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乙酰胆碱酯酶抑制剂Corydaline的分子对接与开环衍生物的虚拟筛选
被引量：
5
1
作者
蒋玉仁
许慧
+1 位作者
陈芳军
马贯军
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009年第7期1379-1384,共6页
用分子对接软件GOLD,研究了延胡索类生物碱corydaline与乙酰胆碱酯酶的结合模型,并虚拟筛选了一系列具有不同碳链长度和取代基的开环衍生物以指导潜在高活性化合物的合成.分子对接结果表明,coryda-line与开口构象的酶结合可能性最大.结...
用分子对接软件GOLD,研究了延胡索类生物碱corydaline与乙酰胆碱酯酶的结合模型,并虚拟筛选了一系列具有不同碳链长度和取代基的开环衍生物以指导潜在高活性化合物的合成.分子对接结果表明,coryda-line与开口构象的酶结合可能性最大.结合模型显示,corydaline的A环与外周阴离子位点Tyr334产生π-π堆积;质子化氮原子与疏水位点Phe330产生阳离子-π作用;而D环上的甲氧基则深入到活性口袋底部占据催化位点.开环衍生物虚拟筛选发现,大部分化合物的得分均高于母体,得分排名前15位的化合物主要为被苄氧基等大基团取代且连接碳链长为2-7的衍生物.基于预测结果,合成了化合物7,其抑制活性为现有药物加兰他敏的3倍.
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关键词
Corydaline
乙酰胆碱酯酶
分子对接
开环
衍生物
虚拟筛选
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职称材料
一类新型罗非昔布开环衍生物抗炎构效关系
被引量：
3
2
作者
汪凤颖
李顺来
冯文林
《北京化工大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
2004年第6期84-87,共4页
用PM 3半经验量化方法优化了一类新型罗非昔布 (RC)开环衍生物与RC的几何构型 ;对其中 11个化合物搜寻和计算了它们的结构参数 ,采用多元逐步回归分析方法 ,建立了经典结构 活性关系 (2D QSAR) ;并用SOM FA2软件分析了全部化合物的 3D Q...
用PM 3半经验量化方法优化了一类新型罗非昔布 (RC)开环衍生物与RC的几何构型 ;对其中 11个化合物搜寻和计算了它们的结构参数 ,采用多元逐步回归分析方法 ,建立了经典结构 活性关系 (2D QSAR) ;并用SOM FA2软件分析了全部化合物的 3D QSAR关系。结构优化表明活性RC开环衍生物具有类似RC的立体结构 ,构效关系研究也表明该类新型RC开环衍生物具有其它环氧合酶选择性抑制剂相似的构效关系。
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关键词
罗非昔布
开环
衍生物
选择性环氧合酶抑制剂
定量构效关系
量子化学计算
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职称材料
题名
乙酰胆碱酯酶抑制剂Corydaline的分子对接与开环衍生物的虚拟筛选
被引量：
5
1
作者
蒋玉仁
许慧
陈芳军
马贯军
机构
中南大学化学化工学院
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009年第7期1379-1384,共6页
基金
国家自然科学基金(20876180)资助项目~~
文摘
用分子对接软件GOLD,研究了延胡索类生物碱corydaline与乙酰胆碱酯酶的结合模型,并虚拟筛选了一系列具有不同碳链长度和取代基的开环衍生物以指导潜在高活性化合物的合成.分子对接结果表明,coryda-line与开口构象的酶结合可能性最大.结合模型显示,corydaline的A环与外周阴离子位点Tyr334产生π-π堆积;质子化氮原子与疏水位点Phe330产生阳离子-π作用;而D环上的甲氧基则深入到活性口袋底部占据催化位点.开环衍生物虚拟筛选发现,大部分化合物的得分均高于母体,得分排名前15位的化合物主要为被苄氧基等大基团取代且连接碳链长为2-7的衍生物.基于预测结果,合成了化合物7,其抑制活性为现有药物加兰他敏的3倍.
关键词
Corydaline
乙酰胆碱酯酶
分子对接
开环
衍生物
虚拟筛选
Keywords
Corydaline
Acetylcholinesterase
Molecular docking
Open ring derivative
Virtual screening
分类号
R91 [医药卫生—药学]
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职称材料
题名
一类新型罗非昔布开环衍生物抗炎构效关系
被引量：
3
2
作者
汪凤颖
李顺来
冯文林
机构
北京化工大学理学院
出处
《北京化工大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
2004年第6期84-87,共4页
文摘
用PM 3半经验量化方法优化了一类新型罗非昔布 (RC)开环衍生物与RC的几何构型 ;对其中 11个化合物搜寻和计算了它们的结构参数 ,采用多元逐步回归分析方法 ,建立了经典结构 活性关系 (2D QSAR) ;并用SOM FA2软件分析了全部化合物的 3D QSAR关系。结构优化表明活性RC开环衍生物具有类似RC的立体结构 ,构效关系研究也表明该类新型RC开环衍生物具有其它环氧合酶选择性抑制剂相似的构效关系。
关键词
罗非昔布
开环
衍生物
选择性环氧合酶抑制剂
定量构效关系
量子化学计算
Keywords
Rofecoxib derivatives
cydoxygenase-2 inhibitor
quantitative structure-activity relationships(QSAR)
quantum chemistry calculation
分类号
O657.7 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
乙酰胆碱酯酶抑制剂Corydaline的分子对接与开环衍生物的虚拟筛选
蒋玉仁
许慧
陈芳军
马贯军
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009
5
下载PDF
职称材料
2
一类新型罗非昔布开环衍生物抗炎构效关系
汪凤颖
李顺来
冯文林
《北京化工大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
2004
3
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职称材料
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