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青海藏族人群HLA-DRB1基因与乙型肝炎预后的相关性 被引量:3
1
作者 任利 邓勇 +3 位作者 王海久 任宾 牛晓尧 樊海宁 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2011年第18期1899-1903,共5页
目的:研究HLA-DRB1基因与青海藏族乙型肝炎病毒(HBV)感染预后的相关性.方法:应用PCR-SSP对30例乙型肝炎后肝硬化患者(B组)、55例慢性乙型肝炎患者(C组)和15名健康体检者(A组)进行HLA-DRB1基因位点的检测,并比较分析.我们选取HLA-DRB1*03... 目的:研究HLA-DRB1基因与青海藏族乙型肝炎病毒(HBV)感染预后的相关性.方法:应用PCR-SSP对30例乙型肝炎后肝硬化患者(B组)、55例慢性乙型肝炎患者(C组)和15名健康体检者(A组)进行HLA-DRB1基因位点的检测,并比较分析.我们选取HLA-DRB1*03、*07、*12、*13、*15检测基因位点.结果:55个基因位点中只有HLA-DRB1*12差异显著,具有统计学意义,而其他基因位点差异不显著;而对HLA-DRB1*123组人群的两两比较,B组基因频率为90%,与A组(6.7%)相比显著性升高(P<0.0125,RR=13.5);C组基因频率为98.2%,与A组(6.7%)相比显著性升高(P<0.0125,RR=14);与B组(98.2%)相比,差异不显著(P>0.0125).结论:HLA-DRB1*12可能是藏族人群乙型肝炎易感基因,同时也可能是该人群乙型肝炎进展为肝硬化的关键位点. 展开更多
关键词 白细胞抗原 白细胞抗原-DRB1等位基因 序列特异性pcr 乙型肝炎 预后
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应用富含GC区SNP分型的序列特异性PCR新方法检测子宫内膜癌特定位点C729T多态性 被引量:1
2
作者 王彩凤 陈葳 李旭 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期986-992,共7页
目的建立适合富含GC区SNP分型的序列特异性PCR方法,分析子宫内膜癌特定ERα Exon3位点C729T多态性基因分型。方法选择22例子宫内膜癌患者与42例良性病患者为研究对象。建立富含GC区序列特异性PCR(SS-PCR)。将两对引物分别进行PCR扩增,... 目的建立适合富含GC区SNP分型的序列特异性PCR方法,分析子宫内膜癌特定ERα Exon3位点C729T多态性基因分型。方法选择22例子宫内膜癌患者与42例良性病患者为研究对象。建立富含GC区序列特异性PCR(SS-PCR)。将两对引物分别进行PCR扩增,所设计的两条特异性引物即内引物分别与DNA 双链的两条单链相同,其3′端正好与SNP位点重合,由引物的3′端控制着引物的延伸反应,根据延伸产物的条带确定SNP类型;并通过在引物的3′端区域倒数第3位引入一个人为不匹配碱基来提高延伸反应的特异性。应用该方法鉴别Exon3 SNP位点C729T基因型,并通过直接测序法验证。结果建立的序列特异性PCR方法适合富含GC区SNP分型,能够准确分析子宫内膜癌的特定ERα Exon3位点C729T多态性基因分型。结论富含GC区SNP分型的序列特异性PCR方法,可以用于子宫内膜癌的特定ERα Exon3位点C729T多态性基因分型。 展开更多
关键词 序列特异性pcr 子宫内膜癌 雌激素受体Α 单核苷酸多态性 直接测序
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应用环介导等温扩增法进行卡马西平安全用药监测 被引量:2
3
作者 王丽彬 孟玲 《中国现代应用药学》 CAS CSCD 2014年第5期574-577,共4页
目的建立环介导等温扩增法(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测卡马西平引起严重皮肤损害的标志基因HLA-B*1502的技术平台。方法对所收集的病例,分别应用LAMP和金标准SSP-PCR进行标志基因HLA-B*1502的检测,验证LAMP方法... 目的建立环介导等温扩增法(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测卡马西平引起严重皮肤损害的标志基因HLA-B*1502的技术平台。方法对所收集的病例,分别应用LAMP和金标准SSP-PCR进行标志基因HLA-B*1502的检测,验证LAMP方法的准确性。结果 LAMP和SSP-PCR检测38例对照组和2例药疹组患者基因型结果完全一致。结论 LAMP操作简单快捷,且准确可靠,可以在临床上广泛推广,提高卡马西平安全用药水平。 展开更多
关键词 卡马西平 SJS TEN HLA-B*1502 环介导等温扩增法 引物序列特异性pcr
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常见ABO抗原和稀有A2抗原同步基因分型的研究 被引量:9
4
作者 喻琼 梁延连 +3 位作者 邓志辉 吴国光 苏宇清 王大明 《中国输血杂志》 CAS CSCD 2006年第5期361-364,共4页
目的建立人类ABO血型系统的同步基因分型法研究ABO血型。方法采用PCR-SSP技术,设计合成13对序列特异性引物,摸索最佳退火温度,通过调整引物浓度、Mg2+浓度等,使ABO系统等位基因在同一条件下进行同步扩增和扩增产物在同一凝胶中进行同步... 目的建立人类ABO血型系统的同步基因分型法研究ABO血型。方法采用PCR-SSP技术,设计合成13对序列特异性引物,摸索最佳退火温度,通过调整引物浓度、Mg2+浓度等,使ABO系统等位基因在同一条件下进行同步扩增和扩增产物在同一凝胶中进行同步电泳;使用此方法,检测34例已知血清学ABO血型的与20例已知序列的A2亚型标本。结果用基因分型法检测出的ABO常见基因和A2基因,与已知血清学ABO分型结果相符合。结论该ABO基因分型方法适合中国人ABO基因常规鉴定与研究。 展开更多
关键词 ABO血型 人类 A2亚型 基因分型 序列特异性引物-pcr
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两种不同的KIR基因分型方法的对比研究 被引量:7
5
作者 金士正 甄建新 +2 位作者 何柳媚 徐筠娉 邓志辉 《国际输血及血液学杂志》 CAS 2012年第5期385-389,共5页
目的探讨常用的序列特异性引物-PCR(PCR—SSP)及流式序列特异性寡核苷酸探针(Flow-rSSO)杂交方法在杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR)框架基因分型结果中的符合率和准确性。方法随机选择2011年6月77例深圳造血干细胞捐献者的外周血... 目的探讨常用的序列特异性引物-PCR(PCR—SSP)及流式序列特异性寡核苷酸探针(Flow-rSSO)杂交方法在杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR)框架基因分型结果中的符合率和准确性。方法随机选择2011年6月77例深圳造血干细胞捐献者的外周血样,分别用PCR-ssp及Flow-rSSO商品化试剂盒进行KIR框架基因定型,分别通过凝胶电泳图及HLA Fusion 2.0 Research软件分析法,分析结果的一致性。对初检结果不一致的样本,采用同一厂家、不同批号的商品化试剂盒进行复检,并采用美国国立卫生研究院癌症研究所KIR PCR-SSP方法进行检测。结果77例样本中,75例完全一致,另2例(2.6%)KIR 2DL2的结果不一致,PCR—SSP方法对KIR 2DL2的初检、复检检测结果均为阴性,但用Flow-rSSO Lot#004批号试剂盒检测结果为阳性。更换新的Flow—rSSO Lot#005批号试剂盒复检,结果与PCR—SSP方法的检测结果相一致。结论为保证KIR基因分型的准确性,开展KIR基因分型的室内、室间质控工作至关重要。 展开更多
关键词 杀伤细胞免疫球蛋白样受体 流式序列特异性寡核苷酸探针 序列特异性引物-pcr KIR框架基因 基因分型
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应用Q-PCR定性检测KIR基因有无方法的建立
6
作者 李宇楠 甄建新 +2 位作者 梁爽 喻琼 邓志辉 《中国输血杂志》 CAS 2024年第6期660-665,共6页
目的建立定性检测KIR基因有无的Q-PCR方法。方法根据高分辨水平中国人群KIR等位基因的多态性,并参考国际IPD-KIR数据库,针对16种KIR基因及2DS4-Normal、2DS4-Deleted两种亚型,设计KIR基因特异性引物用于Q-PCR扩增反应;同时设置一孔阴性... 目的建立定性检测KIR基因有无的Q-PCR方法。方法根据高分辨水平中国人群KIR等位基因的多态性,并参考国际IPD-KIR数据库,针对16种KIR基因及2DS4-Normal、2DS4-Deleted两种亚型,设计KIR基因特异性引物用于Q-PCR扩增反应;同时设置一孔阴性对照、一孔阳性对照(特异性扩增人体生长激素HGH基因片段),以监控假阳性、假阴性的结果。为验证Q-PCR方法的可靠性,随机选择302份已采用KIR PCR-SSP商品化试剂盒检测的标本,采用Q-PCR方法盲检和对比。结果300人份的Q-PCR检测结果与已知的PCR-SSP检测结果相符,有2份标本结果不一致,其中1例标本的2DS5基因Q-PCR检测结果为阴性,而PCR-SSP检测结果为阳性;另一例标本2DS1基因Q-PCR检测结果为阳性,而PCR-SSP检测结果为阴性。对2份标本分别进行2DS5、2DS1基因测序分型,证实Q-PCR定性检测结果正确。结论本文建立的KIR Q-PCR方法结果准确、可靠,可用于KIR基因有无的定性检测。 展开更多
关键词 杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR) KIR基因有无 实时荧光定量-pcr 序列特异性引物-pcr 测序分型
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人类血小板抗原1~6系统同步基因分型的研究 被引量:6
7
作者 邓志辉 吴国光 李大成 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期594-598,共5页
为研究采用PCR SSP技术,建立可靠的人类血小板抗原HPA 1,2,3,4,5,6系统的同步基因分型方法,并以所建立的方法研究血小板抗原。设计合成18条序列特异性引物,探索最佳退火温度,通过调整引物浓度、Mg2+离子浓度,使HPA 1~6系统等位基因在... 为研究采用PCR SSP技术,建立可靠的人类血小板抗原HPA 1,2,3,4,5,6系统的同步基因分型方法,并以所建立的方法研究血小板抗原。设计合成18条序列特异性引物,探索最佳退火温度,通过调整引物浓度、Mg2+离子浓度,使HPA 1~6系统等位基因在同一条件下进行同步扩增和扩增产物在同一凝胶中进行同步电泳。引物的特异性和灵敏度采用基因型已知的质控DNA进行验证。应用此方法,对2000年度国际输血协会(ISBT)第十届血小板基因定型与血清学工作组送检的15份考核样本(其中血样2份,DNA样本13份)进行了基因分型。用此方法检测质控DNA,结果与已知的HPA基因型完全相符;15份第十届血小板基因定型与血清学工作组的考核样本的检测结果,与ISBT公布的结果完全相同,准确率达100%。 展开更多
关键词 序列特异性引物-pcr 人类血小板抗原 基因分型
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中国北方汉族和南方黎族RHCE基因分型 被引量:6
8
作者 孙志刚 丁梅 +1 位作者 王保捷 黄洪武 《法医学杂志》 CAS CSCD 2006年第4期271-274,共4页
目的建立应用PCR技术进行RHCE基因分型的方法。方法应用序列特异性引物PCR技术(PCR-SSP)检测200例中国北方汉族、南方黎族个体的RHCE基因型,同时对5例亲子鉴定样品进行检测。结果2个民族个体RHCE基因分型结果与血清学分型结果完全一致;... 目的建立应用PCR技术进行RHCE基因分型的方法。方法应用序列特异性引物PCR技术(PCR-SSP)检测200例中国北方汉族、南方黎族个体的RHCE基因型,同时对5例亲子鉴定样品进行检测。结果2个民族个体RHCE基因分型结果与血清学分型结果完全一致;其中中国北方汉族RH基因型频率分布为RHCCEE1例,RHCCEe3例,RHCCee88例,RHCcEE4例,RHCcEe20例,RHCcee54例,RHccEE1例,RHccEe22例,RHccee7例;中国南方黎族RH基因型频率分布为RHCCEE2例,RHCCEe2例,RHCCee106例,RHCcEE7例,RHCcEe62例,RHCcee10例,RHccEE3例,RHccEe8例。亲子鉴定样品RHCE基因型检测结果与13个STR位点联合鉴定结论一致。结论PCR-SSP技术能准确判断中国北方汉族和南方黎族个体的RHCE基因型。 展开更多
关键词 RHCE基因 基因分型 序列特异性引物pcr 中国汉族 中国黎族
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Flow-rSSO及PCR-SBT方法检测KIR基因有无的对比研究 被引量:1
9
作者 钟福玲 杨智超 +1 位作者 陈浩 邓志辉 《中国输血杂志》 CAS 2023年第7期563-566,共4页
目的研究流式磁珠序列特异性寡核苷酸探针(Flow-rSSO)杂交及测序分型(PCR-SBT)方法鉴定KIR基因有无的一致性。方法对131例汉族人群的DNA标本采用Flow-rSSO方法鉴定全部16种KIR基因的有无,并采用本实验室建立的PCR-SBT方法对14种功能性KI... 目的研究流式磁珠序列特异性寡核苷酸探针(Flow-rSSO)杂交及测序分型(PCR-SBT)方法鉴定KIR基因有无的一致性。方法对131例汉族人群的DNA标本采用Flow-rSSO方法鉴定全部16种KIR基因的有无,并采用本实验室建立的PCR-SBT方法对14种功能性KIR基因进行高分辨水平基因检测;分析Flow-rSSO及PCR-SBT两种方法鉴定14种功能性KIR基因有无的一致性。对初检结果不一致的标本,采用同一厂家、不同批号的Flow-rSSO试剂盒进行复检,并采用序列特异性引物-PCR(PCR-SSP)方法进行检测。结果131例标本中有129例完全一致,2例不一致,占1.5%(2/131)。不一致的两例标本,1例标本3DL1基因、另1例标本2DS3及2DS5基因,其Flow-rSSO初检结果均为阴性,而PCR-SBT结果均为阳性。更换新的批号Flow-rSSO试剂盒复检,两例标本的结果均为阳性;采用PCR-SSP方法检测的结果亦为阳性。结论经Flow-rSSO试剂盒检测KIR基因有无,出现2例标本初检结果错误,提示检测KIR基因有无时,试剂的质控工作至关重要。 展开更多
关键词 KIR基因 测序分型 流式磁珠序列特异性寡核苷酸探针 序列特异性引物-pcr
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中国白族、佤族和拉祜族人群MBL基因启动子区SNP的研究 被引量:4
10
作者 吕成伟 葛争鸣 +2 位作者 李江川 马丽 陈政良 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期110-113,共4页
 目的:研究中国白族、佤族和拉祜族人群甘露聚糖结合凝集素(MBL)基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)。方法:抽提人外周血白细胞基因组DNA,建立SSP-PCR及PCR-分子灯塔实时分析技术,检测MBL基因启动子区SNP位点-550(G/C,称H/L等位基因)、-2...  目的:研究中国白族、佤族和拉祜族人群甘露聚糖结合凝集素(MBL)基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)。方法:抽提人外周血白细胞基因组DNA,建立SSP-PCR及PCR-分子灯塔实时分析技术,检测MBL基因启动子区SNP位点-550(G/C,称H/L等位基因)、-220(G/C,X/Y等位基因)和 4+4(C/T,P/Q等位基因),分析其单倍型及基因型频率。结果:从 71例白族、73例佤族和 94例拉祜族人中,分别检出等位基因型LYP/LYP4例(5.6% )、4例(5. 5% )和 2例(2. 1% );HYP/LYQ6例 (8. 5% )、11例(15. 1% )和 12例 (12. 8% );LYP/LYQ21例 (29. 6% )、14例 (19.2% )和 51例 (54. 3% );LXP/LXP1例 (1. 4% )、2例 (2. 7% )和 0例;LYQ/LYQ10例(14. 1% )、14例 (19. 2% )、7例 (7. 4% );LXP/LYQ10例(14. 1% )、13例 (17. 8% )和 15例 (16. 0% );HYP/LYP4例(5. 6% )、3例(4. 1% )和 4例(4. 3% );HYP/LXP3例(4. 2% )、1例(1. 4% )和 0例;HYP/HYP12例(16. 9% )、11例(15. 1% )和 3例(3. 2% )。结论:中国白族、佤族、拉祜族普通人群之间,MBL基因启动子区等位基因L/H的分布存在差异(P<0. 01),X/Y和P/Q无统计学意义的差异(P>0. 05);各单倍型和各基因型的分布存在差异(P<0. 01);基因型LYP/LYQ和LXP/LYQ在 3个民族均有较高的分布,其总体频率分别达 36. 1%及 16. 展开更多
关键词 启动子区 甘露聚糖结合凝集素 单核苷酸多态性 序列特异性引物-pcr pcr-分子灯塔实时分析
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人类血小板抗原HPA-15系统PCR-SSP基因分型技术的建立 被引量:5
11
作者 陈悦康 李大成 +2 位作者 王大明 李茜 邓志辉 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2008年第1期185-188,共4页
本研究目的是采用PCR-SSP技术建立人类血小板抗原HPA-15系统的基因分型方法,并应用于血小板供者库的HPA基因定型。采用第11届国际输血协会(ISBT)血小板血清学与基因分型协作组推荐的序列特异性引物,调节引物浓度、Mg2+离子浓度和探索最... 本研究目的是采用PCR-SSP技术建立人类血小板抗原HPA-15系统的基因分型方法,并应用于血小板供者库的HPA基因定型。采用第11届国际输血协会(ISBT)血小板血清学与基因分型协作组推荐的序列特异性引物,调节引物浓度、Mg2+离子浓度和探索最佳PCR扩增条件,建立HPA-15系统基因分型技术。该分型技术的准确性和可靠性,采用第11届ISBT血小板协作组提供的质控样本进行验证,同时采用本研究合成的引物及商品化试剂盒,对50名随机的汉族血小板捐献者进行HPA-15系统基因分型,作为平行对照。应用本研究的方法,对第11届ISBT送检的10份考核样本进行基因分型。结果表明:基因分型结果与ISBT公布的结果完全一致。50名随机的血小板志愿捐献者,经本研究的方法及美国G&T公司的试剂检测,基因分型的结果相符合;观察到的基因频率:HPA-15a和-15b分别为0.5100和0.4900。结论:本研究建立的HPA基因分型技术具有简便、快速、准确的特点,适合于常规HPA基因分型,具有广泛的应用前景。 展开更多
关键词 人类血小板抗原 HPA-15系统 序列特异性引物-pcr 基因分型
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应用分子生物学技术检测及蛋白质模型预测1例弱D型54
12
作者 芮雪 张钰 +3 位作者 蔡杰 许纪玲 傅强 何成涛 《临床检验杂志》 CAS 2023年第3期186-190,共5页
目的对1例血型血清学检测为RHD变异型的样本进行基因分型,并进行家系调查分析。方法运用血型血清学检测方法对先证者及其家系样本进行RHD确认及RH血型抗原表位检测,用序列特异性引物PCR(sequence specific primer PCR,PCR-SSP)法分析RH... 目的对1例血型血清学检测为RHD变异型的样本进行基因分型,并进行家系调查分析。方法运用血型血清学检测方法对先证者及其家系样本进行RHD确认及RH血型抗原表位检测,用序列特异性引物PCR(sequence specific primer PCR,PCR-SSP)法分析RHD基因外显子的表达,运用Sanger和SMRT(single molecule real-timesequencing)测序法对先证者及其家系样本进行RHD基因的1~10外显子测序分析。通过AlphaFold模拟构建蛋白质三级结构,将突变前后的蛋白质结构进行叠合以观察结构内分子间相互作用力的改变。结果先证者为RHD弱表型,其他抗原为Ccee,直接抗人球蛋白试验、抗体筛查、抗体鉴定试验均为阴性,PCR-SSP初步分型为RHD阳性。其父母血型血清学及PCR-SSP结果均为RHD阳性。SMRT测序结果显示先证者母亲为RHD^(+)/RHD^(-)杂合子。Sanger测序结果显示,先证者父亲携带弱D型54等位基因。AlphaFold建模预测揭示,p.Ser122Leu突变不能与146位GLU形成氢键相互作用。结论该样本为弱D型54,p.Ser122Leu突变导致氨基酸内部分子间作用力发生改变,从而引起突变后蛋白质结构和功能的部分改变。 展开更多
关键词 弱D型 血型血清学 序列特异性引物pcr 外显子测序 家系研究
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维、汉两民族脂联素基因+45位点和+349位点SNPs及其与肥胖关系的研究 被引量:3
13
作者 王延蛟 焦谊 +4 位作者 陈红 孙丽丽 张成 艾克拜尔·艾力 关亚群 《新疆医科大学学报》 CAS 2010年第6期609-611,共3页
目的探讨维、汉两民族脂联素基因(adipose most abundant gene transcript1)+45位点及+349位点单核苷酸多态性与肥胖的关系。方法采用优化的特异性引物PCR(SSP-PCR)技术确定脂联素基因+45位点和+349位点的基因型。结果肥胖组与对照组中... 目的探讨维、汉两民族脂联素基因(adipose most abundant gene transcript1)+45位点及+349位点单核苷酸多态性与肥胖的关系。方法采用优化的特异性引物PCR(SSP-PCR)技术确定脂联素基因+45位点和+349位点的基因型。结果肥胖组与对照组中汉族脂联素基因+45位点GT基因型频率均高于维吾尔族,2组维吾尔族TT基因型频率均高于汉族,但差异无统计学意义(P>0.05);维吾尔族人群肥胖组和对照组的脂联素基因+349位点A、G等位基因频率分布差异具统计学意义(P<0.05)。结论维、汉两民族脂联素基因的+45位点可能存在差异,维吾尔族人群脂联素基因+349位点A、G等位基因频率与肥胖有关。 展开更多
关键词 脂联素 单核苷酸多态性 肥胖 序列特异性引物pcr
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江苏启东地区人群KIR基因型及单倍型与HBsAg清除相关 被引量:1
14
作者 缪凤琴 潘宁 +3 位作者 孙杭 张莹 陈建国 张建琼 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期174-176,共3页
目的探讨杀伤细胞免疫球蛋白样受体(killer cell immunoglobulin-like receptor,KIR)的多态性、KIR基因型及单倍型与乙型肝炎病毒(HBV)感染不同转归之间的相关性。方法以肝癌高发的启东地区HBV感染男性人群为研究对象,随访10年后对其再... 目的探讨杀伤细胞免疫球蛋白样受体(killer cell immunoglobulin-like receptor,KIR)的多态性、KIR基因型及单倍型与乙型肝炎病毒(HBV)感染不同转归之间的相关性。方法以肝癌高发的启东地区HBV感染男性人群为研究对象,随访10年后对其再次进行血清学检测,按照HBsAg是否转阴分为HBsAg转阴组(161例)和HBsAg持续阳性组(493例)。采用序列特异性引物PCR方法进行KIR分型,用χ2检验对KIR等位基因阳性率、KIR基因型、KIR单倍型进行统计学分析。结果 HBsAg转阴组KIR2DS4(d)、单倍型1和基因型AG的频率高于HBsAg持续阳性组(P=0.014、P=0.029、P=0.048);KIR2DL5的频率低于HBsAg持续阳性组(P=0.044)。结论江苏启东地区KIR2DS4(d)、单倍型1和基因型AG可能是HBsAg转阴的保护因素,KIR2DL5可能是HBsAg持续阳性的风险因素。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 杀伤细胞免疫球蛋白样受体 序列特异性引物pcr
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改良型序列特异性引物PCR用于脂联素基因单核苷酸多态性的检测
15
作者 王延蛟 孙丽丽 +5 位作者 陈红 焦谊 刘晓宇 张成 艾克拜尔.艾力 关亚群 《地方病通报》 2010年第2期4-6,共3页
目的运用序列特异性引物PCR技术(SSP-PCR)研究基因单核苷酸多态性。方法根据GenBank中人脂联素基因(APM1)序列及SNP信息,利用Primer5.0设计引物,通过PCR技术检测APM1的SNPs。结果建立并优化了序列特异性引物PCR(SSP-PCR)技术,并可快速... 目的运用序列特异性引物PCR技术(SSP-PCR)研究基因单核苷酸多态性。方法根据GenBank中人脂联素基因(APM1)序列及SNP信息,利用Primer5.0设计引物,通过PCR技术检测APM1的SNPs。结果建立并优化了序列特异性引物PCR(SSP-PCR)技术,并可快速、直观、准确地进行基因分型。结论改良的SSP-PCR技术是一种特异性更高、操作简便的SNP检测方法。 展开更多
关键词 序列特异性引物pcr 单核苷酸多态性 脂联素
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广州地区无偿献血者CD36基因突变的频率调查 被引量:9
16
作者 王嘉励 叶欣 +5 位作者 丁浩强 夏文杰 邵媛 陈扬凯 徐秀章 邓晶 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期718-720,共3页
目的:本研究旨在调查广州地区无偿献血者中CD36基因的突变频率,填补国内CD36抗原缺失相关的基因突变空白。方法:收集200份健康无偿献血员的血液标本,通过PCR-SSP的方法检测广州地区CD36抗原缺失相关的基因突变频率,统计分析并对比国外... 目的:本研究旨在调查广州地区无偿献血者中CD36基因的突变频率,填补国内CD36抗原缺失相关的基因突变空白。方法:收集200份健康无偿献血员的血液标本,通过PCR-SSP的方法检测广州地区CD36抗原缺失相关的基因突变频率,统计分析并对比国外报道。结果:在200份血液标本中,一共检测出10个样本产生CD36的基因突变,突变类型、例数和频率分别为:C268T,1例,0.5%;329-330delAC,6例,3.0%;A1237C,3例,1.5%。结论:本课题首次利用PCR-SSP方法检测广州地区无偿献血者CD36基因的突变频率,发现主要突变类型为329-330delAC,其次是A1237C,这与国外报道的主要突变类型,C268T,329-330delAC和949insA有所不同。 展开更多
关键词 血小板抗原-CD36缺失型 基因突变 血小板输注无效(PTR) pcr-序列特异性引物(pcr-SSP)
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遵义地区汉族HLA-DRB1、DQB1等位基因多态性的研究 被引量:3
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作者 罗军敏 孙万邦 +4 位作者 黄学贵 冯继红 张忆雄 姚新生 宋明英 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期542-544,548,共4页
目的:从基因水平调查遵义地区汉族人群HLA-DRB1、DQB1等位基因频率,并了解其多态性分布状况。方法:应用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)方法对遵义汉族200名健康个体进行HLA-DRB1、DQB1等位基因分型。结果:遵义地区汉族HLA-DRB1、... 目的:从基因水平调查遵义地区汉族人群HLA-DRB1、DQB1等位基因频率,并了解其多态性分布状况。方法:应用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)方法对遵义汉族200名健康个体进行HLA-DRB1、DQB1等位基因分型。结果:遵义地区汉族HLA-DRB1、DQB1等位基因频率分布,在中低分辨水平,共检出13个DRB1基因,7个DQB1基因,DRB1*09、DRB1*08及DQB1*05基因频率相对较高;DRB1*10及DQB1*04基因频率相对较低。与我国北方、南方汉族比较,更接近南方汉族人群。结论:遵义汉族人群HLA-DRB1、DQB1基因具有较为丰富的多态性,其分布符合南方汉族的特点,可能与重庆汉族人群有较为密切的民族融合。 展开更多
关键词 遵义 HLA-DRB1、DQB1 基因频率 多态性 聚合酶链反应-序列特异性引物(pcr-SSP)
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应用PCR-SSP方法进行人类血小板抗原1~6系统的基因分型 被引量:4
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作者 李大成 邓志辉 +2 位作者 张姝颖 李茜 吴国光 《江西医学检验》 2005年第4期291-294,共4页
目的研究采用PCR-SSP技术,建立人类血小板抗原1~6系统(HPA-1,2,3,4,5,6)的基因分型方法。方法合成18条序列特异性引物,通过调节引物浓度、Mg2+离子浓度和探索最佳PCR扩增条件,建立HPA-1~6系统同步基因分型技术。对第10届及第11届国际... 目的研究采用PCR-SSP技术,建立人类血小板抗原1~6系统(HPA-1,2,3,4,5,6)的基因分型方法。方法合成18条序列特异性引物,通过调节引物浓度、Mg2+离子浓度和探索最佳PCR扩增条件,建立HPA-1~6系统同步基因分型技术。对第10届及第11届国际输血协会(ISBT)血小板基因定型协作组送检的考核样本进行盲检来验证。并应用该技术对198名深圳地区健康的血小板志愿捐献者进行基因分型。结果应用本研究的方法,对第10届及第11届ISBT送检的考核样本进行基因分型,结果与ISBT公布的结果完全一致,符合率达100%。对198名随机的血小板志愿捐献者观察到的基因频率分别是:HPA-1a和1b为0.9924和0.0076,HPA-2a和2b为0.9545和0.0455,HPA-3a和3b为0.5556和0.4444,HPA-4a和4b为0.9975和0.0025,HPA-5a和5b为0.9848和0.0152,HPA-6a和6b为0.9798和0.0202。结论本研究建立的HPA基因分型技术具有简便、快速、准确的特点,适合于常规HPA基因分型,具有广泛的应用前景。 展开更多
关键词 人类血小板抗原 序列特异性引物-pcr(pcr—SSP) 基因分型
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序列特异性引物PCR法检测MN血型基因型 被引量:2
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作者 祝宏 朱发明 严力行 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期19-20,共2页
目的 建立MN血型系统基因分型的方法 ,检测人群中MN基因的频率。方法 用快速盐析法抽提样本DNA ,序列特异性引物PCR法检测MN基因。结果  115例汉族人群中MM基因型为 2 5例 ,MN基因型为 6 0例 ,NN基因型为 30例。M基因频率为 0 .4 78,... 目的 建立MN血型系统基因分型的方法 ,检测人群中MN基因的频率。方法 用快速盐析法抽提样本DNA ,序列特异性引物PCR法检测MN基因。结果  115例汉族人群中MM基因型为 2 5例 ,MN基因型为 6 0例 ,NN基因型为 30例。M基因频率为 0 .4 78,N基因频率为 0 .5 2 2。结论 该方法可以检测MN血型基因型。 展开更多
关键词 序列特异性引物pcr 检测 MN血型 基因分型 血清学
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PCR-SSP/PCR-SSO两种KIR基因分型方法的比较 被引量:2
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作者 李娟 慕力 +6 位作者 韩兴乔 张华 孙乐静 暨波 魏博 杨俊晔 韩俊领 《生物医学工程与临床》 CAS 2021年第2期225-231,共7页
目的杀伤细胞免疫蛋白样受体(KIR)基因在自然杀伤细胞活性调节、机体抗感染、移植免疫过程中发挥重要作用。在脐带血移植中,KIR基因分型的效率和准确关系到移植的成败。为了满足临床上对KIR基因分型的要求,对比分析聚合酶链反应-序列特... 目的杀伤细胞免疫蛋白样受体(KIR)基因在自然杀伤细胞活性调节、机体抗感染、移植免疫过程中发挥重要作用。在脐带血移植中,KIR基因分型的效率和准确关系到移植的成败。为了满足临床上对KIR基因分型的要求,对比分析聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)和聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSO)两种方法,试图建立一个高效便捷检测KIR基因分型的方法学体系。方法从2018年到2019年已外送到第三方检测实验室(北京博富瑞医学检验实验室有限公司)做过KIR基因分型检测的脐带血样本中随机取出12份,分别用PCR-SSP及PCR-SSO商品化试剂盒进行KIR基因分型检测,并通过凝胶电泳分析或MATCH IT!DNA软件分析,获取KIR基因分型结果。结果12例脐带血样本中,PCR-SSO方法学检测的结果与原PCR-SSO方法检测结果完全一致,PCR-SSP方法学检测的结果与原PCR-SSO方法检测结果9例相同,有2例因出现漏孔而无法判读,有1例出现了假阳性带。结论PCR-SSO方法学检测KIR基因效果优于PCR-SSP,但是PCR-SSO方法学也存在当微珠的荧光校准值接近于临界值时,结果出现错判的现象;为保证KIR基因分型的准确度,建议PCR-SSP方法出现漏孔或者PCR-SSO方法荧光校准值接近于临界值时两种方法相互验证。 展开更多
关键词 KIR基因 基因分型 聚合酶链反应-序列特异性引物(pcr-SSP) 聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(pcr-SSO) 荧光校准值 相互验证
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