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面向异步多时延基因调控网络建模的高阶动态贝叶斯网络模型及其结构学习算法
被引量:
1
1
作者
王广云
邹志康
+2 位作者
季秀才
田燕
牛天慧
《现代生物医学进展》
CAS
2014年第25期4958-4961,共4页
目的:由基因芯片数据精确学习建模具有异步多时延表达调控关系的基因调控网络。方法:提出了一种高阶动态贝叶斯网络模型,并给出了网络结构学习算法,该模型假定基因的调控过程为多阶马尔科夫过程,从而能够建模基因调控网络中的异步多时...
目的:由基因芯片数据精确学习建模具有异步多时延表达调控关系的基因调控网络。方法:提出了一种高阶动态贝叶斯网络模型,并给出了网络结构学习算法,该模型假定基因的调控过程为多阶马尔科夫过程,从而能够建模基因调控网络中的异步多时延特性。结果:由酵母基因调控网络一个子网络人工生成了加入10%含噪声的表达数据用于调控网络结构学习。在75%的后验概率下,本文提出的高阶动态贝叶斯网络模型能够正确建模实际网络中全部的异步多时延调控关系,而经典动态贝叶斯网络仅能够正确建模实际网络中1/3的调控关系;ROC曲线对比表明在各个后验概率水平上高阶动态贝叶斯网络模型的效果均优于经典动态贝叶斯网络。结论:本文提出的高阶动态贝叶斯网络模型能够精确学习建模具有异步多时延表达调控关系的基因调控网络。
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关键词
基因调控网络
异步
多
时延
高阶动态贝叶斯网络
学习算法
原文传递
题名
面向异步多时延基因调控网络建模的高阶动态贝叶斯网络模型及其结构学习算法
被引量:
1
1
作者
王广云
邹志康
季秀才
田燕
牛天慧
机构
空军总医院
北京交通大学计算所
出处
《现代生物医学进展》
CAS
2014年第25期4958-4961,共4页
基金
国家自然科学基金项目(81101177)
文摘
目的:由基因芯片数据精确学习建模具有异步多时延表达调控关系的基因调控网络。方法:提出了一种高阶动态贝叶斯网络模型,并给出了网络结构学习算法,该模型假定基因的调控过程为多阶马尔科夫过程,从而能够建模基因调控网络中的异步多时延特性。结果:由酵母基因调控网络一个子网络人工生成了加入10%含噪声的表达数据用于调控网络结构学习。在75%的后验概率下,本文提出的高阶动态贝叶斯网络模型能够正确建模实际网络中全部的异步多时延调控关系,而经典动态贝叶斯网络仅能够正确建模实际网络中1/3的调控关系;ROC曲线对比表明在各个后验概率水平上高阶动态贝叶斯网络模型的效果均优于经典动态贝叶斯网络。结论:本文提出的高阶动态贝叶斯网络模型能够精确学习建模具有异步多时延表达调控关系的基因调控网络。
关键词
基因调控网络
异步
多
时延
高阶动态贝叶斯网络
学习算法
Keywords
Gene regulatory network
Synchronous multi-time delay
High-order Dynamic Bayesian Network
Learning algorithm
分类号
Q332 [生物学—遗传学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
面向异步多时延基因调控网络建模的高阶动态贝叶斯网络模型及其结构学习算法
王广云
邹志康
季秀才
田燕
牛天慧
《现代生物医学进展》
CAS
2014
1
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
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