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河南地区丙型肝炎病毒1b亚型ISDR变异对聚乙二醇干扰素联合利巴韦林抗病毒疗效的影响因素分析 被引量:3
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作者 魏君锋 曾艳丽 +5 位作者 李宽 肖二辉 刘俊平 丁岗强 康谊 尚佳 《中华实用诊断与治疗杂志》 2016年第9期883-886,共4页
目的探讨河南地区丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)lb亚型干扰素敏感决定区( interferon sensitivitydetermining region, ISDR)氨基酸序列变异是否影响聚乙二醇干扰素(pegylated interferon, PEG-IFN)联合利巴韦林(ribavi... 目的探讨河南地区丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)lb亚型干扰素敏感决定区( interferon sensitivitydetermining region, ISDR)氨基酸序列变异是否影响聚乙二醇干扰素(pegylated interferon, PEG-IFN)联合利巴韦林(ribavirin,RBV)治疗慢性丙型肝炎(chronichepatitisC,CHC)的抗病毒疗效,评价其预测价值。方法对49例HCV1b亚型慢性感染者采用PEG-IFN/RBV联合方案治疗48周,并随访24周。定量检测血清HCV—RNA,RT—PCR扩增治疗前血清标本中HCV—ISDR片段并测序,MEGA4分析氨基酸序列变异度;二分类logistic回归分析各变量与持续病毒学应答(sustained virological response, SVR)之间的关系。结果SVR率为69.4%(34/49);治疗前血清HCV的ISDR氨基酸序列与HCVJ株比较,12例为野生型(未突变),36例为中间型(1~3个突变),1例为突变型(≥4个突变);二分类logistic回归分析显示,影响SVR的主要因素是ISDR氨基酸残基突变(OR=21.505,P=0.001),其次是年龄(OR=0.876,P=0.042);ISDR氨基酸突变数≥2个的CHC组所获得的SVR(13/14)明显高于氨基酸突变数〈2个的CHC组(1/15)(P〈0.05),年龄≤40岁者SVR(14/I7)高于年龄〉40岁者(20/32)(P〈0.05)。结论河南地区HCV1b亚型ISDR突变型极少;PEG-IFN/RBV联合方案治疗中,对SVR有预测价值的为ISDR氨基酸突变数≥2个和年龄≤40岁。 展开更多
关键词 慢性丙型肝炎 干扰素敏感决定 聚乙二醇干扰素 利巴韦林 持续病毒学应答
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丙型肝炎病毒基因型、准种及干扰素敏感决定区对干扰素应答的影响机制 被引量:1
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作者 郭顺明 聂青和 《实用肝脏病杂志》 CAS 2005年第3期180-182,共3页
关键词 丙型肝炎病毒基因型 干扰素敏感决定 干扰素应答 影响机制 丙型肝炎病毒(HCV) 准种 聚乙二醇干扰素 干扰素治疗 慢性丙型肝炎 完全应答率 临床研究 免疫制剂 丙性肝炎 重要因子 研究情况 多样性
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1b型丙型肝炎病毒基因组不同区域基因变异对干扰素疗效的影响 被引量:2
3
作者 张琳 白菡 +2 位作者 黄芬 赵桂珍 李颖 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期83-84,共2页
本研究对14例基因型1b型慢性丙型肝炎患者血清HCV基因组中E2/NS1(含HVR1和HVR2)、NSSA区准种异质性进行了检测,对HVR区准种异质性程度与干扰素(IFN)疗效的关系、NS5A2209-2248区是否存在干扰素敏感决定区(ISDR)等热点问题进行... 本研究对14例基因型1b型慢性丙型肝炎患者血清HCV基因组中E2/NS1(含HVR1和HVR2)、NSSA区准种异质性进行了检测,对HVR区准种异质性程度与干扰素(IFN)疗效的关系、NS5A2209-2248区是否存在干扰素敏感决定区(ISDR)等热点问题进行了探讨,为1b型慢性丙型肝炎患者应用IFN抗病毒治疗时进行疗效预测提供理论依据。 展开更多
关键词 干扰素敏感决定 丙型肝炎患者 疗效预测 1b型 病毒基因组 基因变异 E2/NS1 HCV基因组
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HCV 1b亚型ISDR变异影响PEG-IFN/RBV抗病毒疗效的新特点分析 被引量:2
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作者 李京涛 魏君锋 +9 位作者 周元平 曾艳丽 王俊洁 周斌 李威 刘叔文 吴英松 黎诚耀 郭亚兵 侯金林 《热带医学杂志》 CAS 2012年第1期7-11,共5页
目的探讨HCV干扰素敏感决定区(ISDR)氨基酸(aa)序列变异度对聚乙二醇干扰素(PEG-IFN)联合利巴韦林(RBV)治疗1b亚型慢性丙型肝炎(CHC)疗效的影响。方法 58例HCV1b亚型慢性感染者采用PEG-IFN/RBV联合方案治疗48周,并随访24周。定量检测血... 目的探讨HCV干扰素敏感决定区(ISDR)氨基酸(aa)序列变异度对聚乙二醇干扰素(PEG-IFN)联合利巴韦林(RBV)治疗1b亚型慢性丙型肝炎(CHC)疗效的影响。方法 58例HCV1b亚型慢性感染者采用PEG-IFN/RBV联合方案治疗48周,并随访24周。定量检测血清HCV RNA,逆转录-聚合酶链反应扩增治疗前血标本中HCV ISDR片段并测序,MEGA4分析氨基酸序列变异度;二分类Logistic回归分析各变量与持续病毒学应答(SVR)之间的关系。结果治疗前血清HCV的ISDR氨基酸序列与HCVJ株比较,15例为野生型(未突变),42例为中间型(1-3个突变),1例为突变型(≥4个突变)。其中2218位点突变最多,约为60.3%(35/58)。ISDRaa突变数目与SVR关系密切(P=0.000),ISDRaa突变数≥2的CHC组所获得的EVR和SVR明显高于aa突变数<2的CHC组(P=0.041/P=0.012)。结论华南HCV1b亚型ISDR突变型(氨基酸变异≥4)极少。ISDRaa变异能够预测SVR;采用PEG-IFN/RBV联合方案治疗,对SVR有预测价值的ISDRaa突变数可由4个减少为2个。 展开更多
关键词 慢性丙型肝炎 干扰素敏感决定 聚乙二醇化干扰素 利巴韦林
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中国地区丙型肝炎病毒的NS5A基因序列及干扰素敏感决定区特征分析 被引量:1
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作者 王海滨 宋衍燕 +1 位作者 张晓曦 韩辉 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期857-859,共3页
丙型肝炎病毒(Hepatitis Cvirus,HCV)NS5A基因编码的ISDR、PKRBD和V3等区域氨基酸序列的变异与HCV对干扰素-α(interferon—α,IFN-α)治疗的不同反应性有关,
关键词 丙型肝炎病毒 干扰素敏感决定 基因序列 NS5A 中国 干扰素 氨基酸序列 IFN-Α
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丙型肝炎病毒NS5A分子及其干扰素敏感决定区的研究进展 被引量:1
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作者 代志琰 李刚 《中山大学研究生学刊(自然科学与医学版)》 2002年第4期75-80,共6页
丙型肝炎病毒(HCV)是慢性肚炎的主要病因之一,其基因组为单股正链RNA,NSA是划HCV编码的一种非结构蛋白。位于HCV NS5A区的干扰素敏感决定区(ISDR),与肝细胞中RNA依赖性蛋白激酶(PKR)之间的相互作用,可能决定着HCV对干扰素(IFN-α)的敏... 丙型肝炎病毒(HCV)是慢性肚炎的主要病因之一,其基因组为单股正链RNA,NSA是划HCV编码的一种非结构蛋白。位于HCV NS5A区的干扰素敏感决定区(ISDR),与肝细胞中RNA依赖性蛋白激酶(PKR)之间的相互作用,可能决定着HCV对干扰素(IFN-α)的敏感性。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 NS5A 干扰素敏感决定 慢性肝炎 研究进展 单股正链RNA 基因组
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干扰素对丙型肝炎病毒NS_(5a)内干扰素敏感决定区的影响
7
作者 刘斌 王宇明 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 2003年第2期102-102,108,共2页
HCV NS5a蛋白内存在一个与干扰素疗效直接相关的区域(2209 aa-2248 aa),称干扰素敏感决定区(ISDR)[1].通过对IFN治疗前后宿主体内优势准种ISDR序列的比较,以期明确IFN治疗对ISDR的影响.
关键词 干扰素 丙型肝炎病毒 NS5A蛋白 干扰素敏感决定 氨基酸序列
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丙型肝炎患者HCV-1bISDR序列对干扰素疗效的影响
8
作者 胡婷 郑杰 《山东医药》 CAS 北大核心 2010年第7期54-55,共2页
目的探讨HCV-1b非结构蛋白NS5A干扰素敏感决定区(ISDR)对干扰素治疗丙型肝炎疗效的影响。方法收集18例慢性丙型肝炎患者治疗前后血清,用RT-nested PCR、SSCP法直接测序得出HCV-1b ISDR序列并进行分析。结果18例患者1b ISDR序列为野生型9... 目的探讨HCV-1b非结构蛋白NS5A干扰素敏感决定区(ISDR)对干扰素治疗丙型肝炎疗效的影响。方法收集18例慢性丙型肝炎患者治疗前后血清,用RT-nested PCR、SSCP法直接测序得出HCV-1b ISDR序列并进行分析。结果18例患者1b ISDR序列为野生型9例,中间型6例,突变型3例。仅2例突变型用IFN治疗发生完全反应(P<0.05)。而IFN治疗前HCV-RNA水平及γ-GT/ALT值与IFN疗效无关(P>0.05)。结论HCV-1bISDR序列可作为预测IFN疗效的指标。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 非结构蛋白5A 干扰素 干扰素敏感决定
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HCV干扰素敏感决定区“基因盒”的构建,体外表达及功能探讨
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作者 李刚 江元森 +5 位作者 Jenny L Craigen Lynda Tussey Eric DA D'Souza Tony R Carroll 姚集鲁 Berwyn E Clarke 《世界华人消化杂志》 CAS 2002年第8期892-896,共5页
目的:构建对干扰素敏感和不敏感的丙型肝炎患者的干扰素敏感决定区(ISDR)基因;在体外表达含ISDR的丙型肝炎病毒(HCV)NS5A蛋白,探讨表达的NS5A蛋白是否通过ISDR与干扰素诱导的RNA蛋白激酶(PKR)结合来影响干扰素的抗HCV作用.方法:采用合... 目的:构建对干扰素敏感和不敏感的丙型肝炎患者的干扰素敏感决定区(ISDR)基因;在体外表达含ISDR的丙型肝炎病毒(HCV)NS5A蛋白,探讨表达的NS5A蛋白是否通过ISDR与干扰素诱导的RNA蛋白激酶(PKR)结合来影响干扰素的抗HCV作用.方法:采用合成寡核苷酸,PCR,分子克隆等方法构建ISDR基因“盒”,包括3个对干扰素敏感的丙肝患者ISDR及1个对干扰素耐受的丙肝患者ISDR,将含不同ISDR的NS5A基因克隆进原核表达载体PRSET,转染BL21(DE3)细胞后由IPTG诱导表达,获得蛋白过柱纯化及透析去掉高盐后,与经体外转录和翻译系统获得的PKR进行蛋白结合试验.结果:经测序证实获得4个不同ISDR基因,包括1个对干扰素不敏感基因和3个对干扰素敏感基因;体外表达的含ISDR的NS5A蛋白约58000,体外试验初步证实,无论对干扰素敏感或不敏感的ISDR均可与PKR结合.结论:体外构建的含不同ISDR的NS5A蛋白能在原核细胞系统中获得较好表达;研究显示,ISDR影响干扰素抗病毒作用可能不是由ISDR与PKR直接结合导致的. 展开更多
关键词 HCV 干扰素敏感决定 丙型肝炎病毒 基因构建 体外表达 ISDR RNA蛋白激酶 PKR
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稳定表达HCV 1a NS5A和NS5A-ΔISDR细胞株的构建
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作者 廖继佩 薛小平 +4 位作者 徐志凯 尹文 雷迎峰 吕欣 杨敬 《生物技术通讯》 CAS 2005年第1期1-4,共4页
以pBRTM/HCV-3011模板,通过PCR法扩增ns5a、LISDR(左端序列)和RISDR(右端序列),分别经XhoⅠ/EcoRⅠ、XhoⅠ/HindⅢ和EcoRⅠ/HindⅢ双酶切,连入穿梭质粒pEGFP-N3中,构建重组质粒pEGFP-N3-ns5a和pEGFP-N3-ns5a-ΔISDR。对重组质粒进行酶... 以pBRTM/HCV-3011模板,通过PCR法扩增ns5a、LISDR(左端序列)和RISDR(右端序列),分别经XhoⅠ/EcoRⅠ、XhoⅠ/HindⅢ和EcoRⅠ/HindⅢ双酶切,连入穿梭质粒pEGFP-N3中,构建重组质粒pEGFP-N3-ns5a和pEGFP-N3-ns5a-ΔISDR。对重组质粒进行酶切分析和序列测定。将这2种重组质粒通过电穿孔法转染HeLa细胞,然后在G418选择压力下进行有限稀释法筛选,用RT-PCR和荧光显微镜鉴定。经酶切鉴定和基因测序证实,重组穿梭质粒已插入目的片段ns5a、LISDR和RISDR。RT-PCR和荧光显微镜检测到目的基因的表达。以上结果说明成功构建了真核表达载体pEGFP-N3-ns5a和pEGFP-N3-ns5a-ΔISDR,目的基因在HeLa细胞中得到表达,为研究HCVNS5A中是否存在抗干扰素治疗的功能蛋白提供了实验材料。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 干扰素敏感决定 HELA细胞系 增强型绿色荧光蛋白 丙型肝炎 真核表达载体
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HeLa细胞中HCV NS5A的表达对干扰素敏感病毒VSV复制的影响
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作者 廖继佩 薛小平 +4 位作者 尹文 雷迎峰 吕欣 杨敬 徐志凯 《第四军医大学学报》 北大核心 2005年第23期2122-2124,共3页
目的:研究丙型肝炎病毒(HCV)NS5A的表达对水泡性口炎病毒(VSV)复制的影响.方法:将稳定转染的HeLa-NS5A和HeLa-NS5A-ΔISDR细胞在6孔培养板中培养24h后,加入人基因工程α2a型干扰素(rHuIFN-αt2a)至所需浓度.培养24h后加入VSV,继续培养... 目的:研究丙型肝炎病毒(HCV)NS5A的表达对水泡性口炎病毒(VSV)复制的影响.方法:将稳定转染的HeLa-NS5A和HeLa-NS5A-ΔISDR细胞在6孔培养板中培养24h后,加入人基因工程α2a型干扰素(rHuIFN-αt2a)至所需浓度.培养24h后加入VSV,继续培养相应时间.取培养上清液,按10-1稀释,50μL稀释液加入含Vero细胞的24孔培养板中.每孔加入含100 mL/L小牛血清的DMEM-7.5g/L羧甲基纤维素钠(CMC)1 mL.继续培养48 h后移走培养液,结晶紫染色,自来水轻柔洗净,记录噬斑形成单位(PFU).结果:干扰素(IFN)浓度为1×105 U/L,VSV对HeLa-NS5A细胞的致病变作用要比对HeLa-NS5A-ΔISDR细胞的致病作用更明显.在整个IFN浓度处理中,HeLa-NS5A细胞培养液中的病毒滴度是HeLa-NS5A-ΔISDR细胞培养液中的病毒滴度的2~5倍(P<0.05).结论:NS5A能增强IFN敏感病毒的复制,HCVNS5A内的ISDR可能是造成IFN对HCV患者治疗效果的因素. 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 非结构蛋白5A 干扰素敏感决定 水泡性口炎病毒 空斑形成
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