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基于网络药理学和分子对接技术探讨骨疏康制剂对骨质疏松症的机制研究
1
作者
荣小娟
马兆霞
熊茫茫
《实用中西医结合临床》
2024年第9期113-117,共5页
目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨复方骨疏康制剂治疗骨质疏松症的作用机制。方法 通过TCMSP数据库中筛选出复方骨疏康制剂中各药材的活性成分及所对应的靶点,从GeneCards、OMIM、DrugBank、PharmGKB、TTD数据库中收集骨质疏松症...
目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨复方骨疏康制剂治疗骨质疏松症的作用机制。方法 通过TCMSP数据库中筛选出复方骨疏康制剂中各药材的活性成分及所对应的靶点,从GeneCards、OMIM、DrugBank、PharmGKB、TTD数据库中收集骨质疏松症的治疗靶点;通过R语言获得复方骨疏康-骨质疏松症共同靶点。将共同靶点输入至STRING数据库进行检索获取靶点间相互作用的网络关系数据,采用Cytoscape软件得到治疗骨质疏松症的关键核心靶点;通过R语言对交集基因进行GO和KEGG进行可视化分析。同时构建“复方骨疏康-主要通路-骨质疏松症”核心靶点网络,通过AutoDock Vina分子对接软件进行对接和模拟计算,再使用Pymol 3D绘制软件和Discovery Studio软件对部分对接结果进行三维和二维角度的作用力分析和可视化。结果 筛选出中药复方骨疏康128种活性成分、1 614个骨质疏松症相关的靶点,最终筛选出7个关键核心靶点(依据拓扑学属性),GO和KEGG富集分析发现其功能主要与成骨骨化、腺体发育、对外源性刺激等反应有关,富集在化学致癌-受体激活通路、癌症中的MicroRNAs通路、MAPK信号通路。分子对接显示:EGFR蛋白与小分子Luteolin和Quercetin、STAT1蛋白与小分子Kaempferol和Quercetin、MAPK3和FOS蛋白分别与小分子Naringenin和Quercetin之间均结合稳定。结论骨疏康制剂主要通过作用于钙信号通道,MAPK信号通道对骨质疏松症发挥防治作用。
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关键词
骨质
疏
松症
复
方骨
疏
康
网络药理学
分子对接技术
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题名
基于网络药理学和分子对接技术探讨骨疏康制剂对骨质疏松症的机制研究
1
作者
荣小娟
马兆霞
熊茫茫
机构
江西科技学院医学院
出处
《实用中西医结合临床》
2024年第9期113-117,共5页
基金
江西省中医药管理局科技计划项目(编号:2023B1326)
江西科技学院校级教育教学项目(编号:ZR2113)。
文摘
目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨复方骨疏康制剂治疗骨质疏松症的作用机制。方法 通过TCMSP数据库中筛选出复方骨疏康制剂中各药材的活性成分及所对应的靶点,从GeneCards、OMIM、DrugBank、PharmGKB、TTD数据库中收集骨质疏松症的治疗靶点;通过R语言获得复方骨疏康-骨质疏松症共同靶点。将共同靶点输入至STRING数据库进行检索获取靶点间相互作用的网络关系数据,采用Cytoscape软件得到治疗骨质疏松症的关键核心靶点;通过R语言对交集基因进行GO和KEGG进行可视化分析。同时构建“复方骨疏康-主要通路-骨质疏松症”核心靶点网络,通过AutoDock Vina分子对接软件进行对接和模拟计算,再使用Pymol 3D绘制软件和Discovery Studio软件对部分对接结果进行三维和二维角度的作用力分析和可视化。结果 筛选出中药复方骨疏康128种活性成分、1 614个骨质疏松症相关的靶点,最终筛选出7个关键核心靶点(依据拓扑学属性),GO和KEGG富集分析发现其功能主要与成骨骨化、腺体发育、对外源性刺激等反应有关,富集在化学致癌-受体激活通路、癌症中的MicroRNAs通路、MAPK信号通路。分子对接显示:EGFR蛋白与小分子Luteolin和Quercetin、STAT1蛋白与小分子Kaempferol和Quercetin、MAPK3和FOS蛋白分别与小分子Naringenin和Quercetin之间均结合稳定。结论骨疏康制剂主要通过作用于钙信号通道,MAPK信号通道对骨质疏松症发挥防治作用。
关键词
骨质
疏
松症
复
方骨
疏
康
网络药理学
分子对接技术
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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作者
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1
基于网络药理学和分子对接技术探讨骨疏康制剂对骨质疏松症的机制研究
荣小娟
马兆霞
熊茫茫
《实用中西医结合临床》
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