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题名大花红景天CBF家族生物信息学分析
被引量：2
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作者
徐元江
彭诗原
权红
兰小中
郑维列
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机构
西藏农牧学院高原生态研究所
西藏高原森林生态教育部重点实验室
西藏农牧学院食品科学学院
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出处
《高原农业》
2020年第3期219-225,248,共8页
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基金
第四次全国中药资源普查试点-西藏自治区中(藏)药资源普查(20190512-542127),西藏农牧学院研究生创新计划项目(YJS2018-02)。
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文摘
CBF(CRT/DRE-binding factor)是低温响应转录因子,可增强抗寒基因的表达,从而提高植物抗寒性。为探究大花红景天CBF家族转录因子的结构与功能,本研究利用生物信息学手段从转录组数据库中筛选出7条RcCBF基因,并系统地分析了该基因家族各蛋白的理化性质、导肽、信号肽、亚细胞定位、跨膜结构、磷酸化与糖基化、系统进化、多重比对等。分析发现7个RcCBF为亲水的酸性蛋白,无跨膜结构,定位于细胞核或细胞质,包含2个CBF家族基因保守元件。该研究可为今后进一步解析RcCBF基因功能提供参考。
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关键词
大花红景天
大花红景天cbf家族
生物信息学
分析
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Keywords
Rhodiola crenulata
Rccbf family
bioinformatics
analysis
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分类号
S567.239
[农业科学—中草药栽培]
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