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非均匀外力对粗粒化DNA穿孔行为影响的模拟研究
被引量:
2
1
作者
马姗
马军
杨光参
《物理学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第14期277-282,共6页
通过建立DNA高分子的粗粒化模型,采用分子动力学方法模拟其穿孔行为,研究了不同的孔内非均匀外力对DNA高分子穿孔的影响.外力及高分子链内部势能在分子水平下对单体的综合作用很复杂,某些条件穿孔过程会产生后面粒子超过前面粒子而使高...
通过建立DNA高分子的粗粒化模型,采用分子动力学方法模拟其穿孔行为,研究了不同的孔内非均匀外力对DNA高分子穿孔的影响.外力及高分子链内部势能在分子水平下对单体的综合作用很复杂,某些条件穿孔过程会产生后面粒子超过前面粒子而使高分子链堵塞在孔内的情况.研究还发现,穿孔行为是否成功与孔口力的大小有关,在成功穿孔的情况下,非均匀外力相比于恒力情况穿孔时间至少减少了1/2.这些结果对理解DNA复杂的穿孔机理提供了新的视角.
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关键词
非均匀力场
分子动力学模拟
DNA粗粒化
孔
内
堵塞
下载PDF
职称材料
题名
非均匀外力对粗粒化DNA穿孔行为影响的模拟研究
被引量:
2
1
作者
马姗
马军
杨光参
机构
温州大学物理与电子信息学院
出处
《物理学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第14期277-282,共6页
基金
国家自然科学基金(批准号:11274245
11574243)
国家自然科学基金青年科学基金(批准号:11304232)资助的课题~~
文摘
通过建立DNA高分子的粗粒化模型,采用分子动力学方法模拟其穿孔行为,研究了不同的孔内非均匀外力对DNA高分子穿孔的影响.外力及高分子链内部势能在分子水平下对单体的综合作用很复杂,某些条件穿孔过程会产生后面粒子超过前面粒子而使高分子链堵塞在孔内的情况.研究还发现,穿孔行为是否成功与孔口力的大小有关,在成功穿孔的情况下,非均匀外力相比于恒力情况穿孔时间至少减少了1/2.这些结果对理解DNA复杂的穿孔机理提供了新的视角.
关键词
非均匀力场
分子动力学模拟
DNA粗粒化
孔
内
堵塞
Keywords
non-uniform force field
molecular dynamics simulation
DNA coarse-grained
clogged pores
分类号
Q523 [生物学—生物化学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
非均匀外力对粗粒化DNA穿孔行为影响的模拟研究
马姗
马军
杨光参
《物理学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
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职称材料
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