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基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术对分枝杆菌液体培养系统菌种鉴定的临床研究 被引量:7
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作者 杜岩青 秦中华 张丽霞 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期871-877,共7页
目的应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)对Bactec^(TM) MGIT^(TM) 960液体培养出的阳性培养物进行高通量、快速、准确的菌种鉴定,为... 目的应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)对Bactec^(TM) MGIT^(TM) 960液体培养出的阳性培养物进行高通量、快速、准确的菌种鉴定,为临床早期、精准治疗提供病原学依据。方法选取我院Bactec^(TM) MGIT^(TM) 960分枝杆菌快速液体培养的阳性培养物为研究对象,通过不同的孵育时间、不同大小的研磨珠处理、不同的破壁方式摸索出MALDI-TOF MS对Bactec^(TM) MGIT^(TM) 960阳性培养物鉴定的"最优处理方法",并将所有结果与基因芯片法菌种鉴定做参照进行比对,鉴定不一致的结果通过基因测序确认。结果Bactec^(TM) MGIT^(TM) 960液体培养报阳性后增加孵育时间可提高检出率及鉴定分值,同时使用0.5 mm的氧化锆珠研磨,使用超声震荡混匀处理,鉴定效果最佳。鉴定结果方面,液体系统报阳的420份阳性标本,基因芯片法鉴定结果为结核分枝杆菌占69.05%(290/420),非结核菌占28.81%(121/420),9例未鉴定出,未鉴定占2.14%(9/420),错误鉴定占0.95%(4/420),总鉴定率为97.86%(411/420);采用MALDI-TOF MS质谱鉴定420份阳性标本中鉴定出419例,其中结核分枝杆菌占69.05%(290/420),非结核占30.00%(126/420),星型奴卡菌0.48%(2/420),巴西奴卡菌占0.24%(1/420),1例未鉴定出,总鉴定率为99.76%。质谱鉴定分值≥2.0的400例占95.24%,分值在1.7~2.0的19例占4.52%,分值<1.7的1例占0.24%。结论本实验实现了Bactec^(TM) MGIT^(TM) 960液体培养阳性培养物的直接质谱鉴定,缩短了培养鉴定的时间,将分枝杆菌鉴定到种水平,能区分出结核菌与非结核菌,同时也能将与分枝杆菌相似的奴卡菌鉴定出来,对临床疾病的鉴别诊断起到了积极的作用。 展开更多
关键词 Bactec^(TM)MGIT^(TM)960液体培养 基质辅助激光吸附电离飞行时间质谱技术 结核分枝杆菌 非结核分枝杆菌
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运用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术建立鼻咽癌特异血清多肽谱诊断模型 被引量:3
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作者 陶亚岚 刘志刚 +1 位作者 夏云飞 易炜 《中华肿瘤杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期188-191,共4页
目的探讨鼻咽癌患者与正常健康者血清蛋白谱的差异,建立特异的鼻咽癌血清多肽谱诊断模型。方法收集治疗前的鼻咽癌患者和正常健康对照者的血清标本,通过特异的液体磁珠分选后,进行基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOFM... 目的探讨鼻咽癌患者与正常健康者血清蛋白谱的差异,建立特异的鼻咽癌血清多肽谱诊断模型。方法收集治疗前的鼻咽癌患者和正常健康对照者的血清标本,通过特异的液体磁珠分选后,进行基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOFMS)分析,得到鼻咽癌患者的血清多肽谱。采用专用的生物信息学分析软件ClinProt^TM进行差异分析,运用遗传算法,建立鼻咽癌的血清多肽谱诊断模型。通过盲法检验模型的灵敏度和特异度。结果检测出鼻咽癌患者与正常健康者的差异蛋白峰有99个,选取两组间差异有统计学意义的、相对分子质量为808.99、834.61、3954.82和8141.88的蛋白峰,建立鼻咽癌诊断模型,该模型鼻咽癌的识别率为90.0%,预测能力为84.3%,盲法检验模型的灵敏度为80.0%,特异度为64.0%。结论鼻咽癌患者与正常对照者的血清间存在蛋白表达的差异,建立的特异的血清多肽谱诊断模型在鼻咽癌的诊断中有一定的应用前景,为寻找特异的鼻咽癌血清肿瘤标记物提供了一定的依据。 展开更多
关键词 鼻咽肿瘤 基质辅助激光吸附电离飞行时间质谱技术 血蛋白质类 肽类 鉴别诊断
原文传递
犊牛卵泡液多肽信息分析 被引量:1
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作者 赵海峰 柯浩 +8 位作者 张飒 陈东峰 陈集成 陈宝剑 沈创 韦英将 蒋钦杨 陆凤花 韦英明 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1909-1913,共5页
【目的】了解成年牛和犊牛卵泡液中多肽的信息表达差异,为完善犊牛卵泡液基础研究及犊牛卵母细胞体外培养体系奠定基础。【方法】采用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)对超排成年牛和超排犊牛卵泡液中的肽段进行分... 【目的】了解成年牛和犊牛卵泡液中多肽的信息表达差异,为完善犊牛卵泡液基础研究及犊牛卵母细胞体外培养体系奠定基础。【方法】采用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)对超排成年牛和超排犊牛卵泡液中的肽段进行分析,根据多肽的信号峰信息,通过MASCOT数据库进行蛋白检索。【结果】从成功构建的成年牛与犊牛卵泡液质谱多肽信号峰模型图谱可知,超排犊牛卵泡液多肽表达图谱中有60~80个信号峰,而超排成年牛的有30~40个信号峰;其中成年牛卵泡液有两个特有信号峰,质荷比为1218.58和1509.77 m/z,犊牛有1个特有信号峰,质荷比为953.54 m/z。利用MASCOT数据库对获得的卵泡液多肽信息进行蛋白检索,发现成年牛卵泡液中有18种蛋白,犊牛卵泡液中有11种蛋白。【结论】犊牛卵泡液中蛋白多肽信息峰数量多于成年牛,但卵泡液中总蛋白数量少于成年牛,这种差异可能是导致犊牛卵母细胞发育能力低于成年牛的重要原因之一。 展开更多
关键词 犊牛 卵泡液 超数排卵 多肽 基质辅助激光吸附电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)
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