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火龙果Ty1-copia类反转录转座子反转录酶序列的克隆及分析 被引量:20
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作者 范付华 乔光 +1 位作者 郑思成 文晓鹏 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期265-272,共8页
根据Ty1-copia类反转录转座子反转录酶的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,从火龙果基因组中扩增出260bp左右的目标条带,经回收、克隆、测序及序列分析,获得了23条来源于火龙果试管苗变异和非变异材料的反转录酶序列。通过系统演化分析,... 根据Ty1-copia类反转录转座子反转录酶的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,从火龙果基因组中扩增出260bp左右的目标条带,经回收、克隆、测序及序列分析,获得了23条来源于火龙果试管苗变异和非变异材料的反转录酶序列。通过系统演化分析,所得序列可分为5类,存在较高的异质性;与母株相比,变异植株的反转录酶序列存在缺失、移码和终止密码子突变。经反转录酶氨基酸序列对比,火龙果与其它物种间具有较高的同源性,表明在不同物种间可能存在反转录转座子的横向传递作用。 展开更多
关键词 火龙果 变异 Ty1-copia类转录转座子 反转录酶 异质性
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Telomerase activity and cell apoptosis in colon cancer cell by human telomerase reverse transcriptase gene antisense oligodeoxynucleotide 被引量:15
2
作者 U-FangFan Chong-QingJiang +3 位作者 WeiJinChen Ying-AnJiang He-ShengLuo You-YuanZhang 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2003年第9期1981-1984,共4页
AIM: To evaluate the effect of human telomerase reverse transcriptase (hTERT) gene antisense oligodeoxynudeotide (As-ODN) on telomerase activity and cell apoptosis in colon cancer cell line SW480.METHODS: As-ODN was t... AIM: To evaluate the effect of human telomerase reverse transcriptase (hTERT) gene antisense oligodeoxynudeotide (As-ODN) on telomerase activity and cell apoptosis in colon cancer cell line SW480.METHODS: As-ODN was transfected into cells SW480 by liposomal transfection. Cultured cells were divided into three groups: ASODN (5′GGAGCGCGCGGCATCGCGGG-3), sense oligodeoxynucleotide (5′-CCCGCGATGCCGCGCGCTCC-3; SODN) and control. The concentration of oligodeoxynucleotide and lipsome was 10 μmol/L and 16 mg/L, respectively. The activity of telomerase was examined by telomeric repeat amplification protocol (TRAP)-enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), and cell apoptosis was observed by morphology and flow cytometry in each group.RESULTS: Telomerase activity began to be down-regulated or inhibited when cells SW480 were treated with As-ODN for 72 h, and cell apoptosis was induced.CONCLUSION: It is suggested that hTERT As-ODN might specially inhibit the activity of telomerase in colon cancer cells and it is further proved that the hTERT gene has a significant correlation with telomerase activity. Further evidence is needed to prove whether hTERT As-ODN is a potential tool for the treatment of colon cancer. 展开更多
关键词 结肠癌 细胞凋亡 端粒 反转录酶 义寡脱氧核糖核苷酸
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Antitumor mechanism of antisense cantide targeting human telomerase reverse transcriptase 被引量:15
3
作者 Qing-YouDu Xiao-BoWang +2 位作者 XueJunChen WeiZheng Sheng-QiWang 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2003年第9期2030-2035,共6页
AIM: To investigate the anti-tumor mechanism of antisenseoligodeoxynucleotide cantide against hTERT.METHODS: Tumor cells were cultured overnight and grownto 50-60% confluence. HepG2 and SMMC-7721 were treatedwith cant... AIM: To investigate the anti-tumor mechanism of antisenseoligodeoxynucleotide cantide against hTERT.METHODS: Tumor cells were cultured overnight and grownto 50-60% confluence. HepG2 and SMMC-7721 were treatedwith cantide mixed with lipofectin, or lipofectin alone. Afterinducted for 6 h at 37℃, 10% FCS in DMEM was replacedin each well. After the treatment repeated twice to threetimes in each concentration of cantide, hTERT mRNA andprotein expression were measured by RT-PCR and Westernblot analysis, respectively. Telomerase aclivity was determinedby TRAP-ELISA assay. CPP32- and ICE-like activity was alsoinvestigated using CasPACE assay system at 48 h aftercantide treatment, and apoptosis was evaluated using theDeadEnd assay at 24, 48 and 72 h after cantide treatment.RESULTS: Compared to the control cells, the cells treated with cantide showed a dose-dependent decrease in hTERT mRNA levels at 24 h and in protein levels at 48 h respectively.The telomerase activity was decreased as the concentration of cantide increased at 48 h. At the concentration of 800 nM,the telomerase activity in the treated HepG2 and SMMC7721 cells was only 17.1% (P<0.01) and 20.3% (P<0.01)of that in untreated cells. The levels of CPP32-like protease activity in HepG2 and SMMC-7721 increased by 2.8- and 3.0-fold (P<0.05) at 48 h, and the levels of ICE-like protease activity also increased by 2.6- and 3.2-fold (P<0.05)respectively. The percentage of apoptosis in HepG2 and SMMC-7721 cells treated with 800 nM cantide at 72 h was 63% and 52% (P<0.01), respectively. By contrast, 8%and 9% of the cells were apoptosis after 72 h treatment with lipofectin alone.CONCLUSION: Cantide can decrease telomerase activity by inhibiting the expression of hTERT gene and has a rapid anti-tumor effect through inducing the Caspase-dependent apoptosis. The rapid inhibitory effect of cantide on tumor growth demonstrates its feasibility in cancer treatment. 展开更多
关键词 肿瘤 端粒 反转录酶 义寡脱氧核糖核苷
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桂花LTR类反转录转座子RT序列的克隆及分析 被引量:14
4
作者 王庆竹 李慧平 +1 位作者 文晓鹏 范付华 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期309-320,共12页
克隆获得桂花Ty1-copia和Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶(reverse transcriptase,RT)序列,并对其序列变化特点进行分析,以期为桂花基因组进化和多样性研究提供依据。根据Ty1-copia和Ty3-gypsy类反转录转座子RT保守区设计简并引物,以... 克隆获得桂花Ty1-copia和Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶(reverse transcriptase,RT)序列,并对其序列变化特点进行分析,以期为桂花基因组进化和多样性研究提供依据。根据Ty1-copia和Ty3-gypsy类反转录转座子RT保守区设计简并引物,以桂花叶片基因组DNA为模板,通过PCR扩增,分别得到260和430 bp左右的目标条带,经回收、克隆、测序及相关生物信息学软件进行序列分析后,获得49条Ty1-copia类反转录转座子RT序列和20条Ty3-gypsy类反转录转座子RT序列。通过核苷酸聚类,Ty1-copia类反转录转座子RT序列分为4类。这些序列长度为255~271 bp,序列相似性为32.0%~96.9%。翻译成氨基酸后,有2条序列出现移码突变,16条序列出现终止密码子突变。Ty3-gypsy类反转录转座子RT序列也分为4类。序列长度为408~449 bp,相似性为54.7%~98.8%。有8条序列发生移码突变,10条序列发生终止密码子突变。经反转录转座子RT氨基酸序列比对,桂花与梅花、李、枣等可能有共同的起源。桂花Ty1-copia和Ty3-gypsy类反转录转座子RT序列具有高度异质性;系统进化树分析表明,桂花与不同物种间可能存在反转录转座子的横向传递。 展开更多
关键词 桂花 转录转座子 Ty1-copia Ty3-gypsy 反转录酶 异质性
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牡丹Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶序列的克隆及分析 被引量:13
5
作者 侯小改 郭大龙 +1 位作者 黄燕梅 张曦 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期98-106,共9页
根据 Ty3-gypsy 反转录转座子反转录酶的保守序列设计简并引物,从中原牡丹(Paeonia suffruticosa Andrews)品种‘洛阳红’和野生种卵叶牡丹(Paeonia qiui Y. L. Pei et D. Y. Hong)中扩增出430 bp 左右的目标片段。目的条带经回收、克... 根据 Ty3-gypsy 反转录转座子反转录酶的保守序列设计简并引物,从中原牡丹(Paeonia suffruticosa Andrews)品种‘洛阳红’和野生种卵叶牡丹(Paeonia qiui Y. L. Pei et D. Y. Hong)中扩增出430 bp 左右的目标片段。目的条带经回收、克隆、测序及相关生物信息学软件进行序列分析后,获得了13 条来自牡丹的 Ty3-gypsy 反转录转座子反转录酶序列。这些核苷酸序列具有较高的异质性,主要表现为缺失突变,序列长度变化范围为 412 ~ 446 bp,同源性范围为 71.5% ~ 94.8%。翻译成氨基酸后,有 12 条序列出现 1 ~ 9 个不同程度的终止密码子突变,3 条序列出现移框突变。其核苷酸序列经过系统聚类后可分为 6 个家族。将其氨基酸序列与已登录的不同物种 Ty3-gypsy 反转录转座子反转录酶的氨基酸序列进行聚类分析,结果表明与其他植物具有较高的同源性,表明它们间可能存在着 Ty3-gypsy 反转录转座子的横向传递。 展开更多
关键词 牡丹 Ty3-gypsy 转录转座子 反转录酶 异质性
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mRNA差异显示技术的研究进展 被引量:7
6
作者 陈永华 严钦泉 +1 位作者 余建蒲 肖国樱 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期9-12,43,共5页
针对mRNA差异显示技术中的假阳性高和放射性污染等缺陷,文章从改进引物设计、应用非放射性标记、优化PCR参数、假阳性鉴定等方面进行了综述。1采用4种兼并或单碱基引物作锚定引物;用特异和长序列(≥20bp)专一性引物作为随机引物,可增加... 针对mRNA差异显示技术中的假阳性高和放射性污染等缺陷,文章从改进引物设计、应用非放射性标记、优化PCR参数、假阳性鉴定等方面进行了综述。1采用4种兼并或单碱基引物作锚定引物;用特异和长序列(≥20bp)专一性引物作为随机引物,可增加特异性;在锚定引物之前加上了一段T7启动子序列,在随机引物前加上一段M13重复序列,可使DDRT—PCR的体系的扩增特异性更一致。2针对放射性同位素检测法的缺点,文章提出并比较了几种常用的非放射性同位素标记方法。3保证起始(模板)mRNA质量和浓度,降低dNTP浓度,选择最适的反转录和PCR退火温度,可优化PCR参数。4用两种不同的反转录酶进行反转录平行实验,很容易区分出RNA制备过程中造成的假阳性,目前假阳性鉴定大多还是以Northern印迹为基础,再作些适当的改进。 展开更多
关键词 MRNA差异显示技术 研究进展 NORTHERN 非放射性同位素 非放射性标记 dNTP浓度 锚定引物 随机引物 放射性污染 启动子序列 假阳性 重复序列 标记方法 退火温度 平行实验 反转录酶 制备过程 R参数 特异性 PCR 单碱基 专一性
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火龙果Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶序列的克隆及分析 被引量:8
7
作者 彭磊 吴艳 +3 位作者 刘小翠 杨鵾 范付华 文晓鹏 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期186-195,共10页
【目的】克隆Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶(RT)序列并分析其特性,为火龙果遗传变异和进化研究提供新的信息。【方法】根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT保守区设计简并引物,从红肉和白肉火龙果及其突变体中扩增出430 bp左右的目标片段... 【目的】克隆Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶(RT)序列并分析其特性,为火龙果遗传变异和进化研究提供新的信息。【方法】根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT保守区设计简并引物,从红肉和白肉火龙果及其突变体中扩增出430 bp左右的目标片段,回收、克隆、测序获得RT序列,并进行生物信息学分析;采用RT-PCR检测其转录活性。【结果】共获得82条RT序列,其中有55条序列发生终止密码子突变,5条序列发生移码突变;经RT序列对比,火龙果与水稻、拟南芥有较高的同源性;3条RT序列具有转录活性。【结论】火龙果Ty3-gypsy类反转录转座子RT序列具有高度异质性,部分序列具有转录活性,与其他物种存在反转录转座子的横向传递。 展开更多
关键词 火龙果 Ty3-gypsy类转录转座子 反转录酶 异质性 转录活性
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人参总RNA提取方法及反转录酶的比较 被引量:6
8
作者 张涛 韩梅 +1 位作者 刘翠晶 胥苗苗 《江苏农业科学》 北大核心 2015年第8期34-37,共4页
为了探索人参根、叶片总RNA的提取方法,以多年生人参根、叶片为材料,比较7种提取方法的总RNA质量。结果表明:除改良CTAB法对人参根总RNA的提取效果不明显,其余方法均能从人参根、叶片中提取、分离到总RNA,其中RNAPure高纯总RNA快速提取... 为了探索人参根、叶片总RNA的提取方法,以多年生人参根、叶片为材料,比较7种提取方法的总RNA质量。结果表明:除改良CTAB法对人参根总RNA的提取效果不明显,其余方法均能从人参根、叶片中提取、分离到总RNA,其中RNAPure高纯总RNA快速提取试剂盒法能提取到完整性较好、纯度较高的总RNA,琼脂糖凝胶电泳显示的条带清晰完整,根中RNA的D260 nm/D280 nm为1.87,RNA浓度为351.8 ng/μL;用Reverse Transcriptase M-MLV(RNase H-)试剂盒、Prime Script Reverse Transcriptase试剂盒、Go ScriptTMReverse Transcription System试剂盒对提取的总RNA进行反转录,其中用Go ScriptTMReverse Transcription System试剂盒反转录后进行PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳条带较亮,证明转录效果较好。经反转录、PCR证明,提取的总RNA适用于后续的分子试验研究。 展开更多
关键词 人参 叶片 总RNA 提取方法 反转录酶
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牡丹LINE类反转录转座子RT序列的克隆及分析 被引量:6
9
作者 宋程威 郭大龙 +2 位作者 张曦 郭丽丽 侯小改 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期157-164,共8页
利用LINE简并引物从中原牡丹品种‘洛阳红’中扩增出580 bp左右的目的条带,对其回收、克隆、测序及相关生物信息学软件分析后获得32条LINE类牡丹反转录转座子RT(反转录酶)序列。这些序列长度为547 - 593 bp,主要表现为点突变,经Clusta... 利用LINE简并引物从中原牡丹品种‘洛阳红’中扩增出580 bp左右的目的条带,对其回收、克隆、测序及相关生物信息学软件分析后获得32条LINE类牡丹反转录转座子RT(反转录酶)序列。这些序列长度为547 - 593 bp,主要表现为点突变,经Clustal W比对其同源性为25.7% - 94.2%。将其核苷酸序列经聚类后可分为4个家族,其中家族Ⅰ 和Ⅲ分别占总序列数的50%和28%。将32条RT序列翻译成氨基酸序列,在第18氨基酸序列处有1个非常保守的的甘氨酸(Gly),在138氨基酸序列处有1个半保守的赖氨酸(Lys)位点。32条序列均发生较多的终止密码子突变和移码突变。与其他物种的系统进化树分析,表明牡丹LINE类反转录转座子RT序列既有一定的保守性,同时也与其他物种间存在一定的同源性。 展开更多
关键词 牡丹 非LTR类转录转座子 反转录酶
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Copia类型反转录转座子在籽粒苋中的表现 被引量:2
10
作者 何予卿 孙梅 +1 位作者 朱英国 张利达 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第5期461-466,共6页
利用籽粒苋为材料 ,通过PCR扩增、克隆研究了copia类型反转录转座子的反转录酶序列在籽粒苋中的表现 ,结果表明 :(1)反转录转座子在苋属的 30个品系中同时检测到 ,说明反转录转座子在籽粒苋的不同种中普遍存在 ;(2 )对野生苋 (A .quiten... 利用籽粒苋为材料 ,通过PCR扩增、克隆研究了copia类型反转录转座子的反转录酶序列在籽粒苋中的表现 ,结果表明 :(1)反转录转座子在苋属的 30个品系中同时检测到 ,说明反转录转座子在籽粒苋的不同种中普遍存在 ;(2 )对野生苋 (A .quitensis)中克隆、序列分析 2 8个反转录转座子的反转录酶序列 ,碱基分析表明 ,它们存在高度异质性 ,不同的反转录酶序列均存在不同程度的碱基缺失突变和终止密码子的突变 ;(3)对 2 8个序列与已发表的一些不同物种 (如水稻、矮牵牛和果蝇等 )的同一类型序列聚类分析表明 ,存在于野生苋中的反转录转座子与来源于双子叶或单子叶植物的反转录转座子关系密切 ,它们与果蝇的copia因子和 展开更多
关键词 Copia类型转录转座子 籽粒苋 表现 反转录酶 分子进化
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文昌鱼头部cDNA文库的构建 被引量:3
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作者 方永强 申庆祥 +1 位作者 翁幼竹 沈卫英 《台湾海峡》 CAS CSCD 2003年第2期131-135,共5页
采用cDNA合成技术制备文昌鱼头部cDNA基因文库 .以mRNA为模板 ,用NotIprimer Adaptor为引物 ,在反转录酶的作用下 ,合成第一链cDNA ,进而合成第二链cDNA .含有EcoRI和NotI粘性末端的双链cDNA在T4DNA连接酶作用下与λgt1 1EcoRI/NotI臂相... 采用cDNA合成技术制备文昌鱼头部cDNA基因文库 .以mRNA为模板 ,用NotIprimer Adaptor为引物 ,在反转录酶的作用下 ,合成第一链cDNA ,进而合成第二链cDNA .含有EcoRI和NotI粘性末端的双链cDNA在T4DNA连接酶作用下与λgt1 1EcoRI/NotI臂相连 ,包装蛋白包装 ,得到噬菌体颗粒 ,即原始的文昌鱼头部cD NA文库 .经X Gal/IPTG板测定 ,该文库滴度为 7.8× 1 0 5 pfu/cm3 ,重组率为 70 % . 展开更多
关键词 文昌鱼 cDNA合成技术 cDNA基因文库 反转录酶 分子生物学 目的基因筛选
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小麦反转录转座子家族鉴定及其转录活性分析 被引量:4
12
作者 唐益苗 马有志 +1 位作者 李连城 辛志勇 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第6期546-551,共6页
根据反转录转座子的反转录酶(reverse transcriptase, RT)区域序列特征, 研究了小麦基因组中反转录转座子家族构成及其进化关系. 根据反转录转座子RT保守序列设计引物, 通过RTPCR从接种白粉病菌的小麦品系Pm97034的cDNA中扩增了一批RT片... 根据反转录转座子的反转录酶(reverse transcriptase, RT)区域序列特征, 研究了小麦基因组中反转录转座子家族构成及其进化关系. 根据反转录转座子RT保守序列设计引物, 通过RTPCR从接种白粉病菌的小麦品系Pm97034的cDNA中扩增了一批RT片段. 对51个随机克隆(RT1~51)的测序结果表明: 它们之间具有高度异质性, 核苷酸的同源性在75.4%~97.9%. 结合已报道的7个小麦反转录转座子家族(family 1~7)的代表序列, 构建了系统发育树, 发现3个新的家族, 分别命名为family 8, family 9和family 10. 其中, family 8是发生Pooideae亚族分化之前, 是一类古老的反转录转座子家族. 另外, family 4和family 7这2个家族中某些成员具有转录活性, 并以高拷贝的形式存在于小麦及其近缘属的基因组中. 展开更多
关键词 转录转座子 家族 活性分析 鉴定 系统发育树 反转录酶 序列特征 序列设计 进化关系 cDNA 小麦品系 白粉病菌 转录活性 基因组 异质性 同源性 核苷酸 近缘属 RT 引物 测序 克隆 分化
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非核苷类HIV-1反转录酶抑制剂:一类新的抗艾滋病药物 被引量:2
13
作者 李英富 《国外医学(药学分册)》 CAS 1994年第4期207-213,共7页
非核苷类HIV-1反转录酶抑制剂是近二三年发现的高度专一地抑制HIV-1复制的化合物,它们具有极高的选择性。本文综述了7种非核苷类化合物体外抑制HIV-1的特性,展望了这些化合物成为抗艾滋病新药的前景。
关键词 艾滋病 HIV-1 反转录酶 抑制剂
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哈尔滨市39例HIV-1毒株原发耐药的变异研究 被引量:4
14
作者 李文静 李航 +1 位作者 王福祥 李用国 《中国病毒病杂志》 CAS 2012年第6期440-445,共6页
目的分析哈尔滨市39例未经抗病毒治疗的HIV-1感染者原发耐药的情况,明确哈尔滨市HIV/AIDS患者原发耐药的耐药谱,为今后该市确定对于HIV/AIDS患者进行高效抗逆转录病毒治疗方案提供参考。方法应用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法对哈... 目的分析哈尔滨市39例未经抗病毒治疗的HIV-1感染者原发耐药的情况,明确哈尔滨市HIV/AIDS患者原发耐药的耐药谱,为今后该市确定对于HIV/AIDS患者进行高效抗逆转录病毒治疗方案提供参考。方法应用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法对哈尔滨市39例未经抗病毒治疗的HIV-1感染者血浆HIVpol基因序列进行扩增,分析耐药突变位点以及对各类抗病毒药物的耐药程度。结果 39例扩增阳性的pol区基因中,系统进化树分析结果显示:B亚型共18例(46.15%),包括泰国B′7例(17.95%),欧美B 11例(28.21%);CRF01_AE亚型15例(38.46%);07_BC亚型5例(12.82%);1例出现CRF01_AE与A亚型的重组(2.56%)。基因型耐药结果分析显示:针对蛋白酶抑制剂,未出现蛋白酶抑制剂(PI)主要耐药突变,9例出现次要耐药突变(L10I、A71T/V)。针对核苷类逆转录酶抑制剂(NRTI)和非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTI),出现3例核苷类逆转录酶抑制剂耐药突变(K219Q、T69N),导致对去羟肌苷(ddI)、齐多夫定(AZT)、司他夫定(d4T)的潜在低度耐药;出现10例非核苷类逆转录酶抑制剂耐药突变(V179D/E),导致对依非韦伦(EFV)、奈韦拉平(NVP)潜在低度耐药。结论哈尔滨市未经治疗的HIV-1感染者中原发耐药的发生率出现上涨趋势,需引起足够的重视。 展开更多
关键词 HIV-1 反转录酶 蛋白 耐药相关变异
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四倍体野生种花生Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的分离及序列分析
15
作者 蔡铁城 张冲 +9 位作者 刘菁 阳太亿 陈华 蒋菁 贺梁琼 韩柱强 唐荣华 庄伟建 刘俊仙 熊发前 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2023年第21期6972-6981,共10页
本研究从四倍体野生种花生中分离了Ty3-gypsy类反转录转座子的反转录酶(RT)基因序列,分析了其序列特点和差异,为研究其转录活性和功能奠定基础。根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的保守区设计简并引物,PCR扩增四倍体野生种花生(Arachi... 本研究从四倍体野生种花生中分离了Ty3-gypsy类反转录转座子的反转录酶(RT)基因序列,分析了其序列特点和差异,为研究其转录活性和功能奠定基础。根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的保守区设计简并引物,PCR扩增四倍体野生种花生(Arachis monticola)(PI468199)的DNA,目的条带经回收、克隆和测序后,进行生物信息学分析。结果显示,目的条带大小约为430 bp,共有29条AmRT2-X基因序列被分离出,这些序列长度变化范围为397~433 bp,AT所占比例范围为55.66%~65.97%,核苷酸序列间相似性在45.1%~97.2%之间,存在较高异质性;29条AmRT2-X基因序列被聚类划分为8个家族,家族A是包含序列最多的家族;翻译成氨基酸后,有10条AmRT2-X基因序列发生了无义突变;氨基酸序列间相似性在22.3%~98.6%之间,呈现高度异质性;绝大部分AmRT2-X基因序列的保守基序一致;系统进化树显示,所有RT基因序列被分为6类,其中,Ⅰ类包含20条AmRT2-X基因序列,Ⅱ类中的4条Am RT2-X基因序列与来自拟南芥、多花黑麦草、火龙果、牡丹、果梅、枣、山桑、白皮松等物种的序列之间亲缘关系较近;通过比对花生EST数据库,发现2条具有转录活性的四倍体野生种花生Ty3-gypsy类反转录转座子。本研究为Ty3-gypsy类反转录转座子全长序列的分离及其功能的研究提供一定基础。 展开更多
关键词 花生 Ty3-gypsy类转录转座子 反转录酶 异质性 四倍体野生种
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乙型肝炎病毒前C/C区基因变异检测的临床意义 被引量:2
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作者 吴国荣 杨小娟 唐震 《微循环学杂志》 2008年第2期34-35,共2页
目的:研究乙型肝炎病毒(HBV)前C?C区基因的一级结构及其变异特点。探讨前C区1896位基因突变与血清标志物,肝功能损害的关系。方法:收集慢性乙型病毒性肝炎患者血清388份,进行前C/C区基因测序,HBV标志物、HBV-DNA、ALT、AST测定。结果:HB... 目的:研究乙型肝炎病毒(HBV)前C?C区基因的一级结构及其变异特点。探讨前C区1896位基因突变与血清标志物,肝功能损害的关系。方法:收集慢性乙型病毒性肝炎患者血清388份,进行前C/C区基因测序,HBV标志物、HBV-DNA、ALT、AST测定。结果:HBVA1896突变毒株158例,A1899突变毒株57例。C区变异大部分集中在第5、27、60位氨基酸的序列中。结论:A1896突变与HBeAg分泌障碍有关。A1896突变可加重肝脏损害。 展开更多
关键词 前C/C区基因变异 乙型肝炎病毒 临床意义 检测 生物学特性 反转录酶 复制过程 致病机制
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Inhibition of M-MuLV reverse transcriptase activity by fullerene derivatives 被引量:4
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作者 MENG Xianmei CHEN Zhe LI Bo ZHANG Yufei ZHAO Dongxu YANG Xinlin 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2006年第20期2550-2552,共3页
Influence of fullerene (C60) derivatives on M-MuLV reverse transcriptase activity is investi- gated. Two water-soluble fullerene derivatives, fullerol (C60(OH)23-24) and trimalonic acid C60 (TMA C60, C63(COOH)6) are u... Influence of fullerene (C60) derivatives on M-MuLV reverse transcriptase activity is investi- gated. Two water-soluble fullerene derivatives, fullerol (C60(OH)23-24) and trimalonic acid C60 (TMA C60, C63(COOH)6) are used in the experiments and their effects on in vitro reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) of β-actin mRNA in HeLa cells are determined. PCR products are detected by agarose gel electrophoresis. It is found that the amounts of PCR products decrease with addition of either of two fullerene derivatives to RT reaction mixture. The inhibition of fullerene derivatives is dose-dependent, and IC50 values of fullerol and TMA C60 are 0.089 and 0.039 mmol/L, respectively. The amount of PCR products obtained by direct addition of fullerol or TMA C60 to PCR are greater than those obtained by addition of the equivalent amount of fullerol or TMA C60 to RT, indicating an inhibitory ef- fect of fullerol or TMA C60 on RT. The compensative experiment of M-MuLV reverse transcriptase shows that increasing enzyme amounts can antagonize the activity of fullerol or TMA C60. These results imply that fullerenes can inhibit M-MuLV reverse transcriptase activity, with the inhibition of TMA C60 slightly stronger than fullerol, and that their potential in treatment of diseases induced by RNA viruses such as leukemia virus needs further investigation. 展开更多
关键词 M-MuLV 反转录酶 抑制作用 水溶性 丙二酸
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hTERT、c-fos、c-jun在成釉细胞瘤中的表达及意义 被引量:3
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作者 钟鸣 刘敬东 +4 位作者 王洁 刘洁 李乐 侯琳 张波 《上海口腔医学》 CAS CSCD 2006年第5期461-465,共5页
目的:探讨c-fos、c-jun及hTERTmRNA在人成釉细胞瘤(AB)中的表达及其临床意义。方法:用原位杂交法检测AB中c-fos、c-jun和hTERTmRNA的表达,同时选取正常口腔黏膜7例、牙源性角化囊性瘤(KCOT)16例作为对照。采用SPSS10.0统计软件包进行χ... 目的:探讨c-fos、c-jun及hTERTmRNA在人成釉细胞瘤(AB)中的表达及其临床意义。方法:用原位杂交法检测AB中c-fos、c-jun和hTERTmRNA的表达,同时选取正常口腔黏膜7例、牙源性角化囊性瘤(KCOT)16例作为对照。采用SPSS10.0统计软件包进行χ2检验和Fisher确切概率法及Kendall相关分析。结果:正常口腔黏膜无c-fos、c-junmRNA的表达,hTERTmRNA仅在1/7例正常上皮中表达。c-fos、c-junmRNA和hTERTmRNA在KCOT上皮阳性表达率分别为72.7%(8/11)、35.7%(5/14)和87.5%(14/16)。AB中,c-fosmRNA阳性表达率为91.5%(43/47)、c-junmRNA阳性表达率较低,为26.7%(12/45),而hTERTmRNA高达94.0%(47/50)。c-fos和hTERTmRNA在正常口腔黏膜、KCOT及AB3组间的表达差异显著(P<0.001),而c-jun的表达在各组间未见显著差异。Kendall相关分析表明,c-fos与hTERTmRNA呈正相关(rk=0.024,P<0.05)。结论:c-fos基因在AB的发生、发展及细胞的增殖中起重要作用,且可能为构成AP-1的一个主要亚基,参与AB中端粒酶活性的调节。 展开更多
关键词 成釉细胞瘤 c—los C-JUN 端粒 反转录酶
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人类免疫缺陷病毒耐药性的研究现状 被引量:2
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作者 卢洪洲 刘莉 《内科理论与实践》 2007年第4期224-227,共4页
自1987年始,经过30年临床应用,抗反转录病毒药物已显示其在控制人类免疫缺陷病毒(HIV)疾病的进展及延长患者寿命的巨大疗效,但这些疗效可能因病毒对药物产生耐受性而受到限制。在接受抗反转录病毒治疗(ART)的患者中,约50%会发... 自1987年始,经过30年临床应用,抗反转录病毒药物已显示其在控制人类免疫缺陷病毒(HIV)疾病的进展及延长患者寿命的巨大疗效,但这些疗效可能因病毒对药物产生耐受性而受到限制。在接受抗反转录病毒治疗(ART)的患者中,约50%会发生一个以上主要的耐药性突变。而在近期感染但未接受ART的患者中,原发耐药性突变发生率为5%~20%,说明耐药性突变是可传递的, 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒 药物耐受性 反转录酶 蛋白
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HBV反转录酶A181位点变异与临床耐药的关系 被引量:3
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作者 吴云海 吴云萍 +2 位作者 张晓棠 潘洪洋 赵汝钦 《肝脏》 2009年第2期105-107,共3页
目的分析核苷(酸)类似物(NA)疗程中HBV反转录酶(rt)A181位点的变异与临床耐药的关系。方法对5例rtA181位点变异的慢性HBV感染患者做回顾性调查与随访,对比核苷类似物治疗前后的病毒学及肝功能生化应答情况。结果在85例HBV反转录酶测序... 目的分析核苷(酸)类似物(NA)疗程中HBV反转录酶(rt)A181位点的变异与临床耐药的关系。方法对5例rtA181位点变异的慢性HBV感染患者做回顾性调查与随访,对比核苷类似物治疗前后的病毒学及肝功能生化应答情况。结果在85例HBV反转录酶测序中发现5例rtA181位点变异,5例中2例发生rtA181V变异,2例发生rtA181T变异,1例发生rtA181S变异,均未出现rtN236T及YMDD(rtM204)变异,其中4例与临床耐药相关。结论rtA181V/T/S变异与NA治疗中的耐药有关。 展开更多
关键词 核苷(酸)类似物 抗病毒治疗 P基因 反转录酶 变异
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