通过网络药理学方法探讨逍遥散对动脉粥样硬化和抑郁症的"异病同治"的作用机制。通过TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform)、SymMap数据库检索逍遥散中8味中药相关的所...通过网络药理学方法探讨逍遥散对动脉粥样硬化和抑郁症的"异病同治"的作用机制。通过TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform)、SymMap数据库检索逍遥散中8味中药相关的所有化学成分和作用靶点,经初步筛选后构建"中药-化合物-靶点"作用网络,通过DisGeNET、CTD(Comparative Toxicogenomics Database)和TTD(Therapeutic Target Database)数据库获取动脉粥样硬化和抑郁症的相关基因,将药物作用靶点和疾病基因靶点整合获得共有靶点,使用STRING 11.0和Cytoscape进行共有靶点的蛋白质间相互作用分析筛选关键共有靶点,应用BioGPS获取其在器官组织的分布信息,并使用Metascape对关键共有靶点进行基因本体(gene ontology,GO)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。结果显示,检索到逍遥散化合物共1355个,据口服生物利用度≥30%和类药性指数≥0.18标准筛选出161个活性化合物,获得274个药物作用靶点,构建"中药-化合物-靶点"作用网络;检索到动脉粥样硬化疾病基因靶点共1004个,抑郁症578个,通过与药物作用靶点取交集后获得37个共有靶点;使用STRING和Cytoscape进行共有靶点的蛋白质间相互作用分析筛选关键共有靶点18个,BioGPS显示关键共有靶点主要分布在心脏、杏仁核、松果体、肝脏、平滑肌中;Metascape进行GO功能富集分析得到生物过程929个、细胞组成25个、分子功能23个,KEGG富集分析获得108条信号通路,靠前排序的信号通路如AGE-RAGE,HIF-1,FoxO,Th17细胞分化和IL-17信号通路,主要与神经内分泌、代谢、免疫炎症以及氧化应激相关。该研究表明,逍遥散"异病同治"动脉粥样硬化和抑郁症的主要机制涉及神经内分泌、代谢、免疫炎症以及氧化应激相关信号通路,为进一步试验验证、潜在药理学机制及临床拓展应用提供参考依据。展开更多
目的以经典名方桃红四物汤养血、活血、逐瘀功效为核心,通过构建"成分-靶点-通路-疾病"作用网络探讨其临床异病同治的作用机制。方法利用生物科学与网络药理学平台、蛋白数据库和String数据库收集桃红四物汤化学成分及其相关...目的以经典名方桃红四物汤养血、活血、逐瘀功效为核心,通过构建"成分-靶点-通路-疾病"作用网络探讨其临床异病同治的作用机制。方法利用生物科学与网络药理学平台、蛋白数据库和String数据库收集桃红四物汤化学成分及其相关靶点数据,建立"成分-靶点"作用网络;基于筛选得到的靶点,对桃红四物汤治疗的疾病进行关联分析,建立"靶点-疾病"网络;进而开展基因本体论(gene ontology,GO)和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析桃红四物汤治疗疾病的关键通路;同时将筛选得到的关键有效成分和核心靶点进行分子对接验证,综合探讨桃红四物汤在临床上异病同治的复杂作用网络。结果从桃红四物汤中筛选出40个活性化合物,其中32个成分涉及221个相关靶点、286种相关疾病。其中阿魏酸、山柰酚、槲皮素、丹皮酚、芍药苷、藁本内酯、咖啡酸能匹配到较多靶点。预测到桃红四物汤可治疗疾病主要包括3大类,分别为癌症相关疾病(乳腺癌、前列腺癌等)、心血管疾病(高血压、心肌梗死、心脏衰竭)、神经系统疾病;核心靶点蛋白涉及RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、血清白蛋白、白细胞介素17、血管内皮生长因子A、转录因子AP-1等;KEGG信号涉及促进肿瘤细胞凋亡和抑制肿瘤增生、免疫调节、血液循环系统调节、内分泌调节等多种生物过程的165条通路。结论构建了桃红四物汤"成分-靶点-通路-疾病"之间的关联,一定程度上揭示桃红四物汤多成分、多靶点的复杂作用机制,为经典名方桃红四物汤的临床广泛应用提供理论基础。展开更多
文摘通过网络药理学方法探讨逍遥散对动脉粥样硬化和抑郁症的"异病同治"的作用机制。通过TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform)、SymMap数据库检索逍遥散中8味中药相关的所有化学成分和作用靶点,经初步筛选后构建"中药-化合物-靶点"作用网络,通过DisGeNET、CTD(Comparative Toxicogenomics Database)和TTD(Therapeutic Target Database)数据库获取动脉粥样硬化和抑郁症的相关基因,将药物作用靶点和疾病基因靶点整合获得共有靶点,使用STRING 11.0和Cytoscape进行共有靶点的蛋白质间相互作用分析筛选关键共有靶点,应用BioGPS获取其在器官组织的分布信息,并使用Metascape对关键共有靶点进行基因本体(gene ontology,GO)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。结果显示,检索到逍遥散化合物共1355个,据口服生物利用度≥30%和类药性指数≥0.18标准筛选出161个活性化合物,获得274个药物作用靶点,构建"中药-化合物-靶点"作用网络;检索到动脉粥样硬化疾病基因靶点共1004个,抑郁症578个,通过与药物作用靶点取交集后获得37个共有靶点;使用STRING和Cytoscape进行共有靶点的蛋白质间相互作用分析筛选关键共有靶点18个,BioGPS显示关键共有靶点主要分布在心脏、杏仁核、松果体、肝脏、平滑肌中;Metascape进行GO功能富集分析得到生物过程929个、细胞组成25个、分子功能23个,KEGG富集分析获得108条信号通路,靠前排序的信号通路如AGE-RAGE,HIF-1,FoxO,Th17细胞分化和IL-17信号通路,主要与神经内分泌、代谢、免疫炎症以及氧化应激相关。该研究表明,逍遥散"异病同治"动脉粥样硬化和抑郁症的主要机制涉及神经内分泌、代谢、免疫炎症以及氧化应激相关信号通路,为进一步试验验证、潜在药理学机制及临床拓展应用提供参考依据。
文摘目的以经典名方桃红四物汤养血、活血、逐瘀功效为核心,通过构建"成分-靶点-通路-疾病"作用网络探讨其临床异病同治的作用机制。方法利用生物科学与网络药理学平台、蛋白数据库和String数据库收集桃红四物汤化学成分及其相关靶点数据,建立"成分-靶点"作用网络;基于筛选得到的靶点,对桃红四物汤治疗的疾病进行关联分析,建立"靶点-疾病"网络;进而开展基因本体论(gene ontology,GO)和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析桃红四物汤治疗疾病的关键通路;同时将筛选得到的关键有效成分和核心靶点进行分子对接验证,综合探讨桃红四物汤在临床上异病同治的复杂作用网络。结果从桃红四物汤中筛选出40个活性化合物,其中32个成分涉及221个相关靶点、286种相关疾病。其中阿魏酸、山柰酚、槲皮素、丹皮酚、芍药苷、藁本内酯、咖啡酸能匹配到较多靶点。预测到桃红四物汤可治疗疾病主要包括3大类,分别为癌症相关疾病(乳腺癌、前列腺癌等)、心血管疾病(高血压、心肌梗死、心脏衰竭)、神经系统疾病;核心靶点蛋白涉及RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、血清白蛋白、白细胞介素17、血管内皮生长因子A、转录因子AP-1等;KEGG信号涉及促进肿瘤细胞凋亡和抑制肿瘤增生、免疫调节、血液循环系统调节、内分泌调节等多种生物过程的165条通路。结论构建了桃红四物汤"成分-靶点-通路-疾病"之间的关联,一定程度上揭示桃红四物汤多成分、多靶点的复杂作用机制,为经典名方桃红四物汤的临床广泛应用提供理论基础。
