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甲状腺癌中含伴侣蛋白的TCP1亚基3表达与生物学行为及免疫微环境的关系研究
1
作者
白云峰
施晓辉
+1 位作者
白银宝
塔拉
《中国肿瘤外科杂志》
CAS
2023年第6期546-555,共10页
目的探讨含伴侣蛋白的TCP1亚基3(CCT3)在甲状腺乳头状癌组织中的表达、增殖能力、分子信号通路以及与免疫微环境的关系。方法通过TCGA数据库下载甲状腺癌相关的表达数据和临床数据,分析CCT3在甲状腺癌与癌旁组织中的表达差异。收集30例...
目的探讨含伴侣蛋白的TCP1亚基3(CCT3)在甲状腺乳头状癌组织中的表达、增殖能力、分子信号通路以及与免疫微环境的关系。方法通过TCGA数据库下载甲状腺癌相关的表达数据和临床数据,分析CCT3在甲状腺癌与癌旁组织中的表达差异。收集30例甲状腺乳头状癌组织和癌旁组织,采用免疫组织化学染色法检测并验证CCT3蛋白表达情况。利用RNA干扰技术(RNAi)靶向沉默甲状腺乳头状癌细胞株(K1)CCT3基因的表达为干扰组,CCT3高表达为对照组,采用RT-qPCR和Western Blot法检测沉默效率,MTT、流式细胞技术分别检测两组细胞的增殖、细胞周期和凋亡情况。利用GSEA富集分析预测CCT3在甲状腺癌中参与的信号通路,使用CIBERSORT法分析CCT3表达与免疫浸润的相关性。结果TCGA数据库结果显示,甲状腺乳头状癌组织中CCT3基因较癌旁正常组织高表达(P<0.01)。临床样本及体外实验结果中CCT3蛋白和mRNA水平均表达上调(P<0.001)。与对照组相比,沉默CCT3可显著抑制甲状腺乳头状癌细胞的增殖能力,细胞凋亡率明显增加,可将细胞周期阻滞于G2/M期(P<0.05)。GSEA富集分析和CIBERSORT分析表明,CCT3主要富集于免疫相关通路并通过记忆B细胞、浆细胞、活化记忆CD4+T细胞、巨噬细胞M1、巨噬细胞M2、静息肥大细胞、嗜酸性粒细胞作用于甲状腺乳头状癌的发生发展。结论CCT3与甲状腺乳头状癌的发生发展关系密切,CCT3可能成为甲状腺乳头状癌新的分子标志物、诊断和治疗靶点。
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关键词
甲状腺癌
TCGA数据库
含
伴侣蛋白
的
tcp
1
亚基
3
RNA干扰
GSEA
CIBERSORT
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职称材料
题名
甲状腺癌中含伴侣蛋白的TCP1亚基3表达与生物学行为及免疫微环境的关系研究
1
作者
白云峰
施晓辉
白银宝
塔拉
机构
包头医学院
内蒙古自治区人民医院肿瘤中心甲状腺肿瘤外科
出处
《中国肿瘤外科杂志》
CAS
2023年第6期546-555,共10页
基金
内蒙古医科大学科技百万工程联合项目[YKD2020KJBW(LH)058]。
文摘
目的探讨含伴侣蛋白的TCP1亚基3(CCT3)在甲状腺乳头状癌组织中的表达、增殖能力、分子信号通路以及与免疫微环境的关系。方法通过TCGA数据库下载甲状腺癌相关的表达数据和临床数据,分析CCT3在甲状腺癌与癌旁组织中的表达差异。收集30例甲状腺乳头状癌组织和癌旁组织,采用免疫组织化学染色法检测并验证CCT3蛋白表达情况。利用RNA干扰技术(RNAi)靶向沉默甲状腺乳头状癌细胞株(K1)CCT3基因的表达为干扰组,CCT3高表达为对照组,采用RT-qPCR和Western Blot法检测沉默效率,MTT、流式细胞技术分别检测两组细胞的增殖、细胞周期和凋亡情况。利用GSEA富集分析预测CCT3在甲状腺癌中参与的信号通路,使用CIBERSORT法分析CCT3表达与免疫浸润的相关性。结果TCGA数据库结果显示,甲状腺乳头状癌组织中CCT3基因较癌旁正常组织高表达(P<0.01)。临床样本及体外实验结果中CCT3蛋白和mRNA水平均表达上调(P<0.001)。与对照组相比,沉默CCT3可显著抑制甲状腺乳头状癌细胞的增殖能力,细胞凋亡率明显增加,可将细胞周期阻滞于G2/M期(P<0.05)。GSEA富集分析和CIBERSORT分析表明,CCT3主要富集于免疫相关通路并通过记忆B细胞、浆细胞、活化记忆CD4+T细胞、巨噬细胞M1、巨噬细胞M2、静息肥大细胞、嗜酸性粒细胞作用于甲状腺乳头状癌的发生发展。结论CCT3与甲状腺乳头状癌的发生发展关系密切,CCT3可能成为甲状腺乳头状癌新的分子标志物、诊断和治疗靶点。
关键词
甲状腺癌
TCGA数据库
含
伴侣蛋白
的
tcp
1
亚基
3
RNA干扰
GSEA
CIBERSORT
Keywords
Papillary thyroid carcinoma
TCGA database
Chaperonin containing
tcp
1
,subunit
3
RNA interference
GSEA
CIBERSORT
分类号
R736.1 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甲状腺癌中含伴侣蛋白的TCP1亚基3表达与生物学行为及免疫微环境的关系研究
白云峰
施晓辉
白银宝
塔拉
《中国肿瘤外科杂志》
CAS
2023
0
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