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奶牛隐性乳房炎抗性相关基因多态性与体细胞评分关联分析 被引量：3
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作者 吴培 赵宗胜 +6 位作者 何开兵 朱梦婷 南颖 李增强 邵焱焱 方晨辉 谢梦婷 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2023年第1期68-77,共10页
为了探讨中国荷斯坦奶牛隐性乳房炎相关基因NOD2c.4500、CXCR1+777、SPP1-1301、 TLR4+2021、CXCR2+777、 BRCA1c.46126单核苷酸多态性(SNPs)位点与体细胞评分的关联性,试验利用PCR-SSCP及Sanger测序技术对135头中国荷斯坦奶牛的6个SNP... 为了探讨中国荷斯坦奶牛隐性乳房炎相关基因NOD2c.4500、CXCR1+777、SPP1-1301、 TLR4+2021、CXCR2+777、 BRCA1c.46126单核苷酸多态性(SNPs)位点与体细胞评分的关联性,试验利用PCR-SSCP及Sanger测序技术对135头中国荷斯坦奶牛的6个SNPs位点进行基因分型,分析SNPs位点与中国荷斯坦奶牛体细胞评分的相关性,并运用多座位外显方差分析法(MPVA)对不同多基因聚合与奶牛体细胞数的相关性进行研究。结果表明:在6个SNPs位点上均检测到碱基突变,在NOD2c.4500 C>A、CXCR1+777 G>C、SPP1-1301 G>A、TLR4+2021 C>T位点上均检测到3种基因型,其中优势基因型分别为CA、CC、AA、CC,优势等位基因分别为A、G、A、C。在CXCR2+777 G>C、BRCA1c.46126 G>T位点上均检测到2种基因型,其中优势基因型均为GG,优势等位基因均为G。SPP1-1301 G>A、TLR4+2021 C>T位点均处于低度多态(PIC<0.25),其余位点则均处于中度多态(0.25<PIC<0.5);6个SNPs位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。CXCR2+777 G>C、TLR4+2021 C>T位点与体细胞评分的关联未达到显著差异(P>0.05);NOD2c.4500 C>A位点CA基因型、CXCR1+777 G>C位点CC基因型、SPP1-1301 G>A位点AA基因型、BRCA1c.46126 G>T位点GT基因型个体的体细胞评分显著低于其他基因型个体(P<0.05)。SPP1-1301-CXCR1+777-NOD2 c.4500为多基因聚合分析中最佳多座位组合,SPP1(AA)-CXCR1(CC)-NOD2(CA)为最佳基因型组合。说明SPP1-1301、CXCR1+777、NOD2c.4500位点与中国荷斯坦奶牛体细胞评分显著相关,可作为奶牛隐性乳房炎抗性基因的分子辅助标记。 展开更多
关键词 中国荷斯坦奶牛 隐性乳房炎 基因多态性 体细胞评分 多基因聚合分析
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