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寡核苷酸DNA Microarray用于HLA DRB1基因分型的研究 被引量：17
1
作者 陈君男 李瑶 +5 位作者 李亚莉 秦红友 李荣宇 曹慧敏 谢毅 毛裕民 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第10期887-894,共8页
对寡核苷酸DNAMicroarray用于HLADRB1基因分型的技术进行研究。常规的酚 /氯仿法提取标准血样基因组DNA ,在DRB1的exon 2区域设计一对引物 ,经PCR扩增基因组相应区段并用Cy5 dCTP进行标记。设计寡核苷酸分型探针 ,将探针固定在APS PDC... 对寡核苷酸DNAMicroarray用于HLADRB1基因分型的技术进行研究。常规的酚 /氯仿法提取标准血样基因组DNA ,在DRB1的exon 2区域设计一对引物 ,经PCR扩增基因组相应区段并用Cy5 dCTP进行标记。设计寡核苷酸分型探针 ,将探针固定在APS PDC法制作的DNAMicroarray上 ,用标记的PCR产物与之杂交 ,扫描仪对杂交结果进行扫描 ,Imagene软件对杂交图象进行分析。共检测了 33例标准血样的HLADRB1基因型。检测结果证明研制的DNAMicroarray准确、灵敏。DNAMicroarray技术可以有效地检测DRB1等位基因 ,对比常规的PCR SSP和PCR SSO方法、分型基因芯片方法更为直观 。 展开更多
关键词 HLA DRB1 等位基因 基因分型 寡核苷酸dna微阵列 PCR-SSP PCR-SSO 基因分型
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寡核苷酸DNA微阵列用于人类白细胞抗原-DR53组基因分型的研究 被引量：1
2
作者 肖家全 李成涛 +2 位作者 谭建明 康敏华 李瑶 《中华外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期225-227,共3页
目的　建立用于人类白细胞抗原 (HLA) DR5 3组基因分型的寡核苷酸DNA微阵列。方法　根据中国汉族人群HLA DRB等位基因的频率设计特异性的分型探针 ,制作寡核苷酸DNA微阵列。通过组间特异引物扩增基因组DR5 3相应区段的DNA ,扩增中用Cy5... 目的　建立用于人类白细胞抗原 (HLA) DR5 3组基因分型的寡核苷酸DNA微阵列。方法　根据中国汉族人群HLA DRB等位基因的频率设计特异性的分型探针 ,制作寡核苷酸DNA微阵列。通过组间特异引物扩增基因组DR5 3相应区段的DNA ,扩增中用Cy5 dCTP荧光标记 ,扩增标记后的产物与芯片的探针杂交 ,通过杂交产生的荧光信号及分布格局确定样品的基因亚型。分型结果用标准DNA和序列特异寡核苷酸探针杂交验证。　结果　经寡核苷酸DNA微阵列分型 ,111份样本中共检出DR5 3组位点 72个 ,其中DR934个 ,DR42 5个 ,DR713个 ,无一例假阳性或假阴性 ,重复率和准确率均达到 10 0 %。检测总耗时约 5h。　结论　寡核苷酸DNA微阵列用于HLA DR5 3组基因分型具有高分辨率、高特异性和简单快速的特点 ,适合于临床应用。 展开更多
关键词 寡核苷酸dna微阵列 基因分型 等位基因 人类白细胞抗原 HLA-DR53
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