人腺病毒C亚属(Human mastadenovirus species C,HAdV-C)是呼吸系统疾病最常见的病原体。本文从辽宁省2015年急性弛缓性麻痹(AFP)监测病例的粪便标本中分离出一株HAdV-C的重组毒株LN2015,对其全基因组序列进行了测序和分析,并对HAdV-C...人腺病毒C亚属(Human mastadenovirus species C,HAdV-C)是呼吸系统疾病最常见的病原体。本文从辽宁省2015年急性弛缓性麻痹(AFP)监测病例的粪便标本中分离出一株HAdV-C的重组毒株LN2015,对其全基因组序列进行了测序和分析,并对HAdV-C的分子进化机制进行了研究。我们从GenBank数据库中选取了77条代表各个地区各个年份毒株的全(近)基因组序列,以猴腺病毒SAdV-40.1和SAdV-42.1为外类群,分别构建了基于邻接法和最大似然法的系统发育树,并用软件simplot3.5.1对基因组特征进行分析。结果表明,LN2015与北京株BJ09(MF315029)序列一致性最高,其Penton base、DBP、pV、pVI和HAdV-1相似,Hexon和Fiber为HAdV-2,3’端的E1B和5’的E4和HAdV-5相似,其基因型为P1H2F2。在两个系统发育树中,HAdV-2都聚为5个不同的谱系,每个谱系几乎都没有HAdV-6基因的参与,因此推测出HAdV-C的一条进化路线,即先由HAdV-5(或其共同祖先病毒)进化出HAdV-1,然后再进化出HAdV-2。HAdV-6和HAdV-2是HAdV-C两条独立的进化分支。未来有必要对HAdV-C的进化和变异进行更深入的研究。展开更多
文摘人腺病毒C亚属(Human mastadenovirus species C,HAdV-C)是呼吸系统疾病最常见的病原体。本文从辽宁省2015年急性弛缓性麻痹(AFP)监测病例的粪便标本中分离出一株HAdV-C的重组毒株LN2015,对其全基因组序列进行了测序和分析,并对HAdV-C的分子进化机制进行了研究。我们从GenBank数据库中选取了77条代表各个地区各个年份毒株的全(近)基因组序列,以猴腺病毒SAdV-40.1和SAdV-42.1为外类群,分别构建了基于邻接法和最大似然法的系统发育树,并用软件simplot3.5.1对基因组特征进行分析。结果表明,LN2015与北京株BJ09(MF315029)序列一致性最高,其Penton base、DBP、pV、pVI和HAdV-1相似,Hexon和Fiber为HAdV-2,3’端的E1B和5’的E4和HAdV-5相似,其基因型为P1H2F2。在两个系统发育树中,HAdV-2都聚为5个不同的谱系,每个谱系几乎都没有HAdV-6基因的参与,因此推测出HAdV-C的一条进化路线,即先由HAdV-5(或其共同祖先病毒)进化出HAdV-1,然后再进化出HAdV-2。HAdV-6和HAdV-2是HAdV-C两条独立的进化分支。未来有必要对HAdV-C的进化和变异进行更深入的研究。