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胰腺癌不同分期的差异基因筛选及关键蛋白调控基因的预后分析
被引量:
2
1
作者
韩伟光
王青
《空军军医大学学报》
CAS
2023年第5期432-437,共6页
目的分析胰腺癌低分期组和高分期组差异表达基因和相关富集通路,结合预后信息探讨关键调控蛋白在胰腺癌发展中的作用,为更深入理解高分期组胰腺癌的分子机制提供理论支持。方法本研究使用TCGA数据库中不同肿瘤分期胰腺癌转录组数据来筛...
目的分析胰腺癌低分期组和高分期组差异表达基因和相关富集通路,结合预后信息探讨关键调控蛋白在胰腺癌发展中的作用,为更深入理解高分期组胰腺癌的分子机制提供理论支持。方法本研究使用TCGA数据库中不同肿瘤分期胰腺癌转录组数据来筛选差异表达基因,并对其进行功能富集分析和蛋白质互作网络构建。随后使用Cytoscape软件进行可视化和模块挖掘,最终对得到的关键蛋白调控基因进行生存分析。结果共筛选出差异基因277个,其中上调基因30个,下调基因247个。差异基因主要与消化作用、体液免疫反应、肠道胆固醇吸收及某些物质代谢过程等有关,与血液微粒和内质网腔等细胞组分有关,与丝氨酸相关酶活性、糖的结合和甘油三酸酯脂肪酶活性等分子功能有关。KEGG通路主要与胰腺分泌物、蛋白质消化吸收和脂肪消化吸收等有关。预后分析表明CPA1和AMY2B基因的表达水平与胰腺癌患者总生存时间显著相关(P<0.05)。结论关键蛋白调控基因CPA1和AMY2B在不同分期胰腺癌的发生和预后中紧密相关,为未来胰腺癌高分期患者精准治疗提供了新思路。
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关键词
胰腺癌
肿瘤分期
差异表达基因
关键蛋白调控基因
总
生存曲线
下载PDF
职称材料
不同人种乳腺癌的差异表达基因及关键蛋白调控基因预后分析
2
作者
梁宝宝
黄晶晶
+5 位作者
林帅
毛国超
周章剑
王亚晨
康华峰
张淑群
《国际检验医学杂志》
CAS
2021年第23期2914-2918,共5页
目的分析不同人种乳腺癌的差异表达基因及关键蛋白调控基因与预后的关系。方法基于TCGA数据库中不同人种乳腺癌转录组表达谱来筛选差异表达基因,并进行基因本体论注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。应用STRING数据库构建...
目的分析不同人种乳腺癌的差异表达基因及关键蛋白调控基因与预后的关系。方法基于TCGA数据库中不同人种乳腺癌转录组表达谱来筛选差异表达基因,并进行基因本体论注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。应用STRING数据库构建蛋白质互相作用网络,并在Cytoscape软件中进行可视化和模块挖掘,获取关键蛋白调控基因。结合对应的临床信息使用R软件对这些关键蛋白调控基因绘制生存曲线进行验证。结果共筛选出差异表达基因894个,其中上调基因875个,下调基因19个。差异表达基因主要与角化作用、表皮细胞分化等生物学过程有关,与角质化包膜、中间丝细胞骨架、角蛋白丝等细胞组分有关,与皮肤表皮的结构成分、葡萄糖醛酸转移酶活性等分子功能有关。KEGG通路主要与细胞色素P450代谢异种生物、戊糖和葡萄糖醛酸转换、化学致癌作用等有关。结论关键蛋白调控基因CASP14、MYF6、ALB与不同人种乳腺癌的发生和预后有紧密的关系,为精准治疗提供了新思路。
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关键词
乳腺癌
差异表达基因
关键蛋白调控基因
总
生存曲线
下载PDF
职称材料
题名
胰腺癌不同分期的差异基因筛选及关键蛋白调控基因的预后分析
被引量:
2
1
作者
韩伟光
王青
机构
空军军医大学唐都医院普通外科
出处
《空军军医大学学报》
CAS
2023年第5期432-437,共6页
基金
陕西省重点研发计划项目(2022ZDLSF04-05)。
文摘
目的分析胰腺癌低分期组和高分期组差异表达基因和相关富集通路,结合预后信息探讨关键调控蛋白在胰腺癌发展中的作用,为更深入理解高分期组胰腺癌的分子机制提供理论支持。方法本研究使用TCGA数据库中不同肿瘤分期胰腺癌转录组数据来筛选差异表达基因,并对其进行功能富集分析和蛋白质互作网络构建。随后使用Cytoscape软件进行可视化和模块挖掘,最终对得到的关键蛋白调控基因进行生存分析。结果共筛选出差异基因277个,其中上调基因30个,下调基因247个。差异基因主要与消化作用、体液免疫反应、肠道胆固醇吸收及某些物质代谢过程等有关,与血液微粒和内质网腔等细胞组分有关,与丝氨酸相关酶活性、糖的结合和甘油三酸酯脂肪酶活性等分子功能有关。KEGG通路主要与胰腺分泌物、蛋白质消化吸收和脂肪消化吸收等有关。预后分析表明CPA1和AMY2B基因的表达水平与胰腺癌患者总生存时间显著相关(P<0.05)。结论关键蛋白调控基因CPA1和AMY2B在不同分期胰腺癌的发生和预后中紧密相关,为未来胰腺癌高分期患者精准治疗提供了新思路。
关键词
胰腺癌
肿瘤分期
差异表达基因
关键蛋白调控基因
总
生存曲线
Keywords
pancreatic cancer
tumor staging
differentially expressed genes
key protein regulatory genes
overall survival curve
分类号
R735.9 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
不同人种乳腺癌的差异表达基因及关键蛋白调控基因预后分析
2
作者
梁宝宝
黄晶晶
林帅
毛国超
周章剑
王亚晨
康华峰
张淑群
机构
西安交通大学第二附属医院肿瘤科
西安交通大学第二附属医院普通外科
西安交通大学第二附属医院皮肤科
出处
《国际检验医学杂志》
CAS
2021年第23期2914-2918,共5页
文摘
目的分析不同人种乳腺癌的差异表达基因及关键蛋白调控基因与预后的关系。方法基于TCGA数据库中不同人种乳腺癌转录组表达谱来筛选差异表达基因,并进行基因本体论注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。应用STRING数据库构建蛋白质互相作用网络,并在Cytoscape软件中进行可视化和模块挖掘,获取关键蛋白调控基因。结合对应的临床信息使用R软件对这些关键蛋白调控基因绘制生存曲线进行验证。结果共筛选出差异表达基因894个,其中上调基因875个,下调基因19个。差异表达基因主要与角化作用、表皮细胞分化等生物学过程有关,与角质化包膜、中间丝细胞骨架、角蛋白丝等细胞组分有关,与皮肤表皮的结构成分、葡萄糖醛酸转移酶活性等分子功能有关。KEGG通路主要与细胞色素P450代谢异种生物、戊糖和葡萄糖醛酸转换、化学致癌作用等有关。结论关键蛋白调控基因CASP14、MYF6、ALB与不同人种乳腺癌的发生和预后有紧密的关系,为精准治疗提供了新思路。
关键词
乳腺癌
差异表达基因
关键蛋白调控基因
总
生存曲线
Keywords
breast cancer
differentially expressed genes
key protein regulatory genes
overall survival curve
分类号
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
胰腺癌不同分期的差异基因筛选及关键蛋白调控基因的预后分析
韩伟光
王青
《空军军医大学学报》
CAS
2023
2
下载PDF
职称材料
2
不同人种乳腺癌的差异表达基因及关键蛋白调控基因预后分析
梁宝宝
黄晶晶
林帅
毛国超
周章剑
王亚晨
康华峰
张淑群
《国际检验医学杂志》
CAS
2021
0
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职称材料
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