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中国北方5城市慢性乙型肝炎患者中SEN病毒检测 被引量:6
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作者 闫杰 何忠平 +4 位作者 庄辉 董庆鸣 宋淑静 朱林 王小红 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期33-35,共3页
目的 了解SEN病毒D和H(SENV D H)在中国慢性乙型肝炎患者 (CHB)中的感染情况。方法 应用巢式聚合酶链反应法 (nPCR) ,对中国北方 5城市 5 95例CHB患者和北京市 96名正常人血清检测SENV D HDNA ,并用PCR产物直接测序法对 7株SENV进行... 目的 了解SEN病毒D和H(SENV D H)在中国慢性乙型肝炎患者 (CHB)中的感染情况。方法 应用巢式聚合酶链反应法 (nPCR) ,对中国北方 5城市 5 95例CHB患者和北京市 96名正常人血清检测SENV D HDNA ,并用PCR产物直接测序法对 7株SENV进行了序列分析。结果CHB患者SENV感染率为 61.3 % ,正常人为 62 .5 % ,两者差异无显著性 ( χ2 =0 .0 47,P =0 .82 9)。但不同城市CHB患者中SENV感染率存在一定差异。从不同城市分离的SENV的核苷酸序列同源性较高 ,4株SENV D同源性为 91%~ 98% ,3株SENV H同源性为 95 %~ 98%。结论 在 5城市CHB患者中存在SENV D H感染 ,其感染率与正常人群相似 ,提示SENV D 展开更多
关键词 慢性乙型肝炎 SEN病毒 聚合酶反应 CHB
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中国北方5城市慢性乙型肝炎患者的基因分型 被引量:40
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作者 宋淑静 何忠平 +2 位作者 庄辉 闫杰 董庆鸣 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期166-167,共2页
目的 了解中国慢性乙型肝炎 (CHB)患者中的基因分型情况。方法 根据GenBank中 18株HBVS基因核苷酸序列 ,设计共同的外引物及其因型特异性内引物 ,对中国北方 5个城市 5 95例CHB患者血清进行基因分型 ,并对A、B、C及B、C混合型各一株... 目的 了解中国慢性乙型肝炎 (CHB)患者中的基因分型情况。方法 根据GenBank中 18株HBVS基因核苷酸序列 ,设计共同的外引物及其因型特异性内引物 ,对中国北方 5个城市 5 95例CHB患者血清进行基因分型 ,并对A、B、C及B、C混合型各一株进行测序。结果  5 95例血清标本中 ,A型 8例 ,占 1 4 % ;B型 5 3例 ,占 8 9% ;C型 36 0例 ,占 6 0 5 % ;B、混合型 112例 ,占 18 8% ;A、C混合型 14例 ,占 2 4 % ;A、B混合型 15例 ,占 2 5 % ;A、B、C混合型 6例 ,占 1 0 % ;未分型者 2 7例 ,占 4 5 %。 5城市间在B、C及B、C混合型的分布上有显著性差异 (P <0 0 5 ) ,4份测序结果与PCR基因分型法一致。结论 在 5个城市CHB患者中HBV基因型以C型为主 ,B型次之 ,并见各种混合基因型感染 ,各地区在主要基因型分布上存在显著性差异。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 基因分型 聚合酶反应
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甲氨蝶呤对银屑病患者皮损内VEGF mRNA影响的研究 被引量:30
3
作者 李常兴 张锡宝 +5 位作者 吴志华 罗权 胡斌 黄振明 刘玉梅 何玉清 《中国皮肤性病学杂志》 CAS 北大核心 2005年第9期522-524,共3页
目的研究甲氨蝶呤(methotrexate,MTX)对银屑病皮损内血管内皮生长因子(VEGF)表达的影响,探讨其对银屑病的治疗机理。方法随机选择12例正常对照者和13例中度、重度银屑病患者,所有患者治疗前和治疗6周后行皮肤活检。利用巢式聚合酶链反... 目的研究甲氨蝶呤(methotrexate,MTX)对银屑病皮损内血管内皮生长因子(VEGF)表达的影响,探讨其对银屑病的治疗机理。方法随机选择12例正常对照者和13例中度、重度银屑病患者,所有患者治疗前和治疗6周后行皮肤活检。利用巢式聚合酶链反应法测定12例正常对照和13例银屑病患者治疗前及治疗6周后皮损内VEGFmRNA的定量。结果银屑病皮损内VEGFmRNA高于正常对照者皮肤内的水平(P=0.005)。银屑病患者经过MTX治疗6周后,皮损明显改善,皮损内VEGFmRNA的水平低于银屑病患者治疗前皮损内的水平(P=0.030),但与正常对照者皮肤内的水平无统计学差异(P=0.687)。结论MTX能抑制银屑病皮损内VEGFmRNA的过度表达,这可能是MTX治疗银屑病的作用机制之一。 展开更多
关键词 甲氨蝶呤 银屑病 血管内皮生长因子 聚合酶反应
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巢式PCR扩增梅毒螺旋体polA及其临床应用的研究 被引量:24
4
作者 曾铁兵 吴移谋 +1 位作者 黄澍杰 吴志周 《中国皮肤性病学杂志》 CAS 北大核心 2004年第2期74-76,共3页
目的 建立一种检测临床标本中微量梅毒螺旋体 (Tp)的敏感、特异的方法。方法 运用常规及巢式PCR扩增了Tp的DNA多聚酶I基因 (polA)的特异性片段 ,检测了两方法的特异性和敏感性 ;与血清学方法比较 ,评价了两方法在诊断梅毒中的意义。... 目的 建立一种检测临床标本中微量梅毒螺旋体 (Tp)的敏感、特异的方法。方法 运用常规及巢式PCR扩增了Tp的DNA多聚酶I基因 (polA)的特异性片段 ,检测了两方法的特异性和敏感性 ;与血清学方法比较 ,评价了两方法在诊断梅毒中的意义。结果 常规及巢式 polAPCR只在扩增Tp时有特异性产物 ,灵敏度分别约为 40个 /10 0 μl及 1个 /10 0 μl。检测 13 1份拟诊为梅毒的血清标本 ,血清学方法与巢式 polAPCR结果无显著性差异 ;巢式和常规 polAPCR结果有显著性差异 ,巢式PCR敏感性高于常规PCR。结论 巢式 polAPCR具有高度敏感、特异、标本处理简便等优点 ,适用于检测血清等标本中微量Tp ,可作为血清学方法的补充用于梅毒诊断。 展开更多
关键词 梅毒螺旋体 polA 聚合酶反应 DNA多聚I基因 梅毒 诊断
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侵袭性烟曲霉菌感染早期诊断的实验研究 被引量:21
5
作者 余进 李若瑜 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第9期534-536,共3页
目的 探讨巢式聚合酶链反应 (PCR)方法和曲霉菌半乳甘露聚糖抗原酶联免疫吸附试验 (ELISA)检测方法早期诊断侵袭性曲霉菌感染的可行性和临床应用价值。方法  (1)建立侵袭性曲霉菌感染的动物模型 ,收集不同时期实验动物的血样及各脏器... 目的 探讨巢式聚合酶链反应 (PCR)方法和曲霉菌半乳甘露聚糖抗原酶联免疫吸附试验 (ELISA)检测方法早期诊断侵袭性曲霉菌感染的可行性和临床应用价值。方法  (1)建立侵袭性曲霉菌感染的动物模型 ,收集不同时期实验动物的血样及各脏器标本 ,进行巢式PCR方法的检测。 (2 )对临床确诊或拟诊的侵袭性曲霉菌感染患者的血液标本进行巢式PCR方法的检测 ;对血清标本进行曲霉菌半乳甘露聚糖抗原ELISA方法的检测。结果  (1)动物实验中 ,巢式PCR和血培养阳性率分别为 77 8%和 16 7% ,两者差异具有显著意义 ;灵敏度和特异度分别为 77 8%和 10 0 %。 (2 )在临床确诊或拟诊的侵袭性曲霉菌感染患者的检测中巢式PCR方法的灵敏度和特异度分别为 10 0 %和 83 3% ;曲霉菌半乳甘露聚糖抗原ELISA检测的灵敏度和特异度分别为 5 5 6 %和 88 2 %。结论 巢式PCR方法具有良好的灵敏度和特异性 ,适用于临床早期诊断侵袭性曲霉菌感染。曲霉菌半乳甘露聚糖抗原ELISA检测可用于临床诊断侵袭性曲霉菌菌感染 ,有望辅助或替代传统方法。 展开更多
关键词 侵袭性烟曲霉菌感染 早期 诊断 实验 聚合酶反应 曲霉菌病
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河南省首次实验室证实恙虫病暴发疫情 被引量:22
6
作者 夏胜利 申晓靖 +6 位作者 邓文斌 黄丽莉 王建丽 李林红 马宏 李孟磊 许汴利 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期230-233,共4页
目的调查以发热、头痛、淋巴结肿大、皮疹为主要症状的不明原因疾病病因。方法对可疑病人进行流行病学调查,用血清学、巢式PCR方法检测病人血清抗体滴度、血清型及立克次体特异性基因片段。结果对发生在农村的32例病人中的20例病人进行... 目的调查以发热、头痛、淋巴结肿大、皮疹为主要症状的不明原因疾病病因。方法对可疑病人进行流行病学调查,用血清学、巢式PCR方法检测病人血清抗体滴度、血清型及立克次体特异性基因片段。结果对发生在农村的32例病人中的20例病人进行血清外裴OXk凝集反应,阳性率达100%,其中11份的第2次病人血清OXk反应呈4倍升高;间接免疫荧光法检测IgM和IgG抗体,20份均为阳性,最高达到1∶2560;恙虫病血清学分型Gilliam 4例,Karp6例,Kato 8例。巢式PCR检测病人血凝块,结果3份扩增出Ot特异性DNA片段。结论首次证实河南省出现恙虫病暴发疫情。 展开更多
关键词 恙虫病 立克次体 聚合酶反应 血清型 流行病学
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3种实验室检测方法在疟疾诊断中的应用比较 被引量:19
7
作者 雷露 刘学升 +3 位作者 毛玲玲 王博 滕聪 姚文清 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2015年第2期206-207,210,共3页
目的探讨3种实验室检测方法在疟疾诊断方面的应用价值。方法分别采用传统镜检法、Opti MAL法及巢式PCR法,对辽宁省2011-2013年的102份疟疾疑似病例血样进行检测。结果镜检法、Opti MAL法和PCR法阳性率分别为54.90%、63.73%和70.59%,三... 目的探讨3种实验室检测方法在疟疾诊断方面的应用价值。方法分别采用传统镜检法、Opti MAL法及巢式PCR法,对辽宁省2011-2013年的102份疟疾疑似病例血样进行检测。结果镜检法、Opti MAL法和PCR法阳性率分别为54.90%、63.73%和70.59%,三者两两比较,只有镜检法和PCR法差异有统计学意义(χ2=4.718,P=0.030)。3种方法中,PCR法的敏感性和特异性最好。结论镜检法结合Opti MAL法和PCR法会提高疟疾病例的诊断水平。 展开更多
关键词 疟疾 OPTI MAL法 聚合酶反应 镜检法
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深圳市HIV-1毒株的流行状况 被引量:17
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作者 冯铁建 赵广录 +2 位作者 陈琳 王晓辉 石向东 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期637-641,共5页
目的了解深圳地区人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株亚型及流行情况,分析其传染来源和传播规律。方法应用巢式聚合酶链反应技术,对122例在深圳市发现的HIV-1感染者外周血单个核细胞中的env基因和gag基因进行扩增,并对各基因区核苷酸序列... 目的了解深圳地区人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株亚型及流行情况,分析其传染来源和传播规律。方法应用巢式聚合酶链反应技术,对122例在深圳市发现的HIV-1感染者外周血单个核细胞中的env基因和gag基因进行扩增,并对各基因区核苷酸序列进行测定和分析。结果122份样本中共存在CRF01_AE、CRF08_BC、CRF07_BC3种重组毒株以及B'、B、C3种亚型,其在所有分析样本中的比例分别为45.1%(55/122)、31.1%(38/122)、6.6%(8/122)、14.8%(18/122)、1.6%(2/122)和0.8%(1/122)。CRF01_AE、CRF08_BC、CRF07_BC、B和B'亚型间的组内离散率分别为(4.455±1.478)%、(2.997±1.345)%、(4.380±2.024)%、(5.186±2.487)%和(4.869±2.638)%,与部分国内和国际参考株01AE.TH.90.CM240、97CNGX-9F、CN.97.C54A、B.US.83.JRFL、RL42核苷酸序列间的离散率分别为(5.228±0.823)%、(3.634±1.073)%、(4.233±1.119)%、(4.950±2.564)%、(5.795±2.198)%。CRF07_BC和CRF08_BC亚型以吸毒人群为主,CRF01_AE重组亚型以性途径和吸毒人群为主,B和B'亚型主要分布在静脉吸毒、性传播和献/输血人群。结论深圳地区有3种亚型和3种重组亚型HIV-1毒株流行,CRF01_AE、CRF08_BC重组亚型和B'亚型为主要流行毒株,CRF01_AE是性传播人群中的主要流行毒株,CRF08_BC和CRF01_AE是静脉吸毒人群中的主要流行毒株。 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒1型 序列分析 亚型 聚合酶反应
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首次实验室证实北京平谷地区恙虫病东方体暴发流行 被引量:16
9
作者 付秀萍 刘玉英 +4 位作者 张宝华 王景泉 张景山 贺金荣 张守印 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2011年第2期137-140,共4页
目的了解北京市平谷地区是否存在恙虫病东方体感染。方法采用巢式聚合酶链反应(nPCR),对平谷地区采集的30份临床标本进行恙虫病东方体热休克蛋白(groEL)基因和56×103蛋白扩增并测序分析。采用间接免疫荧光试验(IFA)对血清标本恙虫... 目的了解北京市平谷地区是否存在恙虫病东方体感染。方法采用巢式聚合酶链反应(nPCR),对平谷地区采集的30份临床标本进行恙虫病东方体热休克蛋白(groEL)基因和56×103蛋白扩增并测序分析。采用间接免疫荧光试验(IFA)对血清标本恙虫病东方体特异抗体检测。结果采用PCR共检测血液标本30份,均阳性(100%);用IFA检测28份患者血清抗体,25份阳性(89.3%);长片段PCR扩增,3份标本扩增阳性,阳性结果测序比对所有核苷酸序列相同,与Kawasaki的同源性为96%。结论首次从分子流行病学和血清流行病学的角度证实北京平谷地区存在恙虫病东方体。 展开更多
关键词 恙虫病 聚合酶反应 间接免疫荧光试验
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江苏省艾滋病病毒感染的分子流行病学研究 被引量:14
10
作者 羊海涛 邢辉 +6 位作者 贾成梅 梁浩 徐晓琴 魏明 李雷 陈钊 邵一鸣 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第11期976-979,共4页
目的 了解江苏省不同人群中艾滋病病毒 (HIV )各亚型毒株的流行情况和传播规律。方法 收集HIV感染者及患者的流行病学资料 ;无菌采集HIV感染者或艾滋病 (AIDS)患者抗凝全血标本 5ml,提取前病毒DNA ,用巢式聚合酶链反应 (nested PCR)... 目的 了解江苏省不同人群中艾滋病病毒 (HIV )各亚型毒株的流行情况和传播规律。方法 收集HIV感染者及患者的流行病学资料 ;无菌采集HIV感染者或艾滋病 (AIDS)患者抗凝全血标本 5ml,提取前病毒DNA ,用巢式聚合酶链反应 (nested PCR)扩增膜蛋白基因的C2~V3区 ,进行序列测定 ,鉴定病毒亚型。用威斯康星GCG软件进行共享序列、基因离散率的计算和毒株的聚类分析。结果 截止 2 0 0 1年底 ,江苏省已发现HIV 1中的A、B、C、D、E五种亚型和一个B亚型变种(B’)流行 ,C(占 40 .48% )和B’(3 8.10 % )亚型为主要流行株 ;静脉吸毒感染人群中 86.67%为C亚型 ,采供血和受血感染人群中 91.67%为B’亚型 ,在性途径传播人群中所有六种亚型均有 ,且分布较为均一。结论 有偿献血人群中B’亚型毒株由邻省传入 ,吸毒人群中C亚型毒株的传入主要与新疆籍流动人口的介入有关 ;多种亚型的并存说明江苏省存在着适宜AIDS流行的各种危险因素 ;提示今后在药物治疗。 展开更多
关键词 江苏 艾滋病病毒感染 分子流行病学 人类免疫缺陷病毒感染 聚合酶反应
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中国艾滋病病毒1型AE循环重组型毒株env基因的变异和进化分析 被引量:14
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作者 梁浩 邢辉 +8 位作者 魏民 陈钊 关琪 黄海龙 全宇 陈健平 洪坤学 施侣元 邵一鸣 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第11期966-970,共5页
目的 研究中国艾滋病病毒 1型 (HIV 1)AE循环重组型 (CRF0 1 AE)毒株env不同基因区序列变异的特点及其与进化压力的关系。方法 应用巢式聚合酶链反应 (nested PCR)对从全国部分省收集来的HIV 1感染者血液样本中的HIV 1外膜蛋白 (env)... 目的 研究中国艾滋病病毒 1型 (HIV 1)AE循环重组型 (CRF0 1 AE)毒株env不同基因区序列变异的特点及其与进化压力的关系。方法 应用巢式聚合酶链反应 (nested PCR)对从全国部分省收集来的HIV 1感染者血液样本中的HIV 1外膜蛋白 (env)基因进行扩增和亚型鉴定后 ,选择 3 4份CRF0 1 AE重组型HIV 1毒株env基因V3~V4区及其邻近区域的序列进行系统进化树和氨基酸变异分析 ,并计算和分析氨基酸同义替换 (Ks)值和非同义替换 (Ka)值及Ks Ka比值。结果基因系统树显示中国的 3 4份样本CRF0 1 AE重组型毒株与我国代表株AE .97CNGX2F和泰国代表株AE .CM 2 40、AE .93TH2 53聚集在一起。氨基酸替换主要发生在C3和V4区 ,而V3区和V3上游区氨基酸序列相对保守 ,糖基化位点也比较保守。V 3环顶端四肽以GPGQ为主 (87.50 % )。大部分毒株的第 3 0 6和 3 2 0位点上没有出现带正电荷的氨基酸。整个V 3~V4区的Ks值显著高于Ka值(P <0 .0 0 1) ,且Ks Ka比值显著高于 1(P <0 .0 0 1) ,只有V4区Ks Ka比值显著低于 1(P <0 .0 1)。结论 目前多数流行于中国的CRF0 1 AE重组型HIV 1毒株具有较高的同源性 ,在进化上关系密切。氨基酸替换主要发生在C3和V4区 ,而不是V3区。由于大部分毒株的第 3 0 6和 3 2 0位点上没有出现带正电荷的? 展开更多
关键词 中国 艾滋病病毒1型 AE循环重组型 ENV基因 基因变异 聚合酶反应
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永川毛霉型豆豉在发酵过程中微生物总量与区系变化规律 被引量:15
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作者 索化夷 赵欣 +4 位作者 骞宇 陈娟 李键 张玉 阚建全 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第19期124-131,共8页
采用巢式聚合酶链式反应配合变性梯度凝胶电泳技术对永川豆豉发酵过程中微生物区系生态演化进行解析。结果表明:永川豆豉在制曲过程中霉菌和细菌呈对数增长,进入后发酵阶段菌落总数快速下降,并保持在较低水平。永川豆豉在制曲前期有多... 采用巢式聚合酶链式反应配合变性梯度凝胶电泳技术对永川豆豉发酵过程中微生物区系生态演化进行解析。结果表明:永川豆豉在制曲过程中霉菌和细菌呈对数增长,进入后发酵阶段菌落总数快速下降,并保持在较低水平。永川豆豉在制曲前期有多种乳酸菌生长,后期乳酸菌受霉菌增长抑制,种类减少。在后发酵阶段奥德赛芽孢杆菌(Bacillus odysseyi)、乳酸杆菌(Lactobacillus oligofermentans)和乳酸杆菌(Lactobacillus lindneri)是优势菌群。同时在制曲初期也发现了费格森埃希菌(Escherichia fergusonii)等杂菌生长。永川豆豉制曲阶段优势霉菌是总状毛霉(Mucor racemosus),同时伴有有性根霉(Rhizopus sexualis)、匍枝根霉(Rhizopus stolonifer)、大孢联轭霉(Syzygites megalocarpus)、米根霉(Rhizopus oryzae)的生长,后发酵阶段有接合酵母(Zygosaccharomyces sp.)的参与。 展开更多
关键词 永川豆豉 微生物区系 聚合酶反应 变性梯度凝胶电泳
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巢式PCR和实时荧光定量PCR在莱姆病宿主动物监测中的应用评价 被引量:13
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作者 张琳 苗广青 +2 位作者 侯学霞 李博 郝琴 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS 2018年第5期425-427,共3页
目的应用巢式PCR和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法检测啮齿动物中伯氏疏螺旋体的带菌率,对2种方法在莱姆病宿主动物监测中的应用效果进行评价。方法2017年7-9月,在新疆维吾尔自治区(新疆)古尔图地区野外放置鼠夹,采集啮齿动物,并鉴别种类... 目的应用巢式PCR和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法检测啮齿动物中伯氏疏螺旋体的带菌率,对2种方法在莱姆病宿主动物监测中的应用效果进行评价。方法2017年7-9月,在新疆维吾尔自治区(新疆)古尔图地区野外放置鼠夹,采集啮齿动物,并鉴别种类;采用巢式PCR和qRT-PCR 2种方法检测标本携带伯氏疏螺旋体情况,并对2种方法的检测结果进行统计学分析。对巢式PCR检测的阳性标本进行测序和序列比对分析,以初步确定伯氏疏螺旋体的基因型别。结果共检测啮齿动物标本134份,巢式PCR和qRT-PCR检测阳性率分别为13.43%和12.69%,差异无统计学意义(χ~2=0.000,P=1.000);阳性标本均为长尾黄鼠,总阳性率为20.15%,其中8份标本经2种方法检测结果均为阳性;10份巢式PCR检测为阳性的标本经qRT-PCR检测为阴性,9份qRT-PCR检测为阳性的标本经巢式PCR检测为阴性。采用q RT-PCR方法共检出伯氏疏螺旋体阳性17份,阳性样本Ct值为33.49~37.89。结论2种方法均可用于啮齿动物的伯氏疏螺旋体检测,同时使用2种方法可提高伯氏疏螺旋体的检出率。巢式PCR方法检测可以了解新疆古尔图地区啮齿动物感染伯氏疏螺旋体的基因型别;而qRT-PCR方法则可对标本中的细菌载量进行定量分析。 展开更多
关键词 伯氏疏螺旋体 啮齿动物 聚合酶反应 实时荧光定量聚合酶反应
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北京地区流行的HIV-1 CRF01AE株基因特征研究 被引量:11
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作者 叶景荣 卢红艳 +2 位作者 白立石 辛若雷 曾毅 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1231-1234,共4页
目的 分析北京地区HIV-1 CRF01 AE株在的基因特征.方法 采集北京地区2006-2008年新确证HIV感染者的抗凝全血标本,分离血浆和提取病毒RNA,用反转录/巢式聚合酶链式反应扩增病毒gag基因,对获得的105条CRF01_AE株序列进行系统进化分析,并... 目的 分析北京地区HIV-1 CRF01 AE株在的基因特征.方法 采集北京地区2006-2008年新确证HIV感染者的抗凝全血标本,分离血浆和提取病毒RNA,用反转录/巢式聚合酶链式反应扩增病毒gag基因,对获得的105条CRF01_AE株序列进行系统进化分析,并通过计算组间距离和Entropy核苷酸多态性差异方法分析病毒株的遗传特征.结果 在CRF01 AE株序列系统进化树中存在4个主要的亚簇,Homo-Max亚簇包含67例样本,同参考株CM240组间基因 离散率为5.4%,组内离散率为2.8%;Hetero亚簇包含6例样本,组间基因离散率为4.8%,组内离散率为4.2%.Mix亚簇包含8例样本,组间基因离散率为4.2%,组内离散率为5.2%.Homo-Min亚簇包含18例样本,组间基因离散率为4.4%,组内离散率为2.8%.Homo-Max、Hetero和Homo-Min亚簇无其他国家的序列,Mix亚簇与越南和泰国CRF01 AE株关系密切;核苷酸多态性分析结果显示,以Mix亚簇为参照,Homo-Max、Homo-Min和Hetero亚簇分别有37、29和11个位点的核苷酸组成,差异有统计学意义.结论 北京地区流行的CRF01_AE病毒株中首次观察到4个独立的亚簇;Homo-Max亚簇株为最主要的CRF01_AE株;Mix亚簇株与来自于泰国和越南的CRF01 AE株有较高同源性. 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒 亚型 聚合酶反应
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三种检测方法在疟疾诊断中的应用 被引量:11
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作者 李明 魏卓超 +1 位作者 邓晓丽 许航 《中国热带医学》 CAS 2019年第6期598-599,共2页
目的探讨三种检测方法在辽宁省鞍山地区疟疾诊断中的应用价值。方法分别采用镜检、疟原虫抗原快速检测(RDT)胶体金法、巢式PCR法,对鞍山地区2016-2018年16份疟疾疑似病例血样进行检测。结果镜检法、胶体金法、PCR法检测阳性率分别为62.... 目的探讨三种检测方法在辽宁省鞍山地区疟疾诊断中的应用价值。方法分别采用镜检、疟原虫抗原快速检测(RDT)胶体金法、巢式PCR法,对鞍山地区2016-2018年16份疟疾疑似病例血样进行检测。结果镜检法、胶体金法、PCR法检测阳性率分别为62.50%、75.00%和68.75%,三种检测方法阳性率比较差异无统计学意义(P=0.748)。以镜检法为金标准,PCR法敏感性为100.00%,特异性为83.33%,以胶体金法为金标准,PCR法敏感性为83.33%,特异性为75.00%,胶体金法敏感性最强。结论在鞍山地区疟疾检测中,RDT胶体金法结合PCR法和镜检法诊断疟原虫,能有效提高诊断率。 展开更多
关键词 疟疾 镜检 胶体金法 聚合酶反应
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深圳市2010年HIV-1分子流行病学调查 被引量:10
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作者 石向东 陈琳 +3 位作者 杨峥嵘 王晓辉 赵锦 王芳 《中国热带医学》 CAS 2012年第2期192-194,197,共4页
目的了解2010年艾滋病病毒-1型(HIV-1)毒株亚型在深圳市的流行情况,为预防和控制HIV在本市的流行提供有价值的资料。方法收集2010年深圳市HIV-1确认为阳性的样本150例,应用巢式聚合酶链反应(nested-PCR)技术,对该样本膜蛋白基因(env基因... 目的了解2010年艾滋病病毒-1型(HIV-1)毒株亚型在深圳市的流行情况,为预防和控制HIV在本市的流行提供有价值的资料。方法收集2010年深圳市HIV-1确认为阳性的样本150例,应用巢式聚合酶链反应(nested-PCR)技术,对该样本膜蛋白基因(env基因)和核心蛋白(gag基因)进行扩增,并对各基因区核苷酸序列进行测定和分析。结果共有128份样本获得分型结果,其中CRF01_AE重组株占63.3%(81/128),B’亚型占14.1%(18/128),CRF07_BC重组株占13.3%(17/128),CRF08_BC重组株占7.0%(9/128),C亚型占0.8%(1/128),A1亚型占1.6%(2/128);CRF01_AE重组株以吸毒传播、异性性传播和同性性传播为主,分别占其感染人群的23.5%、45.7%和30.9%,CRF07_BC、CRF08_BC重组株以异性性传播和同性性传播为主,分别占各感染人群的41.2%、58.8%和66.7%、33.3%%,B’亚型主要分布在性传播、献/输血和母婴传播人群。本文首次在吸毒人群中发现A1亚型。结论 2010年深圳市的HIV-1是以CRF01_AE重组株、B’亚型、CRF07_BC和CRF08_BC重组株为主要流行毒株,也存在A1和C亚型;CRF01_AE重组株是各传播途径人群中的主要流行株,并且CRF01_AE重组株在各人群中所占的比例高于国内其他地区。 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒-1型 序列分析 亚型 聚合酶反应
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复发性阿弗他溃疡患者唾液、菌斑中幽门螺杆菌的观察 被引量:7
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作者 张特 聂敏海 +1 位作者 周骢 胡佳 《华西口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期378-379,共2页
关键词 复发性阿弗他溃疡 口腔牙菌斑 幽门螺杆菌 H.PYLORI感染 唾液 患者 聚合酶反应 H.PYLORI 口腔黏膜病 chain
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广西HIV/AIDS患者合并感染隐孢子虫现况及基因分型初步研究 被引量:10
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作者 王尊付 蒋智华 +3 位作者 于冰雪 周冬生 林源 唐雯茜 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期550-553,共4页
目的了解广西艾滋病病毒感染/艾滋病(HIV/AIDS)患者隐孢子虫感染情况及虫株类型。方法收集广西南宁、桂林、钦州、百色及河池等地285名HIV/AIDS患者和南宁150名HIV阴性人群粪便样本,分别采用改良抗酸染色法和基于18S rRNA基因巢式PCR方... 目的了解广西艾滋病病毒感染/艾滋病(HIV/AIDS)患者隐孢子虫感染情况及虫株类型。方法收集广西南宁、桂林、钦州、百色及河池等地285名HIV/AIDS患者和南宁150名HIV阴性人群粪便样本,分别采用改良抗酸染色法和基于18S rRNA基因巢式PCR方法进行隐孢子虫检测,并对巢氏PCR产物进行测序和同源性比对,以明确基因型。结果广西HIV/AIDS患者隐孢子虫感染率为0.70%(2/285),其中伴有慢性腹泻者感染率为6.67%(2/30),HIV阴性者隐孢子虫感染率为0(0/150),后两者差异有统计学意义(P=0.002)。2例合并感染隐孢子虫的HIV/AIDS患者均来自桂林,虫株基因鉴定为安氏隐孢子虫和人隐孢子虫。结论广西HIV/AIDS患者存在隐孢子虫合并感染,感染虫株为安氏隐孢子虫和人隐孢子虫。 展开更多
关键词 隐孢子虫 感染 HIV 艾滋病 聚合酶反应 腹泻 广西壮族自治区
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西沙群岛恙螨所携恙虫病东方体的序列分析 被引量:10
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作者 王珊珊 詹道成 +4 位作者 彭桂福 潘华 黄佳亮 曾年华 王志斌 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2002年第6期66-68,共3页
目的 用分子生物学技术鉴定西沙群岛恙虫病东方体的基因序列 ,探讨南海岛屿恙虫病疫源地的形成。方法 以巢式聚合酶链反应 (NPCR)检测西沙群岛恙螨所携恙虫病东方体的 5 6kDa蛋白基因片段 ,继而将NPCR产物克隆进pGEM-T载体并且测序 ,... 目的 用分子生物学技术鉴定西沙群岛恙虫病东方体的基因序列 ,探讨南海岛屿恙虫病疫源地的形成。方法 以巢式聚合酶链反应 (NPCR)检测西沙群岛恙螨所携恙虫病东方体的 5 6kDa蛋白基因片段 ,继而将NPCR产物克隆进pGEM-T载体并且测序 ,测序结果在国际互联网作多序列比较和进化树分析。结果 从西沙群岛收集的恙螨扩增出 5 0 7bp目的片段 ,序列分析证实与Karp株同源性 85 % ,与Gilliam株同源性 6 8% ,与Yonchon株同源性 6 7% ,与Kato株同源性 6 5 %。结论 西沙群岛的恙螨携带恙虫病东方体以Karp型为主。 展开更多
关键词 恙虫病东方体 序列分析 西沙群岛 基因序列 聚合酶反应
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转基因玉米59122品系的特异性检测 被引量:8
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作者 许文涛 杨蓉 +4 位作者 陆姣 张南 罗云波 何景 黄昆仑 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第4期139-142,共4页
使用反向聚合酶链式反应(PCR)技术克隆了转基因玉米59122的外源基因与玉米基因组之间的两段侧翼序列,并据其左侧侧翼序列设计了具品系特异性的引物,运用半巢式PCR技术建立了59122的品系特异性二重PCR检测方法,扩增片段100bp,横跨pat终... 使用反向聚合酶链式反应(PCR)技术克隆了转基因玉米59122的外源基因与玉米基因组之间的两段侧翼序列,并据其左侧侧翼序列设计了具品系特异性的引物,运用半巢式PCR技术建立了59122的品系特异性二重PCR检测方法,扩增片段100bp,横跨pat终止子与转基因玉米侧翼基因之间。以转基因玉米59122、MON863、MON810、GA21、NK603,转基因大豆Roundup Ready和转基因油菜GT73等为材料,证明本方法与其他转基因作物具有高特异性。本方法在检测59122时,确定出连接体系中线性DNA的最佳质量浓度为1ng/μL左右,检出限达到0.1%,灵敏度为38个单倍体基因组拷贝数。因此可准确、快速、高效地检测转基因玉米及其产品,或作为常规PCR定性检测后的验证方法。 展开更多
关键词 转基因作物 品系特异性检测 聚合酶反应 反向聚合酶反应 二重聚合酶反应
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