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利用实验细菌种群的元素表型尝试构建适应性景观
1
作者
赵琳
张全国
张大勇
《北京师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期161-166,共6页
适应性景观这一概念激发了进化生物学领域内的许多研究,它的性质对预测种群进化过程具有重要意义.理论研究预测了多种景观的形态,但能被实验数据支持的还很少,因为实验构建适应性景观非常困难.一些微生物实验进化研究通过分析种群进化...
适应性景观这一概念激发了进化生物学领域内的许多研究,它的性质对预测种群进化过程具有重要意义.理论研究预测了多种景观的形态,但能被实验数据支持的还很少,因为实验构建适应性景观非常困难.一些微生物实验进化研究通过分析种群进化的可重复性,间接推测了景观的崎岖性,但不能给出其拓扑结构的具体信息.本研究尝试将适合度数据映射到表型空间的办法来直接呈现适应性景观的形态.共使用9个不同基因型的大肠杆菌株系作为祖先,对每个基因型建立6个重复家系,在一个限定养分的环境中对这54个种群进行了约1 100代的选择实验.在考察后代种群对选择环境响应(菌株的氮、磷质量分数w及适合度变化)的同时,利用进化断点处的实测数据信息,通过局域多项式回归拟合的方法,构建了基于细菌元素表型的适应性景观.研究发现,不同菌株家系对相同的选择环境表现出不同的响应模式;大部分后代种群相比其祖先提高了适应性;适应性景观呈现崎岖多峰的形态.
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关键词
大肠杆菌
实验进化
选择响应
崎岖
景观
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职称材料
题名
利用实验细菌种群的元素表型尝试构建适应性景观
1
作者
赵琳
张全国
张大勇
机构
北京师范大学生物多样性与生态工程教育部重点实验室
出处
《北京师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期161-166,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(31030014)
文摘
适应性景观这一概念激发了进化生物学领域内的许多研究,它的性质对预测种群进化过程具有重要意义.理论研究预测了多种景观的形态,但能被实验数据支持的还很少,因为实验构建适应性景观非常困难.一些微生物实验进化研究通过分析种群进化的可重复性,间接推测了景观的崎岖性,但不能给出其拓扑结构的具体信息.本研究尝试将适合度数据映射到表型空间的办法来直接呈现适应性景观的形态.共使用9个不同基因型的大肠杆菌株系作为祖先,对每个基因型建立6个重复家系,在一个限定养分的环境中对这54个种群进行了约1 100代的选择实验.在考察后代种群对选择环境响应(菌株的氮、磷质量分数w及适合度变化)的同时,利用进化断点处的实测数据信息,通过局域多项式回归拟合的方法,构建了基于细菌元素表型的适应性景观.研究发现,不同菌株家系对相同的选择环境表现出不同的响应模式;大部分后代种群相比其祖先提高了适应性;适应性景观呈现崎岖多峰的形态.
关键词
大肠杆菌
实验进化
选择响应
崎岖
景观
Keywords
Escherichia coli
experimental evolution
responses to selection
rugged landscape
分类号
Q931 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用实验细菌种群的元素表型尝试构建适应性景观
赵琳
张全国
张大勇
《北京师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016
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