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基于网络药理学与分子对接技术的鲜竹沥治疗“咳、喘、痰”机制及其质量标志物预测分析
被引量:
18
1
作者
张雨恬
伍振峰
+5 位作者
黄艺
章俊
张询
林瑞华
万娜
杨明
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第24期7538-7549,共12页
目的应用网络药理学和分子对接方法,对鲜竹沥发挥“咳、喘、痰”作用的机制及潜在的质量标志物(quality marker,Q-Marker)预测分析。方法采用干馏法和火烤法制备鲜竹沥,对鲜竹沥的指纹图谱进行研究,筛选并预测其中14个成分的潜在作用靶...
目的应用网络药理学和分子对接方法,对鲜竹沥发挥“咳、喘、痰”作用的机制及潜在的质量标志物(quality marker,Q-Marker)预测分析。方法采用干馏法和火烤法制备鲜竹沥,对鲜竹沥的指纹图谱进行研究,筛选并预测其中14个成分的潜在作用靶点及通路,结合文献数据库分析确定“咳、喘、痰”病症的靶基因;取药物与疾病交集基因,将交集基因上传String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,利用Rstudio的clusterProfiler功能对交集基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;预测鲜竹沥的Q-Marker,并运用分子对接软件对部分关键靶点及其对应成分进行分子对接,验证网络分析结果。结果采用指纹图谱研究得到8批干馏法、火烤法的鲜竹沥主要活性成分,经网络药理学及分子对接分析鲜竹沥对“咳、喘、痰”病症的治疗作用,推测鲜竹沥的Q-Marker为香草酸、对乙基苯酚、丁香醛、二氢丁香酚、对乙烯基愈创木酚,主要通过调节炎症反应、环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)信号通路、缺氧诱导因子-1α(hypoxiainducible factor-1α,HIF-1α)信号通路、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)信号通路等重要生物通路来发挥止咳、平喘、化痰的作用。结论通过预测鲜竹沥的Q-Marker,为提升其质量控制标准奠定了基础,同时也为鲜竹沥功效关联物质的研究及作用机制的阐释提供参考,为其二次开发以及扩大临床使用范围提供参考依据。
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关键词
鲜竹沥
网络药理学
质量标志物
分子
对
接
止咳
化痰
平喘
香草酸
对
乙
基
苯酚
丁香醛
二氢丁香酚
对
乙烯基
愈创木酚
原文传递
基于偏最小二乘法与亲水亲油平衡值探讨当归挥发油乳化物质基础
被引量:
4
2
作者
柳小莉
王芳
+6 位作者
黄小英
雷星
王梁凤
李慧婷
陈青垚
杨明
张小飞
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第14期3583-3591,共9页
基于偏最小二乘法(PLS)与亲水亲油平衡值(HLB)探讨当归挥发油乳化物质基础。对产地甘肃、云南、青海的当归挥发油乳化液样品测定浊度,GC-MS分析乳化液中化学成分;以化学成分为自变量浊度为因变量建立PLS模型,模型诊断参数R^(2) X与R^(2...
基于偏最小二乘法(PLS)与亲水亲油平衡值(HLB)探讨当归挥发油乳化物质基础。对产地甘肃、云南、青海的当归挥发油乳化液样品测定浊度,GC-MS分析乳化液中化学成分;以化学成分为自变量浊度为因变量建立PLS模型,模型诊断参数R^(2) X与R^(2) Y为评价指标,筛选出与浊度呈正相关的化学成分进行HLB计算,以确定当归挥发油乳化物质基础。当归挥发油乳化液81组样品化学成分与浊度PLS分析中,模型R^(2) X与R^(2) Y较高有较好的拟合解释能力,乳化液中与浊度呈正相关的7种化学成分分别为对乙烯基愈疮木酚、丁烯基酞内酯、正癸烷、(E)-β-罗勒烯、正十二烷、藁本内酯与萜品油烯。对乙烯基愈疮木酚HLB为4.4,在表面活性剂乳化作用范围内,且都与主产地乳化液浊度正相关,确定对乙烯基愈疮木酚为当归挥发油产生乳化的物质基础。筛选的乳化物质基础为当归挥发油乳化机制及去乳化解决方案奠定实验基础。
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关键词
当归挥发油
乳化
偏最小二乘法
亲水亲油平衡值
物质
基
础
对
乙烯基
愈创木酚
原文传递
题名
基于网络药理学与分子对接技术的鲜竹沥治疗“咳、喘、痰”机制及其质量标志物预测分析
被引量:
18
1
作者
张雨恬
伍振峰
黄艺
章俊
张询
林瑞华
万娜
杨明
机构
江西中医药大学现代中药制剂教育部重点实验室
江西中医药大学附属医院
江西中医药大学药学院
南昌大学第一附属医院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第24期7538-7549,共12页
基金
国家重点研发计划项目(2018YFC1707203)
江西省科学技术协会项目(赣科协字[2018]117号)
+2 种基金
国家级大学生创新创业计划项目(202010412011)
江西省中医药管理局科技计划项目(2019A031)
江西省教育厅科学研究青年项目(GJJ180692)。
文摘
目的应用网络药理学和分子对接方法,对鲜竹沥发挥“咳、喘、痰”作用的机制及潜在的质量标志物(quality marker,Q-Marker)预测分析。方法采用干馏法和火烤法制备鲜竹沥,对鲜竹沥的指纹图谱进行研究,筛选并预测其中14个成分的潜在作用靶点及通路,结合文献数据库分析确定“咳、喘、痰”病症的靶基因;取药物与疾病交集基因,将交集基因上传String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,利用Rstudio的clusterProfiler功能对交集基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;预测鲜竹沥的Q-Marker,并运用分子对接软件对部分关键靶点及其对应成分进行分子对接,验证网络分析结果。结果采用指纹图谱研究得到8批干馏法、火烤法的鲜竹沥主要活性成分,经网络药理学及分子对接分析鲜竹沥对“咳、喘、痰”病症的治疗作用,推测鲜竹沥的Q-Marker为香草酸、对乙基苯酚、丁香醛、二氢丁香酚、对乙烯基愈创木酚,主要通过调节炎症反应、环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)信号通路、缺氧诱导因子-1α(hypoxiainducible factor-1α,HIF-1α)信号通路、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)信号通路等重要生物通路来发挥止咳、平喘、化痰的作用。结论通过预测鲜竹沥的Q-Marker,为提升其质量控制标准奠定了基础,同时也为鲜竹沥功效关联物质的研究及作用机制的阐释提供参考,为其二次开发以及扩大临床使用范围提供参考依据。
关键词
鲜竹沥
网络药理学
质量标志物
分子
对
接
止咳
化痰
平喘
香草酸
对
乙
基
苯酚
丁香醛
二氢丁香酚
对
乙烯基
愈创木酚
Keywords
fresh bamboo sap
network pharmacology
quality marker
molecular docking
relieving cough
resolving phlegm
relieving asthma
vanillic acid
p-ethylphenol
syringaldehyde
dihydroeugenol
p-vinylguaiacol
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
基于偏最小二乘法与亲水亲油平衡值探讨当归挥发油乳化物质基础
被引量:
4
2
作者
柳小莉
王芳
黄小英
雷星
王梁凤
李慧婷
陈青垚
杨明
张小飞
机构
成都中医药大学药学院
江西中医药大学现代中药制剂教育部重点实验室
陕西中医药大学药学院
出处
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第14期3583-3591,共9页
基金
江西省重大科技研发专项(20194ABC28009)
国家自然科学基金项目(81703720)。
文摘
基于偏最小二乘法(PLS)与亲水亲油平衡值(HLB)探讨当归挥发油乳化物质基础。对产地甘肃、云南、青海的当归挥发油乳化液样品测定浊度,GC-MS分析乳化液中化学成分;以化学成分为自变量浊度为因变量建立PLS模型,模型诊断参数R^(2) X与R^(2) Y为评价指标,筛选出与浊度呈正相关的化学成分进行HLB计算,以确定当归挥发油乳化物质基础。当归挥发油乳化液81组样品化学成分与浊度PLS分析中,模型R^(2) X与R^(2) Y较高有较好的拟合解释能力,乳化液中与浊度呈正相关的7种化学成分分别为对乙烯基愈疮木酚、丁烯基酞内酯、正癸烷、(E)-β-罗勒烯、正十二烷、藁本内酯与萜品油烯。对乙烯基愈疮木酚HLB为4.4,在表面活性剂乳化作用范围内,且都与主产地乳化液浊度正相关,确定对乙烯基愈疮木酚为当归挥发油产生乳化的物质基础。筛选的乳化物质基础为当归挥发油乳化机制及去乳化解决方案奠定实验基础。
关键词
当归挥发油
乳化
偏最小二乘法
亲水亲油平衡值
物质
基
础
对
乙烯基
愈创木酚
Keywords
Angelicae Sinensis Radix volatile oil
emulsifying
partial least squares
hydrophile-lipophile balance value
material basis
2-methoxy-4-vinylphenol
分类号
R284 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学与分子对接技术的鲜竹沥治疗“咳、喘、痰”机制及其质量标志物预测分析
张雨恬
伍振峰
黄艺
章俊
张询
林瑞华
万娜
杨明
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2021
18
原文传递
2
基于偏最小二乘法与亲水亲油平衡值探讨当归挥发油乳化物质基础
柳小莉
王芳
黄小英
雷星
王梁凤
李慧婷
陈青垚
杨明
张小飞
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
4
原文传递
已选择
0
条
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