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广西3个猪种线粒体DNA D-loop序列遗传多样性及系统进化研究 被引量:8
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作者 綦文晶 何剑雄 +5 位作者 郭晓萍 兰干球 谢文斌 蒋钦杨 杨秀荣 郭亚芬 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期2367-2374,共8页
本研究旨在了解广西石头猪、德保猪和隆林猪的起源、群体遗传结构和亲缘关系。通过PCR扩增和测序技术获得3个群体61个个体的线粒体D-loop序列,采用DNASP 5.0进行多态性分析,MEGA 6.0计算各品种间的遗传距离及构建系统发育树。结果显示,... 本研究旨在了解广西石头猪、德保猪和隆林猪的起源、群体遗传结构和亲缘关系。通过PCR扩增和测序技术获得3个群体61个个体的线粒体D-loop序列,采用DNASP 5.0进行多态性分析,MEGA 6.0计算各品种间的遗传距离及构建系统发育树。结果显示,3个猪种mtDNA D-loop区全长1 124~1 325 bp,石头猪和德保猪的中间重复序列变异仅存在A型,隆林猪存在A型和B型;石头猪mtDNA D-loop区8个多态性位点归纳出10种单倍型,德保猪8个多态性位点归纳出5种单倍型,隆林猪11个多态性位点归纳出9种单倍型;3种猪单倍型多样度分别为0.857、0.81和0.917,核算多样度分别为0.002 29、0.002 9和0.002 83。石头猪和德保猪可能有相同的母源血统,隆林猪可能有2种母系起源;3个品种猪单倍型多样性较为丰富,但核苷酸多样性匮乏,亟需进行科学保护。 展开更多
关键词 石头 德保 隆林 线粒体DNA D-LOOP 遗传多样性 系统进化
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基于iTRAQ技术挖掘德保猪睾丸内调控繁殖的关键蛋白
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作者 马原鼎 郑钧文 +1 位作者 曾素先 黎宗强 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2023年第4期58-63,129,130,共8页
为了筛选德保猪性成熟前后睾丸中差异表达蛋白(differentially expressed proteins,DEPs),试验选取相同饲养环境下的健康且无亲缘关系的1月龄(性成熟前)与6月龄(性成熟后)德保公猪各3头,采集它们的睾丸并提取蛋白质,利用同位素标记相对... 为了筛选德保猪性成熟前后睾丸中差异表达蛋白(differentially expressed proteins,DEPs),试验选取相同饲养环境下的健康且无亲缘关系的1月龄(性成熟前)与6月龄(性成熟后)德保公猪各3头,采集它们的睾丸并提取蛋白质,利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术对性成熟前后德保猪睾丸中DEPs进行分析,并对DEPs在GO、KOG、KEGG数据库中进行功能注释及通路分析。结果表明:在性成熟前后德保猪睾丸中共鉴定7767个蛋白,筛选出611个DEPs,其中在性成熟后德保猪中显著上调的DEPs 347个,显著下调的DEPs 264个;397个蛋白在GO数据库中得到注释,并富集到53条GO term中,包括细胞过程、生物调节、代谢过程、催化活性等信号通路;409个蛋白在KOG数据库中得到注释,并富集到24种功能,包括信号转导机制、翻译后修饰、蛋白周转、监督等功能;329个蛋白在KEGG数据库得到注释,并富集到287条通路中,包括代谢途径通路、吞噬体、补体与凝血级联反应、肺结核、PI3K-Akt通路等;筛选出4个与繁殖相关的DEPs,包括脂联素(adiponectin)、AQP7、ODF1、磷酸甘油酸激酶2(PGK2),这4个DEPs在精子发生和成熟、保护精子完整性及维持精子活力与功能方面起重要作用。 展开更多
关键词 iTRAQ技术 德保 睾丸 差异表达蛋白 生物学信息
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德保猪的繁殖性能研究
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作者 谭冰冰 袁依依 +3 位作者 杨日旺 胡效东 唐雯丽 黎宗强 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2023年第8期43-47,135,共6页
为了研究德保猪的繁殖性能,试验采集了75,82,113,115,120日龄德保母猪卵巢,利用石蜡切片方法对德保母猪的初情期进行研究;选择8头后备德保母猪和9头经产德保母猪对其发情周期进行研究;统计20头初产德保母猪和5头经产德保母猪的产仔数据... 为了研究德保猪的繁殖性能,试验采集了75,82,113,115,120日龄德保母猪卵巢,利用石蜡切片方法对德保母猪的初情期进行研究;选择8头后备德保母猪和9头经产德保母猪对其发情周期进行研究;统计20头初产德保母猪和5头经产德保母猪的产仔数据,计算母猪窝平均产仔数、仔猪平均出生重、公母比例(公∶母)、出生存活率和35 d断奶存活率;观察14头德保小公猪的爬跨行为对其初次爬跨行为进行研究;采集15,26,28,30,32,34,36,38,40,42,43,44,45,46,47,49,51,53,55,62,70日龄德保公猪睾丸,利用石蜡切片方法对德保公猪睾丸初次产生精子的日龄进行了研究。结果表明:德保母猪的初情期在120日龄左右,后备和经产德保母猪发情周期分别为(26.00±2.00)d和(23.89±1.97)d,差异显著(P<0.05);初产德保母猪的窝平均产仔数为(7.45±1.80)头,显著小于经产德保母猪[(10.00±2.10)头,P<0.05],但初产德保母猪的仔猪平均出生重、公母比例(公∶母)、出生存活率、35 d断奶存活率与经产德保母猪差异不显著(P>0.05);德保小公猪最早出现爬跨的日龄是8日龄;德保公猪睾丸初次产生精子的日龄是45日龄。说明德保母猪具有发情周期长的特点,德保公猪是较早出现爬跨行为、曲细精管较早出现精子的品种之一,具有明显的性早熟特征。 展开更多
关键词 德保 初情期 发情周期 产仔特性 初次爬跨行为 精子
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广西德保猪抵抗素基因的克隆与分析 被引量:3
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作者 廖玲玲 李俊 +3 位作者 杨厚德 刘庆友 谢炳坤 崔奎青 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期1276-1280,共5页
【目的】克隆广西德保猪抵抗素(Resistin,RENT)基因并进行系统生物信息学分析,阐明德保猪脂肪细胞分化与脂肪生成的分子机制。【方法】根据NCBI已公布的猪RENT基因序列(NM_213783.2)设计特异性引物,以从德保猪血液中提取的总RNA为模板,... 【目的】克隆广西德保猪抵抗素(Resistin,RENT)基因并进行系统生物信息学分析,阐明德保猪脂肪细胞分化与脂肪生成的分子机制。【方法】根据NCBI已公布的猪RENT基因序列(NM_213783.2)设计特异性引物,以从德保猪血液中提取的总RNA为模板,PCR扩增RENT基因序列,T-A克隆至pEASY-T1载体后进行测序分析,并将所得测序结果用BLAST程序、MEGA 5.0软件、EXPASY服务器、SMART程序、SignIP程序、Softberry服务器和DNASTAR软件进行生物信息学分析。【结果】扩增获得468 bp的RENT基因序列片段,包含全长的德保猪RENT基因编码区和部分非编码区序列。多重序列比较分析结果显示,德保猪RENT基因编码区核酸序列与猪、牛、山羊、绵羊、人、兔、猕猴和豚鼠的同源性分别为100.0%、85.5%、85.5%、84.5%、81.2%、80.3%、80.0%和77.3%。德保猪RENT蛋白结构预测结果显示,其理论分子质量11.69 ku,等电点7.82,为弱碱性蛋白;N-末端存在信号肽,定位于胞质外,仅具有1个低复杂度结构域,包含1个α-螺旋、8个β-折叠、7个T-转角及两个无规则卷曲。【结论】RENT基因在德保猪中呈高度保守特征,是其脂肪细胞分化中的重要调控基因。 展开更多
关键词 德保 RENT基因 克隆 基因功能分析 同源性 蛋白结构预测
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德保猪饲养管理技术 被引量:2
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作者 秦谦涛 《中国畜禽种业》 2020年第10期132-133,共2页
德保猪原产于德保县,是一种具有耐粗饲、抗病力强及适应性广泛的优良黑猪品种。由于德保猪的优良性状,自上世纪90年代开始,德保猪母猪绝大多数均用于猪只的杂种改良工作,导致德保猪群体数量急剧下降,德保公猪的数量更是濒临灭绝。对德... 德保猪原产于德保县,是一种具有耐粗饲、抗病力强及适应性广泛的优良黑猪品种。由于德保猪的优良性状,自上世纪90年代开始,德保猪母猪绝大多数均用于猪只的杂种改良工作,导致德保猪群体数量急剧下降,德保公猪的数量更是濒临灭绝。对德保猪的饲养管理技术进行介绍,旨在为德保猪数量的提高及生猪遗传资源的保护提供帮助。 展开更多
关键词 德保 饲养管理 耐粗饲 优良性状 遗传资源
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广西德保猪MC1R基因的克隆与分析 被引量:2
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作者 杨厚德 林宇纾 +4 位作者 廖玲玲 刘庆友 石德顺 谢炳坤 崔奎青 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期88-93,共6页
近年来含有天然黑色素的动植物黑色食品得到青睐,为探讨广西地方品种德保猪全黑毛色形成的分子机制,本文克隆了广西德保猪MC1R基因并进行了系统生物信息学分析。根据NCBI已公布的猪MC1R基因序列(GI:347618788)设计特异性引物,以从德保... 近年来含有天然黑色素的动植物黑色食品得到青睐,为探讨广西地方品种德保猪全黑毛色形成的分子机制,本文克隆了广西德保猪MC1R基因并进行了系统生物信息学分析。根据NCBI已公布的猪MC1R基因序列(GI:347618788)设计特异性引物,以从德保猪血液中提取的基因组DNA为模板,通过PCR扩增克隆获得长1 519 bp的MC1R基因序列片段。多重序列比较结果显示克隆片段与已公布的猪、牛、人、狗、绵羊、小鼠和鸡的相似性依次分别为99%、87%、86%、85%、84%、81%和77%,表明MC1R基因在不同哺乳动物间具有较高的保守型。德保猪MC1R蛋白结构预测结果显示,其理论分子质量为34.65 ku,等电点为8.70,为弱碱性蛋白,N-末端不存在信号肽,定位于细胞质膜,具有1个低复杂度结构域和7个跨膜结构域,具有典型的细胞膜受体蛋白结构。多项研究报道表明MC1R基因是动物毛皮颜色重要的决定基因,德保猪MC1R基因克隆为揭示其全黑色形成的分子机制奠定了较好的实验基础。 展开更多
关键词 德保 黑素皮质激素1受体 毛色
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