荔枝蒂蛀虫转录组及嗅觉相关基因分析 被引量：23

1

作者 孟翔 胡俊杰 +2 位作者 刘慧 欧阳革成 郭明昉 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期823-830,共8页

【目的】荔枝蒂蛀虫Conopomorpha sinensis Bradley是专一性危害我国华南地区荔枝和龙眼的重要害虫,隐蔽性强,防治困难,基因组信息缺乏。本研究的目的是获得荔枝蒂蛀虫的基因数据,寻求有效控制害虫的分子靶标。【方法】采用新一代高通... 【目的】荔枝蒂蛀虫Conopomorpha sinensis Bradley是专一性危害我国华南地区荔枝和龙眼的重要害虫,隐蔽性强,防治困难,基因组信息缺乏。本研究的目的是获得荔枝蒂蛀虫的基因数据,寻求有效控制害虫的分子靶标。【方法】采用新一代高通量测序技术Illumina Hi SeqTM4000对荔枝蒂蛀虫进行转录组测序和生物信息学分析。【结果】经序列拼接获得68 996条unigenes。进一步利用七大公共数据库进行同源比对,注释了22 348 unigenes。注释到Nr数据库的unigenes数量最多,达27.01%,其中Nr注释的荔枝蒂蛀虫unigenes中与小菜蛾Plutella xylostella unigenes同源性最高,达34.1%。将unigenes与GO数据库比对发现,15 585条unigenes根据其功能大致可分为3类47亚类。KEGG pathways分析表明,7 272条unigenes定位为267个代谢通路。基因注释进一步筛选鉴定获得100个荔枝蒂蛀虫嗅觉相关基因;与鳞翅目相关气味结合蛋白基因联合分析发现,与荔枝蒂蛀虫气味结合蛋白基因直系同源的有18组,部分基因形成独立一簇。【结论】本研究首次获得了荔枝蒂蛀虫的转录组数据,研究结果为生物控制荔枝蒂蛀虫提供了重要的基础数据和候选分子靶标。荔枝蒂蛀虫独有的气味结合蛋白基因可能与其生境中特有的化学物质相关。 展开更多

关键词 荔枝蒂蛀虫 转录组 高通量测序 基因注释 嗅觉基因

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梨网蝽触角嗅觉相关基因分析 被引量：7

2

作者 王宏民 董田 +3 位作者 郑海霞 白鹏华 刘宝生 张仙红 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期367-375,共9页

为阐明梨网蝽Stephanitis nashi对其寄主植物的化学感受机制,本研究采用高通量测序平台对梨网蝽成虫触角进行转录组测序,基于7大数据库对转录组数据进行基因功能注释,筛选获得梨网蝽的主要嗅觉相关基因并进行生物信息学和系统进化树分... 为阐明梨网蝽Stephanitis nashi对其寄主植物的化学感受机制,本研究采用高通量测序平台对梨网蝽成虫触角进行转录组测序,基于7大数据库对转录组数据进行基因功能注释,筛选获得梨网蝽的主要嗅觉相关基因并进行生物信息学和系统进化树分析。结果表明:共获得28017条unigenes,长度在1000 bp以上的unigenes有9921条;通过与7大数据库进行BLAST比对,梨网蝽触角转录组数据中的17891条unigenes被成功注释;在已成功注释的unigenes中,鉴定得到12个OBP基因和17个CSP基因,其中OBP基因所编码的蛋白有6个属于Classic家族;而CSP基因所编码的蛋白全部具有4个保守的半胱氨酸位点,符合昆虫CSP基因的结构特征。进化分析结果显示,梨网蝽6个OBP基因的氨基酸序列与其他昆虫OBP基因的氨基酸序列聚为3个分支;梨网蝽16个CSP基因与其他昆虫CSP基因的进化树也聚为3个分支。 展开更多

关键词 梨网蝽 触角转录组 高通量测序 嗅觉基因 基因注释

原文传递

桃蛀果蛾雌雄虫不同发育时期嗅觉基因的表达水平差异

3

作者 张倩 门丽娜 +6 位作者 李一然 刘巧 Angie DENG 胡晓雯 张宇宏 张志伟 张伟 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期151-162,共12页

桃蛀果蛾是严重隐蔽危害的蛀果害虫,亟待开发环境友好型防治方法,昆虫行为调控技术被认为是新型绿色的害虫防控手段,明晰嗅觉识别机制是开发行为调控剂的基础。基于桃蛀果蛾触角转录组得到242个嗅觉基因,基于序列比对和近缘物种相似基... 桃蛀果蛾是严重隐蔽危害的蛀果害虫,亟待开发环境友好型防治方法,昆虫行为调控技术被认为是新型绿色的害虫防控手段,明晰嗅觉识别机制是开发行为调控剂的基础。基于桃蛀果蛾触角转录组得到242个嗅觉基因,基于序列比对和近缘物种相似基因的功能背景,选取了13个嗅觉基因,采用RT-qPCR进一步分析其潜在识别功能。结果表明,13个嗅觉基因中有6个基因在雌雄虫不同发育时期的表达水平存在显著差异(P<0.05),推测这6个基因与成虫期嗅觉识别行为相关;根据雌雄成虫初羽化、成熟未交尾和交尾后基因表达水平的差异推测,OBP11可能在识别性信息素和交配行为中发挥重要作用,OR45可能与雌虫识别寄主植物和产卵过程相关,IR5可能与交配和产卵行为相关。以上研究结果为解析桃蛀果蛾嗅觉识别机制奠定了基础,同时也为开发新型昆虫行为调控剂、构建环境友好的害虫治理策略提供了思路。 展开更多

关键词 桃蛀果蛾 转录组 嗅觉基因 触角 RT-QPCR

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南亚实蝇转录组及嗅觉相关基因的初步分析 被引量：5

4

作者 杜迎刚 季清娥 赖钟雄 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2019年第9期1796-1803,共8页

南亚实蝇Bactrocera tau(Walker),是葫芦科、茄科蔬菜和多种热带、亚热带果树上的主要害虫,抗逆性强,繁殖速度快,防治难度大。为挖掘可用于生物防治的分子靶标和探讨副信息素类引诱剂对其作用的分子基础,本研究采用Illumina HiSeq2500 P... 南亚实蝇Bactrocera tau(Walker),是葫芦科、茄科蔬菜和多种热带、亚热带果树上的主要害虫,抗逆性强,繁殖速度快,防治难度大。为挖掘可用于生物防治的分子靶标和探讨副信息素类引诱剂对其作用的分子基础,本研究采用Illumina HiSeq2500 PE125 bp测序技术对其混合样进行转录组测序和生物信息学分析。经序列拼接获得36109条Unigenes,进一步与七大公共数据库进行同源比对,注释了21127条Unigenes,其中在Nr数据库中注释成功的Unigenes数目最多,20948条。Nr数据库注释的南亚实蝇B.tau Unigenes与地中海实蝇Ceratitis capitata同源性最高,达59.80%;与模式昆虫黑腹果蝇Drosophila melanogaster的同源性次之,达14.86%。将Unigenes与GO数据库比对发现,14029条Unigenes根据功能分为了3个大类57个亚类;而与KOG数据库比对结果为,13479个Unigenes基因其功能属于25个类别;进一步KEGG数据库代谢分析表明,6442条Unigenes参与了5大类共152个代谢通路。基因注释进一步筛选鉴定获得了嗅觉相关基因528个,对其中气味结合蛋白基因氨基酸序列的分析表明,其大多为具有6个保守的半胱氨酸位点的典型气味结合蛋白,且与黑腹果蝇D.melanogaster、地中海实蝇C.Capicata、瓜实蝇B.cucuribitae、橘小实蝇B.dorsalis的气味结合蛋白基因具有很高的同源性。这为南亚实蝇对副信息素类引诱剂反应的相关功能基因的挖掘及从嗅觉上寻求科学的防治措施提供了基础数据。 展开更多

关键词 南亚实蝇 转录组分析 高通量测序 基因注释 嗅觉基因

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昆虫性信息素结合蛋白功能研究进展 被引量：5

5

作者 田志强 孙丽娜 +5 位作者 李艳艳 张怀江 闫文涛 岳强 全林发 仇贵生 《农学学报》 2017年第9期14-20,共7页

嗅觉系统在昆虫的生命活动中具有重要的功能作用。通过嗅觉蛋白来识别环境中以及种内所释放的化学信号物质,进而指导昆虫完成求偶,躲避天敌等生命活动。近些年来,随着转录组测序技术的日益发展,许多昆虫的嗅觉家族相关基因已被鉴定。而... 嗅觉系统在昆虫的生命活动中具有重要的功能作用。通过嗅觉蛋白来识别环境中以及种内所释放的化学信号物质,进而指导昆虫完成求偶,躲避天敌等生命活动。近些年来,随着转录组测序技术的日益发展,许多昆虫的嗅觉家族相关基因已被鉴定。而性信息素结合蛋白(pheromone binding protein,PBPs)因其功能的特殊性与重要性,一直以来备受研究者的关注。目前,丰富的科学手段,例如电压钳,RNAi,EAG等已为嗅觉蛋白功能做出了不同的阐述,并有一些新的发现,但目前尚存在一些问题亟待解决。笔者根据国内外近些年的研究进展,从昆虫性信息素结合蛋白的理化性质、不同组织表达模式及其与其他嗅觉相关蛋白之间的关系等方面进行了综述。 展开更多

关键词 性信息素结合蛋白 触角 昆虫 嗅觉基因 功能

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寄生蜂外周嗅觉识别系统的研究进展

6

作者 任炳忠 纪若冰 陈琪 《吉林农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期253-263,共11页

嗅觉通讯是寄生蜂与外界进行信息交流的主要方式之一,在寄生蜂搜寻寄主、交配、选择产卵场所等过程中均发挥重要作用。文章简要概述了寄生蜂外周嗅觉识别系统相关嗅觉基因的研究进展,并探讨其研究意义与应用前景,通过对寄生蜂嗅觉基因... 嗅觉通讯是寄生蜂与外界进行信息交流的主要方式之一,在寄生蜂搜寻寄主、交配、选择产卵场所等过程中均发挥重要作用。文章简要概述了寄生蜂外周嗅觉识别系统相关嗅觉基因的研究进展,并探讨其研究意义与应用前景,通过对寄生蜂嗅觉基因展开研究,有助于阐明寄生蜂识别、接收和转换外界化学信号的分子机制,为农林业害虫的绿色防控提供理论指导,对于现代生物防治的发展具有重要意义。 展开更多

关键词 寄生蜂 外周嗅觉识别系统 嗅觉基因 生物防治

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草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫的转录组比较分析 被引量：3

7

作者 廖永林 李燕芳 +5 位作者 杨斌 赵华 高燕 陈伟平 蔡时可 王继华 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期523-532,共10页

【目的】草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda是一种新近入侵我国的重要害虫。本研究旨在对草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫两个不同发育阶段的转录组进行比较分析。【方法】利用高通量测序技术对草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫进行转录组测序... 【目的】草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda是一种新近入侵我国的重要害虫。本研究旨在对草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫两个不同发育阶段的转录组进行比较分析。【方法】利用高通量测序技术对草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫进行转录组测序和数据组装,并对转录组数据进行功能注释和比较分析。【结果】经de novo组装共获得209002条转录本,平均长度为687.55 bp,N50为982 bp。共有46198条(57.43%)unigene在至少一个数据库中获得功能注释,其中1713条(2.13%)unigene在所有数据库中均能获得注释。在GO数据库中获得205269条unigene的注释,主要包括68个功能分类;在KEGG数据库中共有3408条unigene得到注释,涉及277个代谢通路。共鉴定到424个嗅觉相关的基因,并且在雄性成虫和5龄幼虫之间的表达存在差异。通过比较转录组分析,在雄性成虫中鉴定到9162个上调和6399个下调差异表达基因(DEGs);功能富集分析发现在上调DEGs中涉及信息素以及信号转导的代谢通路显著富集,而下调DEGs中涉及解毒相关的通路显著富集。【结论】这些转录组数据为探究草地贪夜蛾的生长发育、嗅觉相关功能基因以及候选分子靶标提供资源信息。 展开更多

关键词 草地贪夜蛾 发育阶段 嗅觉基因 转录组 基因注释 生物信息学

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青杨天牛嗅觉相关基因的鉴定及表达谱分析 被引量：2

8

作者 张健 谢婉莹 +1 位作者 董曼羽 付立波 《江苏农业科学》 北大核心 2022年第4期23-28,共6页

为探讨青杨天牛嗅觉基因的种类,以期为采用RNA干涉技术调控青杨天牛种群提供理论依据,采用Illumina HiSeq^(TM)2500测序平台对青杨天牛的触角进行转录组测序,利用BLAST同源搜索的方法鉴定嗅觉相关的基因,采用RT-PCR技术研究嗅觉相关基... 为探讨青杨天牛嗅觉基因的种类,以期为采用RNA干涉技术调控青杨天牛种群提供理论依据,采用Illumina HiSeq^(TM)2500测序平台对青杨天牛的触角进行转录组测序,利用BLAST同源搜索的方法鉴定嗅觉相关的基因,采用RT-PCR技术研究嗅觉相关基因的表达谱。共鉴定出青杨天牛嗅觉基因包括:43个气味结合蛋白(OBP)、15个化学感受蛋白(CSP)、56个嗅觉受体(OR)和24个离子受体(IR)。反转录PCR(RT-PCR)结果表明,青杨天牛的嗅觉基因存在性别及组织器官间的特异性。 展开更多

关键词 青杨天牛 嗅觉基因 表达分析

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淡色库蚊与骚扰库蚊触角嗅觉基因表达分析 被引量：3

9

作者 周洁 李春晓 +4 位作者 兰策介 高剑 刘钦梅 孙爱娟 赵彤言 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期453-457,共5页

目的了解淡色库蚊与骚扰库蚊触角中差异性表达的嗅觉基因,为揭示二者遗传分化特征提供参考依据。方法分别设置淡色库蚊吸血前、后,骚扰库蚊吸血前、后等4个实验组。每组共设4个生物学重复样品,每个样品取20只蚊虫触角。采用TRIzol法提... 目的了解淡色库蚊与骚扰库蚊触角中差异性表达的嗅觉基因,为揭示二者遗传分化特征提供参考依据。方法分别设置淡色库蚊吸血前、后,骚扰库蚊吸血前、后等4个实验组。每组共设4个生物学重复样品,每个样品取20只蚊虫触角。采用TRIzol法提取各组样品总RNA,采用NEBNext Ultra^TMRNA■文库构建试剂盒构建文库。对转录组基因进行测序,通过FPKM值差异性分析,筛选淡色库蚊与骚扰库蚊分别在吸血前、后表达差异显著的嗅觉基因,并进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证。结果淡色库蚊吸血前、后触角转录组共注释了50个气味结合蛋白(OBP)和31个气味受体(OR)基因,骚扰库蚊吸血前、后触角转录组共注释T36个OBP和12个OR。淡色库蚊吸血后较吸血前显著上调的OBP有4个,无显著下调的OBP。骚扰库蚊吸血后较吸血前显著上调和下调的OBP分别有3个。淡色库蚊吸血后较吸血前无显著上调的OR,显著下调的OR有3个。骚扰库蚊吸血后较吸血前无显著上调的OR,显著下调的OR有1个。qRT-PCR验证结果显示,淡色库蚊吸血后OBP17显著上调;骚扰库蚊吸血后OBP31、OBP44表达量显著上调,其中OBP44与测序结果一致,OBP31与测序结果相反。吸血前,骚扰库蚊0BP17显著高于淡色库蚊;吸血后,骚扰库蚊0BP31、OBP44显著高于淡色库蚊,OBP99a显著低于淡色库蚊。骚扰库蚊吸血后0R31、OR65、CPIJ001069表达量均显著上调,其中OR65和CPU001069表达量显著高于淡色库蚊(P<0.05)。淡色库蚊吸血后无显著变化的OR基因。结论淡色库蚊与骚扰库蚊的嗅觉基因OBP和OR表现出了进化分化,OBP17、0BP44可能参与调控骚扰库蚊吸血后行为。0R31、OR65、CPIJ001069可能参与调控骚扰库蚊吸血后行为。 展开更多

关键词 淡色库蚊 骚扰库蚊 高通量分析技术 嗅觉基因

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米蛾嗅觉基因的转录组分析 被引量：1

10

作者 李鹏燕 张秋婷 +3 位作者 黄铮昱 黄华 陈伟平 廖永林 《应用昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1347-1355,共9页

【目的】建立米蛾Corcyra cephalonica成虫转录组数据库,获得米蛾的嗅觉基因信息。【方法】采用高通量测序平台(Illumina Hiseq)对米蛾进行转录组测序,用Trinity软件对原始数据进行组装分析,在7个数据库中用Blast软件对unigene进行注释,... 【目的】建立米蛾Corcyra cephalonica成虫转录组数据库,获得米蛾的嗅觉基因信息。【方法】采用高通量测序平台(Illumina Hiseq)对米蛾进行转录组测序,用Trinity软件对原始数据进行组装分析,在7个数据库中用Blast软件对unigene进行注释,用PCR方法检测米蛾信息素结合蛋白基因(Pheromone bindingprotein,PBPs)和普通气味结合蛋白基因(General odorant bindingprotein,GOBPs)在成虫不同组织中的表达情况。【结果】最终获得58 534条unigene,其中25 879条得到注释;N50为2 212 bp,平均长度1 251 bp;与脐橙螟Amyelois transitella相似度最高(28.2%);发掘了20个气味结合蛋白(Odorant binding proteins, OBPs),18个化学感受蛋白(Chemosensory proteins, CSPs),2个GOBPs和3个PBPs,均已上传NCBI。组织表达分析发现PBPs和GOBPs基因都在米蛾成虫触角上大量表达,在头、胸、腹、足、翅中少量表达,PBP3在成虫胸部组织中无表达,GOBP2仅在成虫触角上大量表达,在其他组织中无表达。【结论】研究结果丰富和完善了米蛾的嗅觉基因信息,为米蛾的嗅觉识别机制研究和诱剂研发奠定了分子基础。 展开更多

关键词 米蛾 转录组测序 嗅觉基因 代谢通路 功能注释

原文传递

抗生素对马铃薯甲虫嗅觉基因的影响

11

作者 于昕 王玉晗 +4 位作者 薛腾 李红卫 郑超 石旺鹏 于艳雪 《黑龙江农业科学》 2021年第4期49-54,共6页

为促进马铃薯甲虫嗅觉行为及生物防治研究,本文对马铃薯甲虫成虫饲喂抗生素后,利用转录组测序探究健康和取食抗生素后成虫头部的嗅觉基因差异。结果表明:通过Illumina Hiseq^(TM)测序和差异基因的筛选富集,发现饲喂抗生素后,在代谢途径... 为促进马铃薯甲虫嗅觉行为及生物防治研究,本文对马铃薯甲虫成虫饲喂抗生素后,利用转录组测序探究健康和取食抗生素后成虫头部的嗅觉基因差异。结果表明:通过Illumina Hiseq^(TM)测序和差异基因的筛选富集,发现饲喂抗生素后,在代谢途径上的相关基因显著上调(q-value≤0.05),并且筛选出4种差异显著的气味分子结合蛋白(OBP),分别是LdecOBP6、LdecOBP11、LdecOBP26和LdecOBP28;利用实时荧光PCR和数字PCR验证了健康与饲喂抗生素的嗅觉基因表达量的变化,饲喂抗生素后LdecOBP6、LdecOBP11、LdecOBP26和LdecOBP28这4种基因的表达量确有显著变化。 展开更多

关键词 马铃薯甲虫 嗅觉基因 肠道微生物 抗生素

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茶银尺蠖触角嗅觉相关基因的筛选与分析

12

作者 陈明皓 周新苗 +3 位作者 谢婉莹 武孟瑶 李岩松 张方梅 《华中昆虫研究》 2023年第1期244-244,共1页

茶银尺蠖[Scopula subpunctaria(Herrich-Schaeffer)]又称白尺蠖、青尺蠖,属鳞翅目(Lepidoptera)尺蛾科(Geometridae),是茶树上一种常见的害虫,主要以幼虫咬食茶叶,严重时会将茶园食成光秃状,导致茶叶的产量和品质的下降,在四川、浙江... 茶银尺蠖[Scopula subpunctaria(Herrich-Schaeffer)]又称白尺蠖、青尺蠖,属鳞翅目(Lepidoptera)尺蛾科(Geometridae),是茶树上一种常见的害虫,主要以幼虫咬食茶叶,严重时会将茶园食成光秃状,导致茶叶的产量和品质的下降,在四川、浙江、江苏、河南等地都有广泛的分布。昆虫对外界的感知主要通过视觉、触觉和嗅觉,其中嗅觉在寻找配偶、定位寄主或产卵地点、识别同类、躲避敌害等方面起到了非常关键的作用。对茶银尺蠖嗅觉识别机制进行深入研究,可为开发新型的嗅觉行为调控剂提供理论基础。本试验基于Illumina高通量测序技术对其雌雄触角进行转录组测序、组装和注释,获得的有效reads占比达98.36%以上,Q20的碱基占比达98.65%以上,Q30的碱基占比达95.87%以上,GC所占的含量最大的比例为47.91%。将所有的茶银尺蠖触角样本混合组装,最终获得Unigenes数量为93335个,作为后续分析基因。基于其触角转录组数据,共筛选到茶银尺蠖嗅觉相关可溶性蛋白基因21个,其中包括7个气味结合蛋白SsubOBPs,2个信息素结合蛋白SsubPBPs,12个化学感受蛋白SsubCSPs。序列比对结果表明,SsubOBPs具有保守的9~10个以上半胱氨酸Cys残基,属于非典型的OBP;SsubCSPs具有保守的4个半胱氨酸Cys残基位点。基于理论表达量FPKM分析表明,这些可溶性蛋白基因理论表达量偏向于雄虫触角。此外,共筛选出了茶银尺蠖27个嗅觉受体基因,包括12个SsubORs和15个SsubIRs。多序列比对的结果显示,SsubORs基因序列有4个高度保守的半胱氨酸Cys残基位点,SsubIRs基因序列有高度保守的3个半胱氨酸Cys残基位点。系统发育树结果表明,SsubORs和SsubIRs基因均与槐尺蠖(Semiothisa cinerearia)的亲缘关系比较近。以上结果初步筛选和分析了茶银尺蠖嗅觉相关可溶性蛋白基因和嗅觉受体基因,并对这些基因的序列特征进行了分析,为研究该虫的嗅觉行为机� 展开更多

关键词 茶银尺蠖 转录组 嗅觉基因 行为机制

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绿豆象触角转录组及嗅觉相关基因的分析 被引量：22

13

作者 郑海霞 张耀文 +1 位作者 张仙红 杨美红 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期168-177,共10页

【目的】建立绿豆象Callosobruchus chinensis触角转录组数据库,挖掘绿豆象的基因数据。【方法】采用高通量测序平台(Illumina Hiseq)对绿豆象成虫触角进行转录组测序、序列组装及生物信息学分析。【结果】共获得51.10 Gb的clean data(N... 【目的】建立绿豆象Callosobruchus chinensis触角转录组数据库,挖掘绿豆象的基因数据。【方法】采用高通量测序平台(Illumina Hiseq)对绿豆象成虫触角进行转录组测序、序列组装及生物信息学分析。【结果】共获得51.10 Gb的clean data(NCBI SRA数据库登录号:SRP119884)及83 535条unigenes,长度在1 kb以上的unigenes有15 075条,unigenes的N50为1 492 bp。使用BLAST软件将绿豆象触角Unigene序列与公共数据库比对,共注释到22 148条unigenes,其中NR数据库注释的unigenes最多,为18 744条,且与赤拟谷盗Tribolium castaneum的相似基因最多,达39.57%。通过GO数据库注释,将unigenes功能分为细胞组分、分子功能与生物学过程三大类54个分支,其中参与代谢进程以及结合与催化活性的unigenes比例较大。KEGG代谢途径分析表明,9 084条unigenes形成289条代谢通路,其中核糖体代谢通路所含unigene最多,为516条。进一步基因注释分析筛选到140个嗅觉相关基因,包括12个气味结合蛋白(odorant binding protein,OBP)基因,4个化学感受蛋白(chemosensory protein,CSP)基因,116个气味受体(odorant receptor,Or)基因,1个离子型受体(ionotropic receptor,IR)基因和7个感觉神经元膜蛋白(sensory neuron membrane protein,SNMP)基因,并用FPKM值对基因表达量进行评估。【结论】本研究获得了绿豆象触角转录组数据,为进一步研究绿豆象的基因功能分析及嗅觉感受机制奠定分子基础。 展开更多

关键词 绿豆象 触角转录组 高通量测序 基因注释 嗅觉相关基因

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丁香精油和茉莉精油对抑郁症小鼠的治疗效果及其作用机制 被引量：15

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作者 林慧玥 万新龙 +1 位作者 杜永均 谢红莉 《温州医科大学学报》 CAS 2018年第5期330-337,共8页

目的:研究芳香物质对抑郁症的治疗效果及其作用机制。方法:首先选取多项生理指标相近的C57BL/6J小鼠45只,随机选取其中8只作为正常组,其余小鼠采用慢性不可预知轻度应激模型(CUMS)和孤养建立抑郁模型。28 d后筛选出造模成功的32只小鼠... 目的:研究芳香物质对抑郁症的治疗效果及其作用机制。方法:首先选取多项生理指标相近的C57BL/6J小鼠45只,随机选取其中8只作为正常组,其余小鼠采用慢性不可预知轻度应激模型(CUMS)和孤养建立抑郁模型。28 d后筛选出造模成功的32只小鼠并随机分为4组,丁香组、茉莉组和蒸馏水组分别采用丁香精油、茉莉精油及蒸馏水雾化治疗,抑郁组与正常组不给予任何治疗,正常饲养。治疗完毕后测试每组小鼠的体质量、悬尾不动时间百分比、强迫游泳不动时间百分比、血5羟色胺(5-HT)浓度及13个嗅觉受体(OR)基因(MOR11、MOR1、MOR124、MOR16、MOR378、MOR544、MOR19、MOR744、MOR63、MOR148、MOR9、MOR151和MOR15)表达水平。结果:小鼠抑郁模型造模成功。治疗后,丁香组和正常组小鼠体质量、悬尾不动时间百分比、强迫游泳不动时间百分比及血清5-HT浓度差异无统计学意义(P>0.05),但和抑郁组及蒸馏水组比,这4项指标显著降低(P<0.05)。茉莉组小鼠与正常组比除体质量差异无统计学意义(P>0.05),其余指标均显著升高(P<0.05),和抑郁组及蒸馏水组比,除体质量显著升高外,其余指标差异无统计学意义(P>0.05)。蒸馏水组与抑郁组小鼠这4项指标差异无统计学意义。荧光定量PCR结果显示,小鼠抑郁之后,除MOR11外,其余12个OR基因表达水平显著降低。治疗后,与正常组比,丁香组小鼠中有8个基因(MOR11、MOR124、MOR15、MOR16、MOR378、MOR63、MOR744、MOR1)表达水平显著升高(P<0.05),3个基因(MOR19、MOR151、MOR544)表达水平差异无统计学意义(P>0.05),2个基因(MOR148、MOR9)表达水平明显下降(P<0.05);茉莉组小鼠中则只有2个基因(MOR744、MOR1)表达水平显著升高(P<0.05),3个基因(MOR11、MOR63、MOR151)表达水平差异无统计学意义(P>0.05),其余基因(MOR124、MOR15、MOR16、MOR19、MOR378、MOR544、MOR148、MOR9)表达水平显著下降(P<0.05);蒸馏水组小鼠有4个基因(MOR1 展开更多

关键词 抑郁症 丁香精油 茉莉精油 嗅觉受体基因 慢性不可预知轻度应激模型 聚合酶链反应 小鼠

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大蜡螟触角转录组及嗅觉相关基因分析 被引量：11

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作者 杨爽 赵慧婷 +7 位作者 徐凯 郭丽娜 杜亚丽 李新宇 苏文婷 冯宇佳 龙登隆 姜玉锁 《应用昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1279-1291,共13页

【目的】大蜡螟Galleria mellonella Linnaeus是世界范围内蜂群中普遍存在的害虫,给世界养蜂业带来了巨大的危害。本研究旨在建立大蜡螟触角转录组数据库,挖掘大蜡螟嗅觉相关基因,为今后利用嗅觉基因靶标防治大蜡螟提供分子生物学信息... 【目的】大蜡螟Galleria mellonella Linnaeus是世界范围内蜂群中普遍存在的害虫,给世界养蜂业带来了巨大的危害。本研究旨在建立大蜡螟触角转录组数据库,挖掘大蜡螟嗅觉相关基因,为今后利用嗅觉基因靶标防治大蜡螟提供分子生物学信息数据。【方法】利用高通量测序平台(Illumina HiSeq^TM 2500)对大蜡螟触角进行转录组测序和组装,通过筛选转录组数据库,鉴定出嗅觉相关基因。【结果】成功构建了大蜡螟触角转录组,经序列拼接获得188278条unigenes,平均长度为781 bp,N50为1161 bp。使用BLAST软件将大蜡螟触角unigenes序列与7大公共数据库比对,共注释到108047条unigenes,其中NR数据库注释的unigenes最多,为78746条,占41.82%,且NR注释的大蜡螟unigenes中与家蚕Bombyx mori类似基因最多,为18.4%。将unigenes与GO数据库比对发现,共有69794条unigenes注释到GO数据库中,按照其所参与的生物过程、细胞组分和分子功能对其进行GO功能分类,共含有55个亚类,其中参与结合和催化功能及代谢过程的unigenes比例较大;KEGG代谢途径分析表明,14699条unigenes形成231条代谢通路,其中被注释在信号传导通路中的unigenes最多,为2401条,占16.33%。进一步基因注释分析,鉴定得到226个候选嗅觉相关基因,包括52个气味结合蛋白(Odorant binding proteins,OBPs)基因,36个化学感受蛋白(Chemosensory proteins,CSPs)基因,80个气味受体(Odorant receptors,ORs)基因,56个离子型受体(Ionotropic receptors,IRs)基因和2个感觉神经元膜蛋白(Sensory neuron membrane proteins,SNMPs)基因;通过比较雌、雄大蜡螟转录组鉴定出114个差异表达基因,包括5个嗅觉相关基因(OBP8、OBP17、CSP3、CSP34和OR15);114个差异表达基因中,66个基因在雌蛾触角中高表达,48个基因在雄蛾触角中高表达。【结论】本研究获得了大蜡螟触角转录组数据,并鉴定出候选嗅觉相关基因,结果为进一步研究大蜡螟的基� 展开更多

关键词 大蜡螟 触角转录组 高通量测序 基因注释 嗅觉相关基因 差异表达基因

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甜菜夜蛾非典型嗅觉受体基因OR2的组织特异性和时空表达 被引量：12

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作者 张逸凡 修伟明 +2 位作者 杨殿林 董双林 刘玉升 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2011年第7期231-235,共5页

本研究采用反转录多聚酶链式反应(RT-PCR)和实时定量PCR(Real-time quantitative PCR)技术对甜菜夜蛾Spodoptera exigua(Hübner)成虫不同羽化时期,不同部位组织内的非典型嗅觉受体OR2(SexiOR2)的组织表达谱和时空表达量进行了研究... 本研究采用反转录多聚酶链式反应(RT-PCR)和实时定量PCR(Real-time quantitative PCR)技术对甜菜夜蛾Spodoptera exigua(Hübner)成虫不同羽化时期,不同部位组织内的非典型嗅觉受体OR2(SexiOR2)的组织表达谱和时空表达量进行了研究。结果表明,SexiOR2在甜菜夜蛾成虫的雌、雄蛾触角和喙内均表达。羽化后36h的雄虫触角中的SexiOR2表达量最大,约为同期雌虫的5.5倍。SexiOR2在雌、雄虫喙内表达量极低,其他组织中均未发现表达。本研究明确了甜菜夜蛾非典型嗅觉受体OR2在不同性别、羽化时期和组织的表达情况。 展开更多

关键词 甜菜夜蛾 非典型嗅觉受体基因 组织特异性 时空表达

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云斑天牛成虫触角转录组及嗅觉相关基因分析 被引量：10

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作者 胡佳萌 徐丹萍 +3 位作者 卓志航 杨伟 杨桦 郑奕然 《应用昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1037-1047,共11页

【目的】 建立云斑天牛Batocera horsfieldi (Hope)成虫触角转录组数据库,深入挖掘云斑天牛的基因数据信息。【方法】 采用高通量测序平台(Illumina HiSeq)对云斑天牛成虫触角进行转录组测序、序列组装及生物信息学分析。【结果】 云斑... 【目的】 建立云斑天牛Batocera horsfieldi (Hope)成虫触角转录组数据库,深入挖掘云斑天牛的基因数据信息。【方法】 采用高通量测序平台(Illumina HiSeq)对云斑天牛成虫触角进行转录组测序、序列组装及生物信息学分析。【结果】 云斑天牛成虫触角转录组共获得137 485条Transcript序列和69 214条Unigene序列;其中,Transcript序列平均长度1 142 bp,Unigene序列平均长度1 983 bp。将Unigene分别比对到NR、NT、SwissProt、KO、PFAM、GO、KOG数据库进行基因功能注释,NR注释41 636条,NT注释14 895条,KO注释19 287条,SwissProt注释33 442条,PFAM注释34 687条,GO注释35 321条,KOG注释20 582条。NR注释表明,72.0%的云斑天牛Unigene与赤拟谷盗Tribolium castaneum和中欧山松大小蠹Dendroctonus ponderosae具有相似性。基因功能注释分类表明,云斑天牛成虫触角转录组在GO数据库三大类中包含5个最主要功能,分别是细胞过程、代谢过程、单有机体过程、结合和催化活性,分别占20 912、19 086、17 202、21 477和15 823条Unigenes;云斑天牛转录组在KOG数据库26个功能目录共注释20 585条Unigenes,其中,翻译后修饰、蛋白质转换和伴侣共有1 977条,一般功能预测3 285条(最多),信号传导机制3 053条,合计8 315条占全部Unigenes 40.39%;总共19 287条Unigenes分至5个KEGG功能类别,其中细胞过程6 793条,环境信息处理6 255条,遗传信息处理3 038条,代谢3 852条,有机系统3 508条。进一步基因功能注释分析筛选得到161个嗅觉相关基因,包含96个气味结合蛋白(Odorant binding protein,OBP),34个化学感受蛋白(Chemosensory protein,CSP)和31个气味受体(Odorant receptor,OR)。【结论】 本研究获得了云斑天牛成虫触角转录组数据库,为进一步研究云斑天牛的基因功能分析及嗅觉感受机制奠定了分子基础。 展开更多

关键词 云斑天牛 触角转录组 嗅觉相关基因 基因组注释 高通量测序

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七星瓢虫触角转录组及嗅觉相关基因分析 被引量：10

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作者 杨雪娇 张蔓 +4 位作者 江宇航 唐启河 张棋麟 林连兵 陈均远 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期717-726,共10页

【目的】瓢虫科食性高度分化。本研究旨在通过建立七星瓢虫Coccinella septempunctata触角转录组数据库,探讨其触角嗅觉相关基因与食性分化的关系。【方法】采用Illumina HiSeq 4000高通量测序平台对七星瓢虫成虫触角转录组进行测序、... 【目的】瓢虫科食性高度分化。本研究旨在通过建立七星瓢虫Coccinella septempunctata触角转录组数据库,探讨其触角嗅觉相关基因与食性分化的关系。【方法】采用Illumina HiSeq 4000高通量测序平台对七星瓢虫成虫触角转录组进行测序、组装、注释,挖掘嗅觉相关基因,并与已发表的茄二十八星瓢虫Henosepilachna viginyioctopunctata转录组进行比较。【结果】共获得七星瓢虫触角转录组31775条unigenes,其中69.71%的序列得以注释,NR数据库中注释最多,为20539条。据注释信息,挖掘到27个嗅觉相关基因,包括1个气味结合蛋白(odorant binding protein,OBP)基因,13个化学感受蛋白(chemosensory protein,CSP)基因,4个气味受体(odorant receptor,OR)基因,7个味觉受体(gustatory receptor,GR)基因和2个感觉神经元膜蛋白(sensory neuron membrane protein,SNMP)基因。相对应地,在植食性茄二十八星瓢虫转录组中鉴定到38个嗅觉相关基因,包括七星瓢虫中未发现的1个离子型受体(ionotropic receptor,IR)基因。在各类型嗅觉相关基因中,茄二十八星瓢虫转录组的OBP基因比例(13.16%)高于七星瓢虫触角转录组的(3.70%),而七星瓢虫触角转录组的GR基因比例(25.93%)则高于茄二十八星瓢虫转录组的(13.16%)。【结论】触角嗅觉相关基因数目不是昆虫食性分化的主因。本研究获得了七星瓢虫触角转录组学资源,初步探讨了嗅觉相关基因同瓢虫食性分化的关系,为了解瓢虫乃至昆虫食性分化的分子基础提供了信息。 展开更多

关键词 七星瓢虫 触角转录组 食性分化 基因注释 嗅觉相关基因

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嗅觉受体基因的研究进展 被引量：8

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作者 高一龙 缪勤 +3 位作者 张汇东 温海 秦海斌 谢庄 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期17-24,共8页

嗅觉在动物的生命活动中起着重要的作用,与嗅觉相关的基因主要是嗅觉受体(Olfactory receptor,OR)基因。文章介绍了嗅觉受体基因的结构、表达调控、分布、分子进化及其多态性研究进展,并讨论了该基因与嗅觉功能和嗅觉障碍的关系。

关键词 嗅觉受体基因 多态性 嗅觉功能 嗅觉障碍

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叉角厉蝽触角转录组及嗅觉相关基因分析 被引量：8

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作者 赵航 吴国星 +5 位作者 汤永玉 张曼 梁晨 邢孔政 兰明先 高熹 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2022年第5期1205-1217,共13页

叉角厉蝽Eocanthecona furcellata是一种在生物防治方面有重要作用和潜力的捕食性天敌昆虫,触角是昆虫进行信息交换的重要器官,而嗅觉相关基因则是调控天敌昆虫捕食行为的重要分子基础。为获得叉角厉蝽触角转录组数据库,挖掘叉角厉蝽嗅... 叉角厉蝽Eocanthecona furcellata是一种在生物防治方面有重要作用和潜力的捕食性天敌昆虫,触角是昆虫进行信息交换的重要器官,而嗅觉相关基因则是调控天敌昆虫捕食行为的重要分子基础。为获得叉角厉蝽触角转录组数据库,挖掘叉角厉蝽嗅觉相关基因,本研究利用Illumina高通量测序平台对叉角厉蝽雌雄成虫与5龄若虫触角进行转录组测序。成功构建了叉角厉蝽触角转录组,获得了67843条unigenes,N50长度为2300 bp。与七大公共数据库比对注释到27686条unigenes,其中NR数据库注释最多(33.33%),且与茶翅蝽Halyomorpha halys相似度最高(64.20%)。14258条注释到GO数据库中,分为生物过程、细胞组分和分子功能3个大类42个亚类;KEGG代谢途径分析表明,7703条形成282条代谢通路,其中被注释在信号传导通路中的unigenes最多(11.50%)。进一步基因注释分析,鉴定得到134个候选嗅觉相关基因,32个化学感应蛋白基因(Chemosensory protein genes,CSP),10个气味结合蛋白基因(Odorant binding protein genes,OBP),21个气味受体基因(Gustatory receptor genes,GR),48个嗅觉受体基因(Olfactory receptor genes,OR),17个离子型受体基因(Ionotropic receptor genes,IR),6个感觉神经元膜蛋白基因(Sensory neuron membrane protein genes,SNMP)。通过比较叉角厉蝽5龄若虫、雌雄成虫触角转录组,共筛选出7324个差异表达基因,分析发现5龄若虫与成虫间的差异表达基因较多,雌雄成虫之间差异表达基因较少;利用FPKM值对OBP与CSP基因进行表达量分析发现,大部分OBP与CSP的表达量在雌雄间差异不大,而若虫与成虫相比基因表达量差异较大,除少部分基因在5龄若虫中高表达外,其余大部分基因均在雌雄成虫间高表达。本研究获得了叉角厉蝽触角转录组数据,并鉴定出候选嗅觉相关基因,结果为进一步研究叉角厉蝽的嗅觉感受机制及昆虫化学生态奠定分子基础。 展开更多

关键词 叉角厉蝽 触角转录组 基因注释 嗅觉相关基因 差异表达基因

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