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和蔼巴非蛤的肌肉颜色分化与微卫星遗传结构
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作者 王绥腾 吴星星 +5 位作者 於锋 廖婷馨 李琼珍 张兴志 罗帮 王嫣 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期494-503,共10页
和蔼巴非蛤(Paphia amabilis)是广泛分布于东南亚海岸的重要贝类,因其体内富含C37类胡萝卜素,其足部和虹吸管的肌肉通常是亮橙色的。然而,在4个北部湾野生群体[越南群体CT(采自Co To岛),北海群体(BH,BHA)与湛江群体ZJ]中,有10.5%~18.6%... 和蔼巴非蛤(Paphia amabilis)是广泛分布于东南亚海岸的重要贝类,因其体内富含C37类胡萝卜素,其足部和虹吸管的肌肉通常是亮橙色的。然而,在4个北部湾野生群体[越南群体CT(采自Co To岛),北海群体(BH,BHA)与湛江群体ZJ]中,有10.5%~18.6%的个体其肌肉是黄色的(yellow-muscled,YMs)。为辅助该物种育种中亲本群体的选择,并探索和蔼巴非蛤肌肉颜色的遗传模式,本研究开发了20个基因组微卫星标记,并用其中的12个微卫星标记分析了3个地理群体(CT,BH和ZJ,n=32/种群)以及YM和RM(red-muscled,红肌肉)亚种群的遗传分化。3个地理群体的遗传多样性均为中等水平,其等位基因数分别为:CT群体4~21(8.4±4.5),BH群体4~16(7.6±3.3),ZJ群体4~18(7.5±3.7)。平均观察杂合度/预期杂合度CT为0.66/0.66,BH为0.62/0.63,ZJ为0.55/0.62。在对微卫星进行的36次试验中,经MICRO-CHECKER分析,有4个位点偏离了哈迪-温伯格平衡(HWE,经Bonferroni校正后P<0.05),均在ZJ群体可能由于无效等位基因的存在。精确检验表明,在越南群体CT和两个中国群体(BH/ZJ)之间存在极显著的遗传分化(F_(ST),0.099/0.123)。结果表明,未发现微卫星标记的等位基因与肌肉颜色显著相关,在两个颜色亚群YM和RM之间未发现显著的遗传分化。 展开更多
关键词 和蔼巴非蛤 微卫星 群体遗传结构 肌肉颜色变异 遗传多样性
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