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3D基因组结构调控蛋白质的相分离特征分析
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作者 邢佳庆 李腾 +1 位作者 李卫华 李亭亭 《军事医学》 CAS 2022年第3期161-166,共6页
目的系统分析相分离和3D基因组结构调控蛋白质之间的关系。方法通过预测所有氨基酸长度>100的人类蛋白质的内在固有无序序列(IDR),进行基于IDR比例的基因集富集分析(GESA),并筛选受相分离调控的3D基因组相关生物过程。结果总共19843... 目的系统分析相分离和3D基因组结构调控蛋白质之间的关系。方法通过预测所有氨基酸长度>100的人类蛋白质的内在固有无序序列(IDR),进行基于IDR比例的基因集富集分析(GESA),并筛选受相分离调控的3D基因组相关生物过程。结果总共19843个人类蛋白质中有3885个蛋白质富含IDR,其中1427个参与调控3D基因组结构。这些富含IDR并参与3D基因组组织结构的蛋白质具有氨基酸种类和模块结构域偏好性。研究开发Phasepro Shiny应用程序,能够分析和可视化蛋白质的相分离潜力。结论3D基因组结构相关的生物学过程中具有IDR的蛋白质高度富集,提示相分离在细胞核结构调节中的关键作用,为蛋白质相分离和3D基因组的研究提供了完整蓝图和候选蛋白质。 展开更多
关键词 3D基因组结构 相分离 固有无序序列 生物过程 Phasepro
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