CSCD 2017年第2期71-75,共5页
目的探讨扩增阻滞突变系统(amplification refractory mutation system,ARMS)法检测BRAF V600E突变的可行性,并评估BRAF V600E突变对鉴别甲状腺结节性质的临床价值。方法采用ARMS法检测并比较179例甲状腺乳头状癌(papillary thyroid car... 目的探讨扩增阻滞突变系统(amplification refractory mutation system,ARMS)法检测BRAF V600E突变的可行性,并评估BRAF V600E突变对鉴别甲状腺结节性质的临床价值。方法采用ARMS法检测并比较179例甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)和115例甲状腺良性病变组织的BRAF V600E突变状态,计算BRAF V600E突变对鉴别甲状腺结节性质的各项诊断指标,分析BR A F V600E突变与PTC临床病理特征的相关性。结果ARMS法检测甲状腺病灶组织中的BRAF V600E突变方法可行,结果可信。BRAF V600E在PTC中的突变率为82.68%,而在良性组织中的突变率仅为1.74%,两者差异有统计学意义(χ2=183.568,P<0.01)。利用BRAF V600E突变判定甲状腺结节性质的诊断敏感度为82.68%,特异度为98.26%,准确度为88.76%,约登指数为0.8094。BRAF V600E突变与PTC患者的性别、年龄、肿瘤大小、病灶数目、双侧病灶、腺外侵犯以及淋巴结转移等因素无关。结论 ARMS法检测BRAF V600E突变具有较高的诊断敏感度和特异度,其对鉴别甲状腺结节的性质具有重要的临床早期诊断价值。 展开更多
关键词 甲状腺肿瘤 诊断 突变 扩增阻滞突变系统 BRAF基因
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微滴式数字PCR技术检测非小细胞肺癌患者外周血EGFR基因突变 被引量:10
14
作者 毛旭华 汤俊明 +1 位作者 马芬芬 王彦 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2018年第8期589-592,共4页
目的分析微滴式数字PCR技术(droplet digital PCR,dd PCR)在非小细胞肺癌(non-small-cell lung cancer,NSCLC)患者外周血EGFR基因突变检测中的应用价值。方法采用dd PCR法与扩增阻滞突变系统技术(amplification refractory mutation sys... 目的分析微滴式数字PCR技术(droplet digital PCR,dd PCR)在非小细胞肺癌(non-small-cell lung cancer,NSCLC)患者外周血EGFR基因突变检测中的应用价值。方法采用dd PCR法与扩增阻滞突变系统技术(amplification refractory mutation system,ARMS)分别检测58例NSCLC患者及TKI治疗后耐药患者20例外周血EGFR基因突变,Kappa检验验证dd PCR法检测EGFR基因突变结果与ARMS法的一致性,并对检测结果进行分析比较。结果 ARMS法检测EGFR基因突变共检出34例患者,其中双突变患者5例,dd PCR法共检出38例患者,其中双突变患者10例;两者Kappa值=0.72,阳性一致率为97.50%,阴性一致率为72.73%,总一致率为86.30%;dd PCR法检测接受TKI治疗患者的20外显子p.T790M位点突变检出率为50.00%(10/20),而无TKI用药史患者均未检出;dd PCR法检出突变丰度<1%的突变位点占总突变位点的29.17%(14/48),ARMS法仅检出其中的35.71%(5/14)。结论 dd PCR法与ARMS法相比具有更高敏感性,且可绝对定量,EGFR基因突变的检出率更高。 展开更多
关键词 微滴式数字PCR技术 扩增阻滞突变系统技术 EGFR基因突变
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水稻Wx复等位基因基于PCR的功能标记开发与利用 被引量:10
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作者 毛艇 李旭 +1 位作者 李振宇 徐正进 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期1715-1723,共9页
直链淀粉含量是影响稻米食味品质的重要因素,主要由蜡质基因(Wx)调控,Wx基因座存在Wxa、Wxb、Wxin、Wxmw等多个复等位基因,通过分子标记辅助选择(marker-assisted selection,MAS)培育中低直链淀粉含量的水稻品种是提高稻米适口性的重要... 直链淀粉含量是影响稻米食味品质的重要因素,主要由蜡质基因(Wx)调控,Wx基因座存在Wxa、Wxb、Wxin、Wxmw等多个复等位基因,通过分子标记辅助选择(marker-assisted selection,MAS)培育中低直链淀粉含量的水稻品种是提高稻米适口性的重要途径。Wx复等位基因的功能由单碱基核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)决定,其检测依赖于测序或酶切,存在耗时多、费用昂贵等缺点。为提高选择效率,本文利用Wx复等位基因的SNP差异和四引物扩增受阻突变(tetra-primer ARMS-PCR)原理,进行PCR功能标记的开发。引物设计过程中,针对扩增效率低和非匹配的延伸2个技术难题,提出了调整错配位点的解决方案,成功开发了基于PCR技术的两对功能性标记Waxygt-ARMS2和Waxyac-ARMS2,可以准确区分上述复等位基因型,且具有操作简单、耗费较低的特点。利用新开发标记对辽宁省育成的部分水稻品种进行Wx基因型检测的结果表明,40份辽宁育成品种均携带Wxb基因,遗传基础单一。上述结果为利用Wx基因位点的分子标记培育中低直链淀粉含量的水稻品种,改良辽宁省水稻品种的食味品质提供了技术支撑。 展开更多
关键词 水稻 蜡质基因 四引物扩增受阻突变体系 直链淀粉含量 稻米食味品质改良
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血浆EGFR基因突变检测在晚期非小细胞肺癌患者EGFR-TKI疗效评估中的价值 被引量:9
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作者 冯卫能 张华 +3 位作者 陈泽程 唐溢聪 梁剑苗 邓燕明 《山东医药》 CAS 北大核心 2017年第13期17-19,共3页
目的探讨血浆表皮生长因子受体(EGFR)突变状态检测在晚期非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体酪氨酸酶抑制剂(EGFR-TKI)疗效评估中的价值。方法应用扩增阻滞突变系统(ARMS)法检测70例晚期非小细胞肺癌患者肿瘤组织及血浆的EGFR突变状态。... 目的探讨血浆表皮生长因子受体(EGFR)突变状态检测在晚期非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体酪氨酸酶抑制剂(EGFR-TKI)疗效评估中的价值。方法应用扩增阻滞突变系统(ARMS)法检测70例晚期非小细胞肺癌患者肿瘤组织及血浆的EGFR突变状态。以肿瘤组织中的EGFR突变状态检测为对照,计算血浆中EGFR突变状态检测的敏感性、特异性、一致性,并比较两种检测对患者EGFR-TKI疗效及预后评估的差异。结果以配对的肿瘤组织EGFR突变检测结果为对照,ARMS法检测血浆EGFR突变的敏感性、一致性及特异性分别为58.1%、72.9%、96.3%。在38例经过EGFR-TKI治疗的患者中,肿瘤组织EGFR突变型患者的有效率及中位无进展生存期均优于EGFR野生型患者(有效率:69%比11.1%,P=0.005;无进展生存期:10个月比3个月,P=0.003)。血浆EGFR突变型患者与肿瘤组织EGFR突变型患者的有效率及中位无进展生存期均相似(有效率:P=0.908;中位无进展生存期:P=0.593)。在血浆标本中,EGFR突变型患者的中位无进展生存期长于EGFR野生型患者(10个月比7个月,P=0.032)。EGFR突变型患者的有效率高于EGFR野生型患者,但差异无统计学意义(70.6%比42.9%,P=0.111)。结论血浆EGFR突变可预测晚期非小细胞肺癌患者EGFR-TKI疗效,但因较高的假阴性率,血浆EGFR野生型患者需应用肿瘤组织进一步检测。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 扩增阻滞突变系统 表皮生长因子受体 循环肿瘤DNA
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ARMS技术联合Taqman探针检测100例非小细胞肺癌EGFR基因突变 被引量:8
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作者 赵静 赵金银 +5 位作者 赵肖 陈唯军 钟巍 张力 李龙芸 王孟昭 《中国肺癌杂志》 CAS 北大核心 2013年第1期25-32,共8页
背景与目的表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突变是决定表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR tyrosine kinase inhibitor,EGFR-TKI)疗效最重要的预测因子,对EGFR基因突变进行检测,对指导患者个体化治疗... 背景与目的表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突变是决定表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR tyrosine kinase inhibitor,EGFR-TKI)疗效最重要的预测因子,对EGFR基因突变进行检测,对指导患者个体化治疗具有重要意义。EGFR基因突变检测方法有很多,每种方法各有优缺点,本研究拟采用扩增阻滞突变系统(ampli cation refractory mutation system,ARMS)技术与Taqman探针相结合的方法,建立一种能快速、敏感及特异检测非小细胞肺癌EGFR基因突变的方法。方法首先,应用Primer Premier5.0软件在EGFR基因E746_A750和L858R处设计ARMS引物及Taqman水解探针。然后,以包含E746_A750缺失和L858R点突变的质粒为研究对象,进一步分析所建立方法的灵敏度、敏感性以及特异性。最后,用所建立的ARMS-Taqman法检测100例非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)临床标本。结果在无背景DNA干扰的情况下,ARMS-Taqman法检测灵敏度可达10copies。对于检测敏感性,在500copies/L野生型基因背景下,其敏感性达1%;在5,000copies/l野生型基因背景下,其敏感性高达0.1%-0.5%。对于检测特异性,以正常人白细胞DNA为研究对象,21L858R突变存在一定程度的非特异性扩增,但其最小Ct高达14.89,而19Del未见非特异性扩增。对100份临床标本进行检测,19Del21例,21L858R18例,总突变率为39.0%。结论我们所构建的ARMS-Taqman法是一种快速、简便以及具有较高灵敏度和特异性的EGFR基因突变检测方法,值得在临床上进一步推广和验证。 展开更多
关键词 扩增阻滞突变系统 TAQMAN探针 表皮生长因子受体 突变检测 肺肿瘤
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云南地区非小细胞肺癌EGFR、ALK和ROS1基因突变联合检测 被引量:8
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作者 王娟 苏国苗 +3 位作者 潘国庆 边莉 杨哲 曾定涛 《昆明医科大学学报》 CAS 2020年第9期1-6,共6页
目的探讨云南地区非小细胞肺癌(NSCLC)患者表皮生长因子受体(epidermic growth factor receptor,EGFR)、间变性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase,ALK)和C-ros原癌基因1酪氨酸激酶(C-ros oncogene 1-receptor tyrosine kinase,ROS1... 目的探讨云南地区非小细胞肺癌(NSCLC)患者表皮生长因子受体(epidermic growth factor receptor,EGFR)、间变性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase,ALK)和C-ros原癌基因1酪氨酸激酶(C-ros oncogene 1-receptor tyrosine kinase,ROS1)驱动基因突变特点及其与临床病理特征的关系。方法收集昆明医科大学第一附属医院2016年7月至2019年7月212例NSCLC的肿瘤组织和临床病理资料,采用扩增阻滞突变系统(amplification refractory mutation system,ARMS)检测EGFR、ALK、ROS1三基因突变状态,统计分析其突变率及与临床病理特征的关系。结果云南地区212例NSCLC中EGFR基因突变率50.9%(108/212),以19-del和21号外显子L858R位点突变为主型(76.0%),多见于女性、无吸烟史及腺癌患者(P<0.05),与年龄大小无关(P>0.05),其中宣威地区发现G719X与S768I位点少见双突变(12.0%),可能与民族、遗传背景、环境等有相关性,有待进一步跟踪调查;ALK融合基因突变率为4.70%(10/212),ROS1融合基因突变率为1.89%(4/212),两基因突变均与患者性别、年龄、吸烟史及组织学类型无关(P>0.05)。结论云南地区NSCLC患者均可发生EGFR、ALK和ROS1基因突变,其中以EGFR基因突变率最高,ALK基因突变次之,ROS1基因突变最低;EGFR突变多见于女性、无吸烟史及腺癌患者,以19-del和21号外显子L858R位点突变为主型,宣威地区发现G719X与S768I位点少见双突变,有待进一步跟踪研究;ALK、ROS1融合基因突变与患者性别、年龄、吸烟史及组织学类型均无相关性。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 表皮生长因子受体 间变性淋巴瘤激酶 C-ros原癌基因1酪氨酸激酶 扩增阻滞突变系统
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应用扩增不应突变系统技术对β-地中海贫血行快速产前基因诊断 被引量:7
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作者 傅俊江 李麓芸 +1 位作者 李秀蓉 卢光琇 《中华妇产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第6期359-360,共2页
关键词 Β-地中海贫血 产前基因诊断 扩增不应突变系统
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利用四引物扩增受阻突变体系PCR技术检测水稻光温敏核不育基因p/tms12-1 被引量:8
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作者 李军 李白 高荣村 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期442-446,共5页
根据p/tms12-1基因存在的单核苷酸变异,利用四引物扩增受阻突变体系PCR(Tetra-primer ARMS-PCR)的方法设计特异引物,对11个两系不育系水稻品种(或品系)以及2个常规稻品系进行扩增。根据其PCR产物带型,可以准确鉴定光温敏核不育基因p/tms... 根据p/tms12-1基因存在的单核苷酸变异,利用四引物扩增受阻突变体系PCR(Tetra-primer ARMS-PCR)的方法设计特异引物,对11个两系不育系水稻品种(或品系)以及2个常规稻品系进行扩增。根据其PCR产物带型,可以准确鉴定光温敏核不育基因p/tms12-1的基因型,其检测结果与通过CAPS标记检测的结果完全一致。该方法成本低、简单、可靠,可用于p/tms12-1基因的鉴定和分子标记辅助育种。 展开更多
关键词 水稻 光温敏核不育 p/tms12-1基因 四引物扩增受阻突变体系PCR
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