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基于级联Vnet-S网络的CT影像单一器官自动分割算法 被引量:7
1
作者 徐宝泉 凌彤辉 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2019年第8期2420-2425,共6页
为了快速准确地对计算机断层扫描(CT)影像中的器官进行分割,提出基于级联Vnet-S网络的单一器官自动分割算法。首先,使用第一个Vnet-S网络对CT影像中的器官进行粗分割;然后,选择分割结果中的最大连接通量做两次膨胀,根据膨胀后的最大连... 为了快速准确地对计算机断层扫描(CT)影像中的器官进行分割,提出基于级联Vnet-S网络的单一器官自动分割算法。首先,使用第一个Vnet-S网络对CT影像中的器官进行粗分割;然后,选择分割结果中的最大连接通量做两次膨胀,根据膨胀后的最大连接通量确定器官边界并提取器官区域;最后,使用第二个Vnet-S网络对器官进行细分割。为了验证算法的性能,采用MICCAI 2017 Liver Tumor Segmentation Challenge(LiTS)数据集进行肝脏分割实验,采用ISBI LUng Nodule Analysis 2016(LUNA16)数据集进行肺分割实验。级联Vnet-S算法在LiTS的70例线上测试数据上的Dice系数为0.9600,在LUNA16的288例测试数据上的Dice系数为0.9810,均高于Vnet-S网络和Vnet网络。实验结果表明,基于级联Vnet-S网络的单一器官分割算法可以准确地对器官进行分割,而且级联Vnet-S算法的计算量小于Unet网络和Vnet网络。 展开更多
关键词 器官分割 Vnet-S 深度学习 分割网络 级联网络结构
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基于虚拟现实的腹部手术仿真系统研究 被引量:6
2
作者 李璧江 张学军 +3 位作者 韦涛 黄菊 韦依尼 孙映华 《医疗卫生装备》 CAS 2020年第8期19-24,44,共7页
目的:设计并实现一套基于虚拟现实的腹部手术仿真系统,探讨其在临床外科应用的可行性、使用者的评价以及相关临床影响。方法:以多时相增强CT影像作为原始数据,采用基于主观阈值和三维标签技术的半自动器官分割方法对腹部器官进行分割,通... 目的:设计并实现一套基于虚拟现实的腹部手术仿真系统,探讨其在临床外科应用的可行性、使用者的评价以及相关临床影响。方法:以多时相增强CT影像作为原始数据,采用基于主观阈值和三维标签技术的半自动器官分割方法对腹部器官进行分割,通过3D-Doctor图像处理工具进行三维模型重建,结合虚拟现实技术与力反馈设备构建腹部手术仿真系统,并通过主观和客观的多方面评价指标对系统性能进行综合度量。结果:构建的腹部手术仿真系统在执行虚拟手术时能够保持流畅运行,得到了外科医生的认可,符合临床应用的要求。结论:该系统保证可靠性的同时易于实现,对于临床治疗和手术训练有着积极的意义。 展开更多
关键词 虚拟现实 虚拟手术 器官分割 手术训练 腹部模型 触觉反馈
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基于多尺度三维卷积神经网络的头颈部危及器官分割方法 被引量:6
3
作者 慕光睿 杨燕平 +1 位作者 高耀宗 冯前进 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期491-498,共8页
目的研究一种基于三维卷积神经网络的CT图像头颈部危及器官分割算法。方法本文构建了一个基于V-Net模型的头颈部危及器官自动分割算法。为了增强分割模型的特征表达能力,将SE(Squeeze-and-Excitation)模块与V-Net模型中残差卷积模块相结... 目的研究一种基于三维卷积神经网络的CT图像头颈部危及器官分割算法。方法本文构建了一个基于V-Net模型的头颈部危及器官自动分割算法。为了增强分割模型的特征表达能力,将SE(Squeeze-and-Excitation)模块与V-Net模型中残差卷积模块相结合,提高与分割任务相关性更大的特征通道权重;采用多尺度策略,使用粗定位和精分割两个级联模型完成器官分割,其中输入图像在预处理时重采样为不同分辨率,使得模型分别专注于全局位置信息和局部细节特征的提取。结果我们在头颈部22个危及器官的分割实验表明,相比于已有方法,本文提出的方法分割平均精度提升了9%,同时平均测试时间从33.82 s降低至2.79 s。结论基于多尺度策略的三维卷积神经网络达到了更好的分割精度,且耗时极短,有望在临床应用中提高医生的工作效率。 展开更多
关键词 器官分割 卷积神经网络 多尺度 CT图像
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肾上腺形态影像学测量及其临床应用的研究进展
4
作者 唐皓 张志强 《中华解剖与临床杂志》 2024年第7期498-502,共5页
目的总结肾上腺形态影像学测量及其临床应用的研究进展。方法在中国知网、万方数据库、PubMed等数据库中,检索1999年1月—2023年12月有关肾上腺形态影像学测量和临床应用的相关文献。共检索2897篇文献,排除内容不相符、无法获取全文、... 目的总结肾上腺形态影像学测量及其临床应用的研究进展。方法在中国知网、万方数据库、PubMed等数据库中,检索1999年1月—2023年12月有关肾上腺形态影像学测量和临床应用的相关文献。共检索2897篇文献,排除内容不相符、无法获取全文、质量较低、证据等级不高、重复研究的文献,最终纳入文献39篇。从肾上腺形态影像学测量方法及指标、肾上腺形态学变化在疾病评估中的应用两个方面进行归纳和总结。结果作为人体内分泌器官,肾上腺在维持机体稳态、疾病相关应激反应中起着至关重要的作用。肾上腺形态学的变化能在一定程度上反映其功能状态,也是肾上腺疾病影像诊断的主要依据之一。对于肾上腺形态的影像学测量,以往临床实践及科学研究中多以视觉大体观察或半定量分析为主。计算机辅助影像测量尤其是人工智能在器官分割中的应用日渐成熟,该技术可提供丰富的形态学指标,这些指标与多种疾病相关,并可用于肾上腺形态学的定量描述和分析。结论肾上腺形态影像学测量方法逐渐自动化、测量指标多样化,可用于相关疾病的诊断、治疗策略制订与预后评估。 展开更多
关键词 肾上腺 形态学 人工智能 器官分割
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基于三维点云的大豆植株器官分割及表型分析
5
作者 肖奕同 刘帅 +3 位作者 侯晨连 刘琦 李富忠 张吴平 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期115-125,共11页
为了解决大豆等多分枝作物叶片成簇、叶片相互遮挡带来的高通量表型测量困难问题,提出了基于植株三维点云的器官分割及表型参数测量方法。以分枝期大豆植株为研究对象,采集植株多视角图像,利用三维重建技术得到植株稠密点云、过滤点云... 为了解决大豆等多分枝作物叶片成簇、叶片相互遮挡带来的高通量表型测量困难问题,提出了基于植株三维点云的器官分割及表型参数测量方法。以分枝期大豆植株为研究对象,采集植株多视角图像,利用三维重建技术得到植株稠密点云、过滤点云噪声并还原实际尺度;以法线微分差异算法、改进的区域生长算法以及点云曲率特征实现植株各器官的分割;最后采用有向包围盒、改进的三角剖分法以及最邻近算法提取植株叶面积、叶宽、叶长、叶倾角和茎粗等表型参数。试验结果表明,器官分割后冠层叶片点云平均分割率为84.24%,单叶点云分割率均高于95.29%,表型参数测量值与人工实测值具有较强相关性,叶面积、叶宽、叶长、叶倾角和茎粗测量值与人工实测值的决定系数分别为0.9879、0.9613、0.9626、0.9311和0.9634,均方根误差分别为0.5417 cm2、0.1412 cm、0.1755 cm、3.2796°和0.0475 cm。提出的方法对叶片相互粘连的植株具有较好的分割效果,为多分枝作物的器官分割及表型参数测量提供了有效的解决方案。 展开更多
关键词 三维点云 器官分割 叶片分割 表型参数测量
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基于人机协同的FU-Net网络的CT影像肝脏自动分割
6
作者 王佳琪 张广渊 李克峰 《现代信息科技》 2023年第6期54-56,60,共4页
现有的医学图像器官分割方法不能很好地依肝脏形状、位置及大小的变化而进行适当的分割,当肝脏形态变化明显时,不能准确地将肝脏分割出来。鉴于此,文章在传统U-Net网络中加入了全局注意力模块,通过通道注意力和自我注意力增强了对肝脏... 现有的医学图像器官分割方法不能很好地依肝脏形状、位置及大小的变化而进行适当的分割,当肝脏形态变化明显时,不能准确地将肝脏分割出来。鉴于此,文章在传统U-Net网络中加入了全局注意力模块,通过通道注意力和自我注意力增强了对肝脏的特征提取;并在自动分割的基础上进行了人机协同操作,对分割不好的部分增加数据量,有效提高了分割准确率。该模型在MIOU和MPA指标上分别达到了86.71%、92.58%。 展开更多
关键词 医学影像 人机协同 器官分割 U-Net网络
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磁感应治疗计划系统中组织器官分割方法的研究 被引量:2
7
作者 吴益 张荣华 +1 位作者 王亨 唐劲天 《生物医学工程研究》 2018年第2期173-176,181,共5页
磁感应热疗计划系统(MHTPS)需要向计划医生提供更加直观的三维病灶属性,以辅助制定最优适形热疗计划。传统方法需手动勾画所有包含目标的片层,而后进行三维重建,分割耗时巨大,无法满足临床实用性和高效性要求。本研究针对手动分割效率... 磁感应热疗计划系统(MHTPS)需要向计划医生提供更加直观的三维病灶属性,以辅助制定最优适形热疗计划。传统方法需手动勾画所有包含目标的片层,而后进行三维重建,分割耗时巨大,无法满足临床实用性和高效性要求。本研究针对手动分割效率较低的问题,探究了新的热疗计划系统中组织器官分割方法,引入并优化基于多方向片层的薄板样条最小能量半自动分割方法。实验结果表明该分割方法能够较好地描述人体组织器官和肿瘤的二维轮廓和三维模型,解决磁感应热疗计划系统中三维治疗靶区的适形确定问题,显著改善了传统手动分割方法的效率,可集成至计划系统使用,减轻医生和物理师负担。 展开更多
关键词 磁感应治疗 热疗计划系统 适形热疗 医学影像 器官分割 薄板样条 半自动分割
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基于V-Net的腹部多器官图像分割 被引量:1
8
作者 李庆勃 苏丹 《数字技术与应用》 2019年第1期89-89,91,共2页
基于深度学习的图像分割中,好的训练效果不仅仅是选择了合适的网络框架,损失函数的选择也同样重要。本文中我们实现一种全卷积神经网络的三维图像分割方法,该方法基于V-Net框架[1]。该网络是end-to-end的,的连接训练方案使用了PyTorch... 基于深度学习的图像分割中,好的训练效果不仅仅是选择了合适的网络框架,损失函数的选择也同样重要。本文中我们实现一种全卷积神经网络的三维图像分割方法,该方法基于V-Net框架[1]。该网络是end-to-end的,的连接训练方案使用了PyTorch进行了实现,作为医学图像分割的基本实现。 展开更多
关键词 3D V-Net Pytorch 器官分割 腹部
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基于移动立方体方法的脏内器官重建的研究 被引量:1
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作者 赵晓晴 刘景鑫 +2 位作者 王春月 张海涛 李慧盈 《中国医疗设备》 2018年第1期29-33,共5页
医学影像可视化的一个重要分支——三维重建技术在临床学领域一直发挥着重要的作用,同时也是计算机领域一直关注的热点问题。从三维图像入手,医生可以更加精准地判断患者病灶的形态、状况和位置等,从而提高诊断的准确性。本文针对CT图... 医学影像可视化的一个重要分支——三维重建技术在临床学领域一直发挥着重要的作用,同时也是计算机领域一直关注的热点问题。从三维图像入手,医生可以更加精准地判断患者病灶的形态、状况和位置等,从而提高诊断的准确性。本文针对CT图像的预处理和分割结果做进一步研究,在腹腔二维切片感兴趣器官分割的基础上,提出采用移动立方体方法完成腹部器官和脊椎的重建,可解决二维序列影像到三维立体模型的转换问题。最后本文用试验验证了该方法对腹腔内器官三维重建的有效性。 展开更多
关键词 腹部医学影像 三维重建 移动立方体方法 器官分割
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视觉显著性检测在医学图像分割中的应用
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作者 薛亮 姚光宇 《制造业自动化》 CSCD 北大核心 2021年第11期178-180,共3页
医学机器人精确导航定位的前提是器官的精确分割与识别,本文针对当前深度学习模型在器官分割识别方面需要大量人工标注的不足开展研究,提出了基于视觉显著性检测的医学图像分割模型。该模型首先利用视觉显著性检测算法对医学图像进行显... 医学机器人精确导航定位的前提是器官的精确分割与识别,本文针对当前深度学习模型在器官分割识别方面需要大量人工标注的不足开展研究,提出了基于视觉显著性检测的医学图像分割模型。该模型首先利用视觉显著性检测算法对医学图像进行显著性检测,然后将检测结果进行正负样本划分,最后将划分结果输入到分类器中对分类器进行训练。该模型克服了学习模型需要大量人工标注数据的问题,简化了模型训练的过程。 展开更多
关键词 显著性检测 医学图像 器官分割
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融合上下文和多尺度特征的胸部多器官分割 被引量:10
11
作者 吉淑滢 肖志勇 《中国图象图形学报》 CSCD 北大核心 2021年第9期2135-2145,共11页
目的肿瘤周围高危器官的准确分割是图像引导放射治疗中的关键步骤,也是对抗肺癌和食道癌,规划有效治疗策略的重要组成部分。为了解决不同患者之间器官形状和位置的复杂变化情况以及计算机断层扫描(computed tomography, CT)图像中相邻... 目的肿瘤周围高危器官的准确分割是图像引导放射治疗中的关键步骤,也是对抗肺癌和食道癌,规划有效治疗策略的重要组成部分。为了解决不同患者之间器官形状和位置的复杂变化情况以及计算机断层扫描(computed tomography, CT)图像中相邻器官之间软组织对比度低等问题,本文提出了一种深度学习算法对胸部CT图像中的高危器官进行细分。方法以U-Net神经网络结构为基础,将冠状面下的3个连续切片序列即2.5D(2.5 dimention)数据作为网络输入来获取切片联系,同时利用高效全局上下文实现不降维的跨通道交互、捕获单视图下切片序列间的长距离依赖关系、加强通道联系和融合空间全局上下文信息。在编码部分使用金字塔卷积和密集连接的集成提取多尺度信息,扩大卷积层的感受野,并将解码器与编码器每层进行连接来充分利用多尺度特征,增强特征图的辨识度。考虑到CT图像中多器官形状不规则且紧密相连问题,加入深度监督来学习不同层的特征表示,从而精准定位器官和细化器官边界。结果在ISBI(International Symposium on Biomedical Imaging)2019 Seg THOR(segmentation of thoracic organs at risk in CT images)挑战赛中,对40个胸部多器官训练样本进行分割,以Dice系数和HD(Hausdorff distance)距离作为主要评判标准,该方法在测试样本中食道、心脏、气管和主动脉的Dice系数分别达到0.855 1、0.945 7、0.923 0和0.938 3,HD距离分别为0.302 3、0.180 5、0.212 2和0.191 8。结论融合全局上下文和多尺度特征的算法在胸部多器官分割效果上更具竞争力,有助于临床医师实现高效的诊断与治疗。 展开更多
关键词 器官分割 伪三维 高效全局上下文 金字塔卷积 多尺度特征
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采用多尺度视觉注意力分割腹部CT和心脏MR图像 被引量:2
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作者 蒋婷 李晓宁 《中国图象图形学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期268-279,共12页
目的医学图像分割是计算机辅助诊断和手术规划的重要步骤,但是由于人体器官结构复杂、组织边缘模糊等问题,其分割效果还有待提高。由于视觉Transformer(vision Transformer,ViT)在计算机视觉领域取得了成功,受到医学图像分割研究者的青... 目的医学图像分割是计算机辅助诊断和手术规划的重要步骤,但是由于人体器官结构复杂、组织边缘模糊等问题,其分割效果还有待提高。由于视觉Transformer(vision Transformer,ViT)在计算机视觉领域取得了成功,受到医学图像分割研究者的青睐。但是基于ViT的医学图像分割网络,将图像特征展平成一维序列,忽视了图像的二维结构,且ViT所需的计算开销相当大。方法针对上述问题,提出了以多尺度视觉注意力(multi scale visual attention,MSVA)为基础、Transformer作为主干网络的U型网络结构MSVA-TransUNet。其采用的多尺度视觉注意力是一种由多个条状卷积实现的注意力机制,采用一个条状卷积对近似一个大核卷积的操作,采用不同的条状卷积对近似不同的大核卷积,从不同的尺度获取图像的信息。结果在腹部多器官分割和心脏分割数据集上的实验结果表明:本文网络与基线模型相比,平均Dice分别提高了3.74%和1.58%,其浮点数运算量是多头注意力机制的1/278,网络参数量为15.31 M,是TransUNet的1/6.88。结论本文网络媲美当前较先进的网络TransUNet和SwinUNet,采用多尺度视觉注意力代替多头注意力,在减少计算开销的同时在分割性能上同样具有优势。本文代码开源地址:https://github.com/BeautySilly/VA-TransUNet。 展开更多
关键词 医学图像分割 视觉注意力 TRANSFORMER 注意力机制 腹部多器官分割 心脏分割
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用于腹部CT肝脏肿瘤分割的注意力引导模型
13
作者 于凌涛 熊涛 +2 位作者 王鹏程 马英博 夏勇强 《哈尔滨工程大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1400-1405,共6页
针对肝脏肿瘤在腹部CT影像中占比低,人为分割与传统分割效果、性能差的问题,本文提出一种高效的两阶段注意力引导的肝脏肿瘤分割模型,该模型由肝脏器官分割模块和肝脏肿瘤分割模块构成。肝脏器官分割模块中凭借卷积神经网络得到肝脏器... 针对肝脏肿瘤在腹部CT影像中占比低,人为分割与传统分割效果、性能差的问题,本文提出一种高效的两阶段注意力引导的肝脏肿瘤分割模型,该模型由肝脏器官分割模块和肝脏肿瘤分割模块构成。肝脏器官分割模块中凭借卷积神经网络得到肝脏器官分割图像作为输出,和原始CT影像叠加得到新的输入影像,最后将新输入图像导入肝脏肿瘤分割模块得到精确的肝脏肿瘤分割影像,给出了每个模块的损失函数以监督训练。利用肝脏肿瘤分割挑战提供的数据集进行了实验研究和定性比较分析。结果在Dice系数等指标上优于其他模型,提高了肝脏肿瘤分割准确率和肝脏肿瘤区域定位准确率,从而使分割出的肝脏肿瘤更接近真实边界。 展开更多
关键词 腹部器官分割 医学图像处理 腹部CT 肝脏分割 肝脏肿瘤分割 深度学习 注意力引导 损失函数
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基于MAU-Net的CT多器官分割
14
作者 步洪禧 何利文 《计算机系统应用》 2024年第3期103-110,共8页
基于计算机断层扫描(CT)图像的多器官精准分割能够准确诊断病灶,快速制定治疗计划,提高临床工作的效率.传统分割算法针对形变大、体积较小且边缘模糊的器官分割效果相对较差.本文提出了一种改进的U-Net的医学图像分割网络(MAU-Net),通... 基于计算机断层扫描(CT)图像的多器官精准分割能够准确诊断病灶,快速制定治疗计划,提高临床工作的效率.传统分割算法针对形变大、体积较小且边缘模糊的器官分割效果相对较差.本文提出了一种改进的U-Net的医学图像分割网络(MAU-Net),通过引入两个模块,旨在实现对多器官的精准分割.多尺度空洞卷积模块通过不同内核大小实现捕捉目标器官多尺度特征.动态注意力模块精确提取重要特征实现分支间的权重平衡.通过消融实验和其他主流网络的对比实验,验证了MAU-Net的优越性.相比于传统的U-Net模型,MAU-Net在所有器官上平均Dice相关系数(DSC)提高了3.39%,平均95%豪斯多夫距离(HD)降低了4.84 mm.MAU-Net在多器官分割任务中展现了出色的鲁棒性和应用潜力,有助于提高临床工作效率和医疗诊断的准确性. 展开更多
关键词 深度学习 器官分割 U-Net 注意力机制 多尺度空洞卷积 CT图像 图像分割
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基于三维点云的植物多任务分割网络 被引量:2
15
作者 曾安 罗琳 +4 位作者 潘丹 冼志恒 江旭 冼钰伦 刘立程 《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第12期132-140,共9页
在植物表型研究中,植物器官分割是实现无损、高通量、自动化表型测量的重要步骤。然而,现有植物器官分割方法通常需要凭借经验设置合理的阈值参数,且很少同时执行语义分割和实例分割。该研究提出了一个基于三维点云的植物多任务分割网络... 在植物表型研究中,植物器官分割是实现无损、高通量、自动化表型测量的重要步骤。然而,现有植物器官分割方法通常需要凭借经验设置合理的阈值参数,且很少同时执行语义分割和实例分割。该研究提出了一个基于三维点云的植物多任务分割网络(a multi-task segmentation network for plant on 3D point cloud,MT-SegNet),结合多值条件随机场(multi-value conditional random field,MV-CRF)模型,同时实现茎、叶语义分割和叶实例分割。在MT-SegNet中,为解决用最大池化或平均池化方法来聚合邻域点特征可能会导致重要信息丢失的问题,该研究提出了一种基于注意力机制的多头注意力池化模块。它能自动学习到重要的邻域点特征,从而有利于提高网络的分割性能。同时,MT-SegNet分成两个不同的分支,分别用于预测点的语义类别和将这些点嵌入到高维向量,以便将这些点聚类为实例。最后,使用MV-CRF进行多任务的联合优化。在彩叶芋点云数据集上的试验结果表明,该方法的茎、叶语义分割的交并比、准确率、召回率和F1分数的平均值分别为84.54%、93.64%、91.39%、92.48%,叶实例分割的平均准确率、平均召回率、平均实例覆盖率和平均加权实例覆盖率分别为88.10%、78.44%、76.24%、76.93%,均优于PointNet、JSNet等现有的深度学习网络。该模型也适用于类似植物的点云分割类任务。这有助于为植物自动化表型测量提供必要的技术条件。 展开更多
关键词 深度学习 三维点云 注意力机制 植物器官分割
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基于三维点云的植株联合任务分割框架
16
作者 汤继锐 潘丹 +3 位作者 刘立程 彭鸿 刘柏菁 王家豪 《国外电子测量技术》 2024年第3期83-90,共8页
传统的植株器官分割方法依赖经验选择阈值参数,而当前的深度学习浅层框架可能会导致植株重要的几何特征丢失,并难以有效整合植株的局部和全局特征。因此,提出了一个基于三维点云的植株器官分割网络(local global feature fusion segment... 传统的植株器官分割方法依赖经验选择阈值参数,而当前的深度学习浅层框架可能会导致植株重要的几何特征丢失,并难以有效整合植株的局部和全局特征。因此,提出了一个基于三维点云的植株器官分割网络(local global feature fusion segmentation network,LGF-SegNet)模型,通过引入双权重注意力机制模块和位置编码,更适合在植株点云数据中表达几何特征。在提出的框架的解码层引入特征聚合模块,融合植株点云的局部和全局特征,使得该框架能够关注植株的整体特征轮廓同时保留细节植物纹理(如茎和叶)。实验结果表明,提出的架构在语义分割的交并比、精确率和F1分数的平均值分别达到85.76%、93.18%、91.08%,在实例分割的平均精确率、平均实例覆盖率以及平均实例加权覆盖率达到85.27%、78.46%、79.63%,优于当前流行的植株点云分割任务中使用的深度学习网络架构,并适用于植株语义分割和实例分割的双重任务。这为后续的植株生长预测等研究奠定基础。 展开更多
关键词 深度学习 三维点云 植株器官分割 特征融合 注意力机制
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结合局部全局特征与多尺度交互的三维多器官分割网络
17
作者 柴静雯 李安康 +3 位作者 张浩 马泳 梅晓光 马佳义 《中国图象图形学报》 CSCD 北大核心 2024年第3期655-669,共15页
目的 高度适形放射治疗是常用的癌症治疗方法,该方法的有效性依赖于对癌组织和周边多个危及器官(organ at risk,OAR)解剖结构的精确刻画,因此研究三维图像多器官的高精度自动分割具有重要意义。以视觉Transformer(vision Transformer,V... 目的 高度适形放射治疗是常用的癌症治疗方法,该方法的有效性依赖于对癌组织和周边多个危及器官(organ at risk,OAR)解剖结构的精确刻画,因此研究三维图像多器官的高精度自动分割具有重要意义。以视觉Transformer(vision Transformer,ViT)和卷积神经网络(convolutional neural network,CNN)结合为代表的三维医学图像分割方法表现出了丰富的应用优势。然而,这类方法往往忽略同一尺度内和不同尺度间的信息交互,使得CNN和ViT特征的提取和融合受限。本文提出一种端到端多器官分割网络LoGoFUNet(local-global-features fusion UNet),旨在应对现有方法的缺陷。方法 首先,针对单一器官分割,提出在同一尺度下并行提取并融合CNN和ViT特征的LoGoF(local-global-features fusion)编码器,并构建了一个端到端的三维医学图像分割多尺度网络M0。此外,考虑到器官内部以及器官之间的相互关系,该方法在M0网络的基础上设计并引入了多尺度交互(multi-scale interaction,MSI)模块和注意力指导(attention guidance,AG)结构,最终形成了LoGoFUNet。结果 在Synapse数据集和SegTHOR(segmentation of thoracic organs at risk)数据集上,本文方法相比于表现第2的模型,DSC(Dice similarity cofficient)指标分别提高了2.94%和4.93%,而HD95(Hausdorff distance_95)指标则分别降低了8.55和2.45,切实提升了多器官分割任务的性能表现。在ACDC(automatic cardiac diagnosis challenge)数据集上,3D分割方法的适用性大多较差,但LoGoFUNet依然得到了比2D先进方法更好的结果,说明其对数据集的适应能力更强。结论 该方法的分割模型综合尺度内和尺度间的信息交互,具有更好的分割结果,且在数据集上的泛化性更好。 展开更多
关键词 器官分割 深度神经网络(DNN) 视觉Transformer(ViT) 局部全局特征 多尺度交互(MSI)
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用于多器官分割的多尺度聚合网络研究
18
作者 高学敏 杜晓刚 +2 位作者 张学军 王营博 雷涛 《陕西科技大学学报》 北大核心 2024年第2期189-197,共9页
多器官分割在病理分析、手术方案制定以及临床诊断上都具有重要的应用价值.但是,一些器官形变较大、尺寸较小且组织边缘模糊,导致分割效果较差.为了解决该问题,提出了一种用于多器官分割的多尺度聚合网络(MSANet).MSANet有两个优势:首先... 多器官分割在病理分析、手术方案制定以及临床诊断上都具有重要的应用价值.但是,一些器官形变较大、尺寸较小且组织边缘模糊,导致分割效果较差.为了解决该问题,提出了一种用于多器官分割的多尺度聚合网络(MSANet).MSANet有两个优势:首先,设计了多尺度边界提取模块,使用多尺度卷积核提取多个特征图,将不同尺度的特征图互相结合,从而聚合全局上下文信息,并提取不同器官的边界和细节信息;其次,设计了聚焦式注意力模块,通过学习的注意力权重来调节特征图的重要性,从而聚焦感兴趣的多器官区域并捕捉不同器官的关键特征,进一步提高分割性能.在两个公开数据集CHAOS和MS-CMRSeg上进行了大量实验.实验结果表明:MSANet在两个数据集上的分割效果均优于当前主流的多器官分割方法,显著提高了多器官分割精度. 展开更多
关键词 器官分割 多尺度聚合网络 上下文信息 注意力机制
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多期相CT合成辅助的腹部多器官图像分割
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作者 黄品瑜 钟丽明 +4 位作者 郑楷宜 陈泽立 肖若琳 全显跃 阳维 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期83-92,共10页
目的提出并探讨使用多期相CT合成辅助腹部多器官分割方法。方法提出多期相CT合成辅助腹部多器官分割,多期相CT能够充分提供同一器官不同的图像细节,从而为分割模型提供充分的全面的语义信息,提升腹部多个器官分割的性能。提出基于多头... 目的提出并探讨使用多期相CT合成辅助腹部多器官分割方法。方法提出多期相CT合成辅助腹部多器官分割,多期相CT能够充分提供同一器官不同的图像细节,从而为分割模型提供充分的全面的语义信息,提升腹部多个器官分割的性能。提出基于多头自注意力感知的多期相CT合成方法,引入基于多头自注意力机制的Transformer模块,提升合成网络捕捉长距离语义信息的能力,扩大网络的感受野,并且引入感知损失,在特征层面对合成图像与真实图像特征之间的差异最小化,与Transformer模块有协同作用,从而合成出更清晰、更高质量的多期相CT图像。结果使用南方医院的多期相CT数据集训练模型。其中用526例多期相CT训练合成模型,利用动脉期增强动脉CT(A.CECT)合成出平扫CT(NECT)、静脉期CECT(V.CECT)、延迟期CECT(D.CECT)的平均最大化绝对误差(MAE)分别为19.192±3.381、20.140±2.676、22.538±2.874,结合统计学对比,本文方法优于对比的其他图像合成方法(P<0.05)。多期相CT合成辅助的腹部多器官分割方法验证在内部验证集上进行验证平均Dice系数(DSC)为0.847,在外部验证集上进行验证平均DSC为0.823。结论本文方法能够合成出高质量的多期相CT图像以有效缓解不同期相CT之间存在的配准无法解决的误差问题,同时提高腹部13器官的分割性能,具有良好的泛化性能。 展开更多
关键词 腹部多器官分割 多期相CT合成 对抗生成网络 TRANSFORMER
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基于深度学习的腹部多器官图像分割 被引量:5
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作者 谢飞 权媚阳 +1 位作者 管子玉 段群 《西北大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期1-7,共7页
CT扫描是临床上腹部相关疾病诊断的常规检查方式,通过CT,医生能对腹部的器官结构和组织病变结构产生更加直观的观察,从而提高了疾病诊断的准确性,因此,精准地对CT图片进行图像分割有着非常重要的临床价值。传统的分割算法针对腹部形变... CT扫描是临床上腹部相关疾病诊断的常规检查方式,通过CT,医生能对腹部的器官结构和组织病变结构产生更加直观的观察,从而提高了疾病诊断的准确性,因此,精准地对CT图片进行图像分割有着非常重要的临床价值。传统的分割算法针对腹部形变较大、体积较小且组织边缘模糊的器官分割效果相对较差。为此,该文提出了基于改进nnUNet腹部多器官图像分割方法,在腹部CT图像上分割肝脏、胃、肠道和胰腺4个器官。该文利用自适应权重的损失函数对nnUNet网络进行改进,使得网络在分割过程中更加关注体积较小且样本数量相对较少的器官特征。实验表明,该文提出方法相对于现有传统的分割方法具有更高的准确性和敏感性。 展开更多
关键词 腹部多器官分割 nnUNet 自适应权重损失函数 语义分割
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