剪接体的三维结构及基因剪接的分子机理研究 被引量：4

1

作者 杭婧 施一公 《科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第13期15-19,共5页

中国科协生命科学学会联合体：在真核细胞中,蕴藏在基因组DNA序列中的遗传信息先传递给信使RNA,转录的信使RNA前体需经剪接体剪接成熟之后再翻译成蛋白质,执行生物学功能。剪接体是一个巨大而又复杂的动态分子机器。清华大学施一公课题... 中国科协生命科学学会联合体：在真核细胞中,蕴藏在基因组DNA序列中的遗传信息先传递给信使RNA,转录的信使RNA前体需经剪接体剪接成熟之后再翻译成蛋白质,执行生物学功能。剪接体是一个巨大而又复杂的动态分子机器。清华大学施一公课题组利用酵母细胞内源性蛋白提取获得了性质良好的样品,利用单颗粒冷冻电子显微镜技术,解析了酵母剪接体近原子水平的高分辨率三维结构,阐述了剪接体对信使RNA前体执行剪接的工作机理。 展开更多

关键词 剪接体 基因剪接 高分辨率三维 施一公 内源性蛋白 科学学会 RNA 三维结构 中国科协 结构生物学

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应用序列特征分析基因剪接信号 被引量：2

2

作者 马猛 汪洋 《计算机工程与应用》 CSCD 2012年第27期180-185,共6页

在基因选择性剪接调控过程中,有各种剪接信号参与其中,如剪接位点、剪接调控元件等。如何识别这些剪接信号、研究其在基因组中的分布规律是一个有趣的问题。设计了一个基于序列特征的剪接信号打分算法,该算法可赋予每个信号一个分值,表... 在基因选择性剪接调控过程中,有各种剪接信号参与其中,如剪接位点、剪接调控元件等。如何识别这些剪接信号、研究其在基因组中的分布规律是一个有趣的问题。设计了一个基于序列特征的剪接信号打分算法,该算法可赋予每个信号一个分值,表示其信号强度。基于该打分算法所构建的分类器可用于预测识别新的剪接信号。应用该打分算法研究剪接位点和剪接调控元件在基因组中的分布,发现这两类信号具有互补特性。该研究提供了一种可用于分析生物序列数据的新方法,给出了一个从生物信息学角度来研究基因调控问题的新途径。 展开更多

关键词 序列特征 基因剪接 剪接位点 剪接调控元件

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利用计算方法识别定义内含子保留的基因组特征 被引量：1

3

作者 马猛 汪洋 《计算机工程与应用》 CSCD 2012年第28期36-41,共6页

超过90%的人基因都存在选择性剪接。正确识别不同的选择性剪接模式对深刻理解基因剪接调控机制具有重要意义。内含子保留是一种较为常见的基因剪接模式。从基因组序列本身出发,利用计算方法识别定义内含子保留的各种基因组特征,抽取统... 超过90%的人基因都存在选择性剪接。正确识别不同的选择性剪接模式对深刻理解基因剪接调控机制具有重要意义。内含子保留是一种较为常见的基因剪接模式。从基因组序列本身出发,利用计算方法识别定义内含子保留的各种基因组特征,抽取统计意义上显著差异的特征,利用三种分类方法(SVM,NN,NB)对这些基因组特征进行了分类预测验证实验,保留内含子的平均预测精度达到70%,整体平均精度达到90%,取得了良好效果。研究方法也可应用于其他基因剪接模式的研究。 展开更多

关键词 基因剪接 内含子保留 基因组特征

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基因剪接花样多

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作者 Gil Ast 李贵森 曾少立 《科学（中文版）》 2005年第6期38-45,共8页

2000年春天,一些基础分子生物学家互相打赌,试图预测DNA测序完成后在人类基因组中所能发现的基因数目.那时估计的基因数最高达到15.3万个.毕竟在大多数人看来,人类要产生大约9万种不同类型的蛋白质,因此我们需要至少同样多的基因来编码... 2000年春天,一些基础分子生物学家互相打赌,试图预测DNA测序完成后在人类基因组中所能发现的基因数目.那时估计的基因数最高达到15.3万个.毕竟在大多数人看来,人类要产生大约9万种不同类型的蛋白质,因此我们需要至少同样多的基因来编码它们. 展开更多

关键词 基因剪接 花样 秀丽隐杆线虫 2000年 人类基因组 DNA测序 生物学家 基因数目 基因分类 蛋白质 复杂性 500 细胞

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Tra2β1蛋白在神经特异性的基因剪接中的功能 被引量：1

5

作者 陈献华 李静 +2 位作者 林万敏 吴琨 徐平 《实验生物学报》 CSCD 北大核心 2004年第2期109-117,共9页

体外(in vitro)生化研究已证明哺乳动物Tra2蛋白是前体mRNA剪接的重要调控因子,但是,对该蛋白在in vivo条件下的剪接功能,尤其是在神经特异性基因剪接中的功能及其细胞特异性,目前所知甚少。本文采用in vivo分析模型,在COS-1和PFSK两种... 体外(in vitro)生化研究已证明哺乳动物Tra2蛋白是前体mRNA剪接的重要调控因子,但是,对该蛋白在in vivo条件下的剪接功能,尤其是在神经特异性基因剪接中的功能及其细胞特异性,目前所知甚少。本文采用in vivo分析模型,在COS-1和PFSK两种不同类型的细胞中,研究了两个神经特异性基因(GluR-B,SMN2)剪接的细胞特异性,同时分析了Tra2β1在这两个基因剪接中的功能及其细胞特异性。结果表明,在研究的两种细胞中,GluR-B和SMN2“小基因”的剪接均具有明显的细胞特异性;而Tra2β1蛋白的过量表达在这两种不同的细胞中对“小基因”的剪接有显著的相同倾向的调节作用,提示Tra2β1蛋白对该两个基因剪接的调节作用可能没有细胞特异性。 展开更多

关键词 Tra2β1蛋白 神经特异性 基因剪接 细胞特异性 MRNA

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血管内皮生长因子基因在成人肝组织中的表达

6

作者 赵天力 胡冬煦 +1 位作者 夏家辉 李文正 《湖南医科大学学报》 CSCD 北大核心 2003年第1期91-92,共2页

关键词 血管内皮生长因子 异构体 基因剪接

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辅助蛋白基因的剪接对磷脂酶A1酶活的影响

7

作者 杨蒙 薛正莲 +3 位作者 甘玉飞 周杰 王洲 刘艳 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第6期104-110,共7页

为探究磷脂酶A1辅助蛋白(phospholipase A1 accessory protein,PlaS)对磷脂酶A1(phospholipase A1,PlaA1)酶活关键调控区域,根据PlaS的结构特点,设计出截短突变体,利用聚合酶链式反应技术将PlaA1与PlaS共表达基因plaB中编码辅助蛋白的基... 为探究磷脂酶A1辅助蛋白(phospholipase A1 accessory protein,PlaS)对磷脂酶A1(phospholipase A1,PlaA1)酶活关键调控区域,根据PlaS的结构特点,设计出截短突变体,利用聚合酶链式反应技术将PlaA1与PlaS共表达基因plaB中编码辅助蛋白的基因plaS进行了剪接,并对各截短菌株进行酶活检测和酶学性质分析。结果表明:PlaS属于锚蛋白(ankyrin,ANK)家族,主要由N端域、ANK结构域、C端域三部分组成,其中ANK结构域包含4个典型的ANK重复序列(ANK repeat)。从构建的5株截短菌株中筛选出了2株胞外酶活相对较高的菌株AN-3与AN-4,与未截短菌株BP28相比,比酶活分别提高了73%和78%,催化效率(K_(cat)/K_(m))分别提高了216%和211%,而最适温度(45℃)和最适pH值(6.0)没有发生变化。K_(cat)/K_(m)的结果显示,在所有的截短菌株中AN菌株的催化效率最低。plaS剪接结果表明,PlaS的ANK结构域至少需要3个ANK repeat才会对PlaA1酶活表现为胞外促进作用,PlaS的C端域对维持PlaA1的结构稳定性起到重要的作用,研究为揭示PlaS对PlaA1的调控机制提供了理论基础。 展开更多

关键词 磷脂酶A1 磷脂酶A1辅助蛋白 锚蛋白重复序列 基因剪接 酶学性质 分子截短

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河北省1992年部分医学科研进展

8

作者 杨忠来 《医学研究杂志》 1993年第10期16-20,共5页

1992年河北省卫生系统共取得受奖医学科研成果128项。其中获卫生部科技进步奖一等奖1项,二等奖2项(以上3项我省为受奖单位之一),三等奖1项;获河北省科技进步奖一等奖1项,二等奖2项,三等奖20项,四等奖22项;

关键词 医学科研成果 科研进展 部科技进步奖 卫生系统 省科技进步奖 胃癌高发区 绞股蓝 医学研究 基因剪接 神经氨酸酶

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美国变态反应、哮喘和免疫学会会议报道

9

作者 黄文 《健康大视野》 2005年第6期46-47,共2页

关键词 变态反应性疾病 免疫学家 会议报道 哮喘 免疫治疗 危险因素 研究进展 自身免疫 发病机制 基因剪接

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X-连锁迟发性脊椎骨骺发育不良SEDL基因剪接受体突变导致潜在剪接位点激活(英文) 被引量：6

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作者 麻宏伟 姜俊 +2 位作者 吕峻峰 郭然 牛国辉 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期251-253,共3页

目的深入研究X连锁迟发性脊椎骨骺发育不良(Xlinkedspondyloepiphysealdysplasiatarda,SEDL)的发病机理,为最终防治本病提供依据。方法应用逆转录PCR及克隆测序方法对1例涉及SEDL基因第5内含子剪接受体缺失的SEDL患者进行mRNA表达研究... 目的深入研究X连锁迟发性脊椎骨骺发育不良(Xlinkedspondyloepiphysealdysplasiatarda,SEDL)的发病机理,为最终防治本病提供依据。方法应用逆转录PCR及克隆测序方法对1例涉及SEDL基因第5内含子剪接受体缺失的SEDL患者进行mRNA表达研究。结果该患者存在2个不同片段长度的mRNA表达产物,与GenBank正常序列进行BLAST比较后发现,393bp的表达产物是第6外显子内一个新的潜在剪接位点激活后形成的产物;433bp的表达产物与8号染色体的部分基因组序列完全一致。结论SEDL基因第5内含子剪接受体位点及其后的第6外显子共13个碱基的缺失突变导致第6外显子内一个新的潜在剪接受体位点激活,使转录后的mRNA丢失了第6外显子内47bp的编码序列,并使紧接其后的2个密码子产生移码,导致翻译的提前终止(D109-S123del;S124fsX126)。另外,该突变可能激活了8号染色体上假基因SEDLP2的转录,从而部分地补偿了SEDL蛋白的功能。 展开更多

关键词 X-连锁迟发性脊椎骨骺发育不良 SEDL 基因剪接受体 基因突变 潜在剪接位点

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家族性高胆固醇血症家系低密度脂蛋白受体基因剪接突变的研究 被引量：6

11

作者 蔺洁 王绿娅 +6 位作者 刘舒 潘晓冬 杜兰平 石凤茹 秦彦文 赵庆 郭恒怡 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2004年第1期14-18,共5页

目的　检测中国汉族家族性高胆固醇血症 (familial hypercholesterolemia,FH)大家系低密度脂蛋白受体 (low density lipoprotein receptor,L DL R)基因突变 ,探讨 FH发病的分子机理。方法　首先采用聚合酶链反应 -限制性片段长度多态性 ... 目的　检测中国汉族家族性高胆固醇血症 (familial hypercholesterolemia,FH)大家系低密度脂蛋白受体 (low density lipoprotein receptor,L DL R)基因突变 ,探讨 FH发病的分子机理。方法　首先采用聚合酶链反应 -限制性片段长度多态性 (polymerase chain reaction- restriction fragment lengthpolymorphism,PCR- RFL P)技术检测载脂蛋白 B1 0 0 (apo B1 0 0 )基因 Q35 0 0 R突变 ,排除家族性 apo B1 0 0 缺陷症 ,再采用 PCR扩增结合核苷酸序列分析检测 1例临床诊断为 FH纯合子患儿及其家系成员 L DL R基因启动子和全部 18个外显子片段 ,结果与 Gen Bank公布的该基因正常序列对比找出突变 ,并在家系其他成员中证实该突变。结果　该患儿 L DL R基因第 3内含子剪接供体处存在 IN 5′GT→AT纯合剪接突变 ,并且在家系中得到证实 ,一级和二级亲属中各发现 2例相同位点和相同形式的杂合子 ,其基因型表现为野生型和突变型杂合现象。同时未检测出患儿及其父母 apo B1 0 0 Q35 0 0 R突变。结论　发现 L DL R基因第 3内含子 G→ A纯合剪接突变 ,可能是该 FH家系发病的分子基础 ;检测该突变对临床干预和遗传指导有参考价值。 展开更多

关键词 家族性高胆固醇血症 低密度脂蛋白受体 基因剪接突变 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性

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中国人群中RHAG变异对mRNA剪接影响的体外研究

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作者 贾双双 孙明明 +3 位作者 温机智 魏玲 罗广平 姬艳丽 《中国输血杂志》 CAS 2023年第11期986-990,共5页

目的通过mRNA异常剪接体外验证实验,即体外微基因剪接系统(minigene splicing assay,MSA),研究中国人群中发现的RHAG突变对于RHAG基因mRNA剪接的影响。方法通过对KMxD数据库中RHAG基因数据的分析,选择10种中国人群中分布频率相对较高的... 目的通过mRNA异常剪接体外验证实验,即体外微基因剪接系统(minigene splicing assay,MSA),研究中国人群中发现的RHAG突变对于RHAG基因mRNA剪接的影响。方法通过对KMxD数据库中RHAG基因数据的分析,选择10种中国人群中分布频率相对较高的位于RHAG基因剪接位点附近的突变或编码区域的同义突变,构建相应的RHAG外显子野生型及突变型pSplicePOLR2G微基因表达质粒。转染HEK-293T细胞,48 h后收集细胞提取总RNA,反转录后进行PCR扩增,然后进行琼脂糖凝胶电泳检测和毛细管电泳检测,根据实验结果判断RHAG基因突变是否会影响相应外显子的正常剪接。结果2种RHAG基因剪接位点附近突变(c.158-5delT,c.807+3A>C)轻微减弱了原剪接位点的剪接效率,其余8种突变(c.312G>A,c.341+3G>A,c.609C>T,c.681G>A,c.861G>A,c.957T>A,c.984T>C和c.1139-7G>A)均不影响RHAG基因mRNA的剪接。结论RHAG基因在剪接方面比较保守,剪接位点附近突变及编码区同义突变较少会引起RHAG基因异常剪接。 展开更多

关键词 RHAG突变 体外微基因剪接系统 剪接异常 中国人群

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PTEN-Long通过PI3K-AKT途径对HepG2肝癌细胞的影响 被引量：4

13

作者 张谢 谭麟 +1 位作者 毛琦淇 李宏 《肿瘤学杂志》 CAS 2018年第8期764-768,共5页

[目的]探讨PTEN-Long对肝细胞癌HepG2细胞的影响及其脂质磷酸酶活性与PI3K-AKT信号通路之间的关系。[方法]细胞转染法转染PTEN-Long、PTEN-LongG302R和Vector于HepG2细胞。转染48h后,检测各组细胞增殖数,Westernblot法检测各组细胞PTEN-... [目的]探讨PTEN-Long对肝细胞癌HepG2细胞的影响及其脂质磷酸酶活性与PI3K-AKT信号通路之间的关系。[方法]细胞转染法转染PTEN-Long、PTEN-LongG302R和Vector于HepG2细胞。转染48h后,检测各组细胞增殖数,Westernblot法检测各组细胞PTEN-Long、pAkt、pS6K表达变化,流式细胞法检测各组细胞细胞凋亡水平变化,细胞划痕法检测各组细胞迁移情况。[结果]细胞转染后,PTEN-Long组、PTEN-LongG320R组表达PTENLong蛋白量无显著性差异;与Vector、PTEN-LongG320R组相比,PTEN-Long组pAkt（Ser473）、pS6K（Thr389）表达量明显下降。从转染后48h开始,PTEN-Long组细胞增殖数较Vector组、PTEN-LongG320R组明显减少,差异有统计学意义（P〈0.05）;PTEN-Long组较Vector组、PPTENLongG320R组凋亡明显增强（P〈0.05）;划痕14h后,PTEN-Long组、PTEN-LongG320R组较Vector组的迁移细胞数明显减少（P〈0.05）。[结论]PTEN-long依赖于其脂质磷酸酶活性,通过PI3KAKT通路调控肝癌HepG2细胞的增殖与凋亡。 展开更多

关键词 磷酸酶及张力蛋白同源基因剪接体 HEPG2细胞系 细胞凋亡 磷酸肌醇3-激酶/蛋白激酶B

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反义核酸对β-地中海贫血基因(IVS-2-654C→T)剪接缺陷抑制作用的研究 被引量：2

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作者 宫澜 孙琼 +2 位作者 任兆瑞 黄淑帧 曾溢滔 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 1997年第5期39-43,共5页

应用体外转录和体外剪接系统，以体外转录产生的特异性反义RNA封闭IVS－2－654→T突变基因中3’隐匿剪接位点和5’异常剪接位点，使之失去活性，以减少异常加工的mRNA，且部分恢复了正常剪接途径，其正常剪接mRNA的水平［β／（β十β... 应用体外转录和体外剪接系统，以体外转录产生的特异性反义RNA封闭IVS－2－654→T突变基因中3’隐匿剪接位点和5’异常剪接位点，使之失去活性，以减少异常加工的mRNA，且部分恢复了正常剪接途径，其正常剪接mRNA的水平［β／（β十β）］从处理前的0．25上升到处理后的0．46—0．61。研究结果提示了应用反义核酸临床治疗β－地贫（IVS－2－654C→T突变）的可能性。 展开更多

关键词 反义核酸 地中海贫血 基因剪接缺陷 基因治疗

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合作研究发现胰腺、乳腺神经内分泌肿瘤高频FAK癌基因剪接异常

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《前进论坛》 2023年第9期37-37,共1页

黏着斑激酶(FAK)为非受体型的酪氨酸激酶,存在于细胞质中,活化后转移至黏着斑,催化黏着斑上的靶蛋白的酪氨酸磷酸化。中国医学科学院肿瘤医院周光飚研究组、天津医科大学肿瘤医院郝继辉研究组、中国人民解放军总医院郭明洲研究组。

关键词 神经内分泌肿瘤 酪氨酸磷酸化 肿瘤医院 黏着斑 酪氨酸激酶 基因剪接 靶蛋白 受体型

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解析基因剪接调控机制

16

《中国农业科技导报》 CAS CSCD 2011年第4期135-135,共1页

由植物抗性（Resistance，R）基因编码的免疫受体在植物抗击病原菌的免疫过程中发挥了重要作用。植物中很多R基因，然而植物体调控R基因剪接的机制目前还知之甚少。图位克隆和生物信息学分析显示MOSl4编码了一个和动物中Transportin-SR... 由植物抗性（Resistance，R）基因编码的免疫受体在植物抗击病原菌的免疫过程中发挥了重要作用。植物中很多R基因，然而植物体调控R基因剪接的机制目前还知之甚少。图位克隆和生物信息学分析显示MOSl4编码了一个和动物中Transportin-SR（TRN-SR）存在序列相似性的蛋白质。TRN-SR是importin-beta超家族的一个成员， 展开更多

关键词 调控机制 基因剪接 解析 植物抗性 免疫过程 基因编码 序列相似性 生物信息

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基因剪接形式改变可致早老症及细胞衰老的发生

17

作者 桂宾 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期790-790,共1页

来自NIH的研究人员发现了新的调控正常细胞程序化衰老的通路,并揭示了具有毒性的早老蛋白（progerin）与端粒的密切关系.这一研究成果已在线刊载于Journal of Clinical Investigation.随着细胞的分裂,端粒会逐渐缩短,当超过一定程度,细... 来自NIH的研究人员发现了新的调控正常细胞程序化衰老的通路,并揭示了具有毒性的早老蛋白（progerin）与端粒的密切关系.这一研究成果已在线刊载于Journal of Clinical Investigation.随着细胞的分裂,端粒会逐渐缩短,当超过一定程度,细胞就会停止分裂甚至死亡. 展开更多

关键词 细胞衰老 基因剪接 正常细胞 研究人员 研究成果 程序化 NIH 端粒

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我国科学家发现基因剪接调控新机制

18

作者 本刊讯 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1265-1265,共1页

mRNA选择性剪接是真核生物中基因表达的一种高效、精准的调控机制,它是指剪接体通过在mRNA前体上的识别定位,准确地切除内含子序列,将不同的外显子序列拼接到一起,产生不同的成熟mRNA转录本.选择性剪接是形成结构和功能多样的蛋白质的... mRNA选择性剪接是真核生物中基因表达的一种高效、精准的调控机制,它是指剪接体通过在mRNA前体上的识别定位,准确地切除内含子序列,将不同的外显子序列拼接到一起,产生不同的成熟mRNA转录本.选择性剪接是形成结构和功能多样的蛋白质的重要物质基础,至少90%的人类基因都存在选择性剪接,在细胞生长和组织分化等方面发挥关键作用. 展开更多

关键词 调控机制 基因剪接 科学家 MRNA前体 选择性剪接 内含子序列 基因表达 真核生物

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萤光追踪与“基因剪接”

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作者 夏阳 《科学之友》 2010年第5期61-61,共1页

小小萤火虫，以其点点亮光，为夜幕下的田野、村落平添了几多情趣。在昆虫乃至动物的大干世界中，像萤火虫这样自带“灯笼”的“游客”，确实是寥若晨星。正因为如此，这位自“明”得意的贵客才显得愈加可贵。

关键词 基因剪接 追踪 萤光 萤火虫 动物 昆虫

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清华大学解析出基因剪接的基础结构

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《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期132-132,共1页

清华大学生命科学学院施一公研究组近日得到近原子分辨率的剪接体三维结构和剪接体对前体信使RNA执行剪接的基本工作机理,从而将分子生物学＂中心法则＂在分子机理的研究上大幅度向前推进。成果以两篇背靠背研究论文形式发表在《科学》... 清华大学生命科学学院施一公研究组近日得到近原子分辨率的剪接体三维结构和剪接体对前体信使RNA执行剪接的基本工作机理,从而将分子生物学＂中心法则＂在分子机理的研究上大幅度向前推进。成果以两篇背靠背研究论文形式发表在《科学》杂志。第一篇文章题为《3.6埃的酵母剪接体结构》,报道了通过单颗粒冷冻电子显微镜（冷冻电镜）方法解析的酵母细胞剪接体近原子水平分辨率的三维结构； 展开更多

关键词 剪接体 施一公 中心法则 论文形式 酵母细胞 方法解析 基础结构 基因剪接 生命科学 研发动态

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