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牛MyoG基因启动子的克隆及功能的初步分析 被引量:25
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作者 王秋华 曹允考 +4 位作者 李树峰 佟慧丽 兴孝友 李光鹏 严云勤 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期37-43,共7页
本研究旨在比较日本和牛MyoG基因的不同长度片段启动子的活性强弱并初步探讨其中的机制。根据GenBank已公布的牛MyoG基因的启动子序列,设计特异性PCR引物扩增日本和牛MyoG基因的一系列启动子缺失序列,构建重组克隆载体pMD18-T-MyoGpro,... 本研究旨在比较日本和牛MyoG基因的不同长度片段启动子的活性强弱并初步探讨其中的机制。根据GenBank已公布的牛MyoG基因的启动子序列,设计特异性PCR引物扩增日本和牛MyoG基因的一系列启动子缺失序列,构建重组克隆载体pMD18-T-MyoGpro,对阳性克隆进行限制性酶切鉴定、测序及生物信息学分析,进而构建一系列启动子缺失片段的pGL3-MyoGpro双荧光素酶表达载体,转染牛肌源干细胞(MDSCs)和牛胎儿成纤维细胞,并进行双报告基因活性检测。结果表明,日本和牛MyoG基因的166~2 125bp启动子都能不同程度的启动双荧光素酶报告基因在牛肌源干细胞中的表达,且具有肌肉特异性。通过生物信息学分析得知日本和牛MyoG启动子序列中有1个TATA盒,15个E-box,并可能含有MyoD、MEF2、MEF3、MTBF、TEF1、PRDF、Sp1、多个SRF、ERE、GRE及多个Oct-1等转录因子调控结合位点,本试验通过比较不同长度启动子片段的活性并结合对上述转录因子的分析,认为这些转录因子可能对启动子活性起着重要的调控作用。对牛MyoG基因启动子的克隆与功能和序列分析为进一步研究MyoG基因的表达调控奠定了基础。 展开更多
关键词 MYOG基因 启动子序列 转染 双报告检测 肌肉特异性 生物信息学分析
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JWA参与调控细胞分化的结构和功能 被引量:19
2
作者 夏薇 周建伟 +4 位作者 曹海霞 C. R.Zou 汪承亚 沈群 陆化 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2001年第9期734-738,共5页
为阐明新基因JWA的结构特征、表达调节规律和生物学功能,通过基因重组和测序,确定了大鼠JWA同源基因和人JWA基因 621 hp的启动子序列;用 RT-PCR法,分析了培养细胞株和原代白血病细胞经药物处理后JWA mRN... 为阐明新基因JWA的结构特征、表达调节规律和生物学功能,通过基因重组和测序,确定了大鼠JWA同源基因和人JWA基因 621 hp的启动子序列;用 RT-PCR法,分析了培养细胞株和原代白血病细胞经药物处理后JWA mRNA的表达情况,发现TPA处理后JWA mRNA水平在肿瘤细胞株与非肿瘤细胞株中是反向变化;用维甲酸治疗前的M3型白血病人骨髓白细胞,其JWA基因对多种诱导分化剂处理不敏感;而用维甲酸治疗 10 d后再用诱导分化剂处理,则 JWA基因的转录水平均被下调,提示 M3型白血病细胞在ATRA作用下的分化可能是启动JWA信号转导通路的前提,而JWA基因的表达下调是否为白血病细胞进一步分化及4HPR,As2O3和TPA等诱导细胞凋亡所必需,值得进一步探讨.JWA基因在不同种属中保持较为稳定的序列特征,说明该基因在生物进化中可能较保守并可能具有相近的生物学功能. 展开更多
关键词 JWA基因 启动子序列 同源基因 诱导分化剂 基因调控 细胞分化 M3型白血病
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牛MyoG基因启动子的克隆与序列分析 被引量:17
3
作者 王珊 陈宏 蔡欣 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2006年第8期12-16,共5页
根据G enB ank中已公布的人、猪和小鼠的MyoG基因的5′侧翼和部分第一外显子序列设计PCR引物,用touch-dow n PCR技术扩增了牛MyoG基因的启动子序列,构建了重组克隆载体pGEM-T-MyoG,并通过PCR扩增、限制性酶切对阳性克隆进行了鉴定、测... 根据G enB ank中已公布的人、猪和小鼠的MyoG基因的5′侧翼和部分第一外显子序列设计PCR引物,用touch-dow n PCR技术扩增了牛MyoG基因的启动子序列,构建了重组克隆载体pGEM-T-MyoG,并通过PCR扩增、限制性酶切对阳性克隆进行了鉴定、测序及生物信息学分析。结果表明,牛MyoG基因的启动子序列(G en-bank中注册号为AY 882581)长度为672 bp,其与猪、人和小鼠相应序列的同源性分别为94%,91%和88%,且其在不同物种之间具有一定的保守性。牛MyoG基因启动子的克隆与序列分析为进一步研究牛MyoG基因的表达调控奠定了基础。 展开更多
关键词 MYOG基因 启动子序列 序列分析
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基因表达数据分析 被引量:2
4
作者 刘月明 张蔚 刘海荣 《国外医学(生物医学工程分册)》 2001年第6期247-252,共6页
基因芯片或称微阵列 (gene chip或 microarrays)是最近分子生物学实验技术的一个突破 ,利用该技术可以对成千上万个基因的表达进行平行分析 ,已经产生了总量巨大的有用数据 ,分析与整理这些数据成为利用这一技术的一个主要瓶颈问题。原... 基因芯片或称微阵列 (gene chip或 microarrays)是最近分子生物学实验技术的一个突破 ,利用该技术可以对成千上万个基因的表达进行平行分析 ,已经产生了总量巨大的有用数据 ,分析与整理这些数据成为利用这一技术的一个主要瓶颈问题。原始的微阵列数据是图像 ,必须把它们转化成为基因表达矩阵表 ,矩阵的行代表基因 ,列代表各样本及条件(如 :组织、实验条件、处理因素等 ) ,每个格子的数据表示特定的基因在特定的样本中的表达水平。这些矩阵必须经过进一步的分析才能得到它们潜在生物学过程的信息。本文着重讨论了生物信息学方法在该领域的应用 ,主要探讨了监督与非监督数据分析方法在基因表达数据分析中的应用 ,如预测基因功能分类及恶性肿瘤分级。本文还讨论了如何利用基因表达矩阵预测序列中假想调控信号。 展开更多
关键词 微阵列 基因表达 聚类分析 启动子序列 生物学 生物信息学
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mRNA差异显示技术的研究进展 被引量:7
5
作者 陈永华 严钦泉 +1 位作者 余建蒲 肖国樱 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期9-12,43,共5页
针对mRNA差异显示技术中的假阳性高和放射性污染等缺陷,文章从改进引物设计、应用非放射性标记、优化PCR参数、假阳性鉴定等方面进行了综述。1采用4种兼并或单碱基引物作锚定引物;用特异和长序列(≥20bp)专一性引物作为随机引物,可增加... 针对mRNA差异显示技术中的假阳性高和放射性污染等缺陷,文章从改进引物设计、应用非放射性标记、优化PCR参数、假阳性鉴定等方面进行了综述。1采用4种兼并或单碱基引物作锚定引物;用特异和长序列(≥20bp)专一性引物作为随机引物,可增加特异性;在锚定引物之前加上了一段T7启动子序列,在随机引物前加上一段M13重复序列,可使DDRT—PCR的体系的扩增特异性更一致。2针对放射性同位素检测法的缺点,文章提出并比较了几种常用的非放射性同位素标记方法。3保证起始(模板)mRNA质量和浓度,降低dNTP浓度,选择最适的反转录和PCR退火温度,可优化PCR参数。4用两种不同的反转录酶进行反转录平行实验,很容易区分出RNA制备过程中造成的假阳性,目前假阳性鉴定大多还是以Northern印迹为基础,再作些适当的改进。 展开更多
关键词 MRNA差异显示技术 研究进展 NORTHERN 非放射性同位素 非放射性标记 dNTP浓度 锚定引物 随机引物 放射性污染 启动子序列 假阳性 重复序列 标记方法 退火温度 平行实验 反转录酶 制备过程 R参数 特异性 PCR 单碱基 专一性
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一种改良的启动子序列克隆的染色体步查法 被引量:7
6
作者 吴蔼民 刘进元 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期243-246,共4页
利用染色体步行法,从已知DNA序列克隆侧翼未知序列是非常有效的方法之一,但由于所选用的特定限制性内切酶对目标基因组不能酶解成合适大小的片段,因而受PCR扩增能力的局限,往往扩增不出有效产物.针对这一点,这里我们介绍一种简单有效的... 利用染色体步行法,从已知DNA序列克隆侧翼未知序列是非常有效的方法之一,但由于所选用的特定限制性内切酶对目标基因组不能酶解成合适大小的片段,因而受PCR扩增能力的局限,往往扩增不出有效产物.针对这一点,这里我们介绍一种简单有效的改良方法,它包括以下步骤:首先用不同的限制性内切酶(包括平末端和粘性末端)酶解目标基因组DNA,接着,选择能将基因组酶切成弥散、分布均匀的限制性内切酶,如DraⅠ和HindⅢ,合成相对应的接头;然后,选择弥散的、分布均匀的限制性内切酶的酶解产物,构建成含相应接头的基因组DNA文库,用作PCR的模板;最后,用接头引物和特异引物,通过巢式PCR扩增目的片段,获得了理想的扩增效果.采用改进后的染色体步查法,有效地从较复杂的棉花核DNA中克隆出6个棉花启动子序列. 展开更多
关键词 连接介导的步查法 限制性内切酶 棉花 启动子序列 方法改良
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Dickkopf3 overexpression inhibits pancreatic cancer cell growth in vitro 被引量:8
7
作者 Yu-Mei Gu Yi-Hui Ma Wu-Gan Zhao Jie Chen 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2011年第33期3810-3817,共8页
AIM:To elucidate the role of dickkopf3(Dkk3)in human pancreatic cancer cell growth.METHODS:Dkk3 mRNA and protein expression in human pancreatic cancer cell lines were detected by realtime reverse transcription polymer... AIM:To elucidate the role of dickkopf3(Dkk3)in human pancreatic cancer cell growth.METHODS:Dkk3 mRNA and protein expression in human pancreatic cancer cell lines were detected by realtime reverse transcription polymerase chain reaction(realtime RTPCR),Western blotting and immunofluorescence.Methylation of the Dkk3 promoter sequence was examined by methylationspecific polymerase chain reaction(MSP)and Dkk3 mRNA expression was determined by realtime RTPCR after 5aza2'deoxycytidine(5azadC)treatment.The effects of Dkk3 on cancer cell proliferation and in vitro sensitivity to gemcitabine were investigated by CellTiter 96?AQueous One Solution Cell Proliferation Assay(MTS)after transfecting the Dkk3 expression plasmid into human pancreatic cancer cells.The expression ofβcatenin,phosphorylated extracellular signalregulated protein kinases(pERK)and extracellular signalregulated protein kinases(ERK)was also examined by realtime RTPCR and Western blotting after upregulating Dkk3 expression in human pancreatic cancer cells.RESULTS:The results show that the expression levels of both Dkk3 mRNA and protein were low in all pancreatic cancer cell lines tested.The Dkk3 promoter sequence was methylated in the MIA PaCa2 and AsPC1 cell lines,which showed reduced Dkk3 expression.These two cell lines,which initially had a methylated Dkk3 promoter,showed increased Dkk3 mRNA expression that was dependent upon the dosage and timing of the DNA demethylating agent,5azadC,treatment(P<0.05 or P<0.01).When Dkk3 expression was upregulated following the transfection of a Dkk3 expression plasmid into MIA PaCa2 cells,the ability of cells to proliferate decreased(P<0.01),and the expression ofβcatenin and pERK was downregulated(P<0.01).Sensitivity to gemcitabine was enhanced in Dkk3 expression plasmidtransfected cells.CONCLUSION:Our findings,for the first time,implicate Dkk3 as a tumor suppressor in human pancreatic cancer,through the downregulation ofβcatenin expression via the ERKmediated pathway. 展开更多
关键词 Cell growth Dickkopf3 In vitro OVEREXPRESSION Pancreatic cancer
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真核生物RNA聚合酶Ⅱ启动子的计算机预测 被引量:4
8
作者 姚凤霞 张瑞芳 +2 位作者 刘春宇 夏家辉 夏昆 《国外医学(遗传学分册)》 2005年第1期6-9,共4页
启动子是基因组序列中靠近基因转录起始位点的区域,是影响基因表达的重要功能单位之 一。除实验方法发现或验证序列的启动子外,现已经有多种启动子序列的计算机预测方法,如位点比重 阵列(PWM)、隐马尔柯夫模型(HMM)、神经网络、低聚复... 启动子是基因组序列中靠近基因转录起始位点的区域,是影响基因表达的重要功能单位之 一。除实验方法发现或验证序列的启动子外,现已经有多种启动子序列的计算机预测方法,如位点比重 阵列(PWM)、隐马尔柯夫模型(HMM)、神经网络、低聚复合物和CpG岛等。本文综述了现有真核生物基 因启动子序列的生物信息研究技术。 展开更多
关键词 RNA聚合酶Ⅱ 计算机预测 真核生物 启动子序列 基因组序列 基因转录 功能单位 基因表达 实验方法 预测方法 马尔柯夫 神经网络 CPG岛 研究技术 生物信息 生物基因 复合物 位点
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TGF-β信号通路中Smad蛋白与基因转录调节研究进展 被引量:3
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作者 汪娟 柳惠图 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第z1期13-17,共4页
关键词 启动子序列 基因转录 信号通路 转录调节 TGF SMAD 复合物 信号传递 蛋白
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牛结蛋白基因启动子的克隆及功能的初步分析 被引量:5
10
作者 杜巍 李树峰 +3 位作者 佟慧丽 杨翠翠 刘丹 严云勤 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期56-61,共6页
旨在克隆牛结蛋白基因不同长度的启动子片段,并对其进行功能分析。本研究采用PCR法扩增牛结蛋白基因不同长度的启动子缺失序列,构建pGL3-desminpro双荧光素酶表达载体,使其转染牛骨胳肌卫星细胞和胎儿成纤维细胞,进行活性检测。同时转染... 旨在克隆牛结蛋白基因不同长度的启动子片段,并对其进行功能分析。本研究采用PCR法扩增牛结蛋白基因不同长度的启动子缺失序列,构建pGL3-desminpro双荧光素酶表达载体,使其转染牛骨胳肌卫星细胞和胎儿成纤维细胞,进行活性检测。同时转染牛MyoG和βα-actin基因启动子的表达载体,以比较结蛋白启动子和MyoG及α-actin启动子的表达活性。结果表明,牛结蛋白基因的132~2106 bp启动子都能不同程度的启动双荧光素酶报告基因在牛骨胳肌卫星细胞中的表达,且都具有肌肉特异性。300bp的结蛋白基因启动子活性最高,且高于牛MyoG和α-actin基因启动子的活性。从而筛选出300 bp的结蛋白基因启动子为活性较高且大小合适的肌肉特异性启动子,这为转基因肉牛的生产方面奠定了重要的基础。 展开更多
关键词 结蛋白基因 启动子序列 转染 双荧光素酶报告检测 肌肉特异性
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水稻谷氨酰胺合成酶同工型基因转录表达量与启动子结构关系分析 被引量:5
11
作者 金正勋 李丹 +6 位作者 李明月 同拉嘎 潘冬 张玉磊 王海微 韩云飞 张忠臣 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期1-10,共10页
研究选用籽粒蛋白质含量差异显著的5个品种(系),比较分析品种间GS同工型基因在灌浆过程中籽粒和叶片表达特性及启动子序列与结构特点。结果表明,不同品种间OsGS同工型基因表达量差异显著;OsGS1;1和OsGS1;2基因在籽粒和叶片中大量表达;Os... 研究选用籽粒蛋白质含量差异显著的5个品种(系),比较分析品种间GS同工型基因在灌浆过程中籽粒和叶片表达特性及启动子序列与结构特点。结果表明,不同品种间OsGS同工型基因表达量差异显著;OsGS1;1和OsGS1;2基因在籽粒和叶片中大量表达;OsGS1;3和OsGS2基因分别仅在籽粒和叶片中大量表达;在灌浆过程中籽粒和叶片中OsGS同工型基因m RNA表达量均呈单峰曲线变化,灌浆前期m RNA表达量平稳升高,中期出现峰值,后期快速降低,且高蛋白质含量品种m RNA表达量高于低蛋白质含量品种。籽粒蛋白质含量差异显著品种间OsGS同工型基因启动子序列同源性高达99%以上;品种间有性杂交子代OsGS同工型基因启动子序列可发生碱基变化,但启动子核心元件无变化。在调控元件数量和功能上OsGS同工型基因启动子保守性很强,启动子在结构和功能上不易发生遗传变异,籽粒OsGS同工型基因m RNA表达量变化受OsGS基因启动子调控影响较小。 展开更多
关键词 水稻 超亲变异系 谷氨酰胺合成酶基因 转录表达 启动子序列
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角膜与三叉神经节内HSV1潜伏相关转录启动子的核苷酸序列分析 被引量:4
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作者 谢立信 姜忠良 +2 位作者 董晓光 袁凤波 史伟云 《眼科研究》 CSCD 2000年第2期104-106,共3页
目的 比较角膜与三叉神经节 (TG)内单纯疱疹病毒Ⅰ型 (HSV 1)潜伏相关转录 (LAT)启动子序列 ,进一步证实角膜为HSV 1的另一潜伏地。方法 用新西兰白兔建立HSV 1潜伏感染动物模型 ,提取并PCR扩增角膜及TGLAT启动子 ,比较LAT启动子序列... 目的 比较角膜与三叉神经节 (TG)内单纯疱疹病毒Ⅰ型 (HSV 1)潜伏相关转录 (LAT)启动子序列 ,进一步证实角膜为HSV 1的另一潜伏地。方法 用新西兰白兔建立HSV 1潜伏感染动物模型 ,提取并PCR扩增角膜及TGLAT启动子 ,比较LAT启动子序列。结果  6 6 7% (4/6 )的角膜组织扩增出HSV 1LAT启动子 ,且与TG的电泳位置相同 (2 16bp) ;其在 2~ 16 1间的核苷酸序列完全相同。结论 HSV 1潜伏期的角膜组织存在LAT启动子 ,并与TG内的序列相同 ,表明角膜在很大程度上与TG一样 ,是HSV 1的另一潜伏点。 展开更多
关键词 三叉神经节 角膜 启动子序列 LAT DNA HSV-1
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Isolation and Analysis of Rubber Hevein Gene and Its Promoter Sequence 被引量:4
13
作者 邓晓东 费小雯 +1 位作者 黄俊生 郑学勤 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2002年第8期936-940,共5页
Hevein, a lectin_like protein, is a major factor of lutoids in the latex of rubber trees ( Hevea brasiliensis Muell._Arg.). This factor is involved in coagulation of the latex and has the ability to bind chitin. Th... Hevein, a lectin_like protein, is a major factor of lutoids in the latex of rubber trees ( Hevea brasiliensis Muell._Arg.). This factor is involved in coagulation of the latex and has the ability to bind chitin. The hevein gene with a length of 680 bp was cloned by the method of RT_PCR. Its promoter region with 1 306 bp of this gene was also isolated by genome walking, and its sequence included the typical TATA and CAAT boxes as well as the homologous sequence of abscisic acid (ABA) response elements. Expression of the hevein gene in the latex and leaves was detected by Northern blot. After treatment of the trees with ethylene and ABA, the results showed that the hevein gene was expressed principally in latex, and the expression could be induced by ethylene and ABA. 展开更多
关键词 rubber tree HEVEIN PROMOTER Northern blot
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组蛋白与转录因子在hAMFR基因启动子序列上的结合及相互作用 被引量:3
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作者 曾庆华 尹东 +2 位作者 孙迎春 黄百渠 吕延成 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1999年第4期329-335,共7页
采用从鸡红细胞中分离纯化的组蛋白H1、核心组蛋白H2A+H2B和H3+H4,以及从HeLa细胞中萃取的含有RNA聚合酶Ⅱ和多种Ⅱ类基因转录因子的可溶性HeLa细胞核抽提物,通过凝胶迟滞电泳,对组蛋白和HeLa细胞核抽提物中的转录因子在人自泌移... 采用从鸡红细胞中分离纯化的组蛋白H1、核心组蛋白H2A+H2B和H3+H4,以及从HeLa细胞中萃取的含有RNA聚合酶Ⅱ和多种Ⅱ类基因转录因子的可溶性HeLa细胞核抽提物,通过凝胶迟滞电泳,对组蛋白和HeLa细胞核抽提物中的转录因子在人自泌移动因子受体(Humanautocrinemotilityfactor,简称为hAMFR)基因上游启动子序列的相互作用关系进行了初步研究,得到以下结论:组蛋白Hl对hAMFR基因启动子序列的结合是相对稳定的,H1在稳定染色质小体中起着重要的作用。组蛋白及其组份和转录因子可以同时结合在hAMFR基因启动子序列上形成三元复合物,提示转录因子和组蛋白在与DNA竞争结合过程中不是简单地排斥对方。 展开更多
关键词 组蛋白 核小体 转录因 启动子序列 电泳
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巴戟天MoDXS基因及其启动子的克隆与分析 被引量:3
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作者 谢德金 周成城 +5 位作者 杨柯 任可 杨德明 陈凌艳 荣俊冬 郑郁善 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期577-589,共13页
从药用植物巴戟天根部组织中克隆了3个1–脱氧–D–木酮糖5–磷酸合成酶基因MoDXS1、MoDXS2-1和MoDXS2-2,其全长cDNA分别为2676、2667和2610 bp,编码区序列长度为2154、2121和2190 bp,编码717、706和729个氨基酸。BlastP序列比对分析表... 从药用植物巴戟天根部组织中克隆了3个1–脱氧–D–木酮糖5–磷酸合成酶基因MoDXS1、MoDXS2-1和MoDXS2-2,其全长cDNA分别为2676、2667和2610 bp,编码区序列长度为2154、2121和2190 bp,编码717、706和729个氨基酸。BlastP序列比对分析表明MoDXS蛋白与其他植物的DXS蛋白高度同源;系统进化发育树分析显示,MoDXS蛋白与中粒咖啡和小粒咖啡DXS蛋白亲缘关系最近。MoDXS1、MoDXS2-1和MoDXS2-2蛋白被分别归为clade 1、clade 3和clade 2。MoDXS1在巴戟天根中表达量最高;MoDXS2-1在巴戟天根、茎、叶中的相对表达量差异显著,叶中最高;MoDXS2-2在根中表达量最高,而在茎和叶中最低。MoDXS1、MoDXS2-1和MoDXS2-2基因的5′端上游启动子序列长度分别为2538、732和1744 bp。亚细胞定位预测3个MoDXS均在叶绿体上。 展开更多
关键词 巴戟天 1–脱氧–D–木酮糖5–磷酸合成酶 启动子序列 亚细胞定位
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草鱼诱导型一氧化氮合酶cDNA和启动子的克隆及分析 被引量:1
16
作者 汪新艳 赵太强 +2 位作者 郭嘉聪 杨牧 周红 《四川动物》 CSCD 北大核心 2011年第4期510-516,共7页
应用PCR和RACE技术,以细菌脂多糖(LPS)刺激的草鱼头肾白细胞cDNA为模板,获得草鱼iNOS(In-ducible nitric oxide synthase)全长cDNA序列。该序列共4286 bp,编码含1080个氨基酸残基的蛋白。氨基酸序列比对分析发现草鱼iNOS与金鱼iNOS a和... 应用PCR和RACE技术,以细菌脂多糖(LPS)刺激的草鱼头肾白细胞cDNA为模板,获得草鱼iNOS(In-ducible nitric oxide synthase)全长cDNA序列。该序列共4286 bp,编码含1080个氨基酸残基的蛋白。氨基酸序列比对分析发现草鱼iNOS与金鱼iNOS a和b、斑马鱼iNOS 2b以及鲤鱼iNOS高度保守,序列一致性均大于80%;它们的血红素、四氢生物蝶呤、钙调蛋白、FMN、FAD和NADH等辅因子结合区域也十分保守。用NJ法对新获得的序列和其它脊椎动物NOS的编码序列进行进化分析证实它属于诱导型NOS。在此基础上,运用基因步移技术分离草鱼iNOS基因的启动子序列,共有1978 bp。生物信息学分析发现该序列含有包括GR、AP1、C/EBP、ER、YY1、IRF1和IL-6 REBP在内的多个转录因子的潜在结合位点。 展开更多
关键词 INOS CDNA序列 启动子序列 序列分析
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大鼠脊髓损伤修复相关69号蛋白与内质网应激关系的研究 被引量:2
17
作者 黄海燕 阙海萍 +1 位作者 刘涛 刘少君 《广东医学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期303-306,共4页
目的探究大鼠脊髓损伤修复相关69号蛋白(SCIRR69)在内质网应激中的表达变化,为研究其生物功能打下基础。方法采用免疫印迹、免疫荧光和激光共聚焦方法检测内质网应激诱导剂作用下SCIRR69的表达和分布变化,双荧光素酶实验验证SCIRR69分... 目的探究大鼠脊髓损伤修复相关69号蛋白(SCIRR69)在内质网应激中的表达变化,为研究其生物功能打下基础。方法采用免疫印迹、免疫荧光和激光共聚焦方法检测内质网应激诱导剂作用下SCIRR69的表达和分布变化,双荧光素酶实验验证SCIRR69分子与内质网应激的关键分子BIP基因启动子的相互作用。结果免疫印迹结果显示在内质网应激诱导剂Tg、Tm作用下,PC12细胞中SCIRR69全长分子的表达明显增高,但其剪切体形式仅在Tg作用下有所增加。在免疫荧光的结果中,在转染pEGFP-C1-SCIRR69后正常培养的细胞中,SCIRR69几乎全部分布于胞浆,当Tg存在时,SCIRR69向细胞核的转位增强。双荧光素酶报告基因检测结果显示SCIRR69对BIP基因上游的顺式作用元件没有明显的转录激活作用。结论SCIRR69很可能作为与内质网应激相关的转录因子发挥作用,但是其作用的顺式作用元件不在BIP基因启动子序列-457/-29范围内。 展开更多
关键词 ATF/CREB 内质网应激 启动子序列
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小麦TaDEP1基因启动子区转录增强序列的鉴定 被引量:1
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作者 谷玉娟 毛丰 +3 位作者 路芳芳 刘斌 刘磊 高慧 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1100-1107,共8页
RNAi干涉小麦TaDEP1基因导致小穗密度下降以及小穗数减少,表明该基因转录水平的降低会引起基因功能的丧失。为挖掘影响TaDEP1转录水平的作用元件,通过特异扩增D组TaDEP1基因启动子并进行测序,发现不同品种间存在132 bp序列差异,该序列位... RNAi干涉小麦TaDEP1基因导致小穗密度下降以及小穗数减少,表明该基因转录水平的降低会引起基因功能的丧失。为挖掘影响TaDEP1转录水平的作用元件,通过特异扩增D组TaDEP1基因启动子并进行测序,发现不同品种间存在132 bp序列差异,该序列位于TaDEP1基因起始密码子上游1529~1660 bp处。利用小麦微核心种质材料,鉴定到132 bp序列与TaDEP1基因的转录水平呈正相关,即启动子序列中含有132 bp序列的TaDEP1基因转录水平明显高于不含该序列的转录水平。启动子顺式作用元件分析结果显示,该132 bp序列未包含特殊的顺式作用元件。结合荧光素酶(LUC)活性试验,在小麦原生质体中证明该序列能够显著提高LUC的转录活性,表明该序列可作为小麦基因转录增强序列。本研究鉴定到新的小麦基因转录增强序列,为小麦分子标记辅助选择育种提供了基因资源与技术支持。 展开更多
关键词 小麦 TaDEP1 启动子序列 转录水平
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甘蔗乙烯受体Sc-ERS启动子的克隆与序列分析 被引量:2
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作者 黄静丽 牛俊奇 +3 位作者 朱惠 杨丽涛 李杨瑞 王爱勤 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期722-729,共8页
【目的】克隆甘蔗乙烯受体Sc-ERS基因启动子序列,分析Sc-ERS基因启动子序列的作用元件。【方法】采用基于热不对称交错式PCR原理的染色体步移技术,从甘蔗ROC22基因组DNA中克隆Sc-ERS基因启动子序列,利用启动子预测软件PlantCARE和PLACE... 【目的】克隆甘蔗乙烯受体Sc-ERS基因启动子序列,分析Sc-ERS基因启动子序列的作用元件。【方法】采用基于热不对称交错式PCR原理的染色体步移技术,从甘蔗ROC22基因组DNA中克隆Sc-ERS基因启动子序列,利用启动子预测软件PlantCARE和PLACE在线工具对Sc-ERS启动子序列的作用元件进行预测。【结果】克隆获得Sc-ERS启动子序列1410bp,该序列与玉米ERS25、ERS14核苷酸同源性分别为82%和80%。PlantCARE在线分析结果表明,该序列具有启动子基本作用元件TATA-BOX和CAAT-BOX,还含有参与光响应元件、干旱诱导MYB结合位点、茉莉酸甲酯响应元件、水杨酸响应元件、胚乳表达顺式调控元件、热胁迫响应元件等。【结论】从甘蔗基因组DNA中克隆获得乙烯受体Sc-ERS基因上游1410bp的启动子序列,该序列含有多个特异性调控元件,推测Sc-ERS基因的表达可能受生理周期、激素、干旱、光照等因素调控。 展开更多
关键词 甘蔗 乙烯受体基因 启动子序列 克隆
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米曲霉菌AFLR基因启动子序列的克隆 被引量:2
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作者 刘钟滨 谢艳辉 刘洋 《上海铁道大学学报》 CAS 2000年第9期4-5,21,共3页
目的 从米曲霉菌中克隆 AFL R基因启动子序列 ,为进一步开展有关研究以深入阐明曲霉菌产生黄曲霉毒素的机制打下基础。方法 应用分子生物学手段从基因文库中克隆目的基因 ,对克隆基因进行了限制性酶谱分析 ,再对启动子序列进行亚克隆... 目的 从米曲霉菌中克隆 AFL R基因启动子序列 ,为进一步开展有关研究以深入阐明曲霉菌产生黄曲霉毒素的机制打下基础。方法 应用分子生物学手段从基因文库中克隆目的基因 ,对克隆基因进行了限制性酶谱分析 ,再对启动子序列进行亚克隆并进行了序列测定。结果 从米曲霉菌 ATCC 14895基因文库中克隆获得含 AFL R基因的 8.3kb DNA片段。对该基因片段进行了限制性酶谱分析并绘制了限制性酶切图谱。根据酶谱分析结果 ,将其中 42 0bp片段亚克隆至 p BS 质粒中 ,获得重组质粒 p AP1.1。结论 序列分析结果表明我们成功地从米曲霉菌中克隆了AFL 展开更多
关键词 黄曲霉菌素 AFLR基因 启动子序列 米曲霉菌 克隆
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