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题名合成生物系统的组合优化
被引量：2
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作者
顾群
李一凡
陈涛
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机构
天津大学化工学院生物工程系
教育部系统生物工程重点实验室
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出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第8期1064-1074,共11页
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基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)(Nos.2011CBA00804
2012CB725203)
+5 种基金
国家自然科学基金(Nos.21176182
21206112)
国家高技术研究发展计划(863计划)(Nos.2012AA023102B
2012AA022103B)
天津市自然科学基金(No.12JCYBJC12900)
高等学校博士学科点专项科研基金(No.20100032120014)资助~~
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文摘
合成生物学所面临的一项重要挑战是构建具有全新功能的生物系统。由于生物系统固有的复杂性,仅通过理性设计,通常难以使合成基因线路发挥出最优的功能。组合工程的兴起和发展为获得组合优化性状提供了有利条件,并大大促进了具有全新功能的生物系统的构建。文中主要从单个元件的微调、代谢通路的优化以及基因组范围内靶点的识别和组合修饰三个方面入手,总结和评述了近些年表现突出的合成生物系统的组合优化方法。
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关键词
合成生物学
组合工程
合成启动子文库
多元模块工程
组合转录工程优化法
可追踪多元重组工程
全转录工程
多元自动化基因组工程
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Keywords
synthetic biology
combinatorial engineering
synthetic promoter libraries
multiple module engineering
COMPACTER
global transcription machinery engineering
trackable multiplex recombineering
multiplex automated genome engineering
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分类号
Q819
[生物学—生物工程]
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题名谷氨酸棒杆菌人工合成启动子文库的构建及应用
被引量：8
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作者
刘莫识
刘娇
孙冠男
路福平
王钰
郑平
孙际宾
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机构
天津科技大学生物工程学院
中国科学院系统微生物工程重点实验室天津工业生物技术研究所
国家合成生物技术创新中心
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出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期831-842,共12页
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基金
国家重点研发计划(2019YFA0904900)
国家自然科学基金(31800038)
天津市自然科学基金(18JCQNJC10300)。
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文摘
启动子是实现基因精细表达调控的重要工具,广泛应用于微生物的代谢工程改造。谷氨酸棒杆菌是重要的工业底盘,已报道的启动子文库较少且主要是基于完全人工设计的突变序列构建获得。本研究对谷氨酸棒杆菌odhA基因天然启动子的–10区及附近序列进行随机突变,借助rfp报告基因和荧光成像系统进行高通量筛选,构建了包含57个相对强度为2.4–16.7倍的人工启动子文库,最高强度可达强诱导型启动子P_(trc)的2.3倍。分析文库的突变序列,发现55个启动子突变体的–10区保守序列“TANNNT”均向3′端移动1–4个碱基,其中移动4个碱基的突变体占68%;同时发现强、中、弱启动子突变体在不同位置还呈现T或G保守碱基。选择5个不同强度的启动子应用于L-脯氨酸合成途径γ-谷氨酰激酶(ProB)的表达调控,结果显示,L-脯氨酸产量随着启动子强度增强逐渐提高,相对强度为9.8倍的启动子达到最高产量(6.4 g/L),更高强度的启动子将不再提高L-脯氨酸的产量。本研究基于谷氨酸棒杆菌天然启动子P_(odhA)构建文库,成功获得1个强度增强显著、分布均匀的新型启动子文库,可用于谷氨酸棒杆菌的系统代谢工程改造,还可为更多启动子文库的构建提供思路和方法借鉴。
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关键词
谷氨酸棒杆菌
人工合成启动子文库
P_(odhA)启动子
L-脯氨酸
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Keywords
Corynebacterium glutamicum
synthetic promoter library
PodhA promoter
L-proline
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分类号
Q78
[生物学—分子生物学]
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