流感病毒改造新策略及其应用 被引量：1

1

作者 郭茜亚 陈积 董铭心 《合成生物学》 CSCD 北大核心 2024年第2期267-280,共14页

流感病毒有着极强的变异性和传播性,常在全球范围内引起季节性的流感爆发。流感病毒的基因组序列、蛋白结构与功能、病毒的包装机制等环节研究相对清楚,也是一种重要的模式病毒,用于条件控制基因元件的发现和确证,构建智能响应型病毒等... 流感病毒有着极强的变异性和传播性,常在全球范围内引起季节性的流感爆发。流感病毒的基因组序列、蛋白结构与功能、病毒的包装机制等环节研究相对清楚,也是一种重要的模式病毒,用于条件控制基因元件的发现和确证,构建智能响应型病毒等。随着反向遗传学与合成生物学的发展,通过基因工程改造的流感病毒能更好地控制病毒复制来提高疫苗的安全性,以及诱发机体产生强烈的免疫反应,在肿瘤免疫治疗领域引发广泛关注。本文描述了蛋白质水解靶向嵌合病毒、条件复制型流感减毒活病毒和高干扰素敏感病毒等三种新型减毒流感病毒改造策略,并对编码过早终止密码子的嵌合抗原肽的流感病毒、与PD-L1或CTLA4免疫检查点重组的流感病毒、截短的NS1片段表达GM-CSF的流感病毒分别对黑色素瘤、肝癌的溶瘤作用进行评述。未来,将通过创新性地运用不同策略、不同病毒来构建减毒活疫苗和溶瘤病毒,以便在临床上获得更加安全有效的治疗手段。 展开更多

关键词 流感病毒 基因元件 减毒策略 条件响应 减毒活疫苗 溶瘤病毒

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碳青霉烯类抑制法用于检测产碳青霉烯酶菌株的评价 被引量：6

2

作者 程阔 何京 +2 位作者 冯军花 李燕 张金艳 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期64-66,共3页

碳青霉烯类抗生素抗菌谱广，抗菌活性强，对包括超广谱β内酰胺酶（extended spectrum β-lactamases，ESBLs）在内的大多数B内酰胺酶稳定，已成为治疗严重细菌感染的主要抗菌药物之一。然而，近年来碳青霉烯类抗生素的广泛使用导致细... 碳青霉烯类抗生素抗菌谱广，抗菌活性强，对包括超广谱β内酰胺酶（extended spectrum β-lactamases，ESBLs）在内的大多数B内酰胺酶稳定，已成为治疗严重细菌感染的主要抗菌药物之一。然而，近年来碳青霉烯类抗生素的广泛使用导致细菌的耐药性逐渐增强，产碳青霉烯酶菌株的检出率逐年上升，且编码碳青霉烯酶的基因位于质粒等可移动的基因元件上，易在细菌间水平转移而导致耐药菌株的暴发流行。 展开更多

关键词 碳青霉烯类抗生素 碳青霉烯酶 耐药菌株 超广谱Β内酰胺酶 抑制法 严重细菌感染 检测 基因元件

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氧化还原敏感型基因元件增强酵母木质纤维素水解液抑制物胁迫耐受性 被引量：1

3

作者 王文韬 冯颀 +2 位作者 刘晨光 白凤武 赵心清 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期360-372,共13页

纤维素乙醇作为一种清洁可再生的绿色能源,具有良好的应用前景。然而酿酒酵母利用木质纤维素原料生产乙醇的发酵过程易受多种抑制物胁迫的影响,因此提高其胁迫耐受性具有重要意义。本研究在细胞内设计了一种氧化还原敏感型基因元件,通... 纤维素乙醇作为一种清洁可再生的绿色能源,具有良好的应用前景。然而酿酒酵母利用木质纤维素原料生产乙醇的发酵过程易受多种抑制物胁迫的影响,因此提高其胁迫耐受性具有重要意义。本研究在细胞内设计了一种氧化还原敏感型基因元件,通过生物传感器Yap1感应胞内氧化还原状态,以调控抗胁迫基因智能表达。首先,分析了Yap1调控的天然内源启动子P_(TRR1)、P_(TRX2)和P_(MET16)对木质纤维素水解液中典型抑制物的响应强度。其次,根据不同胁迫种类组合相应启动子与抗胁迫的效益基因,构建氧化还原敏感型基因元件提高了酿酒酵母的胁迫耐受性。最后,将表现较好的基因元件GP-CTT和GP-ADH串联整合到一起构建了双基因元件系统,在5-HMF和H_(2)O_(2)双重胁迫下细胞的死亡率与野生型相比下降了69.6%。相较于单基因元件GP-CTT,双基因元件整合菌株的比生长速率、葡萄糖消耗速率和乙醇生产速率分别提高了64.2%、60.1%和58.9%,重组菌株过氧化氢酶的酶活力提高了40.2%。本研究通过理性设计氧化还原敏感型基因元件的遗传回路,强化胞内关键抗氧化酶和醛降解途径,系统地提高了酿酒酵母的胁迫耐受性,为动态地提高酵母鲁棒性提供了新的见解。 展开更多

关键词 氧化还原电位 基因元件 酿酒酵母 胁迫耐受性 木质纤维素 燃料乙醇

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天然药物研究中的合成生物学 被引量：3

4

作者 庞博 郑庆飞 刘文 《中国科学：生命科学》 CSCD 北大核心 2015年第10期1015-1026,共12页

天然产物一直是药物分子设计和开发过程中的重要灵感来源之一,源自天然产物的临床用药目前也占据着难以替代的地位.但是大多数天然来源的药物分子结构复杂、分离困难,利用传统的合成化学和天然产物化学方法难以满足日益增长的市场需求.... 天然产物一直是药物分子设计和开发过程中的重要灵感来源之一,源自天然产物的临床用药目前也占据着难以替代的地位.但是大多数天然来源的药物分子结构复杂、分离困难,利用传统的合成化学和天然产物化学方法难以满足日益增长的市场需求.天然产物在其产生物种中一定对应着一个由若干功能各异的基因元件所构成的生物合成基因群,或成簇分布或离散分布.合成生物学则旨在通过对不同基因元件的改造、组合、拼装而得到新的生物途径和体系.本文主要将针对合成生物学在天然药物研究中的应用进行总结和展望,并从基因元件以及合成生物学的角度重新认识和理解天然产物的生物合成. 展开更多

关键词 天然药物 合成生物学 基因元件 途径设计 代谢工程 组合生物合成 元件改造

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细菌群体感应元件构建和工程应用 被引量：2

5

作者 周爱林 刘奕 +1 位作者 巴方 钟超 《合成生物学》 CSCD 2021年第2期234-246,共13页

群体感应现象指的是微生物通过独特的交流方式使不同菌个体间的行为同步,从而展现群体性行为。当前在微生物群体感应系统方面的研究,除了促进或抑制天然群体感应方面的基础研究外,研究人员逐渐开始将群体感应系统引入到合成生物学的工... 群体感应现象指的是微生物通过独特的交流方式使不同菌个体间的行为同步,从而展现群体性行为。当前在微生物群体感应系统方面的研究,除了促进或抑制天然群体感应方面的基础研究外,研究人员逐渐开始将群体感应系统引入到合成生物学的工程应用研究,并且将其广泛运用在医学、工业、环境等应用领域。本文主要总结了细菌群体感应元件在构建过程中的常用策略与方法,并探讨了基于群体感应基因元件改造的工程菌在动态代谢调节、周期性振荡呈现、异种菌种间关系的构建等方面的应用。群体感应元件的研究主要包括新群体感应元件的开发和针对已有群体感应元件的优化。通过模拟、优化群体感应元件并将其模块化,研究人员构建了丰富的群体感应基因元件库,使群体感应能被灵活应用于不同场景。另外,通过在细菌中引入群体感应基因回路,可以将单个细菌内部的各类反馈回路较好地拓展到整个细菌群体中,而这种多细胞体系的构建,使得更多复杂的功能得以实现,如通过群体感应实现动态代谢调节从而提高发酵效率,或实现群体周期性振荡以释放肿瘤杀伤药物等。此外,环境中异种微生物的关系也可以通过外源引入群体感应来进行调控,这为微生物的共培养提供了新工具,更为复杂的合成生物学系统的建立提供了新思路。随着机器学习等计算机领域的发展,未来可以更多借助计算机来设计复杂群体感应回路,并对外源群体感应引入后的效果做出更精准的预测。 展开更多

关键词 群体感应 合成生物学 基因元件 微生物 代谢调控

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红冬孢酵母分子遗传操作技术研究进展

6

作者 马冬石 陈震 +2 位作者 彭毅雯 闻志强 金明杰 《生物加工过程》 CAS 2019年第5期504-508,共5页

红冬孢酵母(Rhodosporidium)是一种天然的微生物油脂和β-类胡萝卜素高产菌,有望被开发为工业平台菌株。近年来,基因组测序完成和各种组学研究的开展,为红冬孢酵母分子遗传操作技术开发奠定了基础。基因元件(如启动子、终止子、报告基... 红冬孢酵母(Rhodosporidium)是一种天然的微生物油脂和β-类胡萝卜素高产菌,有望被开发为工业平台菌株。近年来,基因组测序完成和各种组学研究的开展,为红冬孢酵母分子遗传操作技术开发奠定了基础。基因元件(如启动子、终止子、报告基因和筛选标记等)的挖掘和引入,基因转化方法开发以及基因操纵技术(如基因失活和过表达)等的完善,加速了红冬孢酵母的代谢工程研究进程。本文中,笔者总结了红冬孢酵母在分子遗传操作技术方面的研究进展,力图勾勒出红冬孢酵母的分子遗传操作技术研究的概貌,为后续研究提供借鉴。 展开更多

关键词 红冬孢酵母 分子遗传操作 基因元件 基因转化 代谢工程

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同源不同辐射抗拒NPC细胞间总甲基化水平及基因甲基化表达差异的探讨

7

作者 罗海丹 王冬辉 +3 位作者 林伟达 苏箔金 赵存友 杨惠玲 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期1300-1304,共5页

目的:比较同源不同辐射抗拒能力的鼻咽癌细胞CNE2R/CNE2间总甲基化水平及其区域的差异。方法:采用赵存友博士改良的基于甲基化敏感酶全基因组甲基化法检测CNE2R/CNE2细胞全基因组甲基化水平;同时采用Me DIP-Seq测序法对CNE2R/CNE2细胞... 目的:比较同源不同辐射抗拒能力的鼻咽癌细胞CNE2R/CNE2间总甲基化水平及其区域的差异。方法:采用赵存友博士改良的基于甲基化敏感酶全基因组甲基化法检测CNE2R/CNE2细胞全基因组甲基化水平;同时采用Me DIP-Seq测序法对CNE2R/CNE2细胞进行测序,分析比较DNA甲基化区域(主要包括6个基因功能元件即CDS、intron、downstream2k、upstream2k、3’UTR及5’UTR)的差异。结果:CNE2R细胞全基因组甲基化水平比CNE2细胞低约30%;在CNE2R和CNE2细胞中,虽然分布在6个基因功能元件上的峰值个数和峰值在各基因元件上的覆盖度均无明显差异,但2种细胞的6个基因功能元件上基因甲基化存在差异。结论:同源不同辐射抗拒能力的鼻咽癌细胞间总甲基化水平及基因甲基化存在差异,推测DNA甲基化的差异可能与鼻咽癌辐射抗拒相关。 展开更多

关键词 辐射抗拒 甲基化 鼻咽癌 基因元件

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CarbAcineto NP试验检测产碳青霉烯酶鲍曼不动杆菌的研究

8

作者 何京 单亚楠 +2 位作者 冯军花 李燕 张金艳 《国际流行病学传染病学杂志》 CAS 2016年第3期210-211,共2页

鲍曼不动杆菌为医源性条件致病菌，在非发酵菌感染中仅次于假单胞菌[1]。近来产碳青霉烯酶鲍曼不动杆菌在全球范围内的报道呈上升趋势，且其编码碳青霉烯酶的基因主要存在于可移动的基因元件上，可在医院环境中快速播散。因此，产碳青... 鲍曼不动杆菌为医源性条件致病菌，在非发酵菌感染中仅次于假单胞菌[1]。近来产碳青霉烯酶鲍曼不动杆菌在全球范围内的报道呈上升趋势，且其编码碳青霉烯酶的基因主要存在于可移动的基因元件上，可在医院环境中快速播散。因此，产碳青霉烯酶鲍曼不动杆菌的快速识别成为控制医院感染的关键。Carba NP试验在肠杆菌科和铜绿假单胞菌碳青霉烯酶的检测中效果显著，但由于鲍曼不动杆菌产酶活性较弱，在一定情况下 Carba NP 试验容易出现假阴性结果[2]。Dortet等[3]提出采用CarbAcineto NP试验能很大程度上提高产碳青霉烯酶鲍曼不动杆菌的检出率。本研究旨在评估CarbAcineto NP试验检测产碳青霉烯酶鲍曼不动杆菌的效果。 展开更多

关键词 鲍曼不动杆菌 碳青霉烯酶 试验 检测 铜绿假单胞菌 非发酵菌感染 控制医院感染 基因元件

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食源性金黄色葡萄球菌肠毒素及其检测方法 被引量：25

9

作者 李琼琼 范一灵 +2 位作者 宋明辉 施春雷 杨美成 《食品安全质量检测学报》 CAS 2016年第2期555-560,共6页

金黄色葡萄球菌是一种重要的食源性致病菌,在自然界中广泛分布,其引起的食物中毒是世界性的公共卫生问题。金黄色葡萄球菌肠毒素是引起金黄色葡萄球菌食物中毒的主要致病因子。目前共发现22种金黄色葡萄球菌肠毒素或类肠毒素(SEA-SEE、S... 金黄色葡萄球菌是一种重要的食源性致病菌,在自然界中广泛分布,其引起的食物中毒是世界性的公共卫生问题。金黄色葡萄球菌肠毒素是引起金黄色葡萄球菌食物中毒的主要致病因子。目前共发现22种金黄色葡萄球菌肠毒素或类肠毒素(SEA-SEE、SEG-SET、SElU、SElU_2和SElV),其中具有催吐活性的被定义为肠毒素,没有催吐活性或者尚待验证的被定义为类肠毒素(SEl)。传统肠毒素SEA^SEE被报道是引起金黄色葡萄球菌食物中毒的主要肠毒素类型,但是大多数新型肠毒素或类肠毒素与食物中毒的关系还没有被真正认识。本文对近几年关于金黄色葡萄球菌肠毒素与食物中毒的关系、肠毒素的表达调控以及肠毒素检测方法的研究进展进行了总结,以期更好地了解金黄色葡萄球菌新型肠毒素致病性,为今后金黄色葡萄球菌食物中毒的预防和控制提供依据。 展开更多

关键词 金黄色葡萄球菌 肠毒素 食物中毒 可移动基因元件

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沙门氏菌抗生素抗性机理研究进展 被引量：20

10

作者 杨保伟 盛敏 +2 位作者 席美丽 申进玲 孟江洪 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1479-1484,共6页

沙门氏菌的多重耐药性问题已经成为世界范围内的公共卫生和经济问题。目前沙门氏菌抗生素抗性机理的研究主要集中以下方面:(1)基因突变与抗生素抗性;(2)外排泵与抗生素抗性;(3)耐药基因编码的钝化酶和灭活酶引起的抗生素抗性;(4)可移动... 沙门氏菌的多重耐药性问题已经成为世界范围内的公共卫生和经济问题。目前沙门氏菌抗生素抗性机理的研究主要集中以下方面:(1)基因突变与抗生素抗性;(2)外排泵与抗生素抗性;(3)耐药基因编码的钝化酶和灭活酶引起的抗生素抗性;(4)可移动的细菌遗传耐药基因元件及其转移与抗生素抗性。本文基于以上几个方面综述了与沙门氏菌抗生素抗性机理研究相关的研究动态和研究进展。 展开更多

关键词 沙门氏菌 基因突变 外排泵 耐药基因 可移动耐药基因元件 抗生素抗性

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紫色土丘陵区畜禽养殖场土壤中抗生素抗性基因分布特征 被引量：18

11

作者 程建华 唐翔宇 刘琛 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第7期3257-3262,共6页

鉴于紫色土高垦殖丘陵区土壤中抗生素抗性基因的潜在生态环境风险,本研究采用高通量荧光定量PCR技术,分析了抗生素抗性基因在不同类型畜禽养殖场(养猪场、养鸡场和养牛场)土壤中的丰度和多样性.结果表明,3种养殖场土壤中共检出79种抗生... 鉴于紫色土高垦殖丘陵区土壤中抗生素抗性基因的潜在生态环境风险,本研究采用高通量荧光定量PCR技术,分析了抗生素抗性基因在不同类型畜禽养殖场(养猪场、养鸡场和养牛场)土壤中的丰度和多样性.结果表明,3种养殖场土壤中共检出79种抗生素抗性基因和5种可移动基因元件,其中多重耐药类基因是养殖场土壤中丰度最高的耐药基因.不同养殖场土壤中抗生素抗性基因的丰度和多样性均表现为养鸡场和养猪场样品高于养牛场土壤,且3种养殖场土壤样品中的抗性基因表现出不同的类别分布特征.养殖场土壤中较高的可移动基因元件丰度,及其与抗生素抗性基因丰度显著的相关性(P<0.05)说明,可移动基因元件可能促进了抗生素抗性基因在养殖场土壤中的迁移和扩散. 展开更多

关键词 紫色土 畜禽养殖场 抗生素抗性基因(ARGs) 可移动基因元件(MGEs) 高通量荧光定量PCR(HT-QPCR)

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金黄色葡萄球菌肠毒素及移动基因元件研究进展 被引量：11

12

作者 王琼 唐俊妮 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第3期241-246,共6页

金黄色葡萄球菌肠毒素是一种热源性的超抗原。食用被肠毒素污染的食物能够引起食物中毒,导致恶心、呕吐、腹痛有时伴随腹泻。本文综述了肠毒素的分类命名、理化性质、以及编码不同肠毒素的基因在移动基因元件中的存在情况。这些移动基... 金黄色葡萄球菌肠毒素是一种热源性的超抗原。食用被肠毒素污染的食物能够引起食物中毒,导致恶心、呕吐、腹痛有时伴随腹泻。本文综述了肠毒素的分类命名、理化性质、以及编码不同肠毒素的基因在移动基因元件中的存在情况。这些移动基因元件在金黄色葡萄球菌毒力传播和进化过程中起着至关重要的作用,了解它们对于金黄色葡萄球菌流行病学溯源以及理解毒力机制具有一定的指导意义。 展开更多

关键词 金黄色葡萄球菌 葡萄球菌肠毒素 理化性质 移动基因元件

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辽宁省主要设施农业集散地大棚土壤ARGs与MGEs分布特征分析

13

作者 张珣 武轶 +3 位作者 黎馨月 王百羽 安婧 王莹 《沈阳大学学报（自然科学版）》 CAS 2023年第3期199-206,共8页

为分析设施农业集散地大棚土壤中抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)污染与可移动基因元件(mobile genetic elements,MGEs)的分布特征,于辽宁省6个主要设施农业集散地采集温室大棚土壤样品进行实验分析。由于长期施用畜... 为分析设施农业集散地大棚土壤中抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)污染与可移动基因元件(mobile genetic elements,MGEs)的分布特征,于辽宁省6个主要设施农业集散地采集温室大棚土壤样品进行实验分析。由于长期施用畜禽粪肥,致使土壤中ARGs的相对丰度和多样性显著增加。对采样点的土壤进行ARGs及MGEs种类和丰度的检测,并对其相关性进行分析。结果表明:土壤样品中检测出50种ARGs和10种MGEs,其中tetG-01、tetG-02、tetM-01、tetM-02、tetPA、tetPB-03、tetT、oprJ、acrA-04、sul2、dfrA1、folA、blaTEM、fox5、ermX、ermB、ermF、ermT-02以及intI-1、tnpA-01、tnpA-05的检出率为100%,且抗性机制主要为细胞保护;土壤中部分ARGs的相对丰度与MGEs的相对丰度之间存在一定的正相关。 展开更多

关键词 设施农业土壤 抗生素抗性基因 可移动基因元件 抗性机制 分布特征

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药用植物中转基因元件筛查策略研究 被引量：4

14

作者 赵丰兰 孙梦楚 +2 位作者 史梦如 薛建平 段永波 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2018年第15期3703-3709,共7页

通过对已有药用植物转基因研究文献进行总结分析,为药用植物和中药材转基因监管提供有效策略。采用关键词检索法对中国知网和SCI两大数据库进行查询,建立48种常用药用植物转基因研究中常用表达元件的数据库,分析转基因元件使用情况,并... 通过对已有药用植物转基因研究文献进行总结分析,为药用植物和中药材转基因监管提供有效策略。采用关键词检索法对中国知网和SCI两大数据库进行查询,建立48种常用药用植物转基因研究中常用表达元件的数据库,分析转基因元件使用情况,并总结外源转基因的筛查策略。获得1993年4月至2016年5月的转基因研究文献281篇,包括中文文献230篇,英文文献51篇。40.4%的中文文献和54.9%的英文文献研究目的为优化药用植物遗传转化体系。常用启动子包括P-35S、P-Ubi、P-GPD和P-act,其中P-35S的使用频率最高,为68.7%。常用标记基因包括NPTII、HPT、Gent、Bar和aad A,其中NPTII的使用频率最高,为37.4%。常用报告基因包括GUS和GFP,GUS使用频率达到35.2%。常用终止子包括T-NOS、T-35S和T-OCS,其中T-NOS的使用频率最高,为58%。对各元件进行配组分析,发现"P-35S+T-NOS+NPTII+GUS"组合筛选成功率为86.1%,在此基础上加入有一定使用频率的HPT、Bar和GFP,对药用植物转基因元件的筛查率达到91.5%。对于使用同源或内源启动子、标记基因和终止子的研究,可基于T-DNA边界序列进行转基因检测。 展开更多

关键词 药用植物 转基因元件 转化目的 使用频率 筛查策略

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基于高灵敏度全细胞传感器的汞转化基因元件评价体系

15

作者 高子涵 张晶 +4 位作者 郭瑛瑛 熊文君 杨方典 缪炜 熊杰 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1398-1405,共8页

汞是最具毒性的重金属之一;不同形态的汞具有的毒性差异大,发掘高效的不同汞形态转化的基因元件,通过合成生物学手段构建汞的微生物转化减毒体系是未来汞污染治理的重要方向;因此,发展和建立一套基因元件功能和效率的评价体系,是筛选高... 汞是最具毒性的重金属之一;不同形态的汞具有的毒性差异大,发掘高效的不同汞形态转化的基因元件,通过合成生物学手段构建汞的微生物转化减毒体系是未来汞污染治理的重要方向;因此,发展和建立一套基因元件功能和效率的评价体系,是筛选高效汞形态转化基因的关键.基于MerR这一汞离子特异性响应蛋白和绿色荧光蛋白(GFP)报告基因所构建的汞离子大肠杆菌细胞传感器,首先通过引入汞转运蛋白MerT提高汞离子的响应程度,构建含pUC57-MerT-MerR-GFP的细胞传感器.该传感器4h对氯化汞(HgCl_(2))的响应浓度为5-200μg/L,响应能力与汞离子浓度线性相关.在此基础上,将含有待测试汞转化基因的pACYC184质粒转入这一传感器,构建含相容性双质粒的大肠杆菌体系,通过GFP荧光的强度(胞内汞离子浓度)来评价待测基因是否具有将汞离子转化成其他形态的功能及其效率.抗生素处理下,相容性双质粒在大肠杆菌中拷贝数保持稳定,可用于基因元件评价.通过生物信息学分析,分别在原核生物蓝藻和单细胞真核生物四膜虫中鉴定和筛选了潜在的汞离子转化相关基因,包括半胱氨酸合成酶、胱硫醚-β-合成酶和半胱氨酸脱硫酶.利用所构建的大肠杆菌体系对蓝藻和四膜虫的基因元件进行评价,结果表明在100μg/L HgCl_(2)处理4 h下,含蓝藻半胱氨酸脱硫酶的大肠杆菌GFP荧光强度与对照组相比下降了79.5%,含四膜虫半胱氨酸脱硫酶的大肠杆菌GFP荧光强度与对照组相比下降了51.2%,说明两类生物中半胱氨酸脱硫酶能均能高效转化汞离子.本研究所构建的评价体系可用于上述原核生物基因元件和密码子优化后的真核生物基因元件,具备较强的响应速率、灵敏度和稳定性,为实现汞转化基因元件高通量筛选奠定了基础. 展开更多

关键词 汞 基因元件评价 大肠杆菌 相容性双质粒 半胱氨酸脱硫酶

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高垦殖丘陵区不同类型农用地土壤中抗生素抗性基因分布特征

16

作者 陈瑞 程建华 唐翔宇 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第12期6947-6954,共8页

为揭示高垦殖丘陵区不同类型农用地土壤中抗生素抗性基因分布特征,分析了抗生素抗性基因在菜地、果园和耕地土壤中的丰度和多样性.结果表明,所有土壤样品中共检出70种抗生素抗性基因和4种可移动基因元件,其中β-内酰胺类cphA-01抗性基... 为揭示高垦殖丘陵区不同类型农用地土壤中抗生素抗性基因分布特征,分析了抗生素抗性基因在菜地、果园和耕地土壤中的丰度和多样性.结果表明,所有土壤样品中共检出70种抗生素抗性基因和4种可移动基因元件,其中β-内酰胺类cphA-01抗性基因是农用地土壤中相对丰度最高的耐药基因.在菜地和果园土壤中,主要的抗性基因亚型为cphA-01和cmx(A),而耕地土壤以mexF和aacC基因为主.土壤中抗生素抗性基因的相对丰度和多样性均表现为:耕地<菜地<果园,这与不同农用地土壤的养分条件差异有关.类似地,土壤中可移动基因元件的相对丰度和多样性均以耕地土壤为最低,而其最高值分别出现在菜地和果园样品中.高垦殖丘陵区农用地土壤环境中可移动基因元件与抗生素抗性基因丰度呈显著正相关关系(P<0.05),表明基因水平迁移可能促进抗生素抗性基因在高垦殖丘陵区农用地土壤环境中扩散. 展开更多

关键词 高垦殖丘陵区 农用地 抗生素抗性基因(ARGs) 可移动基因元件(MGEs) 高通量荧光定量PCR(HT-QPCR)

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深圳地区耐亚胺培南临床菌株耐药机制及可移动基因元件分析 被引量：3

17

作者 王紫琦 陆学东 +2 位作者 蒋利利 杨维青 赵祖国 《微生物学免疫学进展》 2018年第3期33-39,共7页

目的了解深圳地区耐亚胺培南临床菌株的分布及携带碳青霉烯酶基因的情况,并检测其携带的可移动基因元件。方法 2014—2016年中山大学附属第八医院(深圳)送检标本中分离耐亚胺培南菌株96株,参照美国CLSI的M100S25标准进行药敏分析;采用Ca... 目的了解深圳地区耐亚胺培南临床菌株的分布及携带碳青霉烯酶基因的情况,并检测其携带的可移动基因元件。方法 2014—2016年中山大学附属第八医院(深圳)送检标本中分离耐亚胺培南菌株96株,参照美国CLSI的M100S25标准进行药敏分析;采用Carba NP-d试验检测碳青霉烯酶表型;PCR检测碳青霉烯酶基因及可移动基因元件I类整合子、插入序列共同区(Insertion sequence common region,ISCR),对肠杆菌科加测质粒复制子类型。结果 96株耐亚胺培南临床菌株对多种临床常用抗菌药物均耐药;其中52株碳青霉烯酶表型阳性;68株携带碳青霉烯酶基因,其中61株携带D类碳青霉烯酶基因,3株携带bla_(VIM),2株携带blaKPC,1株携带bla_(IMP),1株携带bla_(NDM-1);I类整合子检出率为69.8%,其可变区携带有耐药相关基因盒aad A1、aac A4、dfr A12、aad A5、dfr A17和未知功能的orf F,未发现碳青霉烯是耐药基因;ISCR1检出率为16.7%;肠杆菌科菌株64.3%携带质粒,以Inc F型为主。结论深圳地区耐亚胺培南临床菌株具有多重耐药表型,绝大多数产碳青霉烯酶,碳青霉烯酶基因多存在于细菌染色体上,这类菌株同时携带多种可移动的基因元件及耐药基因,因此,其耐药性具有稳定遗传和水平播散的能力,应密切关注。 展开更多

关键词 细菌耐药 碳青霉烯酶 可移动基因元件

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携带污染物降解基因的可移动基因元件及其介导的生物修复 被引量：2

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作者 李慧 周丽莎 +3 位作者 王亚菲 Eva M.Top 张颖 徐慧 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期526-536,共11页

可移动基因元件(mobile genetic elements,MGEs)在环境微生物群落中的水平转移是细菌基因组进化和适应特定环境压力的重要机制.在污染土壤和水体中接种携带具有降解基因MGEs的菌株后,随着MGEs的水平基因转移,可使降解基因转移至具有竞... 可移动基因元件(mobile genetic elements,MGEs)在环境微生物群落中的水平转移是细菌基因组进化和适应特定环境压力的重要机制.在污染土壤和水体中接种携带具有降解基因MGEs的菌株后,随着MGEs的水平基因转移,可使降解基因转移至具有竞争性的土著微生物中并在其中表达,从而不必考虑供体菌在环境中是否能够长期存活.这种由可移动降解基因元件水平转移介导的生物修复为探索新的生物修复途径提供了可行性.本文重点综述了环境样品中携带降解基因MGEs的多样性及其在促进污染物降解过程中的重要作用,介绍了从环境样品中分离代谢MGEs的方法,并列举了在污染土壤、活性污泥、其他生物反应器等生态系统中MGEs水平转移的几个实例. 展开更多

关键词 可移动基因元件(MGEs) 水平基因转移(HGT) 外源分离法 生物修复

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鼠伤寒沙门菌CVCC541 rhs基因内部元件缺失株的构建及其功能

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作者 王琬凝 董震 +5 位作者 王志林 陈启伟 吴锦燕 尚佑军 刘永生 兰喜 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期724-732,共9页

利用Red同源重组系统构建5株rhs内部元件缺失株以及回补株,并通过HeLa细胞黏附和侵袭试验、小鼠腹腔巨噬细胞吞噬后存活试验、小鼠致病力试验鉴定rhs内部元件缺失后对菌株黏附能力、侵袭能力和小鼠致病力的影响。旨在通过敲除鼠伤寒沙门... 利用Red同源重组系统构建5株rhs内部元件缺失株以及回补株,并通过HeLa细胞黏附和侵袭试验、小鼠腹腔巨噬细胞吞噬后存活试验、小鼠致病力试验鉴定rhs内部元件缺失后对菌株黏附能力、侵袭能力和小鼠致病力的影响。旨在通过敲除鼠伤寒沙门菌CVCC541的2个rhs基因的内部元件rhs-1N、rhs-1core、rhs-1C、rhs-2core和rhs-2C构建相应缺失株及回补株,研究其对该菌侵袭宿主细胞能力的影响。结果表明,鼠伤寒沙门菌rhs基因内部元件的缺失均增强了其黏附侵袭和抗吞噬能力,但极显著降低了该菌的致病力。回补株对生长速率没有影响,其黏附侵袭能力与亲本株相比没有显著差异,抗吞噬能力与亲本株相比均有显著差异,对小鼠致病力与亲本株相比显著降低。 展开更多

关键词 鼠伤寒沙门菌 rhs基因元件 黏附侵袭 吞噬后存活 基因敲除

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金黄色葡萄球菌基因组岛对多重耐药表型与生物被膜能力的影响机制 被引量：1

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作者 邓阳 梁晏瑞 +3 位作者 苗健 李琳 李冰 徐振波 《现代食品科技》 EI CAS 北大核心 2015年第4期42-50,共9页

本文选择常见的典型食源性微生物金黄色葡萄球菌,从耐药性微生物感染防控角度出发,对广州地区临床分离的127株葡萄球菌的耐药表型、基因组岛分型与生物被膜生长能力进行研究。通过微量肉汤稀释法检测确定菌株对26种抗菌药物的药敏结果;... 本文选择常见的典型食源性微生物金黄色葡萄球菌,从耐药性微生物感染防控角度出发,对广州地区临床分离的127株葡萄球菌的耐药表型、基因组岛分型与生物被膜生长能力进行研究。通过微量肉汤稀释法检测确定菌株对26种抗菌药物的药敏结果;PCR扩增葡萄球菌属特异性基因16S r RNA、金黄色葡萄球菌菌株特异性基因fem A、耐药基因mec A以检测确定菌株耐药特性;多重PCR检测金葡菌基因组岛SCCmec基因元件中ccr复合物,mec复合物以对其进行分型。107株耐药型金葡菌均为多重耐药,且呈耐9种或以上抗生素占76.1%(86/113)。113株葡萄球菌SCCmec分型结果为:I型0株,II型12株,III型73株,IV型10株,V型11株,5株为无法分型;本文对基因组岛和金黄色葡萄球菌耐药表型与生物被膜能力的相关性进行分析与探讨,为进一步对各种食源性微生物引起的食品污染进行安全控制,提供了研究基础。 展开更多

关键词 金黄色葡萄球菌 多重耐药性 SCCmec基因元件 生物被膜 防控措施

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