-
题名啤酒花潜隐病毒新疆分离物的全基因组序列分析
被引量：1
- 1
-
-
作者
许慧敏
张燕玲
王晓燕
林艳虹
刘升学
-
机构
石河子大学绿洲农作物病害防控重点实验室
-
出处
《石河子大学学报（自然科学版）》
CAS
2012年第3期313-316,共4页
-
基金
石河子大学高层次人才启动基金项目(RCZX200808)
-
文摘
对新疆啤酒花上获得的HpLV分离物HpLV-XJ进行了全长克隆和基因组序列分析。结果显示:HpLV-XJ的全基因组序列为8612个核苷酸(nt)(不包括poly A),含有6个开放阅读框(ORF),分别编码224 kDa(ORF1)、25kDa(ORF2)、11 kDa(ORF3)、7 kDa(ORF4)、34 kDa(ORF5)、和12 kDa(ORF6)蛋白。序列相似性分析结果表明,HpLV-XJ与HpLV(GenBank:AB032469)序列相似性达98.5%,6个开放阅读框的核苷酸序列相似性分别为98.3%、99.0%、97.6%、96.7%、99.5%和98.4%;由此推导的氨基酸序列相似性分别为98.6%、98.7%、97.2%、95.0%、99.4%和98.1%,各个基因的核苷酸序列和蛋白的氨基酸之间存在着一定的差异。
-
关键词
啤酒花潜隐病毒
基因组序列分析
新疆
-
Keywords
Hop latent virus
genomic sequence analysis
Xinjiang
-
分类号
S432.41
[农业科学—植物病理学]
TS261.23
[农业科学—农业昆虫与害虫防治]
-
-
题名啤酒花潜隐类病毒的实时荧光RT-PCR检测
被引量：6
- 2
-
-
作者
郭立新
段维军
张祥林
邓丛良
闻伟刚
李世访
-
机构
北仑出入境检验检疫局
宁波出入境检验检疫局
新疆出入境检验检疫局
北京出入境检验检疫局
中国农业科学院植物保护研究所
-
出处
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期466-473,共8页
-
基金
国家质检总局课题(2009IK256
2011IK169)
+2 种基金
国家"973"课题(2011CB932800)
宁波检验检疫局科研项目(甬K07-2011)
国家标准制修订计划项目(20100455-T-469)
-
文摘
根据啤酒花潜隐类病毒(HpLVd)各分离物基因序列,设计并合成1对特异性引物和1条TaqMan-MGB探针,建立了对HpLVd的实时荧光RT-PCR检测方法。通过对反应体系的优化,确定了HpLVd的实时荧光RT-PCR最佳反应条件:Mg2+终浓度为5.5 mmol/L,引物终浓度为0.7μmol/L,探针终浓度为0.5μmol/L。灵敏度对比试验结果显示,实时荧光RT-PCR的灵敏度较普通RT-PCR通过琼脂糖凝胶电泳高10倍,在25μL反应体系中,总RNA含量达到20 pg就能通过实时荧光RT-PCR检测出来。此方法也能成功检测田间样品上的啤酒花潜隐类病毒。
-
关键词
啤酒花潜隐类病毒
实时荧光RT-PCR
检测
TAQMAN-MGB探针
-
Keywords
Hop latent viroid
real-time fluorescent RT-PCR
detection
TaqMan-MGB probe
-
分类号
S432.41
[农业科学—植物病理学]
-
-
题名啤酒花潜隐类病毒研究进展
被引量：2
- 3
-
-
作者
郭立新
徐颖
蔡曹盛
-
机构
北仑出入境检验检疫局
-
出处
《湖南农业科学》
2012年第4期98-101,共4页
-
基金
国家质检总局课题(2009IK256)
宁波检验检疫局科研项目(甬K07-2011)
国家标准制修订计划项目(20100455-T-469)
-
文摘
啤酒花潜隐类病毒在啤酒花上的感染较普遍,且一般不产生明显症状,给生产带来一定损失。对于该类病毒病害,较为可行的控制措施是实行检疫控制其扩展和培育与栽培无类病毒苗。较为系统地综述了国内外啤酒花潜隐类病毒的分布与危害、生物学特性、基因组结构与序列分析、检测方法及防治与控制等方面的研究进展。
-
关键词
啤酒花潜隐类病毒
基因组结构
序列
检测方法
控制
-
Keywords
hop latent viroid
genome structure
sequence
detection method
control
-
分类号
S432.4
[农业科学—植物病理学]
-
-
题名啤酒花潜隐类病毒北京分离物的分子鉴定和序列分析
被引量：1
- 4
-
-
作者
连海燕
汪万春
骆卫峰
邓丛良
许志春
-
机构
北京林业大学
北京出入境检验检疫局检验检疫技术中心
-
出处
《植物检疫》
北大核心
2014年第2期43-47,共5页
-
基金
"十二五"国家课题(2012BAK11B02-1)
国家质检总局科技项目(2013IK267)
-
文摘
应用RT-PCR方法对采自北京地区的啤酒花样品进行检测,结果表明啤酒花携带啤酒花潜隐类病毒(Hop latent viroid,HLVd)。将此分离物(HLVd-bj)的全基因组序列克隆后进行序列分析,结果表明HLVd-bj的基因组全长为256bp,与已经报道中国新疆地区的HLVd分离物同源性达100%,与美国HLVd分离物同源性达99%,表明该分离物为啤酒花潜隐类病毒。二级结构比对的结果表明,碱基变异位置基本在左手区(T1),致病区(P)以及右手末端区(T2)。
-
关键词
啤酒花潜隐类病毒
分子检测
序列分析
-
Keywords
Hop latent viroid
molecular detection
sequence analysis
-
分类号
S432.41
[农业科学—植物病理学]
-
