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结膜吸吮线虫中富亮氨酸结构域蛋白的筛选及生物信息学分析 被引量：6
1
作者 江楠 叶昌林 +3 位作者 黄琳 王灵军 刘晖 郑明辉 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第9期984-988,993,共6页
目的对结膜吸吮线虫分泌蛋白基因组数据进行注释分析,筛选出富亮氨酸结构域蛋白,分析预测该基因序列及其编码蛋白质的结构和功能。方法对结膜吸吮线虫基因组进行结构分析和注释,在分泌蛋白组中筛选富亮氨酸结构域蛋白基因序列,利用ExPAS... 目的对结膜吸吮线虫分泌蛋白基因组数据进行注释分析,筛选出富亮氨酸结构域蛋白,分析预测该基因序列及其编码蛋白质的结构和功能。方法对结膜吸吮线虫基因组进行结构分析和注释,在分泌蛋白组中筛选富亮氨酸结构域蛋白基因序列,利用ExPASY、DNAstar、MEGA 7.0等生物信息学软件预测分析其编码蛋白的理化性质、抗原表位等,并进行同源序列比对分析;建立系统发育树,进行系统进化分析。结果从结膜吸吮线虫分泌蛋白组中筛选出1条含有完整编码框的富亮氨酸结构域蛋白基因序列,其长度为2 439bp,编码812个氨基酸。编码蛋白相对分子质量(Mr)为204.001 24×103,为疏水性蛋白,含一个信号肽,无跨膜区,且含有较多抗原表位,与盘尾丝虫同源序列相似性为66%。结论生物信息学分析结膜吸吮线虫富亮氨酸结构域蛋白含有抗原表位,故该蛋白及其编码基因序列可作为诊断抗原和疫苗候选分子,也为该蛋白的功能研究了提供基础数据。 展开更多
关键词 结膜吸吮线虫 富亮氨酸结构域蛋白 生物信息
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富含亮氨酸重复结构域蛋白3炎症小体在高血压大鼠主动脉夹层模型形成中的作用 被引量：1
2
作者 崔俊 夏军 《中华高血压杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1156-1165,共10页
目的建立高血压大鼠主动脉夹层(AD)模型,探讨富含亮氨酸重复结构域蛋白(NLRP)3炎症小体在高血压促AD形成中的作用及相关分子机制。方法 40只雌性SD大鼠(3周龄,体质量60g左右)随机分为4组,每组10只:对照组:正常喂食饮水;β-氨基丙腈(BAPN... 目的建立高血压大鼠主动脉夹层(AD)模型,探讨富含亮氨酸重复结构域蛋白(NLRP)3炎症小体在高血压促AD形成中的作用及相关分子机制。方法 40只雌性SD大鼠(3周龄,体质量60g左右)随机分为4组,每组10只:对照组:正常喂食饮水;β-氨基丙腈(BAPN)组(AD模型组):0.25%BAPN喂食;醋酸去氧皮质酮(DOCA)组:0.25%BAPN喂食,并皮下注射DOCA油剂;左旋硝基精氨酸甲酯(l-NAME)组:0.25%BAPN喂食,饮含l-NAME水。记录各组大鼠饮水、体质量及血压;动物死亡后(对照组大鼠为处死,模型组为自然死亡)分离主动脉行Masson三色染色及EVG染色,分别观察主动脉内胶原纤维、弹力纤维的变化情况,行免疫组化染色观察主动脉中NLRP3炎症小体相关蛋白[NLRP3、Caspase-1、白细胞介素1β(IL-1β)]的表达情况,采用实时聚合酶链反应及Western blot法分别检测主动脉内NLRP3炎症小体相关蛋白的基因及蛋白表达情况。结果与对照组比较,BAPN喂养2周后大鼠体质量明显减轻,DOCA组大鼠饮水量明显增加。DOCA组、l-NAME组大鼠血压较BAPN组明显升高[干预第2周平均动脉压:(95.4±10.1)、(110.0±9.9)比(70.4±2.9)mm Hg;干预第3周平均动脉压:(128.4±13.8)、(118.5±8.1)比(76.4±5.3)mm Hg,均P<0.01]。Masson三色染色显示:DOCA组、l-NAME组大鼠主动脉中胶原纤维较BAPN组明显增多(均P<0.05)。EVG染色显示:DOCA组、l-NAME组大鼠主动脉中弹力纤维较BAPN组明显增多(均P<0.05),且排列更加紊乱,断裂情况更加严重。免疫组化显示:与BAPN组比较,DOCA组、l-NAME组大鼠主动脉中NLRP3炎症小体相关蛋白表达增加(NLRP3:6.63±0.51、6.78±0.47比3.32±0.39;Caspase-1:5.22±0.45、6.19±0.31比3.36±0.30;IL-1β:5.51±0.53、5.80±0.40比3.18±0.35;均P<0.05)。与BAPN组比较,DOCA组及l-NAME组大鼠主动脉内NLRP3炎症小体相关蛋白在基因水平、蛋白水平的表达显著增加(均P<0.05)。结论 NLRP3炎症小体参与高血压促大鼠AD的形成。 展开更多
关键词 主动脉夹层 高血压 弹性纤维 胶原纤维 富含亮氨酸重复结构域蛋白3炎症小体
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中期胃癌患者根治术后复发情况与术前LETM1、TIMP-1表达的关系研究
3
作者 万云杰 夏甘树 +1 位作者 王子铭 张志忠 《实用癌症杂志》 2024年第1期30-33,共4页
目的探讨中期胃癌患者根治术后复发情况与术前亮氨酸拉链EFhand结构域跨膜蛋白1(LETM1)、基质金属蛋白酶组织抑制剂(TIMP-1)的关系。方法回顾性分析行胃癌根治术的中期胃癌患者102例,术前行LETM1、TIMP-1检查,以术后3年内胃癌是否复发... 目的探讨中期胃癌患者根治术后复发情况与术前亮氨酸拉链EFhand结构域跨膜蛋白1(LETM1)、基质金属蛋白酶组织抑制剂(TIMP-1)的关系。方法回顾性分析行胃癌根治术的中期胃癌患者102例,术前行LETM1、TIMP-1检查,以术后3年内胃癌是否复发为评估标准,经ROC曲线分析术后3年,术前LETM1、TIMP-1及联合检测在评估胃癌根治术后复发状况中的预测效能(敏感度、特异度);比较生存时间≥3年及<3年患者术前LETM1、TIMP-1表达情况。结果术后3年内胃癌复发57例(55.88%),未复发45例(44.12%)。其中65例LETM1阳性患者中,共有48例(73.85%)复发,17例(26.15%)未复发;37例LETM1阴性患者中共有9例(24.32%)复发,28例未复发(75.68%);TIMP-1阳性共63例,有46例(73.02%)复发,17例未复发(26.98%);TIMP-1阴性共有39例,其中有11例(28.21%)复发,28例未复发(71.79%)。联合检测预测3年内复发71例(69.61%),无复发31例(30.39%)。LETM1高表达共54例,其中43例(79.63%)生存时间<3年,11例(20.37%)生存时间≥3年;LETM1低表达共48例,其中10例(20.83%)生存时间<3年,38例(79.17%)生存时间≥3年;TIMP-1阳性共有62例,其中46例(74.19%)生存时间<3年,16例(25.81%)生存时间≥3年;TIMP-1阴性共有40例,其中共有7例(17.50%)生存时间<3年,33例(82.50%)生存时间≥3年。结论中期胃癌根治术后是否复发与LETM1、TIMP-1表达关系密切,同时LETM1、TIMP-1检测亦可用于预测中期胃癌患者根治术后生存状况,且准确率较高,具备临床价值。 展开更多
关键词 胃癌根治术 胃癌 复发 基质金属蛋白酶组织抑制剂 亮氨酸拉链EFhand结构域跨膜蛋白1
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猪囊尾蚴排泄分泌抗原LRRC15蛋白的原核表达及多克隆抗体制备
4
作者 汪倩倩 王世敏 +4 位作者 王乾飞 袁凤玲 何威 李丽竹 周必英 《中华地方病学杂志》 CAS 北大核心 2023年第9期704-709,共6页
目的构建猪带绦虫重组质粒pET30a-富含亮氨酸重复序列(LRR)结构域15(LRRC15),原核表达纯化的LRRC15重组蛋白,制备兔多克隆抗体。方法采用全基因合成方法,获得猪带绦虫LRRC15蛋白编码基因;将其克隆至pET30a载体,构建重组质粒pET30a-LRRC... 目的构建猪带绦虫重组质粒pET30a-富含亮氨酸重复序列(LRR)结构域15(LRRC15),原核表达纯化的LRRC15重组蛋白,制备兔多克隆抗体。方法采用全基因合成方法,获得猪带绦虫LRRC15蛋白编码基因;将其克隆至pET30a载体,构建重组质粒pET30a-LRRC15,并进行双酶切PCR鉴定;将重组质粒转化至大肠埃希菌BL21(DE3)感受态细胞,用异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导表达LRRC15重组蛋白,十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析鉴定表达产物;用Ni-IDA亲和层析柱纯化LRRC15重组蛋白,SDS-PAGE进行分析鉴定;蛋白质印迹法(Western blot,WB)鉴定纯化重组蛋白特异性;用纯化的LRRC15重组蛋白免疫新西兰兔,制备LRRC15多克隆抗体,用间接酶联免疫吸附试验(ELISA)测定纯化多克隆抗体的效价。结果经PCR鉴定,扩增出长度为1506 bp的条带,与LRRC15基因相符;经SDS-PAGE和WB鉴定,获得相对分子质量(Mr)约为55.36×10^(3)的LRRC15目的蛋白;用LRRC15重组蛋白免疫新西兰兔,获得LRRC15多克隆抗体,其效价为1∶1587200。结论成功构建重组质粒pET30a-LRRC15,制备出猪带绦虫LRRC15重组蛋白,并获得了高纯度、高效价的LRRC15重组蛋白兔抗多克隆抗体。 展开更多
关键词 猪带绦虫 猪囊尾蚴 排泄分泌抗原 富含亮氨酸重复序列结构域15蛋白 原核表达 多克隆抗体
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非小细胞肺癌患者组织LETM1表达及价值分析
5
作者 柴晓婧 蔡甜甜 邹龙 《河北医药》 CAS 2023年第16期2444-2447,共4页
目的探讨非小细胞肺癌组织亮氨酸拉链EFhand结构域跨膜蛋白1(leucine zipper/leucine zipper/EF-hand-containing transmembrane protein 1,LETMI1)表达及其与生存预后的关系。方法选取2018年6月至2021年6月收治的102例非小细胞肺癌患... 目的探讨非小细胞肺癌组织亮氨酸拉链EFhand结构域跨膜蛋白1(leucine zipper/leucine zipper/EF-hand-containing transmembrane protein 1,LETMI1)表达及其与生存预后的关系。方法选取2018年6月至2021年6月收治的102例非小细胞肺癌患者作为研究对象,采用免疫组织化学染色检测肺癌组织和癌旁组织LETM1表达水平,比较LETM1表达与临床资料的关系,Kaplan-Meier法分析LETM1表达与非小细胞肺癌患者生存预后关系,Cox多因素回归分析影响患者生存的主要危险因素。结果LETM1蛋白在非小细胞肺癌组织的高表达率为57.9%(59/102),癌旁组织为10.8%(11/102),两者相比差异有统计学意义(χ^(2)=50.108,P<0.001)。LETM1高表达组与低表达组分化程度、临床分期、淋巴结转移情况等一般资料差异有统计学意义(P<0.05)。生存分析显示,LETM1蛋白高表达术后总体生存期为(26.74±3.78)月,明显低于低表达(43.76±5.46)个月,差异有统计学意义(P<0.05)。Cox多因素分析显示,LETM1蛋白高表达是影响患者生存预后的蛀牙危险因素(P<0.05)。结论非小细胞肺癌组织LETM1呈高表达,LETM1可作为评估非小细胞肺癌患者生存预后的潜在指标。 展开更多
关键词 亮氨酸拉链EFhand结构域跨膜蛋白1 非小细胞肺癌 预后价值 生存期
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胃癌组织中LETM1、HIF-1α的表达变化及意义 被引量：4
6
作者 刘伟昌 马秀丽 +1 位作者 刘虎 王洪涛 《山东医药》 CAS 2020年第19期1-4,共4页
目的观察胃癌组织中亮氨酸拉链EFhand结构域跨膜蛋白1(LETM1)与缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)的表达变化,并探讨其意义。方法选取胃癌患者95例,应用免疫组化技术检测胃癌组织及癌旁正常组织中LETM1和HIF-1α表达,并分析二者表达与患者临床... 目的观察胃癌组织中亮氨酸拉链EFhand结构域跨膜蛋白1(LETM1)与缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)的表达变化,并探讨其意义。方法选取胃癌患者95例,应用免疫组化技术检测胃癌组织及癌旁正常组织中LETM1和HIF-1α表达,并分析二者表达与患者临床病理特征的关系。随访5年,采用Kaplan-Meier法分析LETM1、HIF-1α表达与患者预后的关系。结果胃癌组织中LETM1和HIF-1α阳性表达率高于癌旁正常组织(P均<0.05)。胃癌组织中LETM1和HIF-1α表达与浸润深度、临床TNM分期、组织分化程度及淋巴结转移有关(P均<0.05),与患者性别、年龄、组织学分型及肿瘤直径无关(P均>0.05)。相关分析结果显示,胃癌患者LETM1和HIF-1α表达呈正相关(r=0.362,P<0.05)。Kaplan-Meier分析显示,LETM1和HIF-1α检出结果阴性的患者5年生存率高于结果阳性的患者(P均<0.05)。结论胃癌组织中LETM1和HIF-1α表达均升高,二者协同促进胃癌的发生发展;检测二者表达有助于胃癌诊断及病情判断。 展开更多
关键词 胃癌 亮氨酸拉链EFhand结构域跨膜蛋白1 缺氧诱导因子-1Α 预后
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