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杭州市1株不产毒霍乱弧菌食品分离株的基因组特征与溯源研究
被引量：
2
1
作者
俞骅
高佳佳
+6 位作者
朱炜
郑伟
郑之北
吴金飞
王毅意
潘高翔
汪皓秋
《中国食品卫生杂志》
CSCD
北大核心
2023年第4期491-497,共7页
目的研究杭州市1株不产毒小川血清型霍乱弧菌食品分离株与国内外食品和临床分离株的溯源关系及其分子特征。方法采用荧光定量聚合酶链式反应检测菌株毒力基因分布,使用高通量测序获得基因组序列,使用生物信息学方法鉴定其多位点序列分型...
目的研究杭州市1株不产毒小川血清型霍乱弧菌食品分离株与国内外食品和临床分离株的溯源关系及其分子特征。方法采用荧光定量聚合酶链式反应检测菌株毒力基因分布,使用高通量测序获得基因组序列,使用生物信息学方法鉴定其多位点序列分型(MLST)型别。将101株食品和临床分离株基因组序列比对到参考基因组N16961获得单核苷酸突变位点(SNV),去除重组并构建进化树,分析食品分离株和近源菌株的基因分布情况。结果该食品分离株是不产霍乱毒素和产毒素共调菌毛的霍乱弧菌(CNTP),MLST分型结果为ST1480,与杭州地区流行的ST75型CNTP菌株属于同一克隆群。该菌属于进化树L3b.1分支,与杭州2011年临床分离株(HZ11-1,HZ11-2)高度同源,去除重组后仅有26个SNVs位点差异。结论从甲鱼涂抹拭子中检出与杭州地区流行的CNTP高度同源的菌株,杭州地区散发病例感染来源可能与爬行类食品污染因素有关,应加强对其养殖场所及销售场所进行消毒。
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关键词
霍乱弧菌
霍乱毒素
多位点序列分型
基因组
进化树
原文传递
山东省人感染猪链球菌基因组特征分析
被引量：
5
2
作者
胡彬
王建平
+12 位作者
徐迎春
刘军
李涛
贾静
姜文国
毕秀娟
曲新艺
寇增强
房明
孙娜
杨莹
康殿民
侯配斌
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期1232-1239,共8页
对山东省人感染猪链球菌菌株开展基因组流行病学及病原学分析,为制定合理、精准的猪链球菌预防、控制措施提供依据。本研究对分离的猪链球菌菌株开展分子分型、基因组系统进化树、毒力基因型别、耐药谱、耐药基因及其传播元件等方面的分...
对山东省人感染猪链球菌菌株开展基因组流行病学及病原学分析,为制定合理、精准的猪链球菌预防、控制措施提供依据。本研究对分离的猪链球菌菌株开展分子分型、基因组系统进化树、毒力基因型别、耐药谱、耐药基因及其传播元件等方面的分析,并通过比较菌株刺激宿主细胞产生细胞因子的能力评价不同菌株的致病力。结果显示,血清2型、ST1型是山东患者来源猪链球菌的优势型别,其主要临床表现为脑膜炎。系统进化树分析表明山东菌株主要由5个分枝组成。山东菌株均属高致病型菌株,但细胞因子试验表明分枝2的菌株致病力显著强于其他山东菌株。除分枝3的SD2与SD4菌株外,其余山东菌株均携带不同种类的耐药基因及其传播元件。综上,山东猪链球菌的来源及进化途径存在多样性的特征,且致病能力有显著差异,需要在基因组水平开展菌株监测的工作。
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关键词
猪链球菌
脑膜炎
基因组
系统
进化树
高致病型
原文传递
题名
杭州市1株不产毒霍乱弧菌食品分离株的基因组特征与溯源研究
被引量：
2
1
作者
俞骅
高佳佳
朱炜
郑伟
郑之北
吴金飞
王毅意
潘高翔
汪皓秋
机构
杭州市疾病预防控制中心
滨江区疾病预防控制中心
出处
《中国食品卫生杂志》
CSCD
北大核心
2023年第4期491-497,共7页
基金
杭州市科技发展计划(20191203B141)
杭州市医学重点学科建设项目资助。
文摘
目的研究杭州市1株不产毒小川血清型霍乱弧菌食品分离株与国内外食品和临床分离株的溯源关系及其分子特征。方法采用荧光定量聚合酶链式反应检测菌株毒力基因分布,使用高通量测序获得基因组序列,使用生物信息学方法鉴定其多位点序列分型(MLST)型别。将101株食品和临床分离株基因组序列比对到参考基因组N16961获得单核苷酸突变位点(SNV),去除重组并构建进化树,分析食品分离株和近源菌株的基因分布情况。结果该食品分离株是不产霍乱毒素和产毒素共调菌毛的霍乱弧菌(CNTP),MLST分型结果为ST1480,与杭州地区流行的ST75型CNTP菌株属于同一克隆群。该菌属于进化树L3b.1分支,与杭州2011年临床分离株(HZ11-1,HZ11-2)高度同源,去除重组后仅有26个SNVs位点差异。结论从甲鱼涂抹拭子中检出与杭州地区流行的CNTP高度同源的菌株,杭州地区散发病例感染来源可能与爬行类食品污染因素有关,应加强对其养殖场所及销售场所进行消毒。
关键词
霍乱弧菌
霍乱毒素
多位点序列分型
基因组
进化树
Keywords
Vibrio cholerae
cholera toxin
multi-locus sequencing typing
genomic phylogeny
分类号
R155 [医药卫生—营养与食品卫生学]
原文传递
题名
山东省人感染猪链球菌基因组特征分析
被引量：
5
2
作者
胡彬
王建平
徐迎春
刘军
李涛
贾静
姜文国
毕秀娟
曲新艺
寇增强
房明
孙娜
杨莹
康殿民
侯配斌
机构
山东省疾病预防控制中心
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
烟台市疾病预防控制中心
淄博市疾病预防控制中心
临沂市疾病预防控制中心
青岛市疾病预防控制中心
济宁市疾病预防控制中心
泰安市疾病预防控制中心
威海市疾病预防控制中心
出处
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期1232-1239,共8页
基金
山东预防医学会智飞疾病预防控制技术研究基金项目(LYH2017-03)
山东省医药卫生科技发展计划项目(2017WS455)
国家科技重大专项(2018ZX10713001-002)。
文摘
对山东省人感染猪链球菌菌株开展基因组流行病学及病原学分析,为制定合理、精准的猪链球菌预防、控制措施提供依据。本研究对分离的猪链球菌菌株开展分子分型、基因组系统进化树、毒力基因型别、耐药谱、耐药基因及其传播元件等方面的分析,并通过比较菌株刺激宿主细胞产生细胞因子的能力评价不同菌株的致病力。结果显示,血清2型、ST1型是山东患者来源猪链球菌的优势型别,其主要临床表现为脑膜炎。系统进化树分析表明山东菌株主要由5个分枝组成。山东菌株均属高致病型菌株,但细胞因子试验表明分枝2的菌株致病力显著强于其他山东菌株。除分枝3的SD2与SD4菌株外,其余山东菌株均携带不同种类的耐药基因及其传播元件。综上,山东猪链球菌的来源及进化途径存在多样性的特征,且致病能力有显著差异,需要在基因组水平开展菌株监测的工作。
关键词
猪链球菌
脑膜炎
基因组
系统
进化树
高致病型
Keywords
Streptococcus suis
Meningitis
High pathogenicity
Whole genome phylogenetic tree
分类号
R181.3 [医药卫生—流行病学]
R515 [医药卫生—公共卫生与预防医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杭州市1株不产毒霍乱弧菌食品分离株的基因组特征与溯源研究
俞骅
高佳佳
朱炜
郑伟
郑之北
吴金飞
王毅意
潘高翔
汪皓秋
《中国食品卫生杂志》
CSCD
北大核心
2023
2
原文传递
2
山东省人感染猪链球菌基因组特征分析
胡彬
王建平
徐迎春
刘军
李涛
贾静
姜文国
毕秀娟
曲新艺
寇增强
房明
孙娜
杨莹
康殿民
侯配斌
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
5
原文传递
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