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新型三维氨基酸结构描述符的研究及其在多肽QSAR中的应用 被引量：23
1
作者 丁俊杰 丁晓琴 +1 位作者 赵立峰 陈冀胜 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期340-346,共7页
目的　建立一套新型的氨基酸残基结构描述符,用此描述符进行多肽的定量构效关系研究。方法　通过理论计算得出 167个氨基酸结构描述参数,再对 167个参数进行主成分分析,从中提取出与氨基酸残基的三维结构性质密切相关的三个结构描述参数... 目的　建立一套新型的氨基酸残基结构描述符,用此描述符进行多肽的定量构效关系研究。方法　通过理论计算得出 167个氨基酸结构描述参数,再对 167个参数进行主成分分析,从中提取出与氨基酸残基的三维结构性质密切相关的三个结构描述参数c1,c2,c3 scales。然后采用G/PLS算法,建立氨基酸残基结构描述符c scales与多肽生物活性之间的函数关系,确定多肽的QSAR模型。结果　用此方法建立的苦味二肽、ACE抑制剂二肽和缓激肽增效剂五肽的QSAR模型,均有较好的拟合和预测能力,交叉验证相关系数和相关系数都在 0 70以上。结论　氨基酸残基结构描述符c scales能定量的描述氨基酸的三维结构性质,而且利用此描述符能建立预测能力较强的多肽QSAR模型。 展开更多
关键词 氨基酸残基结构描述符 多肽定量构效关系 主成分分析 遗传偏最小二乘算法
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多肽定量构效关系与分子设计 被引量：9
2
作者 丁俊杰 丁晓琴 +1 位作者 赵立峰 陈冀胜 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第1期130-136,共7页
综述了多肽定量构效关系和计算机辅助多肽分子设计方法的最新进展 ,重点介绍了多肽定量构效关系研究中的化学结构定量描述符和建立数学模型的统计方法 ,并对模拟肽学和虚拟组合多肽库在多肽分子设计中的应用进行了简要的论述。
关键词 多肽定量构效关系 遗传算法 人工神经网络 模拟肽学 虚拟组合多肽库
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