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宏基因组第二代测序技术在狂犬病诊断中的应用
1
作者 汪绪伦 刘菲菲 +4 位作者 朱成楼 周志森 陈锦江 刘涛 郭晓磊 《岭南急诊医学杂志》 2024年第2期118-121,共4页
目的:总结宏基因组第二代测序技术(mNGS)诊断狂犬病临床应用价值。方法:回顾性分析广东省东莞市横沥医院1例和文献报告3例狂犬病诊疗资料。结果:4例患者唾液或脑脊液标本的mNGS检测狂犬病毒结果均为阳性,其中3例患者同时进行了狂犬病毒... 目的:总结宏基因组第二代测序技术(mNGS)诊断狂犬病临床应用价值。方法:回顾性分析广东省东莞市横沥医院1例和文献报告3例狂犬病诊疗资料。结果:4例患者唾液或脑脊液标本的mNGS检测狂犬病毒结果均为阳性,其中3例患者同时进行了狂犬病毒PCR检测亦为阳性。结论:唾液和脑脊液标本行mNGS检测为临床确诊狂犬病提供依据。 展开更多
关键词 狂犬病 宏基因组第二代测序技术 诊断
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宏基因组第二代测序技术在神经外科颅内感染病原学诊断中的应用价值
2
作者 于海东 朱东 +1 位作者 高麟 李海龙 《首都食品与医药》 2023年第12期44-45,共2页
目的分析宏基因组第二代测序技术在神经外科颅内感染病原学诊断中的应用价值。方法选择包头医学院第二附属医院2020年1月-2022年1月收治的18例神经外科手术后拟诊颅内感染患者为研究对象,两周后由3位神经外科专家共同判断是否确诊为颅... 目的分析宏基因组第二代测序技术在神经外科颅内感染病原学诊断中的应用价值。方法选择包头医学院第二附属医院2020年1月-2022年1月收治的18例神经外科手术后拟诊颅内感染患者为研究对象,两周后由3位神经外科专家共同判断是否确诊为颅内感染。18例患者均进行常规脑脊液细菌培养和宏基因组第二代测序,将宏基因组二代测序技术检测结果和脑脊液细菌培养结果进行对比。结果宏基因组第二代测序技术检测诊断神经外科术后颅内感染的灵敏度和特异度及准确率分别为100%(12/12)、83.3%(5/6)、94.4%(17/18);脑脊液细菌培养组灵敏度和特异度及准确率分别为66.7%(8/12)、50.0%(3/6)、61.1%(11/18);宏基因组第二代测序技术灵敏度、特异度、准确率均高于脑脊液细菌培养组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论宏基因组第二代测序技术在神经外科颅内感染病原学诊断中具有一定价值,值得临床重视并推广。 展开更多
关键词 宏基因组第二代测序技术 神经外科颅内感染 脑脊液细菌培养
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艾滋病合并播散性诺卡菌病一例 被引量：3
3
作者 池云 许传军 +2 位作者 方明霞 徐春华 胡志亮 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 2020年第9期588-590,共3页
诺卡菌病常见于免疫缺陷人群,但并非常见艾滋病定义性疾病。现报道1例以呼吸道症状起病的艾滋病合并播散性诺卡菌病患者,起初误诊为肺结核,后出现中枢神经系统受累,结合临床资料和抗感染治疗过程,临床初步诊断为播散性诺卡菌病,最终借... 诺卡菌病常见于免疫缺陷人群,但并非常见艾滋病定义性疾病。现报道1例以呼吸道症状起病的艾滋病合并播散性诺卡菌病患者,起初误诊为肺结核,后出现中枢神经系统受累,结合临床资料和抗感染治疗过程,临床初步诊断为播散性诺卡菌病,最终借助脑脊液宏基因组学第二代测序检测明确诊断为诺卡菌感染。就该病例的诊疗过程,分析在病原学检测手段有限的医疗中心,如何结合临床表现及既往抗感染治疗过程,进行临床推论和限定病原学范围,从而优化治疗方案,改善患者预后。 展开更多
关键词 获得性免疫缺陷综合征 诺卡尔菌感染 宏基因组第二代测序技术
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宏基因组学第二代测序技术对比传统实验室微生物培养在脓毒症病原学诊断中的优势 被引量：15
4
作者 张淋 洪城 +1 位作者 孟新科 李颖 《中国急救医学》 CAS CSCD 2022年第2期114-120,共7页
目的通过对宏基因组学第二代测序技术(mNGS)获得的病原体与实验室培养结果进行对比,了解mNGS在脓毒症病原学诊断中的优势及其临床指导意义。方法将入选的脓毒症患者的标本(肺泡灌洗液、痰液、血液、脑脊液、胸水、腹水、分泌物等)同时送... 目的通过对宏基因组学第二代测序技术(mNGS)获得的病原体与实验室培养结果进行对比,了解mNGS在脓毒症病原学诊断中的优势及其临床指导意义。方法将入选的脓毒症患者的标本(肺泡灌洗液、痰液、血液、脑脊液、胸水、腹水、分泌物等)同时送检mNGS和实验室细菌培养,对结果进行对比分析,评价mNGS在脓毒症病原学诊断方面的临床价值。结果mNGS的阳性率为78.9%;细菌培养的阳性率为40.4%(P<0.05)。通过mNGS共检出致病病原体57种,其中细菌31种,真菌16种,病毒7种,非典型病原体3种;细菌培养共检出病原体24种,其中细菌18种,真菌6种。以培养结果为金标准,mNGS的敏感度为76.2%,特异度为29.8%,阳性预测值为42.3%,阴性预测值为64.8%。根据病原学结果的抗生素调整将患者分为三组:按mNGS调整为mNGS组、经验性调整为经验组、按培养结果调整为传统培养组。mNGS组ICU住院时间更短(P<0.05),培养组降钙素原下降更明显(P<0.05)。结论mNGS在感染性疾病病原体的诊断方面较传统微生物培养时间更短,阳性率更高,在少见病原体、罕见病原体诊断方面有显著优势,可缩短患者ICU住院时间。 展开更多
关键词 宏基因组学第二代测序技术(mNGS) 微生物培养 脓毒症 感染 病原体
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以马尔尼菲篮状菌肺炎起病的X连锁高IgM综合征婴儿1例
5
作者 姚亚男 吕雪盈 +4 位作者 李文敏 袁凯旋 廖亚龙 张娟 肖伟欢 《中国真菌学杂志》 CSCD 2024年第2期173-176,共4页
X连锁高IgM综合征(X-linked hyper-immunoglobulin M syndrome,XHIGM)是罕见的原发性免疫缺陷病,该病以反复感染为特征,易感染机会致病微生物。临床上以马尔尼菲篮状菌肺炎起病的XHIGM更为罕见。该文回顾性分析1例以马尔尼菲篮状菌肺炎... X连锁高IgM综合征(X-linked hyper-immunoglobulin M syndrome,XHIGM)是罕见的原发性免疫缺陷病,该病以反复感染为特征,易感染机会致病微生物。临床上以马尔尼菲篮状菌肺炎起病的XHIGM更为罕见。该文回顾性分析1例以马尔尼菲篮状菌肺炎起病的X连锁高IgM综合征婴儿的临床资料,实验室、影像学检查结果和诊疗经过并探讨其基因型,结合最新文献复习,以提高对该疾病的认识。 展开更多
关键词 X连锁高IgM综合征 马尔尼菲篮状菌 婴儿 基因型 宏基因组学第二代测序技术
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宏基因组学第二代测序技术对比传统微生物培养在慢性子宫内膜炎病原学诊断中的优势 被引量：4
6
作者 刘海瑛 谭国英 李爱平 《中国医药指南》 2022年第31期58-61,共4页
目的通过对比宏基因组学第二代测序技术(mNGS)与传统微生物培养在慢性子宫内膜炎病原学检测结果的差异,了解mNGS在慢性子宫内膜炎病原学诊断中的优势。方法选取2017年1月至2021年12月我院生殖中心慢性子宫内膜炎的不孕症患者共计500例,... 目的通过对比宏基因组学第二代测序技术(mNGS)与传统微生物培养在慢性子宫内膜炎病原学检测结果的差异,了解mNGS在慢性子宫内膜炎病原学诊断中的优势。方法选取2017年1月至2021年12月我院生殖中心慢性子宫内膜炎的不孕症患者共计500例,同时取子宫内膜标本送检,每份标本均分为2份,1份行传统微生物培养法检测病原体,另1份行mNGS法检测病原体,统计治疗前两种方法检测出的病原体数量与种类、微生物检出阳性率以及两种检测方法的一致性,并于治疗后对两种方法的复检阳性率进行比较。结果传统微生物培养法的检出阳性率为20.80%;mNGS法的检出阳性率为79.40%,有显著性差异(P<0.05)。通过传统微生物培养法共检出104例,致病菌包括:肺炎克雷伯杆菌、大肠埃希菌、链球菌、粪肠球菌等。通过mGNS法共检出397例,除上述致病菌外,还检测出了细菌(阴道加德纳菌、金黄色葡萄球菌)、病毒(巨细胞病毒、乳头状瘤病毒)、支原体(解脲脲原体)。在500例子宫内膜标本中,两组检测结果完全不一致的有105例(21.00%),检测结果不完全一致的有241例(48.20%),检测结果完全一致的有154例(3.00%)。经后续治疗后,传统微生物培养法复检阳性率为13.46%,mNGS法复检阳性率为15.87%,有显著性差异(P<0.05)。以培养结果为金标准,mNGS的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值分别为85.39%、58.92%、68.47%、61.09%。结论mNGS法在慢性子宫内膜炎病原体的诊断方面较传统微生物培养法敏感度更高,对病原体检出能力更强,尤其在少见病原体诊断方面更具优势。 展开更多
关键词 宏基因组学第二代测序技术 传统微生物培养法 慢性子宫内膜炎 阳性率 敏感度
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二代测序辅助诊断水痘-带状疱疹病毒性脑膜炎1例 被引量：1
7
作者 董媛媛 蒋卫东 +7 位作者 刘震 王蘋 李蕃 魏艳 王尚 孟玉洁 徐营营 孙琳 《山东大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2023年第1期121-124,共4页
水痘-带状疱疹病毒性脑膜炎是由潜伏在脑神经节、背根神经节或神经轴的自主神经节中的水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus,VZV)再次激活引起的中枢神经系统(central nervous system,CNS)并发症,如不能及时有效地接受治疗,可能会... 水痘-带状疱疹病毒性脑膜炎是由潜伏在脑神经节、背根神经节或神经轴的自主神经节中的水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus,VZV)再次激活引起的中枢神经系统(central nervous system,CNS)并发症,如不能及时有效地接受治疗,可能会危及生命[1]。宏基因组学第二代测序技术(metagenomics next-generation sequencing,mNGS)大大提高了VZV脑膜炎诊断的精准性。现将我院神经内科收治的1例经脑脊液mNGS检测出VZV感染引起的病毒性脑膜炎报道如下。 展开更多
关键词 水痘-带状疱疹病毒 脑膜炎 宏基因组学第二代测序技术
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宏基因组学第二代测序技术与传统实验室微生物培养在支气管扩张病原学诊断中的比较
8
作者 刘庆 《大医生》 2023年第11期98-100,共3页
目的研究宏基因组学第二代测序技术(mNGS)与传统实验室微生物培养在支气管扩张病原学诊断中的价值,为临床提供参考。方法选取百色市人民医院2021年9月至2022年10月收治的170例支气管扩张症患者为研究对象进行回顾性分析,根据检测方法不... 目的研究宏基因组学第二代测序技术(mNGS)与传统实验室微生物培养在支气管扩张病原学诊断中的价值,为临床提供参考。方法选取百色市人民医院2021年9月至2022年10月收治的170例支气管扩张症患者为研究对象进行回顾性分析,根据检测方法不同分为mNGS组(65例)和实验室培养组(105例)。根据患者自我选择用药情况将需调整抗生素使用的43例患者分为mNGS1组(22例)、传统培养组(12例)及经验组(9例)。收集其经纤维支气管镜防污染-肺泡灌洗液的常规微生物检查结果,分离培养检查结果及临床宏基因学组检测结果等临床资料,比较实验室培养与mNGS检测阳性率及不同用药状态下患者转归情况。结果mNGS检测阳性率高于实验室培养(P<0.05)。mNGS1组患者平均住院时间短于传统培养组、经验组,mNGS1组患者白细胞计数、中性粒细胞计数、C反应蛋白及白细胞介素-6水平低于传统培养组、经验组(P<0.05)。结论mNGS在支气管扩张病原学诊断中具有一定优势,诊断阳性率更高,对患者经验用药具有一定帮助,能够缩短住院时间,降低炎症因子水平,值得临床应用。 展开更多
关键词 宏基因组学第二代测序技术 实验室微生物培养 支气管扩张 诊断
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粪类圆线虫及多种病原体混合感染致重症肺炎1例 被引量：2
9
作者 任建敏 肖礼民 +4 位作者 丁卉 叶青萍 尤伟波 游星兰 黄建胜 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 2022年第3期175-177,共3页
本研究报道1例粪类圆线虫及多种病原体混合感染致重症肺炎患者。该患者为老年女性,既往基础疾病较多,口服皮质类固醇激素半年余,因"乏力、纳差半个月,加重伴意识不清1 d"入院。病原学检查中发现粪类圆线虫、烟曲霉、新型隐球... 本研究报道1例粪类圆线虫及多种病原体混合感染致重症肺炎患者。该患者为老年女性,既往基础疾病较多,口服皮质类固醇激素半年余,因"乏力、纳差半个月,加重伴意识不清1 d"入院。病原学检查中发现粪类圆线虫、烟曲霉、新型隐球菌等多种病原微生物。考虑该患者的肺部重症感染是由粪类圆线虫及多种病原微生物感染所致。予阿苯达唑、卡泊芬净、奥司他韦等抗感染及对症支持治疗,之后患者病情加重,自动出院。提示长期口服皮质类固醇激素患者免疫功能较弱,需考虑多种病原体合并感染的可能。 展开更多
关键词 类圆线虫 粪 重症肺炎 混合感染 宏基因组学第二代测序技术
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