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家蚕微孢子虫孢壁蛋白与其发芽的相关性 被引量：8
1
作者 谭小辉 潘国庆 +4 位作者 吴正理 李艳红 张瑞芝 许金山 周泽扬 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第6期1068-1074,共7页
为了研究孢壁蛋白与家蚕微孢子虫发芽(孢原质弹出)的相关性,我们采用碳酸钾诱导微孢子虫体外发芽结合密度梯度离心的方法(简称GDGC法),收集纯化发芽后的孢子空壳(简称孢壳),对发芽液、纯化的孢壳及成熟孢子的孢壁蛋白组分进行了分析。... 为了研究孢壁蛋白与家蚕微孢子虫发芽(孢原质弹出)的相关性,我们采用碳酸钾诱导微孢子虫体外发芽结合密度梯度离心的方法(简称GDGC法),收集纯化发芽后的孢子空壳(简称孢壳),对发芽液、纯化的孢壳及成熟孢子的孢壁蛋白组分进行了分析。结果表明:GDGC法可以获得高纯度孢壳,计算出其密度为1.130g/cm3;与发芽前成熟孢子提取的孢壁蛋白相比,空孢壳可以提取到主要孢壁蛋白SWP32、SWP30、SWP25,同时发现SWP32、SWP25丰度有所降低;结合碳酸钾发芽液的蛋白电泳分析,发现孢壳上丰度降低的SWP32在发芽液蛋白样品中存在,LC-MS/MS数据分析也发现SWP32、SWP30、SWP25在碳酸钾处理液中都有存在;而用碳酸钾溶液处理冷冻孢子时,未观察到发芽现象,电泳结果显示此时K2CO3溶液中只有SWP30条带,说明在碳酸钾溶液诱导的发芽过程中SWP32和SWP25从孢壳上脱落可能与发芽相关而不是被碱性的碳酸钾溶解下来的。 展开更多
关键词 家蚕微孢子虫 孢壳 孢壁蛋白 发芽 宿主病原互作
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类鼻疽伯克霍尔德菌致病机制的分子与细胞基础 被引量：2
2
作者 曹旺斌 贺英 《河北科技师范学院学报》 CAS 2012年第4期71-76,共6页
类鼻疽伯克霍尔德菌(Burkholderia pseudomallei)是引起主要发生在东南亚和澳大利亚北部的一种人兽共患病类鼻疽的潜在病原。明确该疾病致病机理及其宿主与病原的互作将加强对该条件致病菌的发病机制的理解。本研究从影响细菌致病性的... 类鼻疽伯克霍尔德菌(Burkholderia pseudomallei)是引起主要发生在东南亚和澳大利亚北部的一种人兽共患病类鼻疽的潜在病原。明确该疾病致病机理及其宿主与病原的互作将加强对该条件致病菌的发病机制的理解。本研究从影响细菌致病性的毒力因子和病原与宿主互作两个方面阐述类鼻疽伯克霍德尔菌的致病机理,为该菌的有效控制提供可能的机制。 展开更多
关键词 类鼻疽伯克霍尔德菌 毒力因子 宿主病原互作 致病机理
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柑橘黄龙病研究进展 被引量：74
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作者 程春振 曾继吾 +3 位作者 钟云 闫化学 姜波 钟广炎 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期1656-1668,共13页
柑橘黄龙病是柑橘生产中重大病害,其病原菌能够侵染几乎所有的柑橘及其近缘属植物,但目前尚无该病的有效防治方法。随着其在全球范围内的传播,该病已是近年来柑橘生产和研究受到普遍关注的热点。本文试图就近年来围绕柑橘黄龙病病原及... 柑橘黄龙病是柑橘生产中重大病害,其病原菌能够侵染几乎所有的柑橘及其近缘属植物,但目前尚无该病的有效防治方法。随着其在全球范围内的传播,该病已是近年来柑橘生产和研究受到普遍关注的热点。本文试图就近年来围绕柑橘黄龙病病原及其对宿主柑橘的影响、黄龙病的防治以及柑橘抗病育种等方面的最新研究进展作一概述。 展开更多
关键词 柑橘黄龙病 黄龙病病原菌 宿主-病原互作 抗病育种
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基于small RNA组学分析揭示意大利蜜蜂响应东方蜜蜂微孢子虫胁迫的免疫应答机制 被引量：9
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作者 陈华枝 熊翠玲 +11 位作者 祝智威 王杰 范小雪 蒋海宾 范元婵 万洁琦 卢家轩 郑燕珍 付中民 徐国钧 陈大福 郭睿 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期1458-1478,共21页
【目的】通过深度测序和组学分析在small RNA组学层面揭示意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)响应东方蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)的免疫应答机制。【方法】利用small RNA-seq技术对正常及N.ceranae胁迫7 d和10 d的意蜂... 【目的】通过深度测序和组学分析在small RNA组学层面揭示意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)响应东方蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)的免疫应答机制。【方法】利用small RNA-seq技术对正常及N.ceranae胁迫7 d和10 d的意蜂工蜂中肠(Am7CK、Am7T、Am10CK和Am10T)进行深度测序。利用相关生物信息学软件对测序数据进行质控、已知micro RNA(mi RNA)鉴定、新mi RNA预测及mi RNA的结构特征分析。通过Stem-loop RT-PCR验证新mi RNA的表达。按照|log2(Fold change)|≥1和P≤0.05的标准筛选出Am7CKvs.Am7T和Am10CKvs.Am10T比较组的差异表达mi RNA(differentially expressed mi RNA,DEmi RNA)。利用软件预测DEmi RNA靶向结合的m RNA并进行GO和KEGG数据库注释,根据注释信息对细胞和体液免疫相关通路及富集靶m RNA进行统计和分析。根据靶向结合关系构建DEmi RNA和免疫通路相关差异表达m RNA(differentially expressed m RNA,DEm RNA)的调控网络。采用RT-q PCR对数据的可靠性和DEmi RNA的差异表达进行验证。【结果】共获得165895574条原始读段和132028990条有效序列标签,各组的组内Pearson相关性平均在87.92%及以上。共鉴定到928个已知mi RNA和56个新mi RNA。这些mi RNA的长度介于18–28nt,多数的长度为18nt和22nt且首位碱基主要偏向U。验证了12个新mi RNA的真实表达。Am7CKvs.Am7T比较组包含48个上调mi RNA和36个下调mi RNA;Am10CK vs.Am10T比较组包含56个上调mi RNA和51个下调mi RNA。两个比较组的DEmi RNA可分别靶向结合9827个和10720个m RNA。这些靶m RNA可分别注释到50和47条功能条目,以及138和135条KEGG通路。DEmi RNA与免疫通路相关靶m RNA的调控网络分析结果显示,Am7CK vs.Am7T中有26个DEmi RNA靶向与内吞作用等免疫通路相关的10个DEm RNA;Am10CK vs.Am10T中有15个DEmi RNA靶向与MAPK信号通路等免疫通路相关的10个DEm RNA。验证了测序数据和4个DEmi RNA差异表达的可靠性。【结论】研究结� 展开更多
关键词 意大利蜜蜂 东方蜜蜂微孢子虫 微小RNA 免疫应答 宿主-病原互作 分子机制
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人工智能在宿主与病原体蛋白质互作预测中的应用进展
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作者 任碧燕 刘璐 +4 位作者 舒坤贤 曾垂省 代劲 刘川 李娜 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1121-1136,共16页
宿主与病原体之间的蛋白质-蛋白质互作(Host-pathogen protein-protein interaction,HP-PPI)是病原体感染宿主的关键分子事件,准确识别HP-PPI对于理解宿主的免疫防御机制、病原体的致病机制,以及研发抗感染药物都具有重要意义。近年来,... 宿主与病原体之间的蛋白质-蛋白质互作(Host-pathogen protein-protein interaction,HP-PPI)是病原体感染宿主的关键分子事件,准确识别HP-PPI对于理解宿主的免疫防御机制、病原体的致病机制,以及研发抗感染药物都具有重要意义。近年来,蛋白质互作实验技术的发展及其在宿主与病原体互作研究中的应用,积累了大量的HPPPI数据,于是人工智能技术逐渐在HP-PPI预测研究领域中脱颖而出。本文综述了人工智能方法在HP-PPI预测研究领域中的应用,首先介绍了基于人工智能方法识别HP-PPI的任务流程,总结了收录HP-PPI数据的常用数据库;然后重点对机器学习和深度学习两大类人工智能方法在HP-PPI预测研究领域中的应用进行分类归纳,介绍了部分经典算法模型的基本原理、特征选择和模型评估结果等;最后,分析了人工智能方法预测HP-PPI面临的问题及挑战,以期为宿主与病原体互作研究领域的科研人员提供思路和参考。 展开更多
关键词 宿主-病原体互作 蛋白质-蛋白质互作 机器学习 深度学习
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